期刊文献+

应用基因表达谱芯片技术筛选NS3TP1转染细胞差异表达基因 被引量:1

在线阅读 下载PDF
导出
摘要 目的:应用基因芯片技术,检测丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白3(NS3)反式激活基因1(NS3TP1)的表达对肝母细胞瘤细胞HepG2基因表达谱的影响,进一步NS3TP1蛋白可能的分子生物学功能. 方法:设计并合成NS3TP1基因序列特异性的引物,应用聚合酶链反应(PCR)技术扩增NS3TP1蛋白编码基因片段, 以常规的分子生物学技术构建表达载体pcDNA3.1(-)- NS3TP1.以脂质体技术转染肝母细胞瘤细胞系HepG2,提取总mRNA,逆转录为cDNA,与转染空白表达载体pcDNA3.1(-)的HepG2细胞进行DNA芯片分析并比较. 结果:构建的表达载体经过限制性内切酶分析和DNA序列测定,证实准确无误,提取高质量的总mRNA并进行逆转录成为cDNA,进行DNA芯片技术分析.在1 152个基因表达谱的筛选中,发现有26个基因表达水平显著上调,14个基因表达水平显著下调. 结论:应用基因表达谱芯片技术成功筛选了NS3TP1转染细胞后差异表达基因,为进一步阐明NS3TP1蛋白可能的生物学功能及HCV的致病机制提供理论依据.
出处 《世界华人消化杂志》 CAS 2004年第7期1707-1711,共5页 World Chinese Journal of Digestology
基金 国家自然科学基金攻关项目 No.C03011402 No.C30070689军队"九 五"科技攻关项目 No.98D063军队回国留学人员启动基金项目 No.98H038军队"十 五"科技攻关青年基金项目 No.01Q138军队"十 五"科技攻关面上项目 No.01MB135
  • 相关文献

参考文献21

二级参考文献385

共引文献252

同被引文献16

  • 1Man XB, Tang L, Qiu XH, Yang LQ, Cao HF, Wu MC, Wang HY. Expression of cytochrome P4502E1 gene in hepatocellular carcinoma. World J Gastroenterol 2004;10:1565-1568
  • 2Draghici S, Kulaeva O, Hoff B, Petrov A, Shams S, Tainsky MA. Noise sampling method: an ANOVA approach allowing robust selection of differentially regulated genes measured by DNA microarrays. Bioinformatics 2003;19:1348-1359
  • 3Yang IV, Chen E, Hasseman JP, Liang W, Frank BC, Wang S, Sharov V, Saeed AI, White J, Li J, Lee NH, Yeatman TJ,Quackenbush J. Within the fold: assessing differential expression measures and reproducibility in microarray assays. Genome Biol 2002;3:research0062
  • 4Li SR, Dorudi S, Bustin SA. Identification of differentially expressed genes associated with colorectal cancer liver metastasis. Eur Surg Res 2003;35:327-336
  • 5Frederiksen CM, Knudsen S, Laurberg S, Orntoft TF. Classification of Dukes'B and C colorectal cancers using expression arrays. J Cancer Res Clin Oncol 2003;129:263-271
  • 6Gupta V, Cherkassky A, Chatis P, Joseph R, Johnson AL,Broadbent J, Erickson T, DiMeo J. Directly labeled mRNA produces highly precise and unbiased differential gene expression data. Nucleic Acids Res 2003;31:e13
  • 7Skubitz KM, Skubitz AP. Gene expression in aggressive fibromatosis. J Lab Clin Med 2004;143:89-98
  • 8Kluger HM, Kluger Y, Gilmore-Hebert M, DiVito K, Chang JT, Rodov S, Mironenko O, Kacinski BM, Perkins AS, Sapi E. cDNA microarray analysis of invasive and tumorigenic phenotypes in a breast cancer model. Lab Invest 2004;84:320-331
  • 9Williams NS, Gaynor RB, Scoggin S, Verma U, Gokaslan T, Simmang C, Fleming J, Tavana D, Frenkel E, Becerra C. Identification and validation of genes involved in the pathogenesis of colorectal cancer using cDNA microarrays and RNA interference. Clin Cancer Res 2003;9:931-946
  • 10Ognjanovic S, Tashima LS, Bryant-Greenwood GD. The effects of pre-B-cell colony-enhancing factor on the human fetal membranes by microarray analysis. Am J Obstet Gynecol 2003; 189:1187-1195

引证文献1

二级引证文献1

相关作者

内容加载中请稍等...

相关机构

内容加载中请稍等...

相关主题

内容加载中请稍等...

浏览历史

内容加载中请稍等...
;
使用帮助 返回顶部