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上海市松江区白纹伊蚊共生微生物宏基因组分析
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作者 叶独秋 张驰 +3 位作者 庞博文 吴佳玲 蒋露芳 吕锡宏 《热带病与寄生虫学》 2024年第6期334-338,381,共6页
目的 研究上海市松江区野外环境中白纹伊蚊共生微生物群物种组成和功能的多样性,了解白纹伊蚊传播疾病的现况,为白纹伊蚊生物防制提供新思路。方法 2023年7—9月,在上海市松江区广富林郊野公园、佘山国家森林公园、辰山等3个野外环境采... 目的 研究上海市松江区野外环境中白纹伊蚊共生微生物群物种组成和功能的多样性,了解白纹伊蚊传播疾病的现况,为白纹伊蚊生物防制提供新思路。方法 2023年7—9月,在上海市松江区广富林郊野公园、佘山国家森林公园、辰山等3个野外环境采样点使用人诱停落法采集白纹伊蚊样本,形态学鉴定后提取DNA,使用宏基因组测序技术进行样本物种注释,通过综合抗生素耐药性数据库(Comprehensive Antibiotic Resistance Database, CARD)、碳水化合物活性酶数据库(Carbohydrate-Active enZymes Database, CAZy)进行功能注释。结果共捕获白纹伊蚊417只,注释到236个细菌属和23个病毒属,其中3处采样点共有的细菌属占52.97%(125/236),共有的病毒微生物属占21.73%(5/23)。白纹伊蚊样本中优势细菌门为假单胞菌门(Pseudomonadota)和芽孢杆菌门(Bacillota),相对丰度较高的细菌属为沃尔巴克氏体属(Wolbachia)、链球菌属(Streptococcus)和肠杆菌属(Enterobacter)。除去无法分类的微生物病毒门,样本中最主要的优势病毒门为反链RNA病毒门(Negarnaviricota)和衣壳病毒门(Peploviricota),相对丰度较高的病毒属为α裸病毒属(Alphanudivirus)和正黏黄病毒属(Orthoflavivirus)。经CARD数据库对抗生素抗性基因进行注释,结果显示fabG、abcA、rpoB等基因丰度较高;经CAZy数据库对碳水化合物活性酶功能进行注释,结果显示糖苷转移酶类(glycosyl transferases, GT)、糖苷水解酶类(glycoside hydrolases, GH)和多糖裂解酶类(polysaccharide lyases, PL)丰度较高。结论 上海市松江区白纹伊蚊共生微生物群构成相似度高,核心菌群稳定,且白纹伊蚊共生微生物群与白纹伊蚊抗药性的形成可能存在潜在关联。 展开更多
关键词 白纹伊蚊 共生微生物群 宏基因组学 数据库 功能注释
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江浙两省案例地区养殖业抗菌药物管理现况——细菌耐药共同治理者的实践
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作者 马聪 王伟 +5 位作者 严非 邓子如 王娜 蒋露芳 姜庆五 付朝伟 《中国社会医学杂志》 2023年第2期137-140,共4页
目的基于细菌耐药共同治理者角度,了解养殖业抗菌药物管理政策和实施现况。方法于2020年7月和2021年1月通过深度访谈养殖业抗菌药物使用及管理的各利益相关者,采用主题框架法分析江苏省和浙江省部分地区养殖业抗菌药物管理现况。结果案... 目的基于细菌耐药共同治理者角度,了解养殖业抗菌药物管理政策和实施现况。方法于2020年7月和2021年1月通过深度访谈养殖业抗菌药物使用及管理的各利益相关者,采用主题框架法分析江苏省和浙江省部分地区养殖业抗菌药物管理现况。结果案例地区农业行政部门主要负责对于药物残留的监测抽查以及相关政策的宣传培训,但在兽药处方和兽药销售方面的监管并不是十分严格。养殖户兽用抗菌药物使用方面存在经验性、预防性用药以及人兽抗菌药物混用现象。结论案例地区养殖业抗菌药物管理工作仍有提升空间,建议从优化抽查监测的反馈与处罚机制、加强兽用抗菌药物流通管理、提升兽用抗菌药物使用认知水平等方面加强养殖业兽用抗菌药物管理,从而完善One Health下抗菌药物治理框架。 展开更多
关键词 抗菌药物 “One Health”框架 养殖业 管理
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浙江省某县中小学生新冠病毒灭活疫苗免疫效果预估模型建立
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作者 张莉 陈颖峰 +5 位作者 毛传武 解玉阳 叶品凯 董晓莲 蒋露芳 姜庆五 《上海预防医学》 CAS 2024年第4期368-374,共7页
【目的】观察浙江省某县中小学生新冠灭活疫苗免疫接种后血清抗体水平并分析其影响因素,构建抗体浓度预测模型。【方法】以浙江省某县为研究现场,对接种新型冠状病毒灭活疫苗的中小学生进行分层整群随机抽样,收集性别、年龄、接种疫苗... 【目的】观察浙江省某县中小学生新冠灭活疫苗免疫接种后血清抗体水平并分析其影响因素,构建抗体浓度预测模型。【方法】以浙江省某县为研究现场,对接种新型冠状病毒灭活疫苗的中小学生进行分层整群随机抽样,收集性别、年龄、接种疫苗种类及接种疫苗时间等信息,采集研究对象血清样本,采用化学免疫发光法(CLIA)检测血清新冠病毒抗S+N IgG抗体,分析其影响因素并构建抗体浓度预测模型。【结果】女性的IgG抗体浓度高于男性;年龄增大,抗体水平下降;接种2剂者抗体浓度高于接种1剂的;KX疫苗接种者抗体浓度高于2种疫苗混合接种者,以及GY生物制品研究所疫苗接种者;时间间隔越长,抗体水平越低。研究构建的随机森林回归预测模型的模型拟合情况及预测能力均优于多元线性逐步回归预测模型。【结论】性别、年龄、疫苗接种剂次、疫苗种类、疫苗接种时间在一定程度上影响了中小学生新冠灭活疫苗的免疫接种效果,预测模型能较好的预测接种人群抗体水平,为未来新发传染病疫苗接种免疫效果评价提供新思路。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 灭活疫苗 中小学生人群 免疫效果 血清评价 预测模型
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国际外科医疗纠纷研究主题演化分析——基于SciMat的研究 被引量:1
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作者 卢锐敏 沈泽方 +4 位作者 初丽媛 刘鸿霞 王敏 蒋露芳 杨天潼 《中国卫生法制》 2024年第2期15-23,共9页
目的:对国际外科医疗纠纷领域的研究主题进行分析,揭示该领域的发展脉络。方法:以Web of Science中2011-2021年发表的有关外科医疗纠纷2841篇科学文献为研究对象,运用SciMAT绘制关键词覆盖图、主题战略坐标图和主题演化路径图,并对各时... 目的:对国际外科医疗纠纷领域的研究主题进行分析,揭示该领域的发展脉络。方法:以Web of Science中2011-2021年发表的有关外科医疗纠纷2841篇科学文献为研究对象,运用SciMAT绘制关键词覆盖图、主题战略坐标图和主题演化路径图,并对各时间分区的主题战略坐标图和主题演化进行分析。结果:近10年来,国际外科医疗纠纷研究的发文量及关键词数量不断增多,各研究时期主题聚类不断增加,形成了重要的演化路径:RISK-FACTORS、SURGICAL-COMPLICATIONS、SURGICAL-SAFETY-CHECKLIST、MALPRACTICE-LITIGATION、PATIENT-SAFTY。结论:国际外科医疗纠纷领域的研究范围和内容呈现多元化的发展态势,研究主题不断丰富。RISK-FACTORS、SURGICAL-COMPLICATIONS、MEDICAL-LIABILITY可能是未来潜在的热点研究主题,可给予更多关注。可揭示外科相关科室、疾病、手术医疗事故诉讼的风险因素、并发症分布规律,为临床外科医生、医院管理者提供风险管理策略,提高患者安全;可探讨新型冠状病毒肺炎影响下紧急医疗纠纷的医疗责任问题。 展开更多
关键词 外科医疗纠纷 主题演化 共词分析 聚类分析 SciMAT
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学龄儿童肥胖与肠道菌群多样性及菌属丰度的关联研究 被引量:7
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作者 蒋露芳 王莹莹 +5 位作者 彭慧 李锐 张芬 王娜 邵月琴 姜庆五 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期260-268,共9页
目的分析学龄肥胖儿童和正常体重儿童肠道菌群多样性差异,识别肥胖儿童肠道特征菌属,为后续相关机制研究和学龄儿童肥胖的防治提供依据。方法基于2016年在上海市嘉定区某小学建立的研究队列人群,将2016-2018年3年均处肥胖状态的儿童共6... 目的分析学龄肥胖儿童和正常体重儿童肠道菌群多样性差异,识别肥胖儿童肠道特征菌属,为后续相关机制研究和学龄儿童肥胖的防治提供依据。方法基于2016年在上海市嘉定区某小学建立的研究队列人群,将2016-2018年3年均处肥胖状态的儿童共63名纳入肥胖组,其中男生43名,女生20名。在3年均为正常体重的儿童中,根据年龄、性别和所在班级,将其与肥胖组儿童进行1∶1匹配,共选择63名纳入对照组。采用问卷收集儿童基本信息、饮食状况、母乳喂养等情况,收集两组儿童的粪便样本并进行16S rDNA测序。对质量优化后的测序序列按照97%相似性进行可操作分类单元聚类及物种注释。分析肥胖组和对照组儿童肠道菌群多样性及菌属丰度差异。计算肠道菌群的Ace、Chao1、Shannon、Simpson 4种α多样性指数,并利用主坐标分析,在非加权Unifrac距离和加权Unifrac距离的基础上表示β多样性。使用相似性分析(ANOSIM)比较两组β多样性的差异。利用STAMP软件挑选出两组儿童共有菌属中的差异细菌,并利用广义线性模型(GLM)分析肥胖与α多样性以及显著差异菌属的关联。结果肥胖组的Ace和Chao1指数低于对照组,差异有统计学意义(P值分别为0.026和0.039),Shannon和Simpson指数差异无统计学意义(P值分别为0.879和0.922)。ANOSIM分析结果显示,两组儿童肠道菌群差异有统计学意义(R>0),但是组别贡献不显著(非加权Unifrac距离:R=0.006,P=0.223;加权Unifrac距离:R=0.010,P=0.134)。在肥胖组的特有菌属中,普雷沃菌属(Prevotella)和八叠球菌属(Sarcina)的相对丰度较高。STAMP分析结果显示,共有菌属中,15个菌属的相对丰度在两组儿童中差异有统计学意义(P<0.05)。GLM分析结果显示,在调整年龄、性别、SBP、饮食频次、近一周内抗生素使用情况、分娩方式、母乳喂养时间后,与对照组儿童相比,肥胖组的Ace指数和阿克曼菌属(Akkermansia muciniphila)的相对丰度显著较低,粪球菌属(Coprococcus_3)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)、不动杆菌属(Agathobacter)、柯林斯菌属(Collinsella)的相对丰度较高。根据性别分层之后,在肥胖男生中,发现Chao1指数低于正常体重男生。但是,在肥胖女生中,仅发现粪球菌属高于正常体重女生。结论与正常体重儿童相比,肥胖儿童肠道菌群α多样性较低、优势益生菌属相对丰度较低,但是与代谢紊乱、炎症促进、胆固醇降低有关的菌属相对丰度较高。 展开更多
关键词 学龄儿童 肥胖 肠道菌群 多样性
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气溶胶微生物健康风险研究进展 被引量:4
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作者 沈雁翎 李厚橙 +4 位作者 李仕祯 蒋露芳 郑懿 蔡婧 何纳 《上海预防医学》 CAS 2023年第3期292-300,共9页
气溶胶微生物是气溶胶的重要组成成分,参与空气中理化反应的同时也与疾病传播及人类健康息息相关。随着新型冠状病毒感染流行,气溶胶微生物成为备受关注的公共卫生话题,因此研究空气微生物组的构成及影响因素,可为疾病传播的有效预防提... 气溶胶微生物是气溶胶的重要组成成分,参与空气中理化反应的同时也与疾病传播及人类健康息息相关。随着新型冠状病毒感染流行,气溶胶微生物成为备受关注的公共卫生话题,因此研究空气微生物组的构成及影响因素,可为疾病传播的有效预防提供重要的信息。由于传统研究中采样及分析技术的限制,现有的气溶胶微生物组的研究还比较有限。但随着近年来高通量测序技术的不断发展与成熟,气溶胶微生物的研究展现了良好的前景。围绕气溶胶微生物构成与特征、相关影响因素、潜在的健康风险以及检测技术等方面进行综述,可作为进一步研究气溶胶微生物的基础知识,对城市空气质量管理、国家安全与公共卫生具有重要的意义和价值。 展开更多
关键词 气溶胶微生物 健康风险 构成特征 影响因素 检测技术
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江苏省海门市某村生活用水相关水环境中抗生素抗性基因的分布 被引量:1
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作者 毛传武 张莉 +7 位作者 臧金鑫 蒋露芳 熊成龙 王娜 江峰 付朝伟 胡晶晶 姜庆五 《上海预防医学》 CAS 2023年第12期1199-1205,共7页
【目的】抗生素抗性基因(ARGs)已经在全世界受到了广泛的重视,旨在探索江苏省海门某村水体中的细菌群落结构、抗生素抗性基因种类与水平,比较分析各水体环境中微生物物种分布与抗生素抗性基因分布的特点。【方法】抽取江苏省海门市10户... 【目的】抗生素抗性基因(ARGs)已经在全世界受到了广泛的重视,旨在探索江苏省海门某村水体中的细菌群落结构、抗生素抗性基因种类与水平,比较分析各水体环境中微生物物种分布与抗生素抗性基因分布的特点。【方法】抽取江苏省海门市10户居民并采集周边相关水环境样本,共采集河水(4份样本)、岷沟水(9份样本)与井水(8份样本)水体样本进行宏基因组测序,利用MetaWRAP进行组装,使用综合抗生素耐药性数据库(CARD)对ARGs进行注释,使用R软件对结果进行分析。【结果】各种水体中优势菌门为变形菌门,优势菌属为后口动物属、假单胞菌属、黄杆菌属与链霉菌属,注释的ARGs中以喹诺酮类、氨基糖苷类、大环内酯类及β‑内酰胺类抗生素抗性基因为主。抗性基因相对丰度前4位为macB、ranA、evgS与txR,井水水体和岷沟水体的抗性基因的绝对丰度平均值与抗性基因表达高于河水水体。【结论】井水、河水与岷沟水体中都检测到了不同程度的多种ARGs,且井水水体与岷沟水体中的抗性基因表达要高于河水水体,可能是由人类生产生活活动导致。 展开更多
关键词 抗生素抗性基因 宏基因组学 微生物多样性 水体环境
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多黏菌素耐药及其机制的研究进展 被引量:3
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作者 蔡家安 蒋露芳 姜庆五 《上海预防医学》 CAS 2022年第3期283-287,共5页
耐药菌已成为人类健康的严重威胁。多黏菌素对部分产生抗生素耐药的革兰阴性菌和革兰阳性菌显示出很强的杀菌活性,成为了对抗多种多药耐药菌的最后治疗选择。然而,由于多黏菌素在动物养殖中的滥用,导致其在人群中的耐药率明显升高。本... 耐药菌已成为人类健康的严重威胁。多黏菌素对部分产生抗生素耐药的革兰阴性菌和革兰阳性菌显示出很强的杀菌活性,成为了对抗多种多药耐药菌的最后治疗选择。然而,由于多黏菌素在动物养殖中的滥用,导致其在人群中的耐药率明显升高。本文综述了多黏菌素抗菌的作用机制、人群耐药流行情况,以及耐药机制和耐药的传播方式等方面的研究进展,以期加深对多黏菌素耐药发生机制的理解,从而采取措施降低其在人群中耐药的发生率。 展开更多
关键词 多黏菌素 耐药 耐药机制 耐药性的传播方式 质粒介导的黏菌素耐药
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湖州市德清县成年人群SARS-CoV-2灭活疫苗全程接种免疫效果的血清学评价 被引量:1
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作者 毛传武 陈颖峰 +4 位作者 张莉 解玉阳 董晓莲 蒋露芳 姜庆五 《上海预防医学》 CAS 2022年第11期1118-1122,共5页
【目的】了解≥18岁成年人群在新型冠状病毒(SARS⁃CoV⁃2)灭活疫苗全程免疫后血清特异性抗体水平,并分析其影响因素。【方法】以浙江省湖州市德清县已完成2剂次SARS⁃CoV⁃2灭活疫苗全程接种的18岁及以上居民为研究对象,收集性别、年龄、... 【目的】了解≥18岁成年人群在新型冠状病毒(SARS⁃CoV⁃2)灭活疫苗全程免疫后血清特异性抗体水平,并分析其影响因素。【方法】以浙江省湖州市德清县已完成2剂次SARS⁃CoV⁃2灭活疫苗全程接种的18岁及以上居民为研究对象,收集性别、年龄、接种疫苗种类以及2剂次接种时间等信息,采集研究对象血清样本,采用酶联免疫吸附测定法(ELISA)定量检测SARS⁃CoV⁃2受体结合结构域(RBD)特异性抗体水平,并分析其影响因素。【结果】接种了SARS⁃CoV⁃2灭活疫苗加强针人群的IgG抗体水平中位数高于完成2剂次全程接种人群,也高于只接种1剂次疫苗人群(P<0.05)。男性IgG抗体水平中位数为9.73(4.01~23.70)RU‧mL^(−1),低于女性[17.76(7.07~49.23)RU‧mL^(−1)](P<0.05)。国药集团北京生物制品研究所疫苗接种人群IgG抗体水平中位数为6.53(0.97~13.69)RU‧mL^(−1),低于北京科兴中维生物技术有限公司疫苗接种人群[17.29(8.54~43.73)RU‧mL^(−1)](P<0.05),也低于2种疫苗序贯接种人群[12.00(5.45~40.06)RU‧mL^(−1)](P<0.05)。距离第2剂次接种的间隔时间>6个月人群的IgG抗体水平中位数为9.73(3.83~23.63)RU‧mL^(−1),低于接种3~6个月人群[14.66(6.36~35.98)RU‧mL^(−1)](P<0.05)。影响因素分析显示,女性比男性疫苗接种效果好(χ^(2)=16.464,P<0.05);18~45岁年龄组人群疫苗接种效果更好(χ^(2)=7.158,P<0.05);接种北京科兴中维生物技术有限公司疫苗的人群效果更好(χ^(2)=49.637,P<0.05);距离第2剂次接种时间间隔>6个月的人群,疫苗接种效果下降(χ^(2)=8.447,P<0.05)。【结论】性别、年龄、疫苗种类一定程度上会影响免疫接种的效果,18岁及以上成年人群全程接种SARS⁃CoV⁃2灭活疫苗后呈现较好的免疫原性,但在接种6个月以后会出现疫苗接种效果显著下降,应及时接种加强针,以保持体内特异性抗体水平。 展开更多
关键词 新型冠状病毒灭活疫苗 新型冠状病毒受体结合结构域IgG抗体 免疫效果 血清学评价
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2017-2018年上海市长宁区流行性腮腺炎病毒基因特征
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作者 庞红 郭家胤 +3 位作者 刘小祥 熊成龙 蒋露芳 姜庆五 《中国疫苗和免疫》 北大核心 2019年第6期650-654,共5页
目的分析2017-2018年上海市长宁区流行性腮腺炎(流腮)病毒(Mumps virus,MuV)分离株的基因特征。方法对疑似流腮病例采集咽拭子标本,开展MuV核酸检测、SH和HN基因扩增和序列测定、基因型鉴定,分析分离株HN蛋白氨基酸序列变异。结果长宁区... 目的分析2017-2018年上海市长宁区流行性腮腺炎(流腮)病毒(Mumps virus,MuV)分离株的基因特征。方法对疑似流腮病例采集咽拭子标本,开展MuV核酸检测、SH和HN基因扩增和序列测定、基因型鉴定,分析分离株HN蛋白氨基酸序列变异。结果长宁区2017-2018年从123例疑似流腮病例中分离到5株MuV,获得4条SH基因序列和2条HN基因序列。5株MuV均鉴定为F基因型(中国优势流行株)。与中国疫苗株(S79株和JL株)相比,分离株HN蛋白第372和464氨基酸位点各增加了1个N-糖基化位点,第336、354-356、442、462、470、473-474和490位点存在氨基酸变异。结论2017-2018年长宁区MuV分离株属于中国优势流行的F基因型毒株,但存在一定的变异;建议持续加强流腮病毒学监测。 展开更多
关键词 流行性腮腺炎 腮腺炎病毒 基因型
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医学微生物学实验课虚拟仿真教学应用需求分析 被引量:8
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作者 蒋露芳 熊海燕 +2 位作者 朱献忠 蒋伟利 熊成龙 《预防医学》 2021年第4期422-423,共2页
目的调查预防医学专业本科生对医学微生物学实验课虚拟仿真教学的需求状况。方法选择复旦大学公共卫生与预防医学专业2017级本科生为调查对象,基于现有医学微生物学实验课程及拟开展的仿真教学内容设计问卷,收集学生对该课程传统教学方... 目的调查预防医学专业本科生对医学微生物学实验课虚拟仿真教学的需求状况。方法选择复旦大学公共卫生与预防医学专业2017级本科生为调查对象,基于现有医学微生物学实验课程及拟开展的仿真教学内容设计问卷,收集学生对该课程传统教学方法的评价及对虚拟仿真教学的需求与建议。结果发放问卷104份,回收有效问卷79份,回收有效率为75.96%。男生27人,占34.18%;女生52人,占65.82%。超过60%的学生肯定了传统实验教学方法原理清晰、方法经典、操作简便和应用范围明确的优点;超过50%的学生认为传统实验教学方法存在偏重单一模块、缺乏系统性训练,缺乏反复练习机会,显微镜观察结果难以共享和一次示范难以掌握规范动作要领等缺点。分别有78.48%、72.15%、72.15%和65.82%的学生希望当前已开展的病原微生物实验室生物安全、PCR法检测细菌耐药基因、病毒分离培养与检测、沙门菌的分离与鉴定等加入虚拟仿真教学;分别有82.28%、82.28%、74.68%、72.15%和70.89%的学生希望增设全自动细菌鉴定及药敏分析系统、全血DNA的提取、实时荧光定量PCR、细菌特殊结构染色和细胞培养综合实验等新技术的虚拟仿真教学。结论医学微生物学实验课程在保留传统教学方式的同时,可对那些需要反复训练才能掌握实验要领的内容,以及新方法、新技术开展虚拟仿真教学。 展开更多
关键词 虚拟仿真 医学微生物学 实验教学 需求
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Serologic study on the outbreak of acute upper respiratory tract infections caused by adenovirus 3
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作者 jiang lufang JU Liwen +4 位作者 jiang Renjie LIN Yuzun ZHOU Liandi YU Shunzhang jiang Qingwu 《Frontiers of Medicine》 SCIE CSCD 2007年第2期215-218,共4页
From April to June,2004,an outbreak of acute upper respiratory tract infections(AURTI)occurred in the north area of Jiangsu Province,China.Twenty throat swabs were collected with 13 of them presenting an adenovirus(Ad... From April to June,2004,an outbreak of acute upper respiratory tract infections(AURTI)occurred in the north area of Jiangsu Province,China.Twenty throat swabs were collected with 13 of them presenting an adenovirus(Ad)-like cytopathogenic effect on HEp-2.These were verified as Ad by the electron microscope,direct immunofluorescence assay and Ad primer-mediated PCR.Moreover,they were identified as adenovirus type 3(Ad3)by type-specific PCR and sequencing of the amplification products.Subsequent serologic studies were carried out to finally diagnose and document the outbreak.The neutralization test of paired serum of six in nine cases show obviously increased antibodies titers.The positive rate of IgM,IgG and recovery phase neutralization antibodies of the cases were 3.7%,44.4%and 59.5%respectively while those of the controls were 0%,8.3%and 33.3%respectively.The P values of Chi-Square were 0.510,0.018 and 0.226 respectively.The concordance between IgG detected by ELISA and neutralization anti bodies detected by the neutralization test was 61.4%and the P value of Kappa was 0.070.By the serologic study,we can definitively diagnose that this outbreak of acute respiratory infections was caused by Adenovirus 3. 展开更多
关键词 adenovirus infectious enzyme-linked immunosorbent assay immunoglobulin G neutralization tests
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