摘要
利用正交设计L16(45)对槲树(Quercus dentata Thunb.)基因组DNASSR-PCR反应体系的5个因素(Tap酶,Mg2+,,模板DNA,dNTP,引物)在4个水平上进行优化试验,筛选出各反应因素的最佳水平,建立了槲树模板DNASSR-PCR反应的最佳体系(20μL):60ng模板DNA,2mmol/LMg2+,0.075U/μLTaq酶,0.4mmol/L dNTP,引物浓度0.1μmol/L。对槲树DNASSR-PCR最佳反应体系的退火温度进行了梯度试验,最佳退火温度为51.3℃。
Orthogonal design was used to optimize SSR-PCR amplification system for Quercus dentata Thunb in terms of 5 factors （ Taq DNA polymerase, Mg^2＋, DNA template,dNTP and primer） from 4 levels. An optimal SSR-PCR system for Quercus dentata Thunb was obtained as 60 ng DNA template, 2 mmol/L Mg^2＋, 0. 075 U/wL Taq DNA polymerase, 0.4 mmol/L dNTP,and 0, 1 wmol/L primer for 20μL reaction system. The optimal annealing temperature for SSR-PCR reaction system was determined as 51.3℃ by gradient PCR.
出处
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第2期307-311,共5页
ACTA SERICOLOGICA SINICA
基金
辽宁省重点实验室专项课题[编号辽科发(2005)36]
关键词
槲树
SSR标记
反应体系
正交设计
Quercus dentata Thunb.
SSR markers
Reaction system
Orthogonal design
