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题名黄瓜响应高温胁迫转录组分析
被引量:7
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作者
陈雪倩
韩静
任仲海
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机构
山东农业大学园艺科学与工程学院
山东农业大学山东果蔬优质高效生产协同创新中心农业部黄淮地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室
山东农业大学作物生物学国家重点实验室
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出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021年第12期3905-3914,共10页
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基金
国家自然科学基金(31872950
31672170)
+2 种基金
山东省自然科学基金(JQ201309)
山东“双一流”项目(SYL2017YSTD06)
山东省人民政府“泰山学者”基金(ts20130932)共同资助。
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文摘
为了挖掘参与黄瓜热激反应的基因,进一步探索黄瓜的耐热分子机制,本研究以华北型黄瓜品种‘9930’的幼苗为试验材料,对其进行42℃的高温处理,并在处理0、3和6 h后取幼苗的叶片进行转录组测序,分析黄瓜响应高温胁迫的差异表达基因。结果表明与对照热处理0 h相比,在热处理3 h和热处理6 h后共同差异表达的基因有6 082个,其中上调表达的有3 245个,下调表达的有2 388个。GO和KEGG富集分析结果表明这些差异表达基因主要参与代谢途径和蛋白质的合成途径。在差异表达的基因中,有许多Hsp家族的基因,包括Hsp20、Hsp70和Hsp90,并且这些基因受热胁迫诱导上调表达,说明这些基因可能在黄瓜热激反应中发挥正向调节功能。此外,许多转录因子的表达水平也受热诱导而提高,主要包括AP2、MYB、WRKY、b HLH和HSF类转录因子。本研究对黄瓜响应高温胁迫的转录水平变化进行了初步分析,进而挖掘出黄瓜耐热候选基因,将有助于进一步研究黄瓜的耐热分子机制。
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关键词
黄瓜
热胁迫
转录组分析
热激蛋白
热激转录因子
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Keywords
Cucumber
Heat stress
Transcriptome analysis
Heat shock protein
Heat shock transcription factor
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分类号
S642.2
[农业科学—蔬菜学]
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