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AlkB同源蛋白5去除前mRNA加工因子6的mRNA甲基化修饰调控肝细胞癌的细胞增殖
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作者 邹岩 李辉 +1 位作者 姜桂春 谢艳敏 《消化肿瘤杂志(电子版)》 2024年第1期67-75,共9页
目的探讨AlkB同源蛋白5(AlkBhomolog5,ALKBH5)在肝细胞癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)的细胞增殖中的作用。方法通过癌症基因组图谱数据库分析ALKBH5和前mRNA加工因子6(pre-mRNA processing factor 6,PRPF6)在HCC组织中的表达水平。... 目的探讨AlkB同源蛋白5(AlkBhomolog5,ALKBH5)在肝细胞癌(hepatocellularcarcinoma,HCC)的细胞增殖中的作用。方法通过癌症基因组图谱数据库分析ALKBH5和前mRNA加工因子6(pre-mRNA processing factor 6,PRPF6)在HCC组织中的表达水平。采用实时荧光定量聚合酶链反应和蛋白质印迹法检测ALKBH5和PRPF6在HCC细胞系(Huh7和Hep3B)中的mRNA和蛋白表达水平。荧光原位杂交确定ALKBH5和PRPF6在HCC细胞系(Huh7和Hep3B)中的亚细胞定位。在免疫沉淀复合物中检测PRPF6的N6-甲基腺苷甲基化水平。通过过表达和敲低基因表达的方法,将Huh7细胞和Hep3B细胞分别进行转染,分组为sh-NC组(阴性对照转染细胞)、sh-ALKBH5实验组(ALKBH5干扰序列转染细胞)、sh-ALKBH5+ex-PRPF6实验组(ALKBH5干扰序列转染+PRPF6 pcDNA 3.1过表达质粒转染细胞),并采用CCK-8和染色增殖试验检测各组细胞的增殖情况。裸鼠异种移植瘤实验验证ALKBH5和PRPF6在体内的生物学功能。蛋白质印迹法检测各组细胞中AKT/mTOR通路相关蛋白的表达水平。结果HCC细胞中ALKBH5的表达上调,可以去除PRPF6的甲基化修饰。体外和体内实验结果显示,ALKBH5可通过调节PRPF6的表达参与HCC细胞的恶性增殖。此外,敲低ALKBH5会抑制丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(serine-threonine kinase,AKT)和哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)的磷酸化,而PRPF6的过表达则有助于AKT和mTOR的磷酸化。结论ALKBH5能促进HCC细胞的增殖,相关机制是通过ALKBH5/PRPF6/AKT/mTOR轴实现的。 展开更多
关键词 Alk B同源蛋白5 mrna加工因子6 N6-甲基腺苷 肝细胞癌 增殖
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野生型和突变型小鼠前体mRNA加工因子31基因克隆及真核表达载体的构建
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作者 袁松涛 李宁东 +2 位作者 左爱军 梁东春 赵堪兴 《眼视光学杂志》 2006年第4期236-239,共4页
目的构建野生型和突变型小鼠前体mRNA加工因子31(pre-mRNA processing factor 31,PRPF31)基因的真核表达载体。方法通过逆转录聚合酶链反应(reverse tran-scriptase polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增小鼠PRPF31野生型全长编码序... 目的构建野生型和突变型小鼠前体mRNA加工因子31(pre-mRNA processing factor 31,PRPF31)基因的真核表达载体。方法通过逆转录聚合酶链反应(reverse tran-scriptase polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增小鼠PRPF31野生型全长编码序列、体外定点突变获得331del12突变型PRPF31的cDNA编码序列,将上述两序列分别克隆入pGEM-T Easy载体,经限制性内切酶NheⅠ和EcoRⅠ双酶切后,再克隆入pTracer-CMV真核表达载体,予DNA测序鉴定。结果PCR成功扩增出野生型和突变型PRPF31基因,DNA序列分析证实两种基因的真核表达载体构建成功。结论野生型和突变型PRPF31基因真核表达载体的构建,为研究PRPF31基因突变引起视网膜色素变性的机制奠定了基础。 展开更多
关键词 前体mrna加工因子31 基因克隆 真核表达载体 视网膜色素变性 小鼠 逆转录聚舍酶链反应/方法
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RNA聚合酶II中的CTD结构在mRNA转录和加工偶联过程中的重要作用 被引量:4
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作者 韩玉波 张飞雄 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期102-106,共5页
RNA聚合酶II最大亚基末端的羧基端结构域(CTD)是由以七氨基酸($CTyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser-)为重复单位的高度保守的重复序列组成的。因其结构与功能上的特殊性,它在近年来受到学术界的广泛关注。诸多的实验表明,该结构可通过与mRNA... RNA聚合酶II最大亚基末端的羧基端结构域(CTD)是由以七氨基酸($CTyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser-)为重复单位的高度保守的重复序列组成的。因其结构与功能上的特殊性,它在近年来受到学术界的广泛关注。诸多的实验表明,该结构可通过与mRNA加工因子的相互作用而对其加工过程产生直接或间接的影响,在mRNA的转录和加工的偶联过程中具有重要的作用。本文即是根据近年来的实验结果对其结构和功能做出的综述性介绍。 展开更多
关键词 RNA聚合酶Ⅱ CTD结构 mrna转录 偶联过程 作用 mrna加工
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长链非编码RNA在mRNA加工过程中的作用 被引量:1
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作者 张静 金倩 +1 位作者 曹鹏博 周钢桥 《生命科学》 CSCD 北大核心 2022年第5期543-553,共11页
长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的RNA分子,几乎不具备蛋白质编码能力,常以RNA形式直接行使功能。已有研究表明,lncRNA参与调控细胞的分化、发育、衰老及疾病的发生和发展等多种生物学过程。lncRNA... 长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的RNA分子,几乎不具备蛋白质编码能力,常以RNA形式直接行使功能。已有研究表明,lncRNA参与调控细胞的分化、发育、衰老及疾病的发生和发展等多种生物学过程。lncRNA可以与DNA、RNA和蛋白质分子等发生相互作用,进而在表观遗传、转录、转录后修饰、翻译及翻译后修饰等多个水平行使功能。其中,一些lncRNA已被证明参与介导m RNA的加工过程,从而在转录后水平调控mRNA分子的命运。lncRNA通过影响mRNA的可变剪接、多聚腺苷酸化、修饰、亚细胞定位、稳定性及翻译等过程,从而调控mRNA的表达或功能。该文通过综述相关研究进展,旨在为发现更多lncRNA的潜在功能提供借鉴。 展开更多
关键词 长链非编码RNA mrna加工 转录后调控
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PRPF31因子对视网膜色素变性影响的研究进展 被引量:1
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作者 李静 毕宏生 宋继科 《国际眼科杂志》 CAS 2024年第12期1932-1938,共7页
剪接因子(SFs)是一种蛋白质,是剪接体的动态复合体的一部分。剪接体就像“剪刀”一样,能够精确地加工真核生物中前mRNA(pre-mRNA),形成多种mRNA序列,该过程对于基因调控和蛋白质表达十分重要。前mRNA加工因子31(PRPF31)是在生物组织中... 剪接因子(SFs)是一种蛋白质,是剪接体的动态复合体的一部分。剪接体就像“剪刀”一样,能够精确地加工真核生物中前mRNA(pre-mRNA),形成多种mRNA序列,该过程对于基因调控和蛋白质表达十分重要。前mRNA加工因子31(PRPF31)是在生物组织中广泛表达的一种SFs, PRPF31突变会特异性地导致常染色体显性视网膜色素变性(adRP),称为PRPF31-RP。目前PRPF31-RP的发病机制尚不清晰。文章从PRPF31突变或缺失导致组织和生物学过程受损的角度对PRPF31在adRP发生发展分子机制及该病治疗的研究进展做一综述,以期为PRPF31-RP的发病机制与防治的研究提供新的思路。 展开更多
关键词 剪接因子 mrna加工因子31(PRPF31) 视网膜色素变性 机制 治疗
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高等植物mRNA3’端形成机制
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作者 郑成超 温孚江 《山东农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 2000年第1期110-114,共5页
植物mRNA3’端加工在基因表达调控中起重要作用,本文着重综述了该领域的最新研究进展。在对动、植物系统进行比较的基础上,提出了Poly(A)信号和Poly(A)信号上游GU丰富区是影响植物mRNA3’端加工的主要顺式作用元件。
关键词 植物 mrna3′端加工 Poly(A)信号 转录 表达调控
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HnRNP A/B蛋白D亚群的生物学功能
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作者 薛传静 刘新光 陈维春 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期996-1004,共9页
核不均一核糖核蛋白(heterogeneous nuclear ribonucleoproteins,hnRNPs)是一类结合DNA和RNA的核蛋白,并能在核质间穿梭.A/B型hnRNPs(heterogeneous nuclear ribonucleoproteins,hnRNP A/B)是hnRNPs中研究最为清楚的一大类别,生物信息... 核不均一核糖核蛋白(heterogeneous nuclear ribonucleoproteins,hnRNPs)是一类结合DNA和RNA的核蛋白,并能在核质间穿梭.A/B型hnRNPs(heterogeneous nuclear ribonucleoproteins,hnRNP A/B)是hnRNPs中研究最为清楚的一大类别,生物信息学分析hnRNP A/B可以区分成A和D两个亚群,已鉴定的D亚群主要成员包括hnRNP AB,D和DL.hnRNP A/B的D亚群均含有2个保守的RNA结合结构域(RNA binding domain,RBD)和1个Gly富集区(glycine-rich domain,GRD),成员间的主要区别在于N端和C端的长度和序列不同.D亚群与pre-mRNA和其它蛋白质结合成微粒系统,参与pre-mRNA的加工、稳定、核输出以及翻译过程.此外,D亚群也能结合单链和双链DNA,参与转录起始和端粒的稳定.因此,hnRNP A/B的D亚群在各个阶段影响基因的表达,在神经系统发育、肿瘤的发生发展及衰老过程中发挥着多样性的功能. 展开更多
关键词 核不均一核糖核蛋白 mrna加工 基因表达 衰老
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斑马鱼ints12的CRISPR/Cas9敲除及其对UsnRNA剪接的调控
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作者 黄思雨 何牡丹 +1 位作者 王厚鹏 孙永华 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期1-8,共8页
整合因子(Integrator)复合体通过调控UsnRNAs(U-rich small nuclear RNAs)的转录成熟过程,影响premRNA的内含子剪切,对生物体内形成成熟mRNA有重要作用。但是在脊椎动物中,整合因子复合体的表达调控及其发育功能研究尚十分缺乏。研究利... 整合因子(Integrator)复合体通过调控UsnRNAs(U-rich small nuclear RNAs)的转录成熟过程,影响premRNA的内含子剪切,对生物体内形成成熟mRNA有重要作用。但是在脊椎动物中,整合因子复合体的表达调控及其发育功能研究尚十分缺乏。研究利用斑马鱼(Danio rerio)模型,通过CRISPR/Cas9技术构建了ints12(Integrator subunit 12)的基因敲除品系,得到了2种缺失不同碱基的突变品系。在ints12的合子突变体(Zints12)中,通过荧光定量PCR分析,发现UsnRNA的3′box剪切存在缺陷。与同龄的野生型斑马鱼相比,Zints12体型偏小且表现为全雄。进一步研究发现,在Zints12成体中,细胞增殖相关因子出现显著下调表达,ints12自身pre-mRNA的加工也出现内含子滞留,表明ints12对自身mRNA的剪切存在一个"自循环"式的调控模式。研究获得了斑马鱼的ints12基因敲除纯合突变体并发现ints12通过调控UsnRNA的剪切参与斑马鱼的个体生长和发育。 展开更多
关键词 ints12 CRISPR/Cas9 UsnRNA mrna加工
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酵母终止子工程:从机理探索到人工设计 被引量:1
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作者 盛月 张根林 《合成生物学》 2020年第6期709-721,共13页
生物系统的复杂性为生物元器件的构建提出了挑战,新型控制元件的发现和稳定可调节的元件设计成为合成生物学的重要内容之一。终止子作为基因元件独立于编码基因行使终止转录的功能,是一种重要的合成生物学控制元件。研究表明终止子作用... 生物系统的复杂性为生物元器件的构建提出了挑战,新型控制元件的发现和稳定可调节的元件设计成为合成生物学的重要内容之一。终止子作为基因元件独立于编码基因行使终止转录的功能,是一种重要的合成生物学控制元件。研究表明终止子作用有强有弱,终止子的选择会直接影响mRNA的量,并且随着终止子结构与功能的逐渐清晰和对转录终止机理的深入解析,以短小、可控、可设计为特征的终止子工程得以快速发展。本文以常规酿酒酵母为基础,系统总结了酿酒酵母中终止子元件在结构发现、功能表征、转录终止机理方面的最新研究进展,并讨论了终止子的人工设计及在途径工程精细调控领域的应用情况,展望了终止子工程面临的挑战、可能的解决途径及在非模式酵母中发展的潜力和意义。这为研究人员开发合成生物学元件和异源合成途径优化提供了科学的理论参考。 展开更多
关键词 酿酒酵母 终止子 mrna加工 转录终止 代谢途径调控
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PRPF3和CHEK1在肝细胞肝癌中的表达水平及临床意义 被引量:2
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作者 梁伟 李娟 +1 位作者 罗中兴 杨晓刚 《国际检验医学杂志》 CAS 2023年第1期116-120,共5页
目的研究肝细胞肝癌(HCC)患者组织中前mRNA加工因子3(PRPF3)和检查点激酶1(CHEK1)的表达水平,探讨两者的临床意义。方法应用R语言分析癌症基因组图谱数据库中HCC癌组织和癌旁组织中PRPF3和CHEK1 mRNA表达水平的差异。利用免疫组化检测... 目的研究肝细胞肝癌(HCC)患者组织中前mRNA加工因子3(PRPF3)和检查点激酶1(CHEK1)的表达水平,探讨两者的临床意义。方法应用R语言分析癌症基因组图谱数据库中HCC癌组织和癌旁组织中PRPF3和CHEK1 mRNA表达水平的差异。利用免疫组化检测该院诊治的86例HCC患者的癌组织和癌旁组织中PRPF3和CHEK1的蛋白表达水平。Spearman秩相关分析癌组织中PRPF3和CHEK1表达水平的相关性。统计学分析癌组织中PRPF3、CHEK1表达水平与临床病理特征的关系。Kaplan-Meier生存分析(Log-rank检验)分析PRPF3、CHEK1表达水平与生存预后的关系。单因素及多因素COX回归分析影响HCC患者生存预后的危险因素。结果TCGA数据库及免疫组化结果,HCC癌组织中PRPF3、CHEK1 mRNA及蛋白表达水平明显高于正常肝组织,差异有统计学意义(均P<0.05)。癌组织中PRPF3与CHEK1蛋白表达水平呈显著正相关(r=0.607,P<0.001)。不同肿瘤TNM分期、病理分级及肝内转移患者癌组织中PRPF3、CHEK1蛋白表达水平差异具有统计学意义(均P<0.05)。癌组织中PRPF3、CHEK1阳性表达患者3年总体生存率明显低于PRPF3、CHEK1阴性表达,差异有统计学意义(均P<0.05)。低分化、TNM分期Ⅱ~Ⅲ期、肝内转移、PRPF3和CHEK1阳性表达是肝细胞肝癌患者不良预后的独立危险因素。结论HCC中PRPF3、CHEK1表达水平升高,两者表达水平与肿瘤TNM分期、病理分级及肝内转移有关,是HCC患者不良生存预后的独立危险因素。 展开更多
关键词 肝细胞肝癌 mrna加工因子3 检查点激酶1 临床意义
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BCLAF1研究进展 被引量:3
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作者 董长江 丁媛媛 张峰 《生命科学》 CSCD 北大核心 2018年第8期848-854,共7页
BCLAF1(Bcl2 associated transcription factor 1,又称为BTF)最初被鉴定为与BCL2家族的抗凋亡成员相互作用的蛋白质。初步研究表明,该蛋白具有细胞凋亡诱导因子和转录抑制因子的作用。但后续的研究表明,BCLAF1在更加广泛的过程中起关键... BCLAF1(Bcl2 associated transcription factor 1,又称为BTF)最初被鉴定为与BCL2家族的抗凋亡成员相互作用的蛋白质。初步研究表明,该蛋白具有细胞凋亡诱导因子和转录抑制因子的作用。但后续的研究表明,BCLAF1在更加广泛的过程中起关键作用,这些过程通常不与BCL2家族成员的作用相关。现总结和概述了BCLAF1所具有的基本结构域和在细胞中的定位,Bclaf1在mRNA的加工成熟、DNA损伤应答(DNA damage response,DDR)、细胞凋亡、细胞衰老、肺泡发育中的功能,以及BCLAF1与肿瘤之间的关系,同时对上述过程中可能的分子机制行了阐述和讨论。 展开更多
关键词 BCLAF1 凋亡 肺发育 mrna加工 DNA损伤应答 肿瘤
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RNA-binding proteins in neurological diseases 被引量:9
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作者 ZHOU HuaLin MANGELSDORF Marie +2 位作者 LIU JiangHong ZHU Li WU Jane Y 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2014年第4期432-444,共13页
Emerging studies support that RNA-binding proteins (RBPs) play critical roles in human biology and pathogenesis. RBPs are essential players in RNA processing and metabolism, including pre-mRNA splicing, polyadenylat... Emerging studies support that RNA-binding proteins (RBPs) play critical roles in human biology and pathogenesis. RBPs are essential players in RNA processing and metabolism, including pre-mRNA splicing, polyadenylation, transport, surveillance, mRNA localization, mRNA stability control, translational control and editing of various types of RNAs. Aberrant expression of and mutations in RBP genes affect various steps of RNA processing, altering target gene function. RBPs have been associ- ated with various diseases, including neurological diseases. Here, we mainly focus on selected RNA-binding proteins including Nova-i/Nova-2, HuR/HuB/HuC/HuD, TDP-43, Fus, Rbfoxl/Rbfox2, QKI and FMRP, discussing their function and roles in human diseases. 展开更多
关键词 RNA-binding proteins post-transcriptional regulation neurological diseases
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