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局部空间-时间显著性的表达过程蕴涵对空间显著性的表达
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作者 姜涛 蒋兴舟 《海军航空工程学院学报》 2005年第6期611-614,共4页
建立的基于独立成分分析进行特征提取器的学习,进而模拟人类对视觉信息的局部空间-时间显著性的表达过程的计算模型,蕴涵了对局部空间显著性的有效表达;从而当据其设计为机器人主动视觉的注意机制的视线控制而用的算法,可以同一个处理... 建立的基于独立成分分析进行特征提取器的学习,进而模拟人类对视觉信息的局部空间-时间显著性的表达过程的计算模型,蕴涵了对局部空间显著性的有效表达;从而当据其设计为机器人主动视觉的注意机制的视线控制而用的算法,可以同一个处理过程适用于动态场景或静态场景的情形.对获自动态场景的特征提取器的频率特性的分析,揭示了此种内在的包含性的成因;算法的实验结果显示了局部空间-时间显著性表达过程对静态场景的局部空间显著性可有效表达. 展开更多
关键词 视觉注意机制 局部显著性表达 空间-时间显著 空间显著 独立成分分析 频率分析 机器人主动视觉
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苏博美利奴羊S100A11基因序列分析及表达研究
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作者 付雪峰 刘春洁 +4 位作者 黄锡霞 石刚 徐新明 石晓雷 田可川 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第6期15-19,283,共6页
为了探讨S100A11基因在苏博美利奴羊中不同类型细度的细毛羊中的表达模式,试验以苏博美利奴羊为研究对象,克隆了钙囊素S100A11基因,采用生物信息学方法进行遗传进化分析,对S100A11蛋白的理化性质进行分析,并对其二级蛋白结构进行预测,... 为了探讨S100A11基因在苏博美利奴羊中不同类型细度的细毛羊中的表达模式,试验以苏博美利奴羊为研究对象,克隆了钙囊素S100A11基因,采用生物信息学方法进行遗传进化分析,对S100A11蛋白的理化性质进行分析,并对其二级蛋白结构进行预测,且通过RT-PCR相对定量方法检测S100A11基因在不同绵羊个体中的表达规律。结果表明:绵羊S100A11基因的CDS全长序列为866bp,编码了105个氨基酸,与绵羊、山羊、牛、猪、鼠、兔、鸡、狗和斑马鱼的CDS同源性分别为96%、96%、96%、87%、24%、44%、70%、70%、60%;分别在1bp、220~336bp、415~864bp有3个开放式阅读框(ORF);S100A11基因全长为4798bp。S100A11蛋白含有1个信号肽、19个磷酸化位点;同时S100A11基因在超细型细毛羊皮肤组织表达量极显著高于细型细毛羊的表达量(P〈0.01),差异倍数为2.048。 展开更多
关键词 绵羊 S100A11基因 生物信息学 RT-PCR 显著性表达
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基于SAM和GA/SVM的肿瘤基因表达谱分类算法 被引量:1
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作者 李小波 《杭州师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2008年第3期202-205,215,共5页
基因芯片技术在肿瘤分型分类的研究中得到了广泛的应用.为了处理肿瘤基因表达谱数据,建立肿瘤分类预测模型,文中采用基因表达差异显著性分析方法,支持向量机,遗传算法相结合的多步骤降维分类方法.采用该方法处理大肠癌和白血病数据集,... 基因芯片技术在肿瘤分型分类的研究中得到了广泛的应用.为了处理肿瘤基因表达谱数据,建立肿瘤分类预测模型,文中采用基因表达差异显著性分析方法,支持向量机,遗传算法相结合的多步骤降维分类方法.采用该方法处理大肠癌和白血病数据集,筛选到基因数量较少并且分类准确度较高的特征基因子集.实验结果表明,文中的方法可以快速有效地筛选肿瘤特征基因,获得更好的分类效果. 展开更多
关键词 基因表达 分类 基因表达差异显著分析方法(SAM) 遗传算法(GA) 支持向量机(SVM)
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小鼠下颌下腺发育关键基因的筛选及功能预测
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作者 崔丽娟 林晓静 +3 位作者 张林 林江红 吕汉孝 杨兆安 《中国口腔颌面外科杂志》 CAS 2011年第1期12-17,共6页
目的:通过筛选小鼠下颌下腺发育起关键作用的基因,并预测其基因功能,为唾液腺组织工程奠定实验基础。方法:选取小鼠胚胎第18.5天、19.5天、出生后当天、出生后3天等4个不同时期的下颌下腺,进行基因芯片检测,BeadStation 500 System扫描... 目的:通过筛选小鼠下颌下腺发育起关键作用的基因,并预测其基因功能,为唾液腺组织工程奠定实验基础。方法:选取小鼠胚胎第18.5天、19.5天、出生后当天、出生后3天等4个不同时期的下颌下腺,进行基因芯片检测,BeadStation 500 System扫描仪(illumina,Inc.)对芯片扫描,然后采用BeadStudio Gene Expression Module图像分析软件(illumina,Inc.)对芯片灰度扫描图进行分析,构建小鼠下颌下腺的全基因表达谱。应用生物信息学STC法分析基因表达趋势,建立发育时间与基因表达相关的调控网络图,从网络中筛选关键基因,预测其基因功能,并对关键基因Skp2进行实时荧光定量PCR验证。结果:应用STC生物学方法,得到差异基因的8种显著性表达趋势,其中有4种与表型相关。构建网络图筛选关键基因,得到Ddx1、Cenpl、Fanci、Skp2、Rbm4、Dak。Skp2基因检测数据与实时荧光定量PCR验证结果一致。其中Skp2与胚胎期细胞的分化、增殖密切相关。结论:6个关键基因在小鼠下颌下腺发育过程中起重要作用。 展开更多
关键词 下颌下腺 基因芯片 基因表达趋势的显著分析 关键基因
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多步骤降维的肿瘤特征基因选择方法 被引量:1
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作者 李小波 《复旦学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期541-544,共4页
针对基因芯片数据量大、样本数低和基因维数高的特点,提出了一种对基因芯片数据进行多步骤降维处理的分类方法.第一步,采用基因表达差异显著性分析方法(SAM)筛选得到差异表达基因子集.第二步,采用支持向量机(SVM)分类器对该差异表达基... 针对基因芯片数据量大、样本数低和基因维数高的特点,提出了一种对基因芯片数据进行多步骤降维处理的分类方法.第一步,采用基因表达差异显著性分析方法(SAM)筛选得到差异表达基因子集.第二步,采用支持向量机(SVM)分类器对该差异表达基因子集进行进一步的分类降维.将该方法用来处理大肠癌和白血病数据集,得到了数量较少而分类能力较强的特征基因子集.实验结果证明该方法可以快速有效地筛选肿瘤特征基因. 展开更多
关键词 基因芯片数据 特征基因选择 基因表达差异显著分析方法 支持向量机 降维
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