期刊文献+
共找到13,252篇文章
< 1 2 250 >
每页显示 20 50 100
基于BSA-Seq定位胡麻耐盐相关基因位点
1
作者 张艳萍 叶春雷 +3 位作者 齐燕妮 陈军 赵玮 柴宗文 《北方园艺》 北大核心 2025年第3期27-34,共8页
以胡麻耐盐材料STS和盐敏感材料DYMS及其杂交后代RIL群体为试材,采用BSA-Seq方法,研究筛选与胡麻抗盐相关的QTLs,以期为胡麻创新培育耐盐种质和分子标记辅助育种提供参考依据。结果表明:经过一系列分析筛选出14个与胡麻耐盐相关的SNP位... 以胡麻耐盐材料STS和盐敏感材料DYMS及其杂交后代RIL群体为试材,采用BSA-Seq方法,研究筛选与胡麻抗盐相关的QTLs,以期为胡麻创新培育耐盐种质和分子标记辅助育种提供参考依据。结果表明:经过一系列分析筛选出14个与胡麻耐盐相关的SNP位点,其中第2号染色体上分布了8个,第3条染色体上分布了2个,第5、6、9号和13号染色体上各分布1个。通过实时荧光定量PCR过表达验证,获得一个候选基因Lus_GLEAN_10024365,其在第2号染色体上,scaffold208号位点5913,基因长度4981 bp。通过注释发现Lus_GLEAN_10024365与胞间连丝胼胝质(β-1,3-葡萄糖聚合物)结合蛋白合成相关,而胼胝质在盐胁迫过程中会有沉积。有关该基因与胼胝质合成与代谢的相关性尚需进一步深入研究。 展开更多
关键词 胡麻 bsa-Seq 抗盐基因
原文传递
基于GWAS和BSA-seq挖掘辣椒果实中辣椒红色素含量的QTL区间及候选基因
2
作者 班国梁 曹亚从 +8 位作者 张正海 于海龙 吴华茂 李戎轩 赵红 张伟丽 聂智星 宋红霞 王立浩 《中国蔬菜》 北大核心 2025年第1期37-45,共9页
辣椒红色素是目前全球销量最大的纯天然可食用色素,培育高辣椒红色素品种为辣椒产业重要任务。通过对255份一年生栽培种辣椒核心种质的辣椒红素含量进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),在第1、2、3、5、6、8、9... 辣椒红色素是目前全球销量最大的纯天然可食用色素,培育高辣椒红色素品种为辣椒产业重要任务。通过对255份一年生栽培种辣椒核心种质的辣椒红素含量进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),在第1、2、3、5、6、8、9、10、11和12号染色体均关联到与辣椒红素含量显著相关的区间,关联区间内共包括93个基因,根据功能注释和转录表达数据预测了3个影响辣椒果实中辣椒红素含量的候选基因。通过对高辣椒红色素材料Pep-340、低辣椒红色素材料Pep-276构建的F2群体进行混合分组分析法-测序(bulked segregant analysis-sequencing,BSA-seq)分析,在第1、3、5和10号染色体定位到与辣椒红色素含量相关区间,其中第3和5号染色体上的定位区间与GWAS分析中的显著相关区间相近或重合;利用这两个区间的In Del分子标记,进行遗传连锁分析,将调控辣椒红色素含量基因定位在3号染色体的q CC3.1,物理位置为22.8~25.9 Mb,其中含有99个基因,根据功能注释和转录组分析,预测了4个影响辣椒果实中辣椒红色素含量的候选基因Capana03g001314、Capana03g001325、Capana03g001334和Capana03g001387。研究结果为调控辣椒中辣椒红色素含量基因精细定位及分子标记辅助选择育种奠定基础。 展开更多
关键词 辣椒 辣椒红色素 GWAS bsa-seq QTL
在线阅读 下载PDF
Regulation of Yield and Eating and Cooking Quality in Rice Through Seed Albumin OsRAL5
3
作者 ZHAO Chunfang HE Lei +9 位作者 GUAN Ju LUO Lei ZHAO Ling ZHOU Lihui YAO Shu CHEN Tao ZHU Zhen ZHAO Qingyong WANG Cailin ZHANG Yadong 《Rice science》 2025年第1期6-10,I0010-I0016,共12页
Seed storage proteins and their abundance are closely related to the formation of rice quality and grain size.A better understanding of the molecular basis of seed storage proteins will provide important information f... Seed storage proteins and their abundance are closely related to the formation of rice quality and grain size.A better understanding of the molecular basis of seed storage proteins will provide important information for developing new rice breeding strategies.In this study,we report that a seed storage protein albumin,named OsRAL5,positively regulates rice quality and grain size.OsRAL5 is specifically expressed during the grain-filling stage,suggesting its key role in regulating seed development.Gene editing of OsRAL5 using the CRISPR/Cas9 system diminished grain size and weight,resulting in the development of white-core endosperm and a reduction in eating and cooking quality(ECQ).Conversely,the endosperm appearance became transparent,and both grain weight and ECQ improved in the OsRAL5 over-expressed lines.The major seed storage components differed significantly between the OsRAL5-edited(dOsRAL5-TS)and OsRAL5-overexpressed(OsRAL5-OE)lines compared with the wild type.The protein and total lipid contents both decreased in the dOsRAL5-TS lines and increased in the OsRAL5-OE lines.Collectively,the over-expression of OsRAL5 significantly increased nutritional content and simultaneously improved yield and ECQ.These results imply that OsRAL5 might be a promising candidate gene for breeding super rice varieties with increased yield potential and superior quality. 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 BREEDING albumin
在线阅读 下载PDF
Prognostic value of preoperative fibrinogen to albumin ratio in predicting postoperative outcomes in patients with gallbladder cancer
4
作者 Peng-Fu Wang Ya-Jian Duan 《World Journal of Gastrointestinal Surgery》 2025年第2期37-44,共8页
BACKGROUND Gallbladder cancer(GBC)is known for its poor prognosis and challenging management.The preoperative fibrinogen to albumin ratio(FAR)has been proposed as a potential prognostic marker for predicting postopera... BACKGROUND Gallbladder cancer(GBC)is known for its poor prognosis and challenging management.The preoperative fibrinogen to albumin ratio(FAR)has been proposed as a potential prognostic marker for predicting postoperative outcomes in GBC patients,but its efficacy and prognostic value remain underexplored.AIM To evaluate the prognostic value of preoperative FAR in GBC outcomes.METHODS This retrospective cohort study included 66 patients who underwent curative surgery for GBC at our institution from January 2018 to January 2022.Preoperative FAR values were obtained within one week prior to surgery.Patients were followed through outpatient visits or telephone interviews,with overall survival(OS)as the primary endpoint.Statistical analyses,including receiver operating characteristic curve analysis and Kaplan-Meier survival estimates,were performed using SPSS software(version 27.0).RESULTS The cohort consisted of 36 male and 30 female patients,with a mean age of 61.81±8.58 years.The optimal FAR cut-off value was determined to be 0.088,with an area under the receiver operating characteristic curve of 0.7899,sensitivity of 68.96%,and specificity of 80.01%.Patients with FAR≤0.088 showed significantly better survival rates(1-year:60.5%,2-year:52.6%,3-year:25.9%)and a median OS of 25.6 months(95%confidence interval:18.8-30.5 months),compared to those with FAR>0.088 who had a median OS of 10.8 months(95%confidence interval:6.3-12.9 months).CONCLUSION Lower preoperative FAR is associated with longer OS in GBC patients,confirming its potential as a valuable prognostic indicator for improving outcome predictions and guiding patient management strategies in gallbladder cancer. 展开更多
关键词 Gallbladder cancer Fibrinogen to albumin ratio Overall survival Prognostic biomarker Surgical outcomes
在线阅读 下载PDF
BSA联合转录组分析发掘西瓜叶片黄化候选基因 被引量:1
5
作者 张朝阳 程瑞 +3 位作者 徐兵划 顾妍 黄大跃 孙玉东 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期165-173,共9页
叶片是植物重要的功能器官之一,不仅是植株进行光合作用的主要场所,也可作为重要的形态标记,应用于育种中。叶片颜色作为形态标记,不仅可用于苗期杂种的清除,亦可用于种子纯度的测定。以西瓜全生育期叶片黄化突变体纯合自交系ly104为母... 叶片是植物重要的功能器官之一,不仅是植株进行光合作用的主要场所,也可作为重要的形态标记,应用于育种中。叶片颜色作为形态标记,不仅可用于苗期杂种的清除,亦可用于种子纯度的测定。以西瓜全生育期叶片黄化突变体纯合自交系ly104为母本(P_(1))、绿叶自交系w3为父本(P_(2)),通过杂交创制F_(1)代、F_(2)代、BC_(1)代群体。遗传分析结果表明,该突变体的叶片黄化由单隐性基因控制。采用混合分组分析(BSA)进行初定位,通过简化基因组测序(RAD)开发全基因组单核苷酸多态性(SNP)标记构建西瓜高密度遗传图谱,将西瓜叶片黄化基因定位于2号染色体13950306~15517591 bp(大小约为1.57 Mb)。以西瓜97103v2为参考基因组,该区间包含24个注释基因。对P_(1)(P1Y)、P_(2)(P2G)和F 2代群体中黄叶(F2Y)、绿叶(F2G)株系进行转录组水平分析,结果表明,目标区间内基因Cla97C02G035950、Cla97C02G036010、Cla97C02G036020、Cla97C02G036060在黄化叶片与正常绿叶材料中的表达量差异显著,可能是西瓜叶片的黄化候选基因。研究结果可为进一步解析西瓜叶片黄化基因功能和生物学特性奠定重要基础。 展开更多
关键词 西瓜 黄化 bsa 遗传图谱 基因定位
在线阅读 下载PDF
Bovine Serum Albumin (BSA) Microspheres Containing Methotrexate (MTX) I.Pharmaceutical Aspects
6
作者 石庭森 陈小平 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS 1993年第1期33-38,共6页
Microspheres Ⅰ,Ⅱ and Ⅲ were produced by emulsion technique.Microsphere I was solidified by glutaraldehyde crosslinking,microsphere Ⅱ was solidified by glutaraldehyde crosslinking and further treated with glycine s... Microspheres Ⅰ,Ⅱ and Ⅲ were produced by emulsion technique.Microsphere I was solidified by glutaraldehyde crosslinking,microsphere Ⅱ was solidified by glutaraldehyde crosslinking and further treated with glycine solution and microsphere Illwas solidified by heating denaturation only.The results showed that the microsphere diameter produced by cross[inking was bigger than that prepared by heating.The microsphere Ⅱ had higher hydrophilicity than Microsphere I had.The methotrexate (MTX) contents in microspheres Ⅰ and Ⅱ were 2.73±0.053%,2.87±0.119% respectively. microsphere Ⅲ was only blank microspheres with MTX adsorbed on their surfaces.In vitro release studies,microspheres I and I have maintained sustained release of MTX till the next day,it was found that the drug releases from microspheres Ⅰ and Ⅱ were governed by Higuchi diffusion law. 展开更多
关键词 Hydrophillic albumin microspheres Emulsion technique METHOTREXATE Drug release kinetics
在线阅读 下载PDF
基于文献计量学BSA在作物育种领域的应用现状与展望
7
作者 张刚 朱林 +2 位作者 聂豪杰 包玉国 程云龙 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期360-372,共13页
为了解国内外集群分离分析法(bulked segregant analysis,BSA)在作物育种领域的研究现状与前沿动态,客观反映各国家、机构及研究人员在该领域的影响力,本文基于文献计量学分析方法使用文献计量分析软件CiteSpace对WOS(Web of Science)... 为了解国内外集群分离分析法(bulked segregant analysis,BSA)在作物育种领域的研究现状与前沿动态,客观反映各国家、机构及研究人员在该领域的影响力,本文基于文献计量学分析方法使用文献计量分析软件CiteSpace对WOS(Web of Science)数据库2000~2023年2111项和CNKI(China National Knowledge Infrastructure)数据库2003~2023年446项研究成果进行关键词共现分析、突显词分析、关键词聚类分析、聚类时间线分析及作者共被引分析。结果表明:BSA在作物育种领域应用的研究成果在国内外的发文趋势相同,国内外期刊发文量均逐年上升;在发文量国家排序中,中国排名第一、美国第二、印度第三。在CNKI数据库中华中农业大学的发文量最多,而在WOS数据库中中国农业科学院的发文量最多。国外BSA在作物育种领域应用的文章主要集中在植物科学、农学、园艺学和遗传学等学科,而国内主要集中在作物学、植物保护学、园艺学、生物学等学科;Michlmore RW、Kosambi DD和Li H这3位作者在该领域的影响力最高,而Michlmore RW、Lander ES、Li H这3位作者与其他作者有更密切的联系。国内研究的热点作物和性状分别是水稻(Oryza sativa)、大豆(Glycine max)、玉米(Zea mays L.)和抗病性、株高;国外研究的热点作物和性状分别是水稻、拟南芥(Arabidopsis thaliana)、小麦(Triticum aestivum L.)和抗病性。目前,BSA在国内集中应用于作物目标性状候选基因及作物突变体突变基因的定位和功能验证,而国外则集中应用于作物目标性状基因的精细定位和功能验证及遗传机制的解析。此外,BSA在作物育种领域应用的研究前沿分析表明,未来在该领域热点研究的对象为水稻、花生(Arachis hypogaea L.)、陆地棉(Gossypium hirsutum L.)、作物突变体和作物代谢产物。 展开更多
关键词 bsa 作物育种 文献计量分析法 CITESPACE
在线阅读 下载PDF
基于BSA-seq的大豆棕色荚皮L2基因定位
8
作者 樊超 毕影东 +5 位作者 李炜 梁文卫 刘淼 刘建新 杨光 邸树峰 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期64-71,共8页
大豆荚皮的颜色是重要的驯化性状和表型特征,与炸荚习性和躲避捕食关系紧密。大豆荚皮颜色主要由2对等位基因控制,其中棕色荚皮L2基因尚未被鉴定。为了在大豆基因组上对该基因进行鉴定,为大豆棕色荚皮相关基因功能解析和育种应用提供一... 大豆荚皮的颜色是重要的驯化性状和表型特征,与炸荚习性和躲避捕食关系紧密。大豆荚皮颜色主要由2对等位基因控制,其中棕色荚皮L2基因尚未被鉴定。为了在大豆基因组上对该基因进行鉴定,为大豆棕色荚皮相关基因功能解析和育种应用提供一定的理论基础。以栽培大豆中龙优203(黄色荚皮)和野生大豆FF1235(黑色荚皮)为亲本构建F 2分离群体进行遗传分析。利用F 2群体棕色豆荚和黄色豆荚单株构建混池进行BSA-seq定位分析,并在此基础上进行重组交换单株分析。结果表明,大豆棕色荚皮性状为1对等位基因控制的质量性状。棕色荚皮L2基因关联区域位于3号染色体0~0.75 Mb的区段。进一步开发InDel分子标记进行精细定位,获得具有多态性的InDel引物7对。最终将棕色荚皮位点定位于3号染色体上的Indel-L2-3~Indel-L2-6,物理距离为344 kb。定位区间内共有候选基因32个,其中Glyma.03G005700基因注释为异丙基苹果酸聚合酶,与已发现的黑色荚皮基因L1(Glyma.19G120400)高度同源,其功能为将4-羟基丙酮酸转化为红果酸和番石榴酸,可能是调控大豆棕色荚皮形成的关键基因。 展开更多
关键词 大豆 荚皮颜色 基因定位 bsa-seq
在线阅读 下载PDF
基于BSA-seq和RNA-seq挖掘西瓜果皮硬度候选基因
9
作者 张敬敬 田鹏 +9 位作者 于洪春 李冰 高秀瑞 刘伟 吴楠 赵鑫泽 宋雪 刘会茹 潘秀清 武彦荣 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第5期63-71,共9页
为了挖掘西瓜果皮硬度关键调控基因,选育耐裂高硬度果皮西瓜品种。以西瓜果皮硬度差异显著的高硬度材料901和低硬度材料BSH为亲本,构建F 2分离群体,采用极端性状混池重测序接合BSA(BSA-seq)方法进行定位,并结合转录组测序(RNA-seq)数据... 为了挖掘西瓜果皮硬度关键调控基因,选育耐裂高硬度果皮西瓜品种。以西瓜果皮硬度差异显著的高硬度材料901和低硬度材料BSH为亲本,构建F 2分离群体,采用极端性状混池重测序接合BSA(BSA-seq)方法进行定位,并结合转录组测序(RNA-seq)数据进行关联分析,挖掘果皮硬度关键调控基因。BSA-seq结果表明,SNPs和InDels关联区域交集位于10号染色体1620000—3760000 bp区间内共2.14 Mb的区段,包含150个候选基因,其中2个非同义突变基因和1个移码突变基因。将BSA-seq测序结果与RNA-seq测序结果进行联合分析发现,共有Cla97C10G187120、Cla97C10G187020、Cla97C10G187430、Cla97C10G187510、Cla97C10G187280和Cla97C10G1865406个基因相关联,经生物信息学分析,确定Cla97C10G187120基因为西瓜果皮硬度候选基因。实时荧光定量(qRT-PCR)试验结果表明,转录组试验数据可靠,并且候选基因Cla97C10G187120在901中表达较BSH明显降低。本研究为进一步精细定位西瓜果皮硬度调控基因奠定了基础。 展开更多
关键词 西瓜 果皮硬度 基因组测序 转录组测序 候选基因
在线阅读 下载PDF
基于BSA-seq技术定位黄瓜黄绿叶色突变基因
10
作者 娄丽娜 羊杏平 +7 位作者 朱凌丽 姚协丰 徐建 张曼 刘广 侯茜 刘金秋 徐锦华 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第9期1711-1718,共8页
为明确课题组从地方收集的黄瓜黄绿叶色突变体中黄绿叶色突变基因,本研究利用绿叶(野生型)与黄绿叶色(突变体)黄瓜材料为亲本,配制正反杂交一代及二代分离群体,在分析黄绿叶色突变基因遗传规律的基础上,利用BSA-seq技术对双亲及F 2代叶... 为明确课题组从地方收集的黄瓜黄绿叶色突变体中黄绿叶色突变基因,本研究利用绿叶(野生型)与黄绿叶色(突变体)黄瓜材料为亲本,配制正反杂交一代及二代分离群体,在分析黄绿叶色突变基因遗传规律的基础上,利用BSA-seq技术对双亲及F 2代叶色极端混池进行测序,筛选黄瓜黄绿叶色突变性状的关联标记及候选基因。结果表明,绿叶色对黄绿叶色为完全显性,黄绿叶色突变基因为隐性基因。突变性状关联分析(SNP-index检测)得到1个与黄绿叶色突变相关的候选区域,位于黄瓜1号染色体上,总长度18484 bp。该候选区域共有118个与黄绿叶色突变相关的SNP位点;候选区域共注释到3个基因,其中CsaV3_1G032820基因为黄瓜黄绿叶色突变最可能相关基因。本研究结果可为黄瓜黄绿叶色突变基因克隆和分子标记辅助育种提供基础。 展开更多
关键词 黄瓜 黄绿叶色突变体 bsa-seq 基因定位
在线阅读 下载PDF
基于BSA-seq法的水稻稻瘟病抗性基因定位
11
作者 陈丽 孙建昌 王昕 《中国稻米》 北大核心 2024年第6期35-41,48,共8页
为挖掘水稻稻瘟病抗性相关性状基因位点,于2022—2023年以水稻2013ZJP-3×京宁11杂交得到的重组自交系群体为试验材料,采用人工接种和自然诱发相结合的方法鉴定其对叶瘟、穗颈瘟的抗性,并采用BSA-seq法进行QTL定位分析。表型鉴定结... 为挖掘水稻稻瘟病抗性相关性状基因位点,于2022—2023年以水稻2013ZJP-3×京宁11杂交得到的重组自交系群体为试验材料,采用人工接种和自然诱发相结合的方法鉴定其对叶瘟、穗颈瘟的抗性,并采用BSA-seq法进行QTL定位分析。表型鉴定结果表明,F11群体的稻瘟病抗性呈连续性分布,且大部分材料表现为中抗,偏向于抗病亲本京宁11。筛选出19个抗性株系和17个感性株系材料,构建了抗感池。经过测序、变异检测和关联分析,共得到2个与稻瘟病抗性相关的区间,主要分布在5号和7号染色体上,区间总长度为1.45 Mb,共筛选出94个差异基因,其中,移码突变基因12个,非同义突变基因82个,移码和非同义突变基因9个。最终预测,基因LOC_Os05g10630、LOC_Os05g10650和LOC_Os07g08960与水稻稻瘟病抗性的相关性较大。 展开更多
关键词 水稻 稻瘟病 bsa-seq 基因定位
在线阅读 下载PDF
Sonocatalytic Damage of Bovine Serum Albumin (BSA) in the Presence of Nanometer Titanium Dioxide (TiO_2) Catalyst 被引量:3
12
作者 Jun WANG Jing WU +6 位作者 Zhao Hong ZHANG Xiang Dong ZHANG Lei WANG Liang XU Bao Dong GUO Hong LI Jian TONG 《Chinese Chemical Letters》 SCIE CAS CSCD 2005年第8期1105-1108,共4页
The sonocatalytic damage of bovine serum albumin (BSA) was studied in the presence of nanometer titanium dioxide (TiO2) powders by low frequency (80 kHz) ultrasound. The destruction of secondary structure and ch... The sonocatalytic damage of bovine serum albumin (BSA) was studied in the presence of nanometer titanium dioxide (TiO2) powders by low frequency (80 kHz) ultrasound. The destruction of secondary structure and change of α-helical structure of BSA were reflected by ultraviolet (UV) and circular dichroism (CD) spectroscopies. 展开更多
关键词 Bovine serum albumin bsa sonocatalytic damage nanometer titanium dioxide (TiO2).
在线阅读 下载PDF
BSA-Seq结合RNA-Seq技术挖掘大豆叶片提前黄化衰老基因 被引量:2
13
作者 李世宽 洪慧龙 +3 位作者 付佳祺 谷勇哲 孙如建 邱丽娟 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期294-309,共16页
大豆产量与其生殖生长的持续时间呈正相关,延缓其开花后叶片的衰老,提高其生理功能,有利于增加植物的粒重。叶片黄化是植物衰老的显著特征之一。关于在大豆鼓粒后期叶片黄化的研究鲜见报道。本研究对鼓粒后期叶片提前黄化突变体ly和野生... 大豆产量与其生殖生长的持续时间呈正相关,延缓其开花后叶片的衰老,提高其生理功能,有利于增加植物的粒重。叶片黄化是植物衰老的显著特征之一。关于在大豆鼓粒后期叶片黄化的研究鲜见报道。本研究对鼓粒后期叶片提前黄化突变体ly和野生型ofc杂交组合进行遗传分析,结果表明,大豆鼓粒后期叶片提前黄化性状受单隐性核基因控制。通过BSA-Seq在19号染色体得到一个2.23Mb的初定位区间,经开发标记图位克隆后将区间缩短至1.75 Mb,区间内有219个基因,再结合RNA-Seq分析,得到了区间内12个候选基因,其中有4个SNP变异基因和8个差异表达基因。本研究结果为大豆鼓粒后期叶片黄化衰老基因的克隆奠定了基础。 展开更多
关键词 大豆 突变体 bsa-Seq RNA-SEQ 图位克隆
在线阅读 下载PDF
基于BSA-seq技术对甘蓝型油菜矮秆性状的显著关联区域和候选基因分析
14
作者 赵卫国 塔娜 +1 位作者 王灏 杨泽林 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第12期1890-1899,共10页
【目的】解析油菜矮秆性状调控遗传位点及关键基因,为油菜株高性状改良和抗倒伏油菜品种选育奠定基础。【方法】利用矮秆油菜DW1分别与高秆油菜WH14和WH20进行正反交,探究F_(1)代和F_(2)代矮秆性状遗传规律。同时,利用BSA-seq技术对油菜... 【目的】解析油菜矮秆性状调控遗传位点及关键基因,为油菜株高性状改良和抗倒伏油菜品种选育奠定基础。【方法】利用矮秆油菜DW1分别与高秆油菜WH14和WH20进行正反交,探究F_(1)代和F_(2)代矮秆性状遗传规律。同时,利用BSA-seq技术对油菜DW1和WH20的F2分离群体中极端高秆和极端矮秆2个DNA混池测序并鉴定矮秆性状的显著关联区域和候选基因。【结果】(1)油菜DW1矮秆性状为质量性状,由1对不完全显性基因控制。(2)在A06染色体21.78—23.88 Mb鉴定到22个与矮秆性状显著关联区,其中置信区间最大为46.71 kb,最小为0.64 kb。(3)在A06染色体上与矮秆性状显著关联区域鉴定到BnaA06g27050D、BnaA06g34100D、BnaA06g34810D、BnaA06g35080D和BnaA06g36480D,其功能涉及植物生长素调控和赤霉素信号转导。【结论】油菜DW1的矮秆性状属于质量性状,由1对不完全显性基因控制。A06染色体上的21.78—23.88 Mb区域为矮秆性状显著关联区域,该区域包含5个候选基因,其功能与植物生长素生物合成和赤霉素信号转导相关。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 矮秆性状 bsa测序 显著关联区域 候选基因
在线阅读 下载PDF
基于BSA-seq技术定位花生种皮颜色基因
15
作者 王恩琪 殷祥贞 +7 位作者 甄萍萍 姜骁 潘丽娟 陈娜 许静 赵旭红 梁成伟 迟晓元 《花生学报》 北大核心 2024年第3期14-20,共7页
花生种皮颜色是花生重要性状,同时种皮颜色和黄酮类化合物例如花青素的含量有着密切关联。定位与种皮颜色相关的基因对培育和开发新品种,提高花生营养成分有重要作用。本研究以紫色种皮花生‘T371’和粉色种皮花生‘T34’为亲本进行杂... 花生种皮颜色是花生重要性状,同时种皮颜色和黄酮类化合物例如花青素的含量有着密切关联。定位与种皮颜色相关的基因对培育和开发新品种,提高花生营养成分有重要作用。本研究以紫色种皮花生‘T371’和粉色种皮花生‘T34’为亲本进行杂交并构建F_2分离群体。基于高通量测序技术,在亲本和分离群体中获得了312.96 G高质量的Clean Reads数据,采用BSA-seq方法定位到1个SNPs和InDels关联区域交集,区间长度为7.61 Mb,位于12号染色体上,区间内有675个基因,其中非同义突变基因14个,移码突变基因3个。根据基因注释结果推测arahy.AFLD8J、arahy.26781N、arahy.YQ76T0、arahy.1KM4NQ、arahy.X3FWT9可能是调控种皮颜色的候选基因。本研究为挖掘花生种皮颜色遗传相关基因和开发新品种提供了一定的理论基础。 展开更多
关键词 花生 bsa-seq 种皮颜色 基因定位
在线阅读 下载PDF
Red cell distribution width-to-albumin ratio is a simple promising prognostic marker in acute cholangitis requiring biliary drainage 被引量:3
16
作者 Fatih Acehan Hüseyin Camli +4 位作者 Cagdas Kalkan Mesut Tez Burak Furkan Demir Emin Altiparmak Ihsan Ates 《Hepatobiliary & Pancreatic Diseases International》 SCIE CAS CSCD 2024年第5期487-494,共8页
Background: It is crucial to assess the severity of acute cholangitis(AC). There are currently several prognostic markers. However, the accuracies of these markers are not satisfied. The present study aimed to investi... Background: It is crucial to assess the severity of acute cholangitis(AC). There are currently several prognostic markers. However, the accuracies of these markers are not satisfied. The present study aimed to investigate the predictive value of the red cell distribution width(RDW)-to-albumin ratio(RAR) for the prognosis of AC. Methods: We retrospectively evaluated consecutive patients diagnosed with AC between May 2019 and March 2022. RAR was calculated, and its predictive ability for in-hospital mortality, intensive care unit(ICU) admission, bacteremia, and the length of hospitalization were analyzed. Results: Out of 438 patients, 34(7.8%) died. Multivariate analysis showed that malignant etiology [odds ratio(OR) = 4.816, 95% confidence interval(CI): 1.936-11.980], creatinine(OR = 1.649, 95% CI: 1.095-2.484), and RAR(OR = 2.064, 95% CI: 1.494-2.851) were independent risk factors for mortality. When adjusted for relevant covariates, including age, sex, malignant etiology, Tokyo severity grading(TSG), Charlson comorbidity index, and creatinine, RAR significantly predicted mortality(adjusted OR = 1.833, 95% CI: 1.280-2.624). When the cut-off of RAR was set to 3.8, its sensitivity and specificity for mortality were 94.1% and 56.7%, respectively. Patients with an RAR of > 3.8 had a 20.9-fold(OR = 20.9, 95% CI: 4.9-88.6) greater risk of mortality than the remaining patients. The area under the curve value of RAR for mortality was 0.835(95% CI: 0.770-0.901), which was significantly higher than that of TSG and the other prognostic markers, such as C-reactive protein-to-albumin ratio, and procalcitonin-to-albumin ratio. Lastly, RAR was not inferior to TSG in predicting ICU admission, bacteremia, and the length of hospitalization. Conclusions: RAR successfully predicted the in-hospital mortality, ICU admission, bacteremia, and the length of hospitalization of patients with AC, especially in-hospital mortality. RAR is a promising marker that is more convenient than TSG and other prognostic markers for predicting the prognosis of patients with AC. 展开更多
关键词 Acute cholangitis albumin Biliary drainage MORTALITY Red blood cell distribution width-to-albumin ratio
在线阅读 下载PDF
基于BSA-seq技术的青花菜花球蜡质基因初定位及鉴定研究
17
作者 陶美奇 张振超 +4 位作者 潘永飞 孙国胜 许丁帆 山溪 姚悦梅 《中国农学通报》 2024年第33期131-140,共10页
为了发掘调控青花菜花球蜡质合成的相关基因,以青花菜有蜡粉野生型(WT20)为父本,无蜡粉突变体(MT20)为母本构建F2群体,基于F2构建极端有蜡混池和无蜡混池,利用BSA-seq技术对亲本混池和F2极端混池进行混池测序,通过ΔSNP-index算法初步... 为了发掘调控青花菜花球蜡质合成的相关基因,以青花菜有蜡粉野生型(WT20)为父本,无蜡粉突变体(MT20)为母本构建F2群体,基于F2构建极端有蜡混池和无蜡混池,利用BSA-seq技术对亲本混池和F2极端混池进行混池测序,通过ΔSNP-index算法初步定位与蜡质合成关联的区间,根据基因注释信息预测候选基因,并采用qRT-PCR分析候选基因在亲本中的表达情况。结果表明F2分离群体中有蜡粉株与无蜡粉株分离比为2.87:1,符合单基因隐性核基因遗传规律;两个混池间共获得高质量SNP位点2,045条、InDel位点687条,基于SNP-index关联分析将候选基因定位在4号、7号和8号染色体的3个区间,包含93个基因。进一步对候选区域内的基因进行KEGG、GO、GOC数据库分析发现0.12 Mb和1.07 Mb的区段内92个基因获得注释,对区间内可能跟蜡质合成相关的11个基因进行定量分析,筛选出4个差异显著表达基因BoAPC3、BoCDH1、BoEEF1A和BoAHP4。本研究结果可以为进一步研究青花菜蜡质合成通路提供新思路,以及为选育高品质青花菜奠定基础。 展开更多
关键词 青花菜 蜡质 bsa-seq 初定位 鉴定 候选基因
在线阅读 下载PDF
基于BSA-seq发掘水稻抽穗期相关QTLs及候选基因
18
作者 魏荣华 尹明 +1 位作者 王文生 崔彦茹 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期12-24,共13页
抽穗期作为水稻重要的性状之一,不仅与水稻生育时期密切相关,还与水稻产量、品质和抗逆性密切相关,决定了水稻品种的种植地区和季节适应性,因此,定位水稻抽穗期相关基因在水稻生产中有着重要的作用。利用HQ20和金23B及其杂交构建的F4群... 抽穗期作为水稻重要的性状之一,不仅与水稻生育时期密切相关,还与水稻产量、品质和抗逆性密切相关,决定了水稻品种的种植地区和季节适应性,因此,定位水稻抽穗期相关基因在水稻生产中有着重要的作用。利用HQ20和金23B及其杂交构建的F4群体为试验材料,根据群体中水稻抽穗期划分3个等级:抽穗期早、抽穗期适中、大青棵(不抽穗),并构建早、中、青3个混池,采用BSA-seq(bulked-segregant analysis sequencing)方法挖掘水稻抽穗期基因。结果表明,BSA-seq结果与参考基因组比对率在94%以上,4×基因组覆盖率在80%以上;基于此,在置信度为0.95时,经SNP-index算法获得位于4条染色体(6、7、8和9号)的17个SNPs与Indels一致的关联区间,进一步分析区域内的候选基因,发现61个基因存在非同义突变。GO与KEGG富集分析表明,与水稻抽穗期密切相关的途径有UDP-糖基转移酶活性、细胞周期G2/M期转变的正向调控和植物激素信号转导等。结合3K水稻数据库中的单倍型分析与已公布的表达量数据,挖掘出3个抽穗期关键候选基因:LOC_Os07g22720、LOC_Os07g23740、LOC_Os08g07200。以上结果为开展水稻抽穗期性状遗传改良以及遗传基础解析奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻 抽穗期 bsa-seq 候选基因
在线阅读 下载PDF
基于BSA-seq技术对乌拉尔图小麦条锈病抗病基因的初步定位 被引量:2
19
作者 倪楠楠 杨小妮 +5 位作者 赵建辉 李子玥 乔柳惠 李广伟 王道文 王换 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期44-51,共8页
【目的】发掘和克隆小麦条锈病抗病基因,为小麦条锈病抗病育种提供遗传基因资源。【方法】以乌拉尔图小麦为材料,通过接种鉴定筛选具有条锈病抗性的材料,利用正向遗传学和混合分组测序分析法(BSA-seq)在乌拉尔图小麦材料中鉴定新的条锈... 【目的】发掘和克隆小麦条锈病抗病基因,为小麦条锈病抗病育种提供遗传基因资源。【方法】以乌拉尔图小麦为材料,通过接种鉴定筛选具有条锈病抗性的材料,利用正向遗传学和混合分组测序分析法(BSA-seq)在乌拉尔图小麦材料中鉴定新的条锈病抗病基因位点。【结果】通过接种鉴定筛选到6个具有小麦条锈病抗性的乌拉尔图小麦材料,通过构建杂交群体结合BSA-seq技术在其中1个抗病材料TuW1中鉴定出1个新的条锈病抗病基因位点,定位于7AS染色体的0~35.2 Mb区间。【结论】通过正向遗传学结合BSA-seq技术在乌拉尔图小麦中鉴定到1个新的条锈病抗病基因位点,为小麦条锈病抗病育种提供了基因资源。 展开更多
关键词 乌拉尔图小麦 条锈病 抗病基因 混合分组测序分析法 遗传定位
在线阅读 下载PDF
2-(2-吡啶)-苯并咪唑Zn(Ⅱ)、Ni(Ⅱ)配合物的合成及其与BSA相互作用研究
20
作者 覃姣兰 黄如川 +2 位作者 袁涛 姚鹏飞 甘永乐 《化学研究与应用》 CAS 北大核心 2024年第5期997-1007,共11页
2-(2-吡啶)-苯并咪唑(2-bd)与Zn(ClO_(4))_(2)·6H_(2)O和Ni(ClO_(4))_(2)·6H_(2)O在无水乙醇溶剂中反应得到[Zn(2-bd)_(3)](ClO_(4))_(2)·(H_(2)O)_(2)(简称:2-bd-Zn)和[Ni(2-bd),](ClO_(4))_(2):(H_(2)O)_(2)(简称:2-bd... 2-(2-吡啶)-苯并咪唑(2-bd)与Zn(ClO_(4))_(2)·6H_(2)O和Ni(ClO_(4))_(2)·6H_(2)O在无水乙醇溶剂中反应得到[Zn(2-bd)_(3)](ClO_(4))_(2)·(H_(2)O)_(2)(简称:2-bd-Zn)和[Ni(2-bd),](ClO_(4))_(2):(H_(2)O)_(2)(简称:2-bd-Ni),两者均属于三斜晶系,空间群P-1。在生理条件下(pH=7.42),利用荧光光谱研究2-bd、2-bd-Zn和2-bd-Ni与牛血清白蛋白(BSA)相互作用。结果表明,在302K、308K、314K三个温度下,2-bd、2-bd-Zn和2-bd-Ni对BSA的猝灭常数K_(q)>10^(10),结合常数K随温度的升高而下降,表明化合物与BSA结合形成复合物,BSA荧光猝灭属于静态猝灭类型。2-bd-Zn和2-bd-Ni与BSA结合的K(10^(5)~10^(6))大于2-bd的K_(a)(10^(3)),大于许多文献报道的Ka值(10^(3)~10^(4)),表明配合物与BSA结合作用较强。2-bd、2-bd-Zn和2-bd-Ni随着浓度的增加,使BSA的紫外可见光谱出现增色现象,使BSA的荧光光谱和Δλ=60nm同步荧光光谱减色且红移,表明化合物改变BSA的微环境,其中2-bd-Zn的作用最明显。位点竞争实验表明,2-bd、2-bd-Zn和2-bd-Ni与BSA亚结构域ⅡA的位点I结合。计算焓变(ΔH)、熵变(ΔS)和吉布斯自由能变化(ΔG)表明,三者与BSA间的作用力主要是氢键和范德华力(ΔH<0、ΔS<0),结合是自发进行(ΔG<0)。 展开更多
关键词 苯并咪唑 金属配合物 牛血清白蛋白 光谱研究 相互作用
在线阅读 下载PDF
上一页 1 2 250 下一页 到第
使用帮助 返回顶部