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两对互作基因重组率EM算法估计的模拟研究 被引量:4

The Monte Carlo simulation on the estimate of recombination rate between two interactional genes using EM algorithm
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摘要 推导出存在上位性互作的两对连锁基因在F2 群体中各表型的概率和条件概率以便利用EM (expectationandmaximization :期望最大化 )算法估计重组率 ,还获得了重组率的标准误公式。通过MonteCarlo模拟发现 :用EM算法和Fisher法估计重组率时其结果一致 ;前者易推广到两基因间具有上位性互作的情形 。 After obtaining the probability and conditional probability of phenotypes in F 2 population,it is easy to estimate recombination rate between two interactional genes using expectation and maximization (EM) algorithm.Moreover,the formulas of the standard error of recombination rate were also obtained.The results from Monte Carlo simulation showed that the estimates of recombination rate using EM algorithm were consistent with those using Fisher method.However,it was very easy for EM algorithm to calculate recombination rate between two interactional genes.
出处 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期24-27,共4页 Journal of Nanjing Agricultural University
基金 973项目 (G19980 10 2 0 6)
关键词 期望最大化 (EM)算法 重组率 MONTECARLO模拟 基因互作 植物 expectation and maximization(EM)algorithm recombination rate Monte Carlo simulation
  • 相关文献

参考文献2

二级参考文献13

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共引文献28

同被引文献24

引证文献4

二级引证文献11

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