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两个南方花生主栽品种荚果与叶片基因表达谱分析
被引量:
2
1
作者
陈小平
朱方何
+8 位作者
洪彦彬
刘海燕
张二华
周桂元
李少雄
钟旎
温世杰
李杏瑜
梁炫强
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第8期1378-1388,共11页
利用高密度花生基因表达谱芯片比较遗传背景相似而在产量上存在显著差异的2个南方花生品种粤油7号和汕油523荚果与叶片的基因表达谱。结果表明,汕油523与粤油7号荚果差异表达基因高达1383个,其中上调表达基因662个,下调表达基因721个。...
利用高密度花生基因表达谱芯片比较遗传背景相似而在产量上存在显著差异的2个南方花生品种粤油7号和汕油523荚果与叶片的基因表达谱。结果表明,汕油523与粤油7号荚果差异表达基因高达1383个,其中上调表达基因662个,下调表达基因721个。叶片中差异表达基因有647个,其中上调表达基因234个,下调表达基因413个。基因表达差异在10倍以上的上调和下调基因在荚果中分别有52个和105个,而在叶片中只有2个和5个。功能注释结果表明,差异表达基因集中在细胞内和膜上,而其分子功能主要为结合和催化活性,主要参与代谢、细胞和生物调控等生物过程。在花生荚果和叶片中,还有近一半的差异表达基因的功能未知,表明这2个器官中还有大量的基因尚待发掘。为验证基因芯片数据的可靠性和重复性,选择4个差异表达基因进行实时定量PCR分析,其结果与芯片检测结果吻合。
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关键词
花生栽培种
基因芯片
基因表达谱
差异表达基因
实时定量RT-PCR
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职称材料
题名
两个南方花生主栽品种荚果与叶片基因表达谱分析
被引量:
2
1
作者
陈小平
朱方何
洪彦彬
刘海燕
张二华
周桂元
李少雄
钟旎
温世杰
李杏瑜
梁炫强
机构
广东省农业科学作物研究所
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第8期1378-1388,共11页
基金
现代农业产业技术体系建设专项资金(nycyta-19)
国家自然科学基金项目(30971819
+2 种基金
30900907)
广东省自然科学基金项目(10151064001000002)
粤港关键领域重点突破项目(2008A024200009)资助
文摘
利用高密度花生基因表达谱芯片比较遗传背景相似而在产量上存在显著差异的2个南方花生品种粤油7号和汕油523荚果与叶片的基因表达谱。结果表明,汕油523与粤油7号荚果差异表达基因高达1383个,其中上调表达基因662个,下调表达基因721个。叶片中差异表达基因有647个,其中上调表达基因234个,下调表达基因413个。基因表达差异在10倍以上的上调和下调基因在荚果中分别有52个和105个,而在叶片中只有2个和5个。功能注释结果表明,差异表达基因集中在细胞内和膜上,而其分子功能主要为结合和催化活性,主要参与代谢、细胞和生物调控等生物过程。在花生荚果和叶片中,还有近一半的差异表达基因的功能未知,表明这2个器官中还有大量的基因尚待发掘。为验证基因芯片数据的可靠性和重复性,选择4个差异表达基因进行实时定量PCR分析,其结果与芯片检测结果吻合。
关键词
花生栽培种
基因芯片
基因表达谱
差异表达基因
实时定量RT-PCR
Keywords
Cultivated peanut (Arachis hypogaea L.); Microarray; Gene expression profiles; Differentially expressed genes; Real-time quantitative RT-PCR
分类号
S565.2 [农业科学—作物学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
两个南方花生主栽品种荚果与叶片基因表达谱分析
陈小平
朱方何
洪彦彬
刘海燕
张二华
周桂元
李少雄
钟旎
温世杰
李杏瑜
梁炫强
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
2
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