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牦牛源牛肠道病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用
1
作者
林伟山
韩元
+5 位作者
马豆豆
李春花
童生林
李秀萍
雷萌桐
王光华
《黑龙江畜牧兽医》
北大核心
2025年第1期123-128,共6页
为了快速、准确地检测牦牛源牛肠道病毒(Bovine enterovirus,BEV),试验根据GenBank中牦牛源BEV-NH2株3D基因序列(登录号为PP746571)设计可用于检测青海牦牛源BEV的实时荧光定量PCR特异性引物,通过构建标准质粒和绘制标准曲线建立牦牛源...
为了快速、准确地检测牦牛源牛肠道病毒(Bovine enterovirus,BEV),试验根据GenBank中牦牛源BEV-NH2株3D基因序列(登录号为PP746571)设计可用于检测青海牦牛源BEV的实时荧光定量PCR特异性引物,通过构建标准质粒和绘制标准曲线建立牦牛源BEV实时荧光定量PCR检测方法,对该方法进行特异性、敏感性和重复性试验,并分别应用该方法及普通RT-PCR方法对青海省海北地区6个牦牛繁育基地的286份腹泻牦牛粪便样品进行检测,计算两种方法的符合率。结果表明:建立的牦牛源BEV实时荧光定量PCR检测方法扩增产物的熔解曲线单一,Tm值在85.6~85.8℃之间,无引物二聚体和非特异性扩增;质粒浓度在3×10^(2)~3×10^(8)copies/μL范围内时标准曲线的线性关系良好,Ct值在10.88~29.63之间,回归方程为y=-3.16x+38.01,R^(2)=0.9964;仅可检测到牦牛源BEV-NH2株,检测不到牛病毒性腹泻病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)MY01株、牛轮状病毒(Bovine rotavirus,BRV)MY20株和牛冠状病毒(Bovine coronavirus,BcoV)QL21株;对牦牛源BEV的最低检测限为3×10^(2)copies/μL;当模板浓度为3×10^(2)copies/μL、3×10^(3)copies/μL和3×10^(7)copies/μL时,Ct值的变异系数分别为1.28%、1.74%和0.15%,均在1.80%以下。286份牦牛粪便样品中,采用建立的实时荧光定量PCR检测方法检出BEV阳性样品182份,阳性率为63.64%;采用普通RT-PCR方法检出BEV阳性样品114份,阳性率为39.86%;两种方法的符合率为76.22%。说明本研究建立的牦牛源BEV实时荧光定量PCR检测方法特异性强、敏感性高、重复性好,可用于牦牛腹泻临床样本的BEV检测。
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关键词
牦牛
牛肠道病毒
3D基因
腹泻
检测方法
实时荧光定量PCR
原文传递
包虫病防控技术研究
被引量:
5
2
作者
李伟
《中国动物保健》
2017年第7期36-41,共6页
本文介绍了青海省棘球绦虫的种类、流行状况和危害性。通过主持和执行的省级、国家科技部包虫病研究项目,较系统的统计分析了2008-2013年及2013-2015年期间青海省包虫病的防治技术研究概况。
关键词
青海省
棘球绦虫
包虫病
防治
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职称材料
题名
牦牛源牛肠道病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用
1
作者
林伟山
韩元
马豆豆
李春花
童生林
李秀萍
雷萌桐
王光华
机构
青海大学畜牧兽医科学院兽医研究所
青海
省动物疾病病原诊断与绿色防控技术
研究
重点实验室
青海大学
生态环境工程
学院
出处
《黑龙江畜牧兽医》
北大核心
2025年第1期123-128,共6页
基金
国家重点研发计划项目(2022YFD1602312)
青海省科技厅项目(2022-NK-118)
青海大学青年科研基金项目(2021-QNY-5)。
文摘
为了快速、准确地检测牦牛源牛肠道病毒(Bovine enterovirus,BEV),试验根据GenBank中牦牛源BEV-NH2株3D基因序列(登录号为PP746571)设计可用于检测青海牦牛源BEV的实时荧光定量PCR特异性引物,通过构建标准质粒和绘制标准曲线建立牦牛源BEV实时荧光定量PCR检测方法,对该方法进行特异性、敏感性和重复性试验,并分别应用该方法及普通RT-PCR方法对青海省海北地区6个牦牛繁育基地的286份腹泻牦牛粪便样品进行检测,计算两种方法的符合率。结果表明:建立的牦牛源BEV实时荧光定量PCR检测方法扩增产物的熔解曲线单一,Tm值在85.6~85.8℃之间,无引物二聚体和非特异性扩增;质粒浓度在3×10^(2)~3×10^(8)copies/μL范围内时标准曲线的线性关系良好,Ct值在10.88~29.63之间,回归方程为y=-3.16x+38.01,R^(2)=0.9964;仅可检测到牦牛源BEV-NH2株,检测不到牛病毒性腹泻病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)MY01株、牛轮状病毒(Bovine rotavirus,BRV)MY20株和牛冠状病毒(Bovine coronavirus,BcoV)QL21株;对牦牛源BEV的最低检测限为3×10^(2)copies/μL;当模板浓度为3×10^(2)copies/μL、3×10^(3)copies/μL和3×10^(7)copies/μL时,Ct值的变异系数分别为1.28%、1.74%和0.15%,均在1.80%以下。286份牦牛粪便样品中,采用建立的实时荧光定量PCR检测方法检出BEV阳性样品182份,阳性率为63.64%;采用普通RT-PCR方法检出BEV阳性样品114份,阳性率为39.86%;两种方法的符合率为76.22%。说明本研究建立的牦牛源BEV实时荧光定量PCR检测方法特异性强、敏感性高、重复性好,可用于牦牛腹泻临床样本的BEV检测。
关键词
牦牛
牛肠道病毒
3D基因
腹泻
检测方法
实时荧光定量PCR
Keywords
yak
Bovine enterovirus
3D gene
diarrhea
detection method
real-time fluorescence quantitative PCR
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
包虫病防控技术研究
被引量:
5
2
作者
李伟
机构
青海大学畜牧兽医科学院兽医研究所
出处
《中国动物保健》
2017年第7期36-41,共6页
文摘
本文介绍了青海省棘球绦虫的种类、流行状况和危害性。通过主持和执行的省级、国家科技部包虫病研究项目,较系统的统计分析了2008-2013年及2013-2015年期间青海省包虫病的防治技术研究概况。
关键词
青海省
棘球绦虫
包虫病
防治
分类号
S855.9 [农业科学—临床兽医学]
在线阅读
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
牦牛源牛肠道病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用
林伟山
韩元
马豆豆
李春花
童生林
李秀萍
雷萌桐
王光华
《黑龙江畜牧兽医》
北大核心
2025
0
原文传递
2
包虫病防控技术研究
李伟
《中国动物保健》
2017
5
在线阅读
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职称材料
已选择
0
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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