基于分子对接和实验验证分析金银花不同溶剂提取物及主要成分抗RNA病毒蛋白酶的活性。利用TCMSP(traditional Chinese medicine systems pharmacology)构建金银花小分子配体库,采用药物分子设计模拟SYBYL 2.1.1软件分析金银花与HIV-1蛋...基于分子对接和实验验证分析金银花不同溶剂提取物及主要成分抗RNA病毒蛋白酶的活性。利用TCMSP(traditional Chinese medicine systems pharmacology)构建金银花小分子配体库,采用药物分子设计模拟SYBYL 2.1.1软件分析金银花与HIV-1蛋白酶和Cathepsin L蛋白酶结合情况。通过荧光法验证金银花不同溶剂提取物(水提物、30%醇提物、60%醇提物和85%醇提物)抗HIV-1和Cathepsin L蛋白酶的活性。收集金银花22个化学成分,其中21个活性成分与HIV-1蛋白酶有较好的结合,金银花抗HIV-1蛋白酶活性强于Cathepsin L蛋白酶。金银花水提物、30%醇提物、60%醇提物和85%醇提物具有抗HIV-1的活性,IC_(50)分别为0.14、0.015、0.05、0.121 mg/mL,其中30%醇提物具有较好的抗HIV-1的活性。金银花不同溶剂提取物未发现有强烈抑制组织蛋白酶的活性,实验结果和计算机筛选结果具有一致性。初步明确金银花抗HIV-1蛋白酶和Cathepsin L蛋白酶活性,为抗病毒药物的开发及应用提供理论依据。展开更多
目的:基于分子对接分析复方一枝黄花喷雾剂化学成分与HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶L的结合情况。方法:利用TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology)结合文献构建复方一枝黄花喷雾剂小分子配体库,采用Surflex-Dock模块完...目的:基于分子对接分析复方一枝黄花喷雾剂化学成分与HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶L的结合情况。方法:利用TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology)结合文献构建复方一枝黄花喷雾剂小分子配体库,采用Surflex-Dock模块完成复方一枝黄花喷雾剂与HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶L的分子对接分析。通过Ligplot计算核心成分与HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶L形成的氢键、疏水作用。结果:获得复方一枝黄花喷雾剂活性成分74个,通过分子对接发现,26个活性成分与HIV-1蛋白酶有较好的结合(Total score>7),5个活性成分与Cathepsin L蛋白酶有较好的结合(Total score>7)。Diosmetin与HIV-1蛋白酶相互作用形成四个氢键(Gly27,Gly48,Gly49,Arg8),Harmonyl与HIV-1蛋白酶相互作用形成两个氢键(Arg8,Asp30)。结论:本研究初步筛选复方一枝黄花喷雾剂具有抗HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶L的化学成分,为抗病毒药物的开发提供思路。展开更多
文摘基于分子对接和实验验证分析金银花不同溶剂提取物及主要成分抗RNA病毒蛋白酶的活性。利用TCMSP(traditional Chinese medicine systems pharmacology)构建金银花小分子配体库,采用药物分子设计模拟SYBYL 2.1.1软件分析金银花与HIV-1蛋白酶和Cathepsin L蛋白酶结合情况。通过荧光法验证金银花不同溶剂提取物(水提物、30%醇提物、60%醇提物和85%醇提物)抗HIV-1和Cathepsin L蛋白酶的活性。收集金银花22个化学成分,其中21个活性成分与HIV-1蛋白酶有较好的结合,金银花抗HIV-1蛋白酶活性强于Cathepsin L蛋白酶。金银花水提物、30%醇提物、60%醇提物和85%醇提物具有抗HIV-1的活性,IC_(50)分别为0.14、0.015、0.05、0.121 mg/mL,其中30%醇提物具有较好的抗HIV-1的活性。金银花不同溶剂提取物未发现有强烈抑制组织蛋白酶的活性,实验结果和计算机筛选结果具有一致性。初步明确金银花抗HIV-1蛋白酶和Cathepsin L蛋白酶活性,为抗病毒药物的开发及应用提供理论依据。
文摘目的:基于分子对接分析复方一枝黄花喷雾剂化学成分与HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶L的结合情况。方法:利用TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology)结合文献构建复方一枝黄花喷雾剂小分子配体库,采用Surflex-Dock模块完成复方一枝黄花喷雾剂与HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶L的分子对接分析。通过Ligplot计算核心成分与HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶L形成的氢键、疏水作用。结果:获得复方一枝黄花喷雾剂活性成分74个,通过分子对接发现,26个活性成分与HIV-1蛋白酶有较好的结合(Total score>7),5个活性成分与Cathepsin L蛋白酶有较好的结合(Total score>7)。Diosmetin与HIV-1蛋白酶相互作用形成四个氢键(Gly27,Gly48,Gly49,Arg8),Harmonyl与HIV-1蛋白酶相互作用形成两个氢键(Arg8,Asp30)。结论:本研究初步筛选复方一枝黄花喷雾剂具有抗HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶L的化学成分,为抗病毒药物的开发提供思路。
