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团头鲂cdc20基因的序列特征和表达分析
被引量：
1
1
作者
庞连慧
罗双双
+3 位作者
石林林
陈天圣
刘红
王焕岭
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期226-232,共7页
为研究鱼类细胞分裂周期蛋白20基因(cell division cycle 20 homolog,c dc20)的功能,以团头鲂为试验对象,经PCR扩增获得了团头鲂cdc20基因的CDS,基于多序列比对和系统进化树分析该基因的结构和不同物种间的进化关系,采用半定量PCR(semi-...
为研究鱼类细胞分裂周期蛋白20基因(cell division cycle 20 homolog,c dc20)的功能,以团头鲂为试验对象,经PCR扩增获得了团头鲂cdc20基因的CDS,基于多序列比对和系统进化树分析该基因的结构和不同物种间的进化关系,采用半定量PCR(semi-quantitative reverse transcription PCR,sqRT-PCR)、荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)和切片原位杂交的方法检测了该基因的时空表达模式。结果显示,该基因编码区所包含的序列长度为1482 bp,编码493 aa。团头鲂Cdc20氨基酸序列在进化上十分保守,具有7个WD40基序形成的稳定7叶β螺旋桨状结构,与鲤和斑马鱼的相似性最高。qRT-PCR结果显示团头鲂cdc20基因在早期胚胎中的表达量最高,随后呈下降趋势。sqRT-PCR检测发现cdc20基因主要在性腺中表达。性腺切片原位杂交结果显示cdc20在团头鲂各时期卵母细胞中均有表达,主要集中在Ⅱ期卵母细胞的胞质和Ⅲ、Ⅵ期卵母细胞的卵黄颗粒中;另外也发现该基因在精巢的精原细胞和生精小管的生殖上皮中表达量最高,在精子中的表达较低。以上结果表明团头鲂cdc20基因是一个母源基因,可能参与生殖细胞的发育。
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关键词
团头鲂
cdc20基因
减数分裂
母源
基因
表达模式
性腺成熟
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职称材料
基于生物信息学数据库分析CDC20基因在膀胱癌中的表达及临床意义
2
作者
汪家盛
沈晓鹏
+2 位作者
蒋恩琰
蔡丹丹
沈瑞林
《蚌埠医学院学报》
CAS
2023年第11期1557-1561,共5页
目的:探讨膀胱癌中CDC20基因的表达及其临床预后意义。方法:使用Oncomine数据库和GEPIA数据库分析CDC20基因在膀胱癌中的表达水平。采用Kaplan-Meier Plotter分析CDC20表达水平与膀胱癌病人总体生存时间的关系,采用LinkedOmics数据库分...
目的:探讨膀胱癌中CDC20基因的表达及其临床预后意义。方法:使用Oncomine数据库和GEPIA数据库分析CDC20基因在膀胱癌中的表达水平。采用Kaplan-Meier Plotter分析CDC20表达水平与膀胱癌病人总体生存时间的关系,采用LinkedOmics数据库分析CDC20基因表达与膀胱癌病人年龄及临床病理特征的相关性,通过STRING数据库绘制CDC20有关蛋白网络图,分析蛋白富集的生理过程。结果:膀胱癌组织中CDC20基因的表达水平明显高于正常膀胱组织(P<0.01)。Kaplan-Meier生存分析显示,CDC20高表达的膀胱癌病人生存时间低于CDC20低表达的膀胱癌病人(P<0.05)。STRING数据库分析显示,与CDC20相关的蛋白有FBXO5、CCNB1、AURKA等,主要富集在细胞周期、卵母细胞减数分裂、孕酮介导的卵母细胞成熟、泛素介导的蛋白水解等生理过程。LinkedOmics数据库分析显示,CDC20的表达与病人年龄、人种均有相关关系(P<0.05和P<0.01),与TNM分期及病理分期均无明显相关关系(P>0.05)。结论:CDC20基因在膀胱癌中高表达,且与膀胱癌病人预后负相关。
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关键词
膀胱肿瘤
cdc20基因
预后
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职称材料
香石竹Dccdc20基因的克隆及表达分析
3
作者
李姝影
李枝林
+4 位作者
马璐琳
桂敏
王玉英
赵雪艳
周旭红
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第19期6266-6273,共8页
减数分裂是香石竹遗传改良的重要环节,Cdc20蛋白在减数分裂中起着重要作用。为了更好的了解Cdc20在香石竹减数分裂中的作用机制。本研究利用RT-qPCR结合RACE技术,从香石竹花药中分离克隆了一个Cdc20基因的全长c DNA序列,命名为Dccdc20 (...
减数分裂是香石竹遗传改良的重要环节,Cdc20蛋白在减数分裂中起着重要作用。为了更好的了解Cdc20在香石竹减数分裂中的作用机制。本研究利用RT-qPCR结合RACE技术,从香石竹花药中分离克隆了一个Cdc20基因的全长c DNA序列,命名为Dccdc20 (GenBanK登录号:2217177)。Dccdc20基因全长1 847 bp,含有439个氨基酸,长1 320 bp的开放阅读框。蛋白序列比对显示Dccdc20基因与其他物种的Cdc20基因有很高的相似度,RT-qPCR结果显示Dccdc20基因的表达量随着花药发育呈现递减趋势,在花蕾长度为1.1~1.2 cm时期的花药中表达最高,而在叶和茎中表达量较低,研究表明该基因可能在调节香石竹减数分裂中发挥作用。
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关键词
香石竹(Dianthus
caryophyllus)
cdc20基因
基因
表达
原文传递
题名
团头鲂cdc20基因的序列特征和表达分析
被引量：
1
1
作者
庞连慧
罗双双
石林林
陈天圣
刘红
王焕岭
机构
华中农业大学水产学院/农业农村部淡水生物繁育重点实验室
集美大学水产学院/农业农村部东海海水健康养殖重点实验室
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期226-232,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31872542)。
文摘
为研究鱼类细胞分裂周期蛋白20基因(cell division cycle 20 homolog,c dc20)的功能,以团头鲂为试验对象,经PCR扩增获得了团头鲂cdc20基因的CDS,基于多序列比对和系统进化树分析该基因的结构和不同物种间的进化关系,采用半定量PCR(semi-quantitative reverse transcription PCR,sqRT-PCR)、荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)和切片原位杂交的方法检测了该基因的时空表达模式。结果显示,该基因编码区所包含的序列长度为1482 bp,编码493 aa。团头鲂Cdc20氨基酸序列在进化上十分保守,具有7个WD40基序形成的稳定7叶β螺旋桨状结构,与鲤和斑马鱼的相似性最高。qRT-PCR结果显示团头鲂cdc20基因在早期胚胎中的表达量最高,随后呈下降趋势。sqRT-PCR检测发现cdc20基因主要在性腺中表达。性腺切片原位杂交结果显示cdc20在团头鲂各时期卵母细胞中均有表达,主要集中在Ⅱ期卵母细胞的胞质和Ⅲ、Ⅵ期卵母细胞的卵黄颗粒中;另外也发现该基因在精巢的精原细胞和生精小管的生殖上皮中表达量最高,在精子中的表达较低。以上结果表明团头鲂cdc20基因是一个母源基因,可能参与生殖细胞的发育。
关键词
团头鲂
cdc20基因
减数分裂
母源
基因
表达模式
性腺成熟
Keywords
Megalobrama amblycephala
cdc
20
gene
meiosis
maternal gene
expression pattern
gonad maturity
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
基于生物信息学数据库分析CDC20基因在膀胱癌中的表达及临床意义
2
作者
汪家盛
沈晓鹏
蒋恩琰
蔡丹丹
沈瑞林
机构
蚌埠医学院研究生院
浙江省嘉兴市第二医院泌尿外科
出处
《蚌埠医学院学报》
CAS
2023年第11期1557-1561,共5页
文摘
目的:探讨膀胱癌中CDC20基因的表达及其临床预后意义。方法:使用Oncomine数据库和GEPIA数据库分析CDC20基因在膀胱癌中的表达水平。采用Kaplan-Meier Plotter分析CDC20表达水平与膀胱癌病人总体生存时间的关系,采用LinkedOmics数据库分析CDC20基因表达与膀胱癌病人年龄及临床病理特征的相关性,通过STRING数据库绘制CDC20有关蛋白网络图,分析蛋白富集的生理过程。结果:膀胱癌组织中CDC20基因的表达水平明显高于正常膀胱组织(P<0.01)。Kaplan-Meier生存分析显示,CDC20高表达的膀胱癌病人生存时间低于CDC20低表达的膀胱癌病人(P<0.05)。STRING数据库分析显示,与CDC20相关的蛋白有FBXO5、CCNB1、AURKA等,主要富集在细胞周期、卵母细胞减数分裂、孕酮介导的卵母细胞成熟、泛素介导的蛋白水解等生理过程。LinkedOmics数据库分析显示,CDC20的表达与病人年龄、人种均有相关关系(P<0.05和P<0.01),与TNM分期及病理分期均无明显相关关系(P>0.05)。结论:CDC20基因在膀胱癌中高表达,且与膀胱癌病人预后负相关。
关键词
膀胱肿瘤
cdc20基因
预后
Keywords
bladder neoplasms
cdc
20
gene
prognosis
分类号
R737.14 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
香石竹Dccdc20基因的克隆及表达分析
3
作者
李姝影
李枝林
马璐琳
桂敏
王玉英
赵雪艳
周旭红
机构
云南农业大学园林园艺学院
云南省农业科学院花卉研究所
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第19期6266-6273,共8页
基金
国家自然科学基金(31860570)
云南省万人计划(YNWR-QNBJ-2018-389)
云南省重点研发项目(2018BB010)共同资助。
文摘
减数分裂是香石竹遗传改良的重要环节,Cdc20蛋白在减数分裂中起着重要作用。为了更好的了解Cdc20在香石竹减数分裂中的作用机制。本研究利用RT-qPCR结合RACE技术,从香石竹花药中分离克隆了一个Cdc20基因的全长c DNA序列,命名为Dccdc20 (GenBanK登录号:2217177)。Dccdc20基因全长1 847 bp,含有439个氨基酸,长1 320 bp的开放阅读框。蛋白序列比对显示Dccdc20基因与其他物种的Cdc20基因有很高的相似度,RT-qPCR结果显示Dccdc20基因的表达量随着花药发育呈现递减趋势,在花蕾长度为1.1~1.2 cm时期的花药中表达最高,而在叶和茎中表达量较低,研究表明该基因可能在调节香石竹减数分裂中发挥作用。
关键词
香石竹(Dianthus
caryophyllus)
cdc20基因
基因
表达
Keywords
Carnation(Dianthus caryophyllus)
cdc
20
gene
Gene expression
分类号
S682.19 [农业科学—观赏园艺]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
团头鲂cdc20基因的序列特征和表达分析
庞连慧
罗双双
石林林
陈天圣
刘红
王焕岭
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于生物信息学数据库分析CDC20基因在膀胱癌中的表达及临床意义
汪家盛
沈晓鹏
蒋恩琰
蔡丹丹
沈瑞林
《蚌埠医学院学报》
CAS
2023
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
香石竹Dccdc20基因的克隆及表达分析
李姝影
李枝林
马璐琳
桂敏
王玉英
赵雪艳
周旭红
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
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