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人类核糖体蛋白加工假基因在进化中的熵变
1
作者
刘国庆
李宏
+1 位作者
王芳平
应智强
《内蒙古大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第6期647-653,共7页
用生物信息学方法计算出人类核糖体蛋白加工假基因(RP加工假基因)的进化距离.假定在统计意义上,不同进化距离的假基因可粗略代表假基因的进化历程.在此假定基础上从信息论的角度去研究假基因在进化中的熵变.结果发现,1)假基因序列的紧...
用生物信息学方法计算出人类核糖体蛋白加工假基因(RP加工假基因)的进化距离.假定在统计意义上,不同进化距离的假基因可粗略代表假基因的进化历程.在此假定基础上从信息论的角度去研究假基因在进化中的熵变.结果发现,1)假基因序列的紧邻碱基关联随进化逐步增强;2)k-mer信息熵中,小k-mer(k=1,2,…,5)信息熵随进化减少,大k-mer(k=7,8)信息熵随进化先迅速减少,随后增加;3)关联信息熵随进化减少,其中紧邻碱基关联信息熵的减少幅度最明显.这些可能与背景突变压力作用有关.
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关键词
加工假基因
紧邻碱基关联
k-mer信息熵
关联
信息熵
背景突变压力
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职称材料
题名
人类核糖体蛋白加工假基因在进化中的熵变
1
作者
刘国庆
李宏
王芳平
应智强
机构
内蒙古大学理工学院物理系
出处
《内蒙古大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第6期647-653,共7页
基金
国家自然科学基金(30660044)
高等学校博士点基金(20050126003)资助项目
文摘
用生物信息学方法计算出人类核糖体蛋白加工假基因(RP加工假基因)的进化距离.假定在统计意义上,不同进化距离的假基因可粗略代表假基因的进化历程.在此假定基础上从信息论的角度去研究假基因在进化中的熵变.结果发现,1)假基因序列的紧邻碱基关联随进化逐步增强;2)k-mer信息熵中,小k-mer(k=1,2,…,5)信息熵随进化减少,大k-mer(k=7,8)信息熵随进化先迅速减少,随后增加;3)关联信息熵随进化减少,其中紧邻碱基关联信息熵的减少幅度最明显.这些可能与背景突变压力作用有关.
关键词
加工假基因
紧邻碱基关联
k-mer信息熵
关联
信息熵
背景突变压力
Keywords
processed pseudogene
adjacent base correlation
k-mer
information entropy
correlation information entropy
background mutational pressure
分类号
Q61 [生物学—生物物理学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人类核糖体蛋白加工假基因在进化中的熵变
刘国庆
李宏
王芳平
应智强
《内蒙古大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2007
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