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甘薯、番茄、拟南芥中SPL转录因子的生物信息学分析 被引量:6

Bioinformatics analysis of SPL transcription factors in sweet potato,tomato and Arabidopsis
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摘要 对甘薯、番茄、拟南芥中63个SPL基因家族进行了系统进化树分析、保守蛋白基序(Motif)分析,筛选归纳出同源性较高的2个分支的12个SPL基因进行理化性质分析、核定位预测等,氨基酸序列比对结果表明这些基因的功能可能较为保守。通过对番茄中的SPL基因Solyc05g015510.2、Solyc10g078700.1进行表达量分析,发现这2个基因可能参与调控果实成熟衰老进程。另外,通过对非生物胁迫下的转录水平进行分析得知,拟南芥中的AT5G43270可能参与对盐胁迫、热胁迫条件下的响应,AT1G27360、AT1G27370可能参与热胁迫条件下的响应,AT2G42200可能参与冷胁迫条件下的响应,而AT3G57920在非生物胁迫条件下表达量没有特别明显的变化,表明AT3G57920可能不参与非生物胁迫下的响应。
出处 《江苏农业科学》 北大核心 2021年第20期74-83,共10页 Jiangsu Agricultural Sciences
基金 国家重点研发计划(编号:2019YFD100070、2019YFD100071、2019YFD1001300、2019YFD1001303) 现代农业产业技术体系项目(编号:CARS-10-B1) 国家自然科学基金(编号:31670278、31970200、31970312、31901993、31872078) 安徽省科技重大项目(编号:16030701073) 中央高校基础研究基金(编号:JZ2018HGTB0241、JZ20181)。
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参考文献2

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共引文献62

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