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6种重要经济鱼类生长激素完整cDNA的克隆和序列分析(英文) 被引量：7
1
作者 张竞男 宋平 +5 位作者 胡珈瑞 莫赛军 彭茂宇 周伟 邹记兴 胡隐昌 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第1期19-29,共11页
通过RT PCR、3′ RACE、5′ RACE方法 ,从 6种重要经济鱼类———大眼鳜 (Sinipercakneri)、石斑鱼 (Epinepheluscoioides)、黄鳝 (Monopterusalbus)、鲶鱼 (Silurusasotus)、泥鳅 (Misgurnusanguillicaudatus)和方正银鲫 (Carassiusaur... 通过RT PCR、3′ RACE、5′ RACE方法 ,从 6种重要经济鱼类———大眼鳜 (Sinipercakneri)、石斑鱼 (Epinepheluscoioides)、黄鳝 (Monopterusalbus)、鲶鱼 (Silurusasotus)、泥鳅 (Misgurnusanguillicaudatus)和方正银鲫 (CarassiusauratusgibelioBloch ,FangZhengcruciancarp)中克隆了生长激素 (GrowthHormone ,GH)的完整cDNA序列 (除石斑鱼序列外 ,其他生长激素序列均系第一次克隆 ) ,并详细分析了其序列特征。测序结果显示 ,克隆的 6种GHcDNA长度依次为95 3bp、10 2 3bp、82 5bp、10 82bp、115 4bp和 1180bp ,它们均包含一个长度为 6 0 0个左右核苷酸的完整阅读框 ,分别编码一个 2 0 0个左右氨基酸的蛋白 :大眼鳜、石斑鱼和黄鳝GH为 2 0 4个氨基酸 ,鲶鱼GH为 2 0 0个氨基酸 ,泥鳅和方正银鲫GH为 2 10个氨基酸。这 6种蛋白序列与其他已知的鱼类GH序列都有较高的同源性 ,特别是与相同目的鱼类序列相比。通过序列比对 ,在这些蛋白序列内鉴定了许多保守的氨基酸残基 ,其中的大多数聚集而成 5个保守域。基于这 6种鱼类序列的编码区和其他鱼类的GH编码序列进行分子系统学分析 ,结果 (MP和NJ树 )与根据形态特征构建的系统发育树基本一致 ,特别是在硬骨鱼类较大分类阶元 (目间、目以上 )的系统发育研究方面? 展开更多
关键词 生长激素 完整cDNA 序列分析
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食蟹猴疟原虫 (Plasmodium cynomolgi)中一个真核翻译起始因子4A(eIF-4A)同源蛋白的cDNA克隆、表达和ATP酶活性测定(英文) 被引量：4
2
作者 宋平 张竞男 +1 位作者 胡珈瑞 李奎 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期294-304,共11页
真核翻译起始因子 4A(eukaryoticinitiationfactor 4A ,eIF 4A)是DEAD盒蛋白家族的ATP依赖性的RNA解旋酶类中的一个原型成员 .它在真核细胞的蛋白质合成的起始过程中起着关键性作用 .通过PCR扩增和放射探针杂交相结合的方法筛选食蟹猴... 真核翻译起始因子 4A(eukaryoticinitiationfactor 4A ,eIF 4A)是DEAD盒蛋白家族的ATP依赖性的RNA解旋酶类中的一个原型成员 .它在真核细胞的蛋白质合成的起始过程中起着关键性作用 .通过PCR扩增和放射探针杂交相结合的方法筛选食蟹猴疟原虫 (Plasmodiumcynomolgi)的cDNA文库 ,克隆了一个eIF 4A同源蛋白的完整cDNA序列 ,命名为CH1F .CH1F全长 1 75 3bp ,包含一个1 1 97bp的完整阅读框 ,推测编码一个由 398个氨基酸组成的蛋白 .对CH1F的蛋白序列用BlastP进行搜索和分析 ,提示它应该是DEAD盒家族的一个eIF 4A同源蛋白 ;用DNAStar将其与许多典型的DEAD盒蛋白序列进行比对分析 ,结果显示 :比起其它的DEAD盒蛋白 ,它与eIF 4A或eIF 4A的同源蛋白具有更高的同源性和更多序列上的相似结构域 .将包含完整阅读框的片段亚克隆进表达载体pET 2 8a (+) ,在大肠杆菌DH5α中表达 ,产生的融合蛋白大小在 4 5kD左右 .对该融合蛋白进行纯化、重新折叠和初步鉴定 .ATP酶活性检测显示 ,该融合蛋白只有很低的ATP酶活性 ,而且它的ATP酶活性似乎不依赖于核酸底物 .对这一检测结果给出 3种可能的原因 .这一检测结果与根据序列分析得到的推论———CH1F蛋白可能是一个eIF 展开更多
关键词 真核翻译起始因子4A(eukaryotic initiation factor 4A eIF-4A) RNA解旋酶 ATP酶 食蟹猴 疟原虫(Plasmodium cynomolgi)
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核糖体蛋白rpl15cDNA序列在真骨鱼类系统进化研究中的价值 被引量：5
3
作者 向筑 张竞男 +2 位作者 宋平 胡珈瑞 钟扬 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期171-178,共8页
应用RTPCR,从真骨总目(Teleostei)5目15种鱼类中首次克隆了核糖体大亚基蛋白L15(rpl15,ribosomalproteinL15)的完整cDNA序列。以海鲢形亚组(Elopomorpha)的鳗鲡作为外类群,对这些真骨鱼类的核糖体蛋白L15cDNA序列进行了系统发育分析,结... 应用RTPCR,从真骨总目(Teleostei)5目15种鱼类中首次克隆了核糖体大亚基蛋白L15(rpl15,ribosomalproteinL15)的完整cDNA序列。以海鲢形亚组(Elopomorpha)的鳗鲡作为外类群,对这些真骨鱼类的核糖体蛋白L15cDNA序列进行了系统发育分析,结果表明:(1)rpl15基因在真骨鱼类等许多真核生物进化中高度保守;(2)系统树中各物种之间的关系与形态分类一致。rpl15编码区适合于真骨鱼类目以上分类阶元的分子系统学研究。 展开更多
关键词 核糖体蛋白L15(rpl15) 分子系统学 真骨鱼类
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植物基因组比较作图研究进展 被引量：5
4
作者 覃瑞 宋发军 宋运淳 《细胞生物学杂志》 CSCD 北大核心 2004年第2期157-161,共5页
基因组比较作图是基因组研究的重要内容。植物比较作图研究表明,在长期的进化过程中,基因的组成表现出高度的保守性。随着植物遗传图谱和物理图谱的迅速发展,为植物比较作图奠定了重要的基础。现就植物基因组遗传图和物理图以及比较作... 基因组比较作图是基因组研究的重要内容。植物比较作图研究表明,在长期的进化过程中,基因的组成表现出高度的保守性。随着植物遗传图谱和物理图谱的迅速发展,为植物比较作图奠定了重要的基础。现就植物基因组遗传图和物理图以及比较作图的最新研究进展作一介绍。 展开更多
关键词 植物 基因组 遗传图谱 物理图谱 比较作图 遗传标记
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恶性疟原虫abstrakt同源基因的克隆及DEAD盒家族蛋白的序列分析(英文) 被引量：1
5
作者 宋平 张竞男 +3 位作者 Pawan MALHOTRA Narendra TUTEJA Virender Singh CHAUHAN 李奎 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第3期420-430,共11页
DEAD盒蛋白家族的ATP依赖性的RNA解旋酶类参与细胞内几乎所有的RNA代谢过程 ,在几乎所有生物的细胞生长发育过程中扮演着众多不可或缺的角色。在本实验中 ,通过PCR和探针杂交相结合的筛选方法 ,筛选恶性疟原虫 (Plasmodiumfalciparum)... DEAD盒蛋白家族的ATP依赖性的RNA解旋酶类参与细胞内几乎所有的RNA代谢过程 ,在几乎所有生物的细胞生长发育过程中扮演着众多不可或缺的角色。在本实验中 ,通过PCR和探针杂交相结合的筛选方法 ,筛选恶性疟原虫 (Plasmodiumfalciparum)的基因组文库 ,克隆了FH1F———abstrakt同源基因的完整序列。通过搜索已经完成测序的恶性疟原虫基因组数据库 ,推测FH1F序列定位在第 5条染色体上。FH1F全长2 80 4bp,包含一个 1 1 6 1bp的完整阅读框 ,编码一个由 386个氨基酸组成的蛋白。对FH1F蛋白序列用BlastP进行搜索和分析以及用DNAStar与许多典型的DEAD盒蛋白序列进行比对分析 ,结果均提示FH1F蛋白应该是DEAD盒家族的一个Abstrakt蛋白。另一方面 ,用DNAStar对已知所有完整的DEAD盒蛋白进行详细的序列分析以及用Mega对这些序列进行系统发育研究的结果都显示 :DEAD盒家族的蛋白聚类成为若干不同的亚群 ;与DEAD盒蛋白的一般保守序列相比 ,Abstrakt,eIF 4A ,Vasa ,P6 8等不同亚群的DEAD盒蛋白在保守区具有各自不同的结构特征。本文对不同的DEAD盒蛋白的结构特征进行了总结并试图给出不同亚群分类上的结构标准 。 展开更多
关键词 恶性疟原虫 abstrakt 同源基因 克隆 DEAD盒 序列分析 RNA解旋酶
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恒定磁场对水稻染色体畸变的影响
6
作者 吴士筠 宋运淳 +1 位作者 宋发军 覃瑞 《癌变．畸变．突变》 CAS CSCD 2006年第1期29-31,共3页
背景与目的已有的研究表明,磁场能够引起水稻遗传特性的改变,其改变主要反映在水稻种子的萌发期、成长期、结实率等特性的变化,目前尚未见磁场对染色体形态结构、影响的研究,为此,我们分析不同磁场对水稻染色体的畸变,进一步探讨磁场的... 背景与目的已有的研究表明,磁场能够引起水稻遗传特性的改变,其改变主要反映在水稻种子的萌发期、成长期、结实率等特性的变化,目前尚未见磁场对染色体形态结构、影响的研究,为此,我们分析不同磁场对水稻染色体的畸变,进一步探讨磁场的生物学机制。材料与方法采用800、1000、1500、1800、2300mT5种不同恒定磁场对水稻种子处理20min,采用ASG法对不同磁场处理后的水稻染色体进行染色,在光学显微镜下观察染色体畸变情况。结果除800mT的处理外,其他处理组水稻染色体均出现染色体环等畸变现象,其中包括无着丝粒、有着丝粒环及染色体间缺失后融合的倒“B”型染色体环,显示强磁场能引起染色体畸变率的提高,其主要为染色体断裂、融合现象出现率高于磁场影响的对照组水稻种子。结论磁场对染色体结构的影响是造成水稻遗传特色改变的重要原因之一。 展开更多
关键词 磁场 水稻 畸变
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利用BAC-ISH对抗性基因Bph3物理定位及水稻第四染色体着丝粒识别的研究
7
作者 覃瑞 鄢彗民 宋运淳 《化学与生物工程》 CAS 2003年第5期28-32,共5页
用水稻BAC克隆21K19作探针进行了ISH。这个克隆是由第4染色体着丝粒连锁的RFLP标记RZ69筛选得到。在Cot-Ⅰ DNA封阻条件下,DAB均获得第4染色体着丝粒区和间期染色质上的一对信号。这一方法不仅可用于特定染色体识别,而且可区分其长臂和... 用水稻BAC克隆21K19作探针进行了ISH。这个克隆是由第4染色体着丝粒连锁的RFLP标记RZ69筛选得到。在Cot-Ⅰ DNA封阻条件下,DAB均获得第4染色体着丝粒区和间期染色质上的一对信号。这一方法不仅可用于特定染色体识别,而且可区分其长臂和短臂。因此,还获得了第四染色体的臂比值以作为它的形态识别依据。由于RFLP标记RZ69与抗性基因Bph3紧密连锁,从而确定抗性基因Bph3位于水稻第4染色体着丝粒处。相对于常规的RFLP-FISH,BAC-ISH可以提高5倍以上的检出率。 展开更多
关键词 BAC-ISH 抗性基因 Bph3 物理定位 水稻 第四染色体 着丝粒 识别
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