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12个水牛群体催乳素基因第4外显子遗传特征分析
被引量:
6
1
作者
袁峰
苗永旺
+4 位作者
李大林
汤守锟
许政
霍金龙
祁宏
《Zoological Research》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第6期575-580,共6页
催乳素对水牛乳腺发育、泌乳和乳蛋白基因的表达有明显的调控作用。该研究采用直接测序并结合PCR-SSCP技术,分析沼泽型水牛和河流型水牛12个群体385个个体的催乳素基因(PRL)第4外显子(exon4)的遗传特征。结果表明:水牛PRLexon4由180个...
催乳素对水牛乳腺发育、泌乳和乳蛋白基因的表达有明显的调控作用。该研究采用直接测序并结合PCR-SSCP技术,分析沼泽型水牛和河流型水牛12个群体385个个体的催乳素基因(PRL)第4外显子(exon4)的遗传特征。结果表明:水牛PRLexon4由180个核苷酸组成,在不同物种中具有高度保守性。序列分析发现水牛中该外显子的第109位碱基处有C>T替换,为沉默突变,与泌乳性状之间无显著相关性。在9个沼泽型水牛群体中均检测到该突变位点,其中PBA基因在7个沼泽型水牛群体中为优势基因,PBB基因在德宏和富钟群体中为优势基因,沼泽型水牛群体中PBA基因频率在0.400~0.917之间,群体平均值为0.629±0.049,具有地域分布特征。在3个河流型水牛群体中,第109位核苷酸处均为C,未检测到多态。提示河流型水牛与沼泽型水牛已有较大的遗传分化。
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关键词
河流型水牛
沼泽型水牛
催乳素
Exon4
测序
PCR-SSCP
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职称材料
黑色素皮质素受体1基因对水牛毛色遗传的影响
被引量:
10
2
作者
苗永旺
吴桂生
+6 位作者
王磊
李大林
汤守锟
梁建平
毛华明
罗怀容
张亚平
《中国科学(C辑)》
CSCD
北大核心
2009年第12期1155-1161,共7页
MC1R在很多动物的色素沉积过程中发挥关键作用.为了阐明MC1R基因是否与水牛毛色性状相关,本研究对216头遗传背景清楚的水牛进行了该基因编码区DNA序列测定.研究的样品包括49头黑色河流型水牛(包括摩拉水牛和尼里-拉菲水牛),136头毛色为...
MC1R在很多动物的色素沉积过程中发挥关键作用.为了阐明MC1R基因是否与水牛毛色性状相关,本研究对216头遗传背景清楚的水牛进行了该基因编码区DNA序列测定.研究的样品包括49头黑色河流型水牛(包括摩拉水牛和尼里-拉菲水牛),136头毛色为灰色或白色的沼泽型水牛(包括德宏水牛、滇东南水牛、德昌水牛、贵州水牛和西林水牛)和31头尼里-拉菲水牛或摩拉水牛与沼泽型水牛的杂交后代.序列分析发现在水牛群体中存在3个单核苷酸突变位点(SNPs),其中SNP684是同义替换,而SNP310和SNP384为非同义替换,并分别导致p.G104S和p.M128I氨基酸的改变.只有基因型为河流型等位基因纯合子EBR/EBR的个体毛色表型为黑色.对黑色河流型水牛与灰色沼泽型水牛的杂交后代基因型和毛色表型的分析进一步揭示:河流型等位基因EBR或编码p.104S的等位基因对保证MC1R具有正常功能起重要作用.生物信息学功能分析显示,p.G104S和p.M128I两个氨基酸替换对MC1R的功能有显著影响,进一步支持EBR等位基因或编码p.104S的等位基因与水牛黑色性状相关.
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关键词
水牛
毛色
黑色素皮质素受体1
原文传递
题名
12个水牛群体催乳素基因第4外显子遗传特征分析
被引量:
6
1
作者
袁峰
苗永旺
李大林
汤守锟
许政
霍金龙
祁宏
机构
云南
农业大学动物
科学技术
学院
云南
大学
云南
省生物资源保护与利用重点实验室
云南水牛科学技术研究所
云南
省德宏州潞西市畜牧站
广西畜牧总站
出处
《Zoological Research》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第6期575-580,共6页
基金
云南省应用基础研究重点项目(2007C0003Z)
云南省应用基础研究计划面上项目(2010ZC243)
+3 种基金
云南省应用基础研究计划面上项目(2006C0034M)
国家自然科学基金项目(30660024)
国家高技术研究发展计划("863"计划)项目(2008AA101001)
云南省教育厅科学研究基金项目(2010Y344)
文摘
催乳素对水牛乳腺发育、泌乳和乳蛋白基因的表达有明显的调控作用。该研究采用直接测序并结合PCR-SSCP技术,分析沼泽型水牛和河流型水牛12个群体385个个体的催乳素基因(PRL)第4外显子(exon4)的遗传特征。结果表明:水牛PRLexon4由180个核苷酸组成,在不同物种中具有高度保守性。序列分析发现水牛中该外显子的第109位碱基处有C>T替换,为沉默突变,与泌乳性状之间无显著相关性。在9个沼泽型水牛群体中均检测到该突变位点,其中PBA基因在7个沼泽型水牛群体中为优势基因,PBB基因在德宏和富钟群体中为优势基因,沼泽型水牛群体中PBA基因频率在0.400~0.917之间,群体平均值为0.629±0.049,具有地域分布特征。在3个河流型水牛群体中,第109位核苷酸处均为C,未检测到多态。提示河流型水牛与沼泽型水牛已有较大的遗传分化。
关键词
河流型水牛
沼泽型水牛
催乳素
Exon4
测序
PCR-SSCP
Keywords
River buffalo
Swamp buffalo
Prolactin
Exon 4
Se quencing
PCR-SSCP
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
黑色素皮质素受体1基因对水牛毛色遗传的影响
被引量:
10
2
作者
苗永旺
吴桂生
王磊
李大林
汤守锟
梁建平
毛华明
罗怀容
张亚平
机构
云南
大学
云南
省生物资源保护与利用重点实验室
云南
农业大学动物
科学技术
学院
中国
科学
院昆明植物
研究所
云南水牛科学技术研究所
云南
省德宏州潞西市畜牧站
中国
科学
院昆明动物
研究所
遗传资源与进化国家重点实验室
出处
《中国科学(C辑)》
CSCD
北大核心
2009年第12期1155-1161,共7页
基金
国家自然科学基金(批准号:30660024和30621092)
国家转基因重大专项(批准号:2008ZX08009)
+2 种基金
云南省应用基础研究重点项目(批准号:2007C0003Z)
云南省应用基础研究计划面上项目(批准号:2006C0034M)
国家高技术研究发展计划(批准号:2008AA101001)资助
文摘
MC1R在很多动物的色素沉积过程中发挥关键作用.为了阐明MC1R基因是否与水牛毛色性状相关,本研究对216头遗传背景清楚的水牛进行了该基因编码区DNA序列测定.研究的样品包括49头黑色河流型水牛(包括摩拉水牛和尼里-拉菲水牛),136头毛色为灰色或白色的沼泽型水牛(包括德宏水牛、滇东南水牛、德昌水牛、贵州水牛和西林水牛)和31头尼里-拉菲水牛或摩拉水牛与沼泽型水牛的杂交后代.序列分析发现在水牛群体中存在3个单核苷酸突变位点(SNPs),其中SNP684是同义替换,而SNP310和SNP384为非同义替换,并分别导致p.G104S和p.M128I氨基酸的改变.只有基因型为河流型等位基因纯合子EBR/EBR的个体毛色表型为黑色.对黑色河流型水牛与灰色沼泽型水牛的杂交后代基因型和毛色表型的分析进一步揭示:河流型等位基因EBR或编码p.104S的等位基因对保证MC1R具有正常功能起重要作用.生物信息学功能分析显示,p.G104S和p.M128I两个氨基酸替换对MC1R的功能有显著影响,进一步支持EBR等位基因或编码p.104S的等位基因与水牛黑色性状相关.
关键词
水牛
毛色
黑色素皮质素受体1
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
12个水牛群体催乳素基因第4外显子遗传特征分析
袁峰
苗永旺
李大林
汤守锟
许政
霍金龙
祁宏
《Zoological Research》
CAS
CSCD
北大核心
2010
6
在线阅读
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职称材料
2
黑色素皮质素受体1基因对水牛毛色遗传的影响
苗永旺
吴桂生
王磊
李大林
汤守锟
梁建平
毛华明
罗怀容
张亚平
《中国科学(C辑)》
CSCD
北大核心
2009
10
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