大鼠肝再生相关基因LRRP1的人同源基因是一种新型琥珀酸脱氢酶的亚单位编码基因

1

作者 成军 王刚 +3 位作者 刘妍 邵得志 张玲霞 陈菊梅 《世界华人消化杂志》 CAS 2004年第7期1714-1717,共4页

目的:应用分子生物学和生物信息学方法,寻找、克隆大鼠肝再生相关基因LRRP1的人的同源基因,阐明LRRP1 基因的结构和功能,为研究肝脏再生调节的分子生物学机制奠定基础. 方法:利用美国国立卫生研究院建立的核苷酸数据库(GenBank)以及相... 目的:应用分子生物学和生物信息学方法,寻找、克隆大鼠肝再生相关基因LRRP1的人的同源基因,阐明LRRP1 基因的结构和功能,为研究肝脏再生调节的分子生物学机制奠定基础. 方法:利用美国国立卫生研究院建立的核苷酸数据库(GenBank)以及相应的核苷酸序列同源性搜索分析软件(BLASTN),以大鼠的LRRP1的cDNA序列作为参照,对于人的同源性cDNA序列进行搜索分析,寻找人的LRRP1 的同源基因序列.利用蛋白质一级结构序列的势据库以及相应的同源蛋白序列的搜索分析,阐明人LRRP1蛋白质一级结构与已知蛋白序列的同源性,从而根据蛋白质一级结构的相似性,对于新克隆基因进行功能方面的预测分析.应用在线软件的分析,对于人LRRP1蛋白质一级结构序列进行分析预测,分析其氨基末端序列是否具有信号肽序列,以判断人LRRP1蛋白是否是一种可以分泌表达的蛋白;同样对人LRRP1蛋白质一级结构序列进行在线软件的分析,对于人LRRP1蛋白质分子结构中的潜在的糖基化位点以及其他类型的修饰位点进行预测. 结果:人的LRRP1的编码基因由480 nt组成,编码产物由159 aa组成.人LRRP1的蛋白质一级结构序列与人琥珀酸脱氢酶亚单位D、牛琥珀酸脱氢酶亚单位D高度同源,同源性分别为79%(126/159),78%(123/156).人LRRP1是一种分泌蛋白,在其分子结构中具有N-糖基化位点、蛋白激酶C磷酸化位点和豆蔻脂化修饰位点. 结论:人LRRP1蛋白是一种新型的琥珀酸脱氢酶的亚单位编码基因. 展开更多

关键词 大鼠 肝再生相关基因 LRRP1 人同源基因 琥珀酸脱氢酶 亚单位编码基因

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脂肪细胞分化相关基因在大鼠再生肝中表达变化(英文) 被引量：4

2

作者 赵利峰 邵恒熠 徐存拴 《分子细胞生物学报》 CSCD 北大核心 2007年第3期224-232,共9页

肝脏由多种细胞构成,肝再生与细胞分化密切相关,细胞分化受基因转录水平调控。为在基因转录水平了解脂肪细胞分化基因在大鼠肝再生中作用,本文用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得上述基因,用Rat Genome2302.0芯片检测它们在大鼠肝... 肝脏由多种细胞构成,肝再生与细胞分化密切相关,细胞分化受基因转录水平调控。为在基因转录水平了解脂肪细胞分化基因在大鼠肝再生中作用,本文用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得上述基因,用Rat Genome2302.0芯片检测它们在大鼠肝再生(liver regeneration,LR)中表达情况,将三次检验结果相同或相似、在肝再生中表达变化2倍以上、真手术组和假手术组相比差异显著的基因视为肝再生相关基因。初步证实上述基因中75个基因与肝再生相关。肝再生启动(PH后0.5-4h)、G0/G1过渡(PH后4-6h)、细胞增殖(PH后6-66h)、细胞分化和组织结构功能重建(PH后72-168h)等四个阶段起始表达的基因数为44、13、30和1;基因的总表达次数为88、58、302和90。表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用。它们共表达上调313次、下调167次,分为43种表达方式。表明肝再生中脂肪细胞发生和分化相关基因活动多样和复杂。根据本文研究结果推测,上述基因不仅调节脂肪细胞分化,而且参与肝再生的生理生化活动。 展开更多

关键词 部分肝切除 Rat GENOME 230 2.0芯片 脂肪细胞分化 肝再生相关基因

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肌细胞分化基因与大鼠肝再生的相关性分析(英文) 被引量：1

3

作者 赵利峰 张明真 徐存拴 《分子细胞生物学报》 CSCD 北大核心 2007年第6期387-394,共8页

肌细胞是组织器官的重要组成部分。为在基因转录水平了解肌细胞分化相关基因在大鼠肝再生中的作用.本文用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得上述基因,用Rat Genome 230 2.0芯片检测它们在大鼠肝再生(liver regeneration,LR)中表达情... 肌细胞是组织器官的重要组成部分。为在基因转录水平了解肌细胞分化相关基因在大鼠肝再生中的作用.本文用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得上述基因,用Rat Genome 230 2.0芯片检测它们在大鼠肝再生(liver regeneration,LR)中表达情况,用比较真、假手术基因表达的差异性方法确定肝再生相关基因。初步证实上述基因中52个基因与肝再生相关。根据肝再生中基因表达的时间相关性将上述基因聚合为0.5-1h:2-12h;16、30、42、96h;18-24、36、48-60h;66-72、120- 168h等5类,表达上调和下调的基因数分别为8和10,24和8,21和24,53和64,28和36。它们表达的相似性分为均上调、上调占优势、均下调、下调占优势、上调和下调次数相近等5类,涉及15、10、17、7和3个基因,共上调表达143次、下调136次,分为8类表达方式。表明肌细胞分化相关基因表达变化多样和复杂。根据上述结果推测,肝再生中成肌细胞和平滑肌细胞分化增强;骨骼肌和心肌细胞分化相关基因参与肝再生的生理生化活动。 展开更多

关键词 部分肝切除 Rat GENOME 230 2.0芯片 肌细胞分化 肝再生相关基因

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CEBPs及其调节的基因与大鼠肝再生相关性分析 被引量：1

4

作者 王望 陈晓光 徐存拴 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2007年第20期2186-2193,共8页

目的:探讨基因转录水平CCAAT增强子结合蛋白(CEBPs)及其调节基因在肝再生(LR)中的作用.方法:将与肝再生相关的CEBPs家族转录因子输入NCBI(www.ncbi.nlm.nih.gov)和RGD(rgd.mcw.edu)等网站查找与其转录功能相关的文献,从中得出大鼠、小... 目的:探讨基因转录水平CCAAT增强子结合蛋白(CEBPs)及其调节基因在肝再生(LR)中的作用.方法:将与肝再生相关的CEBPs家族转录因子输入NCBI(www.ncbi.nlm.nih.gov)和RGD(rgd.mcw.edu)等网站查找与其转录功能相关的文献,从中得出大鼠、小鼠和人的CEBPs家族下游基因.然后将人和小鼠基因与大鼠比对,筛选出与大鼠不重复的人和小鼠基因.再将他们与Rat Genome 230 2.0芯片的检测结果进行比对确认,把其中表达上调或下调2倍以上的基因视为有意义变化的大鼠同源基因.用Rat Genome 230 2.0芯片检测他们在大鼠再生肝中的表达情况,用真、假手术比较方法确定肝再生相关基因.结果:27个基因与肝再生相关,其中11个基因表达上调,6个基因表达下调,10个基因在有的时点表达上调,有的时点表达下调(简称上/下调表达).他们的上调范围为对照的2-128倍,下调范围为对照的2-16倍.肝再生启动[部分肝切除(PH)后0.5-4 h]、G_0/G_1过渡(PH后4-6 h)、细胞增殖(PH后6-66 h)、细胞分化和组织结构功能重建(PH后72-168 h)等4个阶段起始表达的基因数分别为18,3,8和1;基因的总表达次数分别为18,11,25和16.表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用.他们共表达上调126次,下调76次.表明肝再生中表达上调基因多于表达下调基因.结论:CEBPs及其调节的基因与肝再生中细胞增殖、细胞分化、细胞凋亡、炎症反应、应激反应、脂类代谢和细胞外基质变化等密切相关. 展开更多

关键词 部分肝切除 大鼠基因组230 2.0芯片 CCAAT增强子结合蛋白 肝再生相关基因

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氧化磷酸化相关基因在大鼠肝再生中表达模式

5

作者 蔺芳 穆瑞瑞 +2 位作者 赵红艳 朱红霞 徐存拴 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期1107-1112,共6页

为在基因转录水平了解氧化磷酸化相关基因在肝再生(liver regeneration,LR)中的作用,通过搜索网站资料和查阅相关论文等方法获得上述基因,用Rat Genome 230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中表达变化,初步证实上述基因中31个基因与肝再生... 为在基因转录水平了解氧化磷酸化相关基因在肝再生(liver regeneration,LR)中的作用,通过搜索网站资料和查阅相关论文等方法获得上述基因,用Rat Genome 230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中表达变化,初步证实上述基因中31个基因与肝再生相关。它们表达的相似性分为均上调、上调占优势、均下调、下调占优势、上调和下调相近等5类,分别涉及9、1、15、4和2个基因,共表达上调42次、下调102次,表明肝再生中表达降低基因多于表达加强基因。它们表达的时间相关性分为12组,表明肝再生中细胞生理生化活动具有阶段性。根据芯片结果推测,肝再生早期和前期氧化磷酸化反应和ATP合成减少,中期和后期增强。其中,31个肝再生相关基因起重要作用。 展开更多

关键词 部分肝切除 RAT GENOME 230 2.0芯片 氧化磷酸化 肝再生相关基因

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类固醇代谢相关基因在大鼠肝再生中表达模式和作用分析

6

作者 蔺芳 王书丽 徐存拴 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期110-117,共8页

为在基因转录水平了解类固醇代谢相关基因在大鼠肝再生(Liver regeneration,LR)中作用,文章通过搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得了参与上述代谢活动的基因,用基因芯片检测了它们在大鼠再生肝中表达情况,初步证实上述基因中83个基... 为在基因转录水平了解类固醇代谢相关基因在大鼠肝再生(Liver regeneration,LR)中作用,文章通过搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得了参与上述代谢活动的基因,用基因芯片检测了它们在大鼠再生肝中表达情况,初步证实上述基因中83个基因与肝再生相关。肝再生启动(PH后0.5～4h)、G0/G1过渡(PH后4～6h)、细胞增殖(PH后6～66h)、细胞分化和组织结构功能重建(PH后72～168h)等四个阶段起始表达的基因数为48、11、33和3;总表达的基因数为48、41、80和54。表明肝再生相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用。它们共表达上调286次,下调286次,表达和功能的相关性分为12类,表明肝再生中细胞生理生化活动多样和复杂。根据上述结果推测,肝再生前期雌激素合成增强;后期胆固醇、胆汁酸合成增强;雄激素、糖皮质激素、孕酮合成几乎在整个肝再生中增强。肝再生早期、前期和后期孕酮和雌激素分解增强;后期胆固醇分解增强;胆汁酸、雄激素、盐皮质激素分解几乎在整个肝再生中增强。 展开更多

关键词 部分肝切除 基因芯片 类固醇代谢 肝再生相关基因

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氧及活性氧代谢相关基因在大鼠肝脏再生中的作用

7

作者 蔺芳 张家洋 +1 位作者 皮川真 徐存拴 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2010年第10期32-37,共6页

为了在基因转录水平了解氧及活性氧代谢相关基因在大鼠肝脏再生(LR)中的作用,用Rat Genome 230 2.0芯片检测了上述在大鼠再生肝中表达变化,用真、假手术比较方法确定肝再生相关基因。初步证实上述基因中81个与肝再生相关。其中,肝再生... 为了在基因转录水平了解氧及活性氧代谢相关基因在大鼠肝脏再生(LR)中的作用,用Rat Genome 230 2.0芯片检测了上述在大鼠再生肝中表达变化,用真、假手术比较方法确定肝再生相关基因。初步证实上述基因中81个与肝再生相关。其中,肝再生启动、G0/G1过渡、细胞增殖、细胞分化和组织结构功能重建等四个阶段起始表达的基因数为42、9、35和2;基因的总表达次数为42、31、77和50。表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用。它们共上调317次,下调161次,分为6类表达方式,表明肝再生中这些基因的表达变化多样和复杂。芯片结果分析表明,肝再生早期和前期过氧化氢和超氧化物代谢增强;几乎在整个肝再生中氧化反应和谷胱甘肽结合反应增强。 展开更多

关键词 部分肝切除 RAT Genome2302.0芯片 氧及活性氧代谢 肝再生相关基因

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软骨细胞发生和分化基因与大鼠肝再生的相关性(英文)

8

作者 赵利峰 李鹏鸽 徐存拴 《河南科学》 2007年第4期571-577,共7页

肝脏由多种细胞构成,肝再生与细胞分化密切相关,细胞分化受基因转录水平调控.为在基因转录水平了解软骨细胞的发生和分化相关基因在大鼠肝再生中作用,通过搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得参与软骨细胞发生和分化的基因,用Rat Geno... 肝脏由多种细胞构成,肝再生与细胞分化密切相关,细胞分化受基因转录水平调控.为在基因转录水平了解软骨细胞的发生和分化相关基因在大鼠肝再生中作用,通过搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得参与软骨细胞发生和分化的基因,用Rat Genome 230 2.0芯片检测它们在大鼠肝再生(liver regeneration,LR)中表达情况,用比较真、假手术中基因表达差异确定肝再生相关基因.初步证实上述基因中23个基因与肝再生相关.肝再生启动(PH后0.5～4 h)、G0/G1过渡(PH后4～6 h)、细胞增殖(PH后6～66 h)、细胞分化和组织结构功能重建(PH后72～168 h)等四个阶段起始表达的基因数为15、4、8和0;基因的总表达次数为15、10、22和17.表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用.它们共表达上调100次、下调77次,分为17种表达方式,表明肝再生中软骨细胞发生和分化相关基因活动多样和复杂.根据本文研究结果推测,上述基因不仅调节软骨细胞发生和分化,而且参与肝再生的生理生化活动. 展开更多

关键词 部分肝切除 RAT GENOME 230 2.0芯片 软骨细胞发生和分化 鼠肝再生相关基因

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细胞外基质相关基因在大鼠肝再生中表达模式分析 被引量：4

9

作者 李红蕾 陈晓光 +2 位作者 张富春 马纪 徐存拴 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期333-340,共8页

细胞外基质具有维持细胞极性、调节细胞粘附、增殖、组织器官形态、发生、分化等功能。为了进一步在基因转录水平了解细胞外基质在大鼠肝再生中变化和作用,用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得细胞外基质基因,用Rat Genome2302.0芯... 细胞外基质具有维持细胞极性、调节细胞粘附、增殖、组织器官形态、发生、分化等功能。为了进一步在基因转录水平了解细胞外基质在大鼠肝再生中变化和作用,用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得细胞外基质基因,用Rat Genome2302.0芯片检测它们在大鼠再生肝中表达情况,用真、假手术比较方法确定肝再生相关基因。初步证实上述97个基因与肝再生相关。其中,肝再生启动（部分肝切除（parital hepatectomy,PH）后0.5～4h）、G0/G1过渡（PH后4～6h）、细胞增殖（PH后6～66h）、细胞分化和组织结构功能重建（PH后72～168h）等4个阶段起始表达的基因数为49、19、73、5,基因总表达的次数为84、51、369、144,表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用。它们表达的相似性分为均上调、上调占优势、均下调、下调占优势、上调和下调相近等5类,涉及38、21、21、10和7个基因,共上调411次,下调186次,分为24种表达模式,表明肝再生中细胞生理生化活动具有阶段性、多样性和复杂性。根据细胞外基质相关基因在肝再生中表达变化推测,肝再生前期纤粘连蛋白形成相关基因表达增强,肝再生中期胶原形成相关基因表达增强。 展开更多

关键词 部分肝切除 RAT Genome2302.0芯片 细胞外基质 肝再生相关基因

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核糖体相关基因在大鼠再生肝及肝肿瘤中表达异同的比较 被引量：11

10

作者 徐存拴 杨志利 董华明 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期281-287,共7页

目的在基因转录水平了解核糖体相关基因在大鼠再生肝(RL)和肝脏肿瘤(LT)中的表达异同。方法用搜索网站资料和查阅相关论文等方法获得核糖体发生、组装和功能相关基因及它们在肝脏肿瘤中的表达变化,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大... 目的在基因转录水平了解核糖体相关基因在大鼠再生肝(RL)和肝脏肿瘤(LT)中的表达异同。方法用搜索网站资料和查阅相关论文等方法获得核糖体发生、组装和功能相关基因及它们在肝脏肿瘤中的表达变化,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,用统计学方法比较上述基因在再生肝和肝脏肿瘤中的表达异同。结果初步证实上述基因中75个基因与肝再生相关。其中,18个基因在再生肝和肝脏肿瘤中表达上调,6个基因在两者中表达下调,51个基因在肝脏肿瘤中未发生有意义的表达变化。结论再生肝的核糖体相关基因表达谱与肝脏肿瘤有相同之处,也有不同之处,前者的基因表达更具阶段性和复杂性。 展开更多

关键词 部分肝切除 核糖体 肝再生相关基因 基因组2302.0芯片 大鼠

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脂类代谢和运输涉及的基因与大鼠肝再生的相关性分析 被引量：4

11

作者 徐存拴 蔺芳 秦少伟 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期302-309,共8页

目的在基因转录水平了解脂类代谢和运输相关基因在大鼠肝再生（LR）中的表达变化和模式。方法用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得参与脂类代谢和运输基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,用比较手术和... 目的在基因转录水平了解脂类代谢和运输相关基因在大鼠肝再生（LR）中的表达变化和模式。方法用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得参与脂类代谢和运输基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,用比较手术和假手术中基因表达的差异性确定肝再生相关基因。结果初步证实上述基因中193个基因与肝再生相关。肝再生早期[部分肝切除（PH）后0.5～4h]、前期（PH后6～12h）、中期（PH后12～66h）、后期（PH后72～168h）等4个阶段起始表达的基因数为113、20、66和1;基因的总表达次数为250、205、796和293。共上调852次,下调630次,分为27种表达方式。肝再生早期和前期胆汁酸代谢相关基因转录减弱;早期和后期糖皮质激素分解相关基因转录增强;前期和中期磷脂合成相关基因转录增强,磷脂分解相关基因转录减弱;中期脂肪酸、白三烯和鞘糖脂合成相关基因转录增强,甘油三酯和磷脂酰肌醇代谢相关基因转录增强,鞘糖脂分解相关基因转录减弱;中期和后期前列腺素合成和脂肪酸分解相关基因转录增强;几乎在整个肝再生中性激素、糖皮质激素和孕酮合成相关基因转录增强,鞘磷脂代谢相关基因转录增强,脂类运输相关基因转录增强,胆固醇代谢相关基因转录减弱。结论肝再生中脂类代谢和运输变化较大,与肝再生密切相关。 展开更多

关键词 部分肝切除 脂类代谢 运输相关基因 肝再生相关基因 基因组2302.0芯片 大鼠

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大鼠肝再生中细胞周期相关基因表达谱与肝脏细胞增殖活动关系分析 被引量：2

12

作者 徐存拴 邵恒熠 +2 位作者 刘慧娟 王文博 胡浩鹏 《自然科学进展》 北大核心 2008年第6期628-639,共12页

肝再生中细胞增殖必不可少.为在基因转录水平了解大鼠肝再生中细胞周期相关基因的表达动态和作用,文中用查阅网站资料和相关论文等方法获得上述基因,用Rat Genome 230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中表达情况,用比较真、假手术中基因的... 肝再生中细胞增殖必不可少.为在基因转录水平了解大鼠肝再生中细胞周期相关基因的表达动态和作用,文中用查阅网站资料和相关论文等方法获得上述基因,用Rat Genome 230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中表达情况,用比较真、假手术中基因的有意义表达异同确定肝再生相关基因.初步证实上述基因中290个基因与肝再生相关.其中,肝再生的肝细胞激活期(0.5—4h),G0/G1过渡期(4—6h),肝细胞的第一个细胞周期G1期(6—12h),S期(12—24h),G2期(24—30h)和M期(30—36h),肝细胞的第二个细胞周期(36—66h),细胞分化和组织结构功能重建期(72—168 h)等8个时期起始表达的基因数为148,32,30,92,16,16,14和2;基因总表达次数为307,155,224,484,235,239,824和467.根据基因表达变化推测,肝再生中有38%的细胞周期相关基因的表达谱发生了变化. 展开更多

关键词 部分肝切除 Rat GENOME 230 2.0芯片 细胞周期 肝再生相关基因

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大鼠肝再生中糖代谢相关基因的表达变化 被引量：1

13

作者 徐存拴 陈晓光 +1 位作者 刘攀峰 董华明 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期296-301,共6页

目的了解糖类代谢相关基因在大鼠肝再生中的表达变化。方法本研究用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得糖类代谢相关基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,用比较手术组和假手术组中基因表达的差异性确定... 目的了解糖类代谢相关基因在大鼠肝再生中的表达变化。方法本研究用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得糖类代谢相关基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,用比较手术组和假手术组中基因表达的差异性确定肝再生相关基因。结果初步证实上述基因中118个基因与肝再生相关。肝再生早期[部分肝切除（PH）后0.5～4h]、前期（PH后4～12h）、中期（PH后16～66h）和后期（PH后72～168h）等4个阶段起始表达的基因数为33、6、68和7;基因的总表达次数为68、44、210和83。表明肝再生相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用。它们共上调205次,下调200次,分为12种表达方式,表明肝再生中糖代谢活动多样和复杂。其中,单糖和糖原代谢、糖蛋白和糖脂（主要为神经节苷脂）合成相关基因几乎在整个肝再生中表达增强,寡糖和糖胺聚糖合成及糖蛋白和糖脂分解相关基因表达下调。结论肝再生与糖代谢密切相关。 展开更多

关键词 部分肝切除 糖代谢 肝再生相关基因 基因组2302.0芯片 大鼠

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肝细胞生长和分化相关基因在大鼠肝再生中的表达方式及作用分析 被引量：1

14

作者 徐存拴 赵利峰 +1 位作者 常翠芳 陈晓光 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期290-295,共6页

目的在基因转录水平了解肝再生中肝细胞的生长和分化情况。方法用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得参与肝细胞生长和分化基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠肝再生（LR）中的表达情况,通过比较手术组和假手术组中基因表... 目的在基因转录水平了解肝再生中肝细胞的生长和分化情况。方法用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得参与肝细胞生长和分化基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠肝再生（LR）中的表达情况,通过比较手术组和假手术组中基因表达差异性以确定上述基因中的肝再生相关基因。结果初步证实上述基因中110个基因与肝再生相关。肝再生启动（PH后0.5～4h）、G0/G1过渡（PH后4～6h）、细胞增殖（PH后6～66h）、细胞分化和组织结构功能重建（PH后72～168h）等4个阶段起始表达的基因数为63、11、43和3,基因总表达的次数为63、43、101和80,表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用。它们共表达上调488次,下调248次,分为6种表达方式,表明肝再生中细胞生理生化活动的多样性和复杂性。结论肝细胞生长和分化贯穿于整个肝再生中。 展开更多

关键词 部分肝切除(PH) 肝细胞生长 分化 肝再生相关基因 基因组2302.0芯片 大鼠

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蛋白质代谢、折叠、运输、定位、装配相关基因在大鼠肝再生中表达变化(英文) 被引量：2

15

作者 徐存拴 张守兵 +2 位作者 杨志利 崔胜男 张明 《分子细胞生物学报》 CSCD 北大核心 2008年第2期107-119,共13页

为在基因转录水平了解蛋白质代谢、折叠、运输、定位、装配相关基因在大鼠肝再生中表达情况和作用,本文用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得上述基因,用Rat Genome 2302.0芯片检测它们在大鼠再生肝中表达情况,用真、假手术比较方法... 为在基因转录水平了解蛋白质代谢、折叠、运输、定位、装配相关基因在大鼠肝再生中表达情况和作用,本文用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得上述基因,用Rat Genome 2302.0芯片检测它们在大鼠再生肝中表达情况,用真、假手术比较方法确定肝再生相关基因。初步证实上述基因中1147个基因与肝再生相关。其中,参与蛋白质代谢、折叠、运输、定位和装配的基因以上调表达为主;参与蛋白质代谢的基因主要在部分肝切除(partial hepatectomy,PH)后0.5-1h和16-30h起始表达;0.5-12h表达的促进蛋白降解基因数多于促进蛋白积累基因数,而16-48h表达的促进蛋白质积累基因数显著多于促进蛋白质降解基因数;蛋白质合成相关基因在肝再生的16、24、42和66h表达上调较多,在42h最多;几乎在整个肝再生中蛋白质降解相关基因表达上调,在早、前期较多,在后期较少;蛋白质折叠相关基因在2、16-24、42、66、72和168h表达上调较多,在66h最多;蛋白质运输和定位相关基因在整个肝再生中表达上调,在66h表达上调最多;蛋白质装配相关基因在96h前均表达上调,其中,12h表达上调基因最多。根据上述结果推测,在肝再生中期蛋白质合成旺盛,几乎整个肝再生中蛋白质降解、折叠、运输定位和装配活动活跃。 展开更多

关键词 部分肝切除 RAT GENOME 230 2.0芯片 蛋白质代谢 肝再生相关基因

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核酸及其衍生物的代谢加工运输相关基因在大鼠肝再生中表达模式的分析 被引量：1

16

作者 胡珂 徐存拴 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期329-334,共6页

目的在基因转录水平了解核苷酸及其衍生物、DNA及RNA代谢、加工、运输相关基因在大鼠肝再生（LR）中的表达变化。方法用搜索网站资料和查阅相关论文等方法获得核苷酸及其衍生物、DNA及RNA代谢、加工、运输相关基因,用大鼠基因组230 2.0... 目的在基因转录水平了解核苷酸及其衍生物、DNA及RNA代谢、加工、运输相关基因在大鼠肝再生（LR）中的表达变化。方法用搜索网站资料和查阅相关论文等方法获得核苷酸及其衍生物、DNA及RNA代谢、加工、运输相关基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,用手术组和假手术组比较的方法确定肝再生相关基因。结果初步证实,上述基因中有240个基因与大鼠肝再生相关。肝再生早期[部分肝切除（PH）后0.5～4h]、前期（PH后6～12h）、中期（PH后16～66h）、后期（PH后72～168h）等4个时期起始表达的基因数分别为65、14、150和11,基因的总表达次数为133、87、627和169,它们的表达模式分别为6、5、22和9种,共表达上调768次,下调248次。肝再生前期和中期mRNA降解增强;前期、中期和后期DNA重组、修饰、转录及mRNA加工和运输增强;几乎整个肝再生中核苷酸及其衍生物代谢、DNA复制、包装和分解活动增强。结论肝再生相关基因主要在肝再生早期起始表达,在不同时期发挥作用。 展开更多

关键词 部分肝切除 核酸 衍生物 肝再生相关基因 基因组2302.0芯片 大鼠

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性别决定与分化相关基因在大鼠肝再生中的表达模式和作用分析

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作者 李鹏鸽 阴棉棉 +1 位作者 赵利峰 徐存拴 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期446-451,共6页

目的在基因转录水平了解调控性别决定与分化基因在肝再生中的作用。方法查阅相关论文和NCBI、GENMAPP、KEGG、BIOCARTA、RGD等网站获得调控性别决定与分化基因,用Rat Genome 230 2.0芯片分析它们在大鼠肝再生中表达变化和作用。结果肝... 目的在基因转录水平了解调控性别决定与分化基因在肝再生中的作用。方法查阅相关论文和NCBI、GENMAPP、KEGG、BIOCARTA、RGD等网站获得调控性别决定与分化基因,用Rat Genome 230 2.0芯片分析它们在大鼠肝再生中表达变化和作用。结果肝再生启动[部分肝切除(PH)后0.5-4h]、G0/G1过渡(PH后4-6h)、细胞增殖(PH后6-66h)、细胞再分化和组织结构功能重建(PH后72-168h)等4个阶段起始表达的基因数为41、61、8和3;总表达的基因数为41、25、57和41。表明肝再生相关基因主要在肝再生启动阶段开始表达,在不同阶段发挥作用。它们表达的相似性分为均上调、上调占优势、均下调、下调占优势、上调和下调次数相近等5类,涉及22、9、15、9和7个基因,共表达上调231次、下调146次,表明肝再生中多数基因表达加强,少数基因表达降低。它们表达的时间相关性分为15组,表明肝再生中细胞生理生化活动具有阶段性。它们的表达模式分为20类,表明肝再生中细胞生理生化活动多样和复杂。结论雄性性别决定、分化和雌性性别分化相关基因主要在肝再生晚早期和前期表达增强,雌性性别决定相关基因主要在肝再生前期表达增强,与肝再生密切相关。 展开更多

关键词 部分肝切除 性别决定 性别分化 肝再生相关基因 Rat Genome 230 2.0芯片

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细胞凋亡相关基因表达谱与大鼠再生肝的细胞凋亡关系

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作者 徐存拴 阴棉棉 +1 位作者 邢雪琨 常翠芳 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期519-525,共7页

目的在基因转录水平探讨细胞凋亡相关途径对大鼠肝再生的作用。方法采用大鼠2/3部分肝切除（PH）方法,制备再生肝模型,同时设对照手术（假手术）。用查阅网站资料和相关论文等方法获得凋亡相关基因,用大鼠基因230 2.0芯片检测它们在大... 目的在基因转录水平探讨细胞凋亡相关途径对大鼠肝再生的作用。方法采用大鼠2/3部分肝切除（PH）方法,制备再生肝模型,同时设对照手术（假手术）。用查阅网站资料和相关论文等方法获得凋亡相关基因,用大鼠基因230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,通过比较真、假手术中上述基因的表达差异性确定肝再生相关基因。结果细胞凋亡相关基因中,252个基因与肝再生相关。在肝再生启动（PH后0.5～4h）、G0/G1过渡（PH后4～6h）、细胞增殖（PH后6～66h）、细胞分化和结构功能重建期（PH后72～168h）等4个阶段起始表达的基因数为81、231、55和16,总表达的基因数为161、100、733和192,表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用。它们共上调795次,下调291次,表明肝再生中大部分基因表达增强。它们的表达模式分为35种,表明肝再生中细胞凋亡相关基因的表达情况多样和复杂。结论15条细胞凋亡途径参与肝再生调控。 展开更多

关键词 部分肝切除 细胞凋亡 基因组2302.0芯片 肝再生相关基因 大鼠

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肝干细胞的生长和分化与大鼠肝再生的相关性分析 被引量：1

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作者 赵利峰 徐存拴 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期526-530,共5页

目的在基因转录水平了解肝干细胞在大鼠肝再生中的作用。方法用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得参与肝干细胞生长和分化的基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠部分肝切除（PH）后肝再生中的表达情况,用比较真、假手术中... 目的在基因转录水平了解肝干细胞在大鼠肝再生中的作用。方法用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得参与肝干细胞生长和分化的基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠部分肝切除（PH）后肝再生中的表达情况,用比较真、假手术中基因表达差异性确定上述基因中的肝再生相关基因。结果初步证实上述基因中50个基因与肝再生相关。肝再生启动（PH后0.5～4h）、G0/G1过渡（PH后4～6h）、细胞增殖（PH后6～66h）、细胞分化和组织结构功能重建（PH后72～168h）等4个阶段起始表达的基因数为24、10、21和2;基因总表达次数为242、3、46和26,表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用。它们共表达上调153次、下调123次,分为6种表达方式,表明肝再生中细胞生理生化活动多样和复杂。结论肝再生中肝脏干细胞的生长和分化活动加强,与某些基因表达状态和方式有关。 展开更多

关键词 部分肝切除 肝干细胞 生长 分化 肝再生相关基因 大鼠基因组2302.0芯片 大鼠

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转录因子基因在大鼠肝再生中的表达方式和作用分析

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作者 董华明 徐存拴 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期323-328,共6页

目的探讨转录因子基因在肝再生中的表达变化及作用。方法经查阅网站资料和相关论文获得转录因子基因及其参与的生理活动,用大鼠基因组230 2.0芯片检测转录因子基因在大鼠再生肝中的表达,用手术组和假手术组比较的方法确定肝再生相关基... 目的探讨转录因子基因在肝再生中的表达变化及作用。方法经查阅网站资料和相关论文获得转录因子基因及其参与的生理活动,用大鼠基因组230 2.0芯片检测转录因子基因在大鼠再生肝中的表达,用手术组和假手术组比较的方法确定肝再生相关基因。结果初步证实上述基因中有320个基因与肝再生相关,涉及细胞代谢、增殖、分化、凋亡等16种生理活动。它们在肝再生中的表达分为41种方式,表明肝再生中细胞生理生化活动具有阶段性、多样性和复杂性。其中,肝再生早期[部分肝切除（PH）后0.5～4h]和前期（PH后6～12h）糖类合成,脂类代谢和炎症反应相关转录因子基因表达增强,中期和后期细胞增殖、生长、分化和凋亡相关转录因子基因表达增强。结论肝再生的生理生化活动受多种转录因子基因调控。其中,e2f1、fos、copeb等转录因子基因发挥关键作用。 展开更多

关键词 部分肝切除 转录因子 肝再生相关基因 基因组2302.0芯片 大鼠

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