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circ_1764的鉴定及其在鸡脂肪细胞分化中的功能预测
被引量:
1
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作者
庄重
娄姬英
+8 位作者
杨婷
王来娣
江勇
王志秀
陈世豪
毕瑜林
陈国宏
常国斌
白皓
《中国家禽》
北大核心
2024年第8期14-21,共8页
为探究环状RNA circ_1764在鸡脂肪细胞分化中的重要作用,试验通过PCR扩增和RNase酶消化鉴定鸡circ_1764的存在特性,采用qRT-PCR技术检测circ_1764在鸡组织中的表达情况,利用Miranda、miRDB和Target Scan Human等网站预测鸡circ_1764的...
为探究环状RNA circ_1764在鸡脂肪细胞分化中的重要作用,试验通过PCR扩增和RNase酶消化鉴定鸡circ_1764的存在特性,采用qRT-PCR技术检测circ_1764在鸡组织中的表达情况,利用Miranda、miRDB和Target Scan Human等网站预测鸡circ_1764的调控网络,使用DAVID软件可视化预测靶基因的GO和KEGG富集通路,最后通过转染过表达circ_1764载体,验证生物信息学筛选出的调控网络的准确性。结果显示:鸡体内存在circ_1764,并主要在细胞质中表达,在鸡心脏、肝脏、胸腺和脂肪组织中高表达;circ_1764的预测靶miRNA主要为miR-7441-3p、miR-1656、miR-6578-3p、miR-7452-5p、miR-6645-5p、miR-6563-3p、miR-6607-5p和miR-6581-5p,并且circ_1764在DF-1细胞中过表达可以显著降低上述miRNA的表达;circ_1764靶基因主要集中在代谢、泛素介导的蛋白水解以及MAPK通路中。本研究验证了鸡circ_1764的存在,通过生物信息学预测了鸡circ_1764的调控网络,初步探究circ_1764通过吸附miR-1656、miR-6645-5p等miRNA调控靶基因进而影响鸡脂肪细胞分化的分子机制,为进一步阐明circ_1764调控鸡脂肪细胞分化的机理奠定了基础。
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关键词
鸡
脂肪细胞
circ_1764
鉴定
功能预测
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题名
circ_1764的鉴定及其在鸡脂肪细胞分化中的功能预测
被引量:
1
1
作者
庄重
娄姬英
杨婷
王来娣
江勇
王志秀
陈世豪
毕瑜林
陈国宏
常国斌
白皓
机构
扬州大学动物科学与技术学院
扬州大学农业科技发展研究院
出处
《中国家禽》
北大核心
2024年第8期14-21,共8页
基金
国家肉鸡产业技术体系(CARS-41)
江苏省重点研发计划(现代农业)项目(BE2022341)。
文摘
为探究环状RNA circ_1764在鸡脂肪细胞分化中的重要作用,试验通过PCR扩增和RNase酶消化鉴定鸡circ_1764的存在特性,采用qRT-PCR技术检测circ_1764在鸡组织中的表达情况,利用Miranda、miRDB和Target Scan Human等网站预测鸡circ_1764的调控网络,使用DAVID软件可视化预测靶基因的GO和KEGG富集通路,最后通过转染过表达circ_1764载体,验证生物信息学筛选出的调控网络的准确性。结果显示:鸡体内存在circ_1764,并主要在细胞质中表达,在鸡心脏、肝脏、胸腺和脂肪组织中高表达;circ_1764的预测靶miRNA主要为miR-7441-3p、miR-1656、miR-6578-3p、miR-7452-5p、miR-6645-5p、miR-6563-3p、miR-6607-5p和miR-6581-5p,并且circ_1764在DF-1细胞中过表达可以显著降低上述miRNA的表达;circ_1764靶基因主要集中在代谢、泛素介导的蛋白水解以及MAPK通路中。本研究验证了鸡circ_1764的存在,通过生物信息学预测了鸡circ_1764的调控网络,初步探究circ_1764通过吸附miR-1656、miR-6645-5p等miRNA调控靶基因进而影响鸡脂肪细胞分化的分子机制,为进一步阐明circ_1764调控鸡脂肪细胞分化的机理奠定了基础。
关键词
鸡
脂肪细胞
circ_1764
鉴定
功能预测
Keywords
chicken
adipocyte
circ_1764
identification
functional prediction
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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作者
出处
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1
circ_1764的鉴定及其在鸡脂肪细胞分化中的功能预测
庄重
娄姬英
杨婷
王来娣
江勇
王志秀
陈世豪
毕瑜林
陈国宏
常国斌
白皓
《中国家禽》
北大核心
2024
1
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