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组蛋白高乙酰化促进大鼠C6胶质瘤细胞中GDNF基因启动子Ⅱ区RNA POLⅡ的募集
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作者 郭庭文 张宝乐 +3 位作者 李亚东 倪海波 曾振林 线春明 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2022年第19期3472-3476,共5页
目的:探讨大鼠C6胶质瘤细胞中胶质细胞源性神经营养因子(GDNF)启动子Ⅱ区组蛋白高乙酰化引起该基因高转录的机制。方法:采用ChIP-PCR技术检测了大鼠C6星形胶质瘤细胞和正常星形胶质细胞中GDNF启动子I区和Ⅱ区RNA POLⅡ的募集量;利用ChIP... 目的:探讨大鼠C6胶质瘤细胞中胶质细胞源性神经营养因子(GDNF)启动子Ⅱ区组蛋白高乙酰化引起该基因高转录的机制。方法:采用ChIP-PCR技术检测了大鼠C6星形胶质瘤细胞和正常星形胶质细胞中GDNF启动子I区和Ⅱ区RNA POLⅡ的募集量;利用ChIP-PCR技术,检测组蛋白乙酰基转移酶抑制剂姜黄素(Curcumin)和去乙酰化酶抑制剂曲古抑菌素A(TSA)处理C6胶质瘤细胞对GDNF启动子I区和Ⅱ区RNA POLⅡ募集的影响。结果:正常星形胶质细胞和C6胶质瘤细胞中GDNF启动子I区RNA POLⅡ募集量无明显差异;同正常星形胶质细胞相比,C6胶质瘤细胞中GDNF启动子Ⅱ区RNA POLⅡ募集量显著升高。当Curcumin显著降低C6胶质瘤细胞中GDNF启动子Ⅱ区组蛋白乙酰化水平时,RNA POLⅡ募集量显著下调(P<0.05);而当TSA显著升高GDNF启动子Ⅱ区组蛋白乙酰化水平时,RNA POLⅡ募集量显著升高(P<0.05)。结论:在大鼠C6胶质瘤细胞中,GDNF启动子Ⅱ区组蛋白高乙酰化介导的RNA POLⅡ募集量升高可能是其高转录的原因。 展开更多
关键词 GDNF 启动子 乙酰化 rna pol 胶质瘤
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酿酒酵母工业菌株中Ⅱ型启动子介导sgRNA表达的CRISPR/Cas9基因编辑系统的优化
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作者 徐康 侯运华 赵建志 《齐鲁工业大学学报》 CAS 2024年第6期24-32,共9页
CRISPR(clustered regulatory interspersed short palindromic repeat)系统因其高效、无痕、简便等特点已被广泛应用于生物基因编辑研究领域。就微生物基因编辑而言,该系统的研究主要集中于单倍体细胞的基因编辑操作。然而,对于遗传背... CRISPR(clustered regulatory interspersed short palindromic repeat)系统因其高效、无痕、简便等特点已被广泛应用于生物基因编辑研究领域。就微生物基因编辑而言,该系统的研究主要集中于单倍体细胞的基因编辑操作。然而,对于遗传背景更为复杂的多倍体细胞来说,高效基因编辑系统的匮乏是制约工业菌株遗传改造及应用的关键因素。因此,以酿酒酵母二倍体工业菌株为研究对象,构建并系统优化了RNA PolⅡ(PolⅡ)和RNA PolⅢ(PolⅢ)两种启动子驱动sgRNA表达的CRISPR/Cas9基因编辑体系,同时对转化条件进行优化提高多位点基因编辑效率。研究结果表明,PolⅡ启动子可实现3对等位基因(即6个基因)一次性敲除,效率高达68%。随后也对目标基因多位点敲入进行了初步探索。该研究建立的酿酒酵母工业菌株CRISPR/Cas9基因编辑系统为菌株快速遗传改造提供强有力的技术支撑。 展开更多
关键词 二倍体工业酵母 CRISPR/Cas9 rna pol rna pol 基因编辑
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The CREB Regulated Transcription Coactivator 2 Suppresses HIV-1 Transcription by Preventing RNA PolⅡfrom Binding to HIV-1 LTR 被引量:1
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作者 Ling Ma Shumin Chen +11 位作者 Zhen Wang Saisai Guo Jianyuan Zhao Dongrong Yi Quanjie Li Zhenlong Liu Fei Guo Xiaoyu Li Pingping Jia Jiwei Ding Chen Liang Shan Cen 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2021年第4期796-809,共14页
The CREB-regulated transcriptional co-activators(CRTCs),including CRTC1,CRTC2 and CRTC3,enhance transcription of CREB-targeted genes.In addition to regulating host gene expression in response to cAMP,CRTCs also increa... The CREB-regulated transcriptional co-activators(CRTCs),including CRTC1,CRTC2 and CRTC3,enhance transcription of CREB-targeted genes.In addition to regulating host gene expression in response to cAMP,CRTCs also increase the infection of several viruses.While human immunodeficiency virus type 1(HIV-1)long terminal repeat(LTR)promoter harbors a cAMP response element and activation of the cAMP pathway promotes HIV-1 transcription,it remains unknown whether CRTCs have any effect on HIV-1 transcription and HIV-1 infection.Here,we reported that CRTC2 expression was induced by HIV-1 infection,but CRTC2 suppressed HIV-1 infection and diminished viral RNA expression.Mechanistic studies revealed that CRTC2 inhibited transcription from HIV-1 LTR and diminished RNA PolⅡoccupancy at the LTR independent of its association with CREB.Importantly,CRTC2 inhibits the activation of latent HIV-1.Together,these data suggest that in response to HIV-1 infection,cells increase the expression of CRTC2 which inhibits HIV-1 gene expression and may play a role in driving HIV-1 into latency. 展开更多
关键词 Human immunodeficiency virus(HIV) rna polymerase(rna pol) Viral transcription Infection Virology CREB regulated transcription coactivator 2(CRTC2) Long terminal repeat(LTR) Latency
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猪RNA聚合酶Ⅱ单克隆抗体的制备与应用
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作者 田小欢 刘茹 +4 位作者 孙艳 任瑞敏 余梅 赵书红 曹建华 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期2783-2791,共9页
旨在制备猪RNA聚合酶Ⅱ的单克隆抗体并进行初步应用。本研究采用生物信息方法预测免疫原,将其化学合成后免疫5只4~8周龄Bal b/c雌性小鼠,对免疫后呈现阳性的小鼠进行细胞融合试验,取其脾细胞与骨髓瘤细胞进行融合并获得能稳定分泌抗RNA ... 旨在制备猪RNA聚合酶Ⅱ的单克隆抗体并进行初步应用。本研究采用生物信息方法预测免疫原,将其化学合成后免疫5只4~8周龄Bal b/c雌性小鼠,对免疫后呈现阳性的小鼠进行细胞融合试验,取其脾细胞与骨髓瘤细胞进行融合并获得能稳定分泌抗RNA PolⅡ的杂交瘤细胞。鉴定结果显示,RNA PolⅡ单克隆抗体的重链为IgG 2A型,轻链为Kappa型。利用间接ELISA方法对杂交瘤细胞进行筛选和亚克隆,获得了8株稳定分泌RNA PolⅡ单克隆抗体的杂交瘤细胞株。将其初步应用到染色质免疫共沉淀(ChIP-seq)技术,并与商业化抗体的富集性进行比较,结果表明,本研究得到的单克隆抗体富集性更强。本研究获得的猪RNA PolⅡ单克隆抗体可为表观遗传学的研究提供理论基础,并且提供重要的生物学材料。 展开更多
关键词 rna pol 单克隆抗体 杂交瘤细胞
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Human cytomegalovirus RNA2.7 inhibits RNA polymeraseⅡ(PolⅡ)Serine-2 phosphorylation by reducing the interaction between PolⅡand phosphorylated cyclin-dependent kinase 9(pCDK9)
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作者 Yujing Huang Xin Guo +7 位作者 Jing Zhang Jianming Li Mingyi Xu Qing Wang Zhongyang Liu Yanping Ma Ying Qi Qiang Ruan 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2022年第3期358-369,共12页
Human cytomegalovirus(HCMV)is a ubiquitous pathogen belongs to betaherpesvirus subfamily.RNA2.7 is a highly conserved long non-coding RNA accounting for more than 20%of total viral transcripts.In our study,functions o... Human cytomegalovirus(HCMV)is a ubiquitous pathogen belongs to betaherpesvirus subfamily.RNA2.7 is a highly conserved long non-coding RNA accounting for more than 20%of total viral transcripts.In our study,functions of HCMV RNA2.7 were investigated by comparison of host cellular transcriptomes between cells infected with HCMV clinical strain and RNA2.7 deleted mutant.It was demonstrated that RNA polymeraseⅡ(PolⅡ)-dependent host gene transcriptions were significantly activated when RNA2.7 was removed during infection.A145 nt-in-length motif within RNA2.7 was identified to inhibit the phosphorylation of PolⅡSerine-2(PolⅡS2)by reducing the interaction between PolⅡand phosphorylated cyclin-dependent kinase 9(pCDK9).Due to the loss of PolⅡS2 phosphorylation,cellular DNA pre-replication complex(pre-RC)factors,including Cdt1 and Cdc6,were significantly decreased,which prevented more cells from entering into S phase and facilitated viral DNA replication.Our results provide new insights of HCMV RNA2.7 functions in regulation of host cellular transcription. 展开更多
关键词 Human cytomegalovirus(HCMV) rna2.7 rna polymerase(pol) Cyclin-dependent kinase 9(CDK9) PHOSPHORYLATION
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RNA聚合酶Ⅱ转录的ALU序列对HEK293细胞凋亡的影响 被引量:1
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作者 李璇 高建 +7 位作者 杨梅 胡文艳 田绿 彭湃澜 王峰 高昌益 任红 唐开福 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2011年第3期309-312,共4页
目的探讨RNA聚合酶Ⅱ转录的ALU序列对人胚肾293(HEK293)细胞凋亡的影响以及干扰素(IFN)在此机制中的作用。方法取对数生长期的HEK293细胞,分为6组,ALU-293组(瞬时转染重组质粒pcDNA3.1-ALU)、pcDNA3.1-293组[瞬时转染空质粒pcDNA3.1(-)... 目的探讨RNA聚合酶Ⅱ转录的ALU序列对人胚肾293(HEK293)细胞凋亡的影响以及干扰素(IFN)在此机制中的作用。方法取对数生长期的HEK293细胞,分为6组,ALU-293组(瞬时转染重组质粒pcDNA3.1-ALU)、pcDNA3.1-293组[瞬时转染空质粒pcDNA3.1(-),作为阴性对照]、Poly I∶C-293组[瞬时转染dsRNA的多聚肌苷胞苷酸(Poly I∶C),作为阳性对照]、IFNβ-293组(加入1.65×104 U IFNβ,作为阳性对照)、空白对照组(未经处理的HEK293细胞)和HBs-293组(瞬时转染重组质粒pcDNA3.1-HBs),转染后48 h,采用MTT法检测细胞的增殖活性;Cellular DNA Fragmentation ELISA和DNA Ladder法检测细胞的凋亡情况;Real-time PCR检测细胞中IFNβ基因mRNA的水平。结果瞬时转染重组质粒pcDNA3.1-ALU能够抑制HEK293细胞增殖,并促使其凋亡,且细胞中IFNβmRNA的水平显著上调。结论 RNA聚合酶Ⅱ转录的ALU序列能够通过激活干扰素系统来诱导细胞凋亡。 展开更多
关键词 rna聚合酶 ALU元件 细胞凋亡 干扰素类
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Selective recruitment of host factors by HSV-1 replication centers
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作者 Feng-Chao LANG Xin LI +7 位作者 Olga VLADMIROVA Zhuo-Ran LI Gui-Jun CHEN Yu XIAO Li-Hong LI Dan-Feng LU Hong-Bo HAN Ju-Min ZHOU 《Zoological Research》 CAS CSCD 2015年第3期142-151,共10页
Herpes simplex virus type 1(HSV-1) enters productive infection after infecting epithelial cells, where it controls the host nucleus to make viral proteins, starts viral DNA synthesis and assembles infectious virions... Herpes simplex virus type 1(HSV-1) enters productive infection after infecting epithelial cells, where it controls the host nucleus to make viral proteins, starts viral DNA synthesis and assembles infectious virions. In this process, replicating viral genomes are organized into replication centers to facilitate viral growth. HSV-1 is known to use host factors, including host chromatin and host transcription regulators, to transcribe its genes; however, the invading virus also encounters host defense and stress responses to inhibit viral growth. Recently, we found that HSV-1 replication centers recruit host factor CTCF but exclude γH2A.X. Thus, HSV-1 replication centers may selectively recruit cellular factors needed for viral growth, while excluding host factors that are deleterious for viral transcription or replication. Here we report that the viral replication centers selectively excluded modified histone H3, including heterochromatin mark H3K9me3, H3S10 P and active chromatin mark H3K4me3, but not unmodified H3. We found a dynamic association between the viral replication centers and host RNA polymerase II. The centers also recruited components of the DNA damage response pathway, including 53BP1, BRCA1 and host antiviral protein SP100. Importantly, we found that ATM kinase was needed for the recruitment of CTCF to the viral centers. These results suggest that the HSV-1 replication centers took advantage of host signaling pathways to actively recruit or exclude host factors to benefit viral growth. 展开更多
关键词 HSV-1 CTCF γH2AX Viral replication cente rna pol
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单纯疱疹病毒1型立即早期蛋白ICP22研究进展 被引量:1
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作者 陈韵颖 吴英 +1 位作者 汪铭书 程安春 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期245-251,共7页
单纯疱疹病毒1型(Herpes simplex virus 1,HSV-1)感染细胞蛋白22(Infected Cell Protein 22,ICP22)是Us1基因编码的一种翻译后修饰多功能蛋白,为HSV-1的五种立即早期蛋白之一。HSV-1ICP22能与不同的细胞和病毒成分相互作用来执行不... 单纯疱疹病毒1型(Herpes simplex virus 1,HSV-1)感染细胞蛋白22(Infected Cell Protein 22,ICP22)是Us1基因编码的一种翻译后修饰多功能蛋白,为HSV-1的五种立即早期蛋白之一。HSV-1ICP22能与不同的细胞和病毒成分相互作用来执行不同的功能,包括改变RNA聚合酶Ⅱ(RNA polymerase II,RNAPⅡ/PolⅡ)的磷酸化状态、参与抵抗细胞对病毒复制的消极作用、引起细胞周期蛋白A和B水平降低、介导修饰拓扑异构酶Ⅱα、参与胞核内病毒诱导的分子伴侣富集(Virus-induced chaperone-enriched,VICE)区域的形成及促进病毒新生核衣壳的初次包装。这些作用大多与调节病毒在胞核中有效复制相关。此外,HSV-1ICP22还在限制细胞中的病毒复制、病毒致病力和潜伏感染建立过程中发挥重要作用,但ICP22发挥这些作用的机制尚未知。本文就上述目前国内外对HSV ICP22的研究进展作一综述,以期为后续研究提供参考。 展开更多
关键词 单纯疱疹病毒1型(HSV-1) 感染细胞蛋白22(ICP22) rna聚合酶(pol) p53 细胞周期蛋白依赖性激酶1(cdk1) 病毒诱导的伴侣富集 核出芽
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