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题名牦牛ZP3基因的克隆及蛋白质结构的预测
被引量:5
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作者
徐华伟
字向东
黄磊
陈达文
穆晓琨
王红梅
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机构
西南民族大学高原动物遗传育种与繁殖教育部共建重点实验室
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出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第10期156-161,167,共7页
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基金
四川省科技厅应用基础项目(07JY029-128)
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文摘
本研究对牦牛ZP3基因的编码区进行了克隆,在此基础上对ZP3蛋白的分子结构预测,为研究牦牛受精生物学提供基础。根据GenBank中普通牛的ZP3核苷酸序列设计特异性引物,以牦牛卵巢组织总RNA为模板,通过RT-PCR技术扩增牦牛ZP3基因cDNA序列(GenBank登录号为GQ856646),利用DNAMAN生物软件进行核苷酸和氨基酸序列分析、蛋白质专家系统ExPASy进行ZP3蛋白质分子结构预测。结果表明,扩增出的牦牛ZP3基因编码序列长1 266 bp,编码421个氨基酸。牦牛与牛、猪、狗、人、鼠和鸡ZP3基因核苷酸相应序列的同源性分别为98.42%、96.73%、79.67%、78.71%、69.15%和56.61%,氨基酸同源性分别为98.10%、83.85%、74.24%、70.26%、62.62%和46.12%,符合物种进化规律。预测的ZP3蛋白二级和三级结构显示它是一个具有22个氨基酸信号肽的亲水性β-桶状跨膜蛋白。牦牛ZP3基因编码区的成功克隆,为进一步研究该基因的结构与功能及其在受精过程中的作用提供了基础。
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关键词
牦牛
ZP3基因
克隆
分子结构
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Keywords
Yak ZP3 gene Clone Molecular structures
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分类号
S823
[农业科学—畜牧学]
Q78
[生物学—分子生物学]
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