期刊文献+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息

裸大麦PKABA1基因实时荧光定量PCR方法的建立 被引量：2

在线阅读 下载PDF
导出
摘要 根据GenBank上小麦(M94726)、大麦(AB058924)和黑麦(DQ295068)的蛋白激酶外显子3的编码基因的同源序列比对,设计基因PKABA1的引物,建立了用SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR检测裸大麦PKABA1基因在不同低温处理时间下mRNA表达量的方法。以样本循环数为纵坐标、以稀释倍数的对数为横坐标建立标准曲线,其相关系数(r2)达到了0.996,扩增效率99%,熔解曲线分析结果显示产物为特异的单峰,退火温度为(80.5±0.5)℃。结果表明,裸大麦PKABA1基因在不同低温处理时间下的表达量稳定,其实时荧光定量PCR法扩增效率高、特异性强、线性范围广、检测周期短,为PKABA1基因作为内参基因进行裸大麦功能基因表达的定量分析奠定了基础。
作者 吴昆仑 邓晓青 姚晓华
机构地区 青海省农林科学院 青海大学农林科学院/青海省高原作物种质资源创新与利用国家重点实验室培育基地/青海省裸大麦遗传育种重点实验室
出处 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2012年第12期16-18,共3页 Jiangsu Agricultural Sciences
基金 现代农业产业技术体系建设专项(编号:CARS-05) 国家"948"计划(编号:2010-Z29)
关键词 裸大麦 实时荧光定量 PCR扩增 标准曲线 PKABA1基因
分类号 Q785 [生物学—分子生物学]
  • 相关文献

参考文献20

  • 1Higuchi R, Dollinger G, Walsh P S, et al. Simultaneous amplification and detection of specific DNA sequences [ J ]. Biotechnology, 1992, 10:413 -417.
  • 2Montgomery R A, Dallman M J. Semi - quantitative polymerase chain reaction analysis of cytokine and cytokine receptor gene expression during thymic ontogeny [ J ]. Cytokine, 1997,9 ( 10 ) : 717 - 726.
  • 3Dussault A A, Pouliot M. Rapid and simple comparison of messenger RNA levels using real - time PCR [ J ]. Biol Proced Online, 2006, 8(1) :1 -10.
  • 4Dallas P B, Gottardo N G, Firth M J, et al. Gene expression levels assessed by oligonueleotide microarray analysis and quantitative real - time RT - PCR--how will do they correlate? [ J]. BMC Genomics, 2005( 1 ) :59.
  • 5Budhia S, Haring L F, MeConnell I, et al. Quantitation of ovine eyto- kine mRNA by real -time RT- PCR[ J]. J Immunol Methods,2006, 309(1/2) :160 - 172.
  • 6赵焕英,包金风.实时荧光定量PCR技术的原理及其应用研究进展[J].中国组织化学与细胞化学杂志,2007,16(4):492-497. 被引量：136
  • 7陈凤花,王琳,胡丽华.实时荧光定量RT-PCR内参基因的选择[J].临床检验杂志,2005,23(5):393-395. 被引量：59
  • 8郭本兆.青海经济植物志[M].西宁:青海人民出版社,1987.270-2712.
  • 9臧靖巍,阚建全,陈宗道,赵国华.青稞的成分研究及其应用现状[J].中国食品添加剂,2004,15(4):43-46. 被引量：164
  • 10Rcnning SB, Berdal KG,Andersen CB,et al. Novel reference gene, PKABA1, used in a duplex real - time polymerase Chain reaction for detection and quantitation of wheat- and barley -derived DNA[ J]. Agric Food Chem,2006,54( 3 ) :682 - 687.

二级参考文献59

  • 1刘敬忠,闫梅,王立荣,王战勇,周艳,肖白.实时荧光聚合酶链反应结合融解曲线分析在α-地中海贫血基因诊断中的价值[J].中华检验医学杂志,2005,28(8):858-861. 被引量：12
  • 2陈凤花,王琳,胡丽华.实时荧光定量RT-PCR内参基因的选择[J].临床检验杂志,2005,23(5):393-395. 被引量：59
  • 3侯林,姜丽娟,孙文静,张瑞锋,王家庆,赵欣涛,安家璐.中国卤虫actin基因的实时荧光定量PCR方法的建立和优化[J].辽宁师范大学学报（自然科学版）,2006,29(4):466-469. 被引量：8
  • 4王鹏珍,牛忠海,张世满,许锦文.青稞原料营养成分浅析[J].酿酒科技,1997(3):30-31. 被引量：75
  • 5[1]HIGUCHI R,DOLLINGER G,WALSH PS,et al.Simultaneous amplification and detection of specific DNA sequences[J].Biotechnology,1992,10:413-417.
  • 6[2]DUSSAULT AA,POULIOT M.Rapid and simple comparison of messenger RNA levels using real-time PCR[J].Biol Proced.Online,2006,8(1):1-10.
  • 7[3]DALLAS PB,GOTTARDO NG,Firth M J,et al.Gene expression levels assessed by oligonucleotide microarray analysis and quantitative real-time RT-PCR-how well do they correlate?[J].BMC Genomics.2005(1):59.
  • 8[4]BUDHIA S,HARING LF,MCCONNELL I,et al.Quantitation of ovine cytokine mRNA by real-time RT-PCR[J].J Immunol Methods,2006,309(1-2):160-172.
  • 9[5]RADONIC A,THULKE S,MACKAY IM,et al.Guideline to reference gene selection for quantitative real-time PCR[J].Biochem Biophys Res Commun.,2004,313(4):856-862.
  • 10[6]MACKAY IM,ARDEN KE,NITSCHE A.Real-time PCR in virology[J].Nucleic Acids Res.,2002,30(6):1292-1305.

共引文献405

同被引文献30

  • 1王瑞冬,孙连娜,陶朝阳,张卫东,陈万生.独一味化学成分的研究[J].第二军医大学学报,2005,26(10):1171-1173. 被引量：30
  • 2Gao Z M, Wang X C, Peng Z H, et al. Characterization and primary functional analysis of phenylalanine ammonialyase gene from Phyllostachys edulis[J]. Plant Cell Rep, 20 1231 (7): 1345-1356.
  • 3Hou X, Shao F, Ma Y, et al. The phenylalanine ammonialyase gene family in Salvia miltiorrhiza: genome -wide characterization, molecular cloning and expression analysis[J]. Mol Bioi Rep,2013,40(7):4301-4310.
  • 4Ma W, Wu M, Wu Y, et al. Cloning and characterisation of a phenylalanine ammonia -lyase gene from Rhus chinensis[J]. Plant Cell Rep,2013,32(8): 1179-1190.
  • 5Huang L, Wang H, Ye H, et al. Differential expression of benzophenone synthase and chalcone synthase III Hypericum sampsonii[J].Nat Prod Commun,2012,7(12):1615- 1618.
  • 6Pitakdantham W, Sutabutra T, Chiemsombat P, et al. Isolation and characterization of chalcone synthase gene isolated from Dendrobium Sonia Earsakul [J].Pak J Bioi Sci, 2010,13(20): 1000-1005.
  • 7Maoka T, Hataya T. The complete nucleotide sequence and biotype variability of Papaya leaf distortion mosaic virus[J]. Phytopathology, 2005, 95(2): 128-135.
  • 8Tripathi S, Suzuki J Y, Ferreira S A, et al. Papaya ringspot virus-P: characteristics, pathogenicity, sequence variability and control[J]. Molecular Plant Pathology, 2008, 9(3): 269-280.
  • 9Ban H J, KungY J, Raja J A, et al. Potential threat of a new pathotype of Papaya leaf distortion mosaic virus infecting transgenic papaya resistant to Papaya tin.pot vires[J]. Phytopathology, 2008, 98(7) : 848-856.
  • 10Filomena J M T, Sta Cruz C. Detection of Mixed Virus Infection with Papaya ringspot virus(PRSV)in Papaya(Carica papaya L.) Grown in Lazon, Philippincs[J]. Philippine Journal of Crop Science, 2009, 34(1): 62-74.

引证文献2

二级引证文献3

江苏农业科学
2012年 第12期

相关作者

内容加载中请稍等...

相关机构

内容加载中请稍等...

相关主题

内容加载中请稍等...

浏览历史

内容加载中请稍等...
;
使用帮助 返回顶部