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粪便中戊型肝炎病毒散发株的核酸序列分析 被引量:2

Nucleic acid sequence analysis of the sporadic hepatitis E virus strains isolated from stool samples
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摘要 目的了解粪便中戊型肝炎病毒(HEV)散发株的核酸序列变异情况。方法用逆转录-套式-聚合酶链反应(RT-Nested-PCR)检测了8例广州地区散发性戊型肝炎患者粪便中的HEVRNA,3例阳性。对阳性PCR产物的238个碱基进行了基因克隆和核酸序列分析,并与已报道的HEV序列进行比较。结果本地区3株HEV与缅甸株(B)、巴基斯坦株(P)、墨西哥株(M)、中国新疆株(Ch1.1)和广州血清株(G-9)的核苷酸和氨基酸的同源性均值分别为80.67%和88.60(B)、81.25%和89.20%(P)、77.45%和84.81%(M)、81.25%和89.20%(C)、97.85%和96.20%(G)。结论本组3株HEV有一定程度的变异。 Objective In order to investigate the genomutation of sporadic HEV strains we analyzed the nucleotide sequence of sporadic HEV strains in Guangzhou.Methods RT Nested PCR was used to determinate HEV RNA in stool samples from 8 patients with sporadic hepatitis E. Results 3 stool samples were positive for HEV RNA, which were then hybridized、 recombinanted and sequenced. The homology of nucleic acid and amino acid sequences of 3 HEV strains in Guangzhou comparing with the Burmese、Pakistani、Mexican、Chinese Ch1.1 and G 9 strains were 80.67% and 88.60(B)、81.25% and 89.20%(P)、77.45% and 84.81%(M)、81.25% and 89.20%(C)、97.85% and 96.20% (G) respectively.Conclusion The results suggested that 3 strains of HEV in Guangzhou had genomutation to a certain extent.
出处 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 1998年第2期82-84,共3页 Chinese Journal of Infectious Diseases
基金 香港政府94-Chroucher基金 广州市科委资助
关键词 戊型肝炎病毒 RNA 核酸序列分析 粪便 HEV RNA Nucleotide sequences
  • 相关文献

参考文献4

  • 1Huang R T,J Med Virol,1995年,47卷,303页
  • 2Yin S,J Med Virol,1993年,41卷,230页
  • 3庄辉,中华实验和临床病毒学杂志,1992年,6期,111页
  • 4庄辉,中华实验和临床病毒学杂志,1983年,7期,14页

同被引文献10

引证文献2

二级引证文献4

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