摘要
在生物医学领域,通过知识提取过程从海量的生物医学文献中提取疾病、基因和药物之间的关系并可视化显示,可以为临床医学实验提供有效的假设检验,推动生物医学科技的发展。为此,提出一种基于语义关系的以疾病为中心的疾病、基因和药物间的知识提取系统。利用Sem Rep得到特定主题Medline文献的语义输出,通过显著信息提取算法提取Sem Rep的语义输出关系。对照OMIM和GHR在线数据库进行评估,实验结果显示该显著信息提取系统的准确率可达0.76。
In the biomedical field,knowledge summarization can greatly promote the innovation of biomedical science and technology. Dynamic summarization can provide novel clinical experimental hypothesis by extracting the links among diseases,genes,drugs from the mass of biomedical literature and visualizing it. This paper presents a system which summarizes the salient relations by the salient extraction algorithm using the specific subject Medline corpus by Sem Rep semantic output. Experimental results show that the precise of experimental result is 0.76 referring to OMIM and GHR online databases.
出处
《计算机工程》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期284-288,295,共6页
Computer Engineering
基金
国家自然科学基金资助项目(61070098
61272373
61340020)
中央高校基本科研业务费专项基金资助项目(DUT13JB09)
国家社会科学基金资助项目(08BTQ025)
关键词
知识提取
语义关系提取
显著信息提取算法
SEM
Rep工具
语义输出
网络图可视化
knowledge extraction
semantic relation extraction
significant information extraction algorithm
Sem Rep tool
semantic output
network diagram visualization