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全基因组关联分析与PLINK软件的应用 被引量：1
1
作者 李瑞 张引娣 刘奋进 《中国数字医学》 2017年第3期44-45,78,共3页
全基因组关联性分析是近几年发展起来的一种复杂性状的研究方法,与以往的候选基因研究策略所不同的是它不再受预先设定候选基因的限制,从而为进一步了解和控制人类复杂性疾病发生的遗传特征提供了重要的线索。现以1000个样本为例,为了... 全基因组关联性分析是近几年发展起来的一种复杂性状的研究方法,与以往的候选基因研究策略所不同的是它不再受预先设定候选基因的限制,从而为进一步了解和控制人类复杂性疾病发生的遗传特征提供了重要的线索。现以1000个样本为例,为了便于数据分析,用MATLAB软件将每个位点的碱基编码方式转换成数值编码方式,接着用概率统计的思想和MATLAB对数据进行预处理。然后通过PLINK软件对这1000个样本的碱基对进行分析,得出这些位点的曼哈顿图、检验显著性值和发病风险率,最后结合全基因组关联性分析筛选出与疾病有显著性关联的位点是:rs227328。从分析疾病与致病位点关系的过程中可以体会到巧妙运用一些数据处理软件可以减少遗传学研究过程中的成本。 展开更多
关键词 全基因组关联分析 基因识别 plink软件 曼哈顿图
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全基因组数据分析软件PLINK在统计遗传学教学中的应用 被引量：1
2
作者 吕洪超 张瑞杰 +2 位作者 姜永帅 段炼 李晋 《科学中国人》 2016年第10X期245-246,共2页
统计遗传学是一门理论实践相结合的课程,是生物信息学专业重要的必须课程。我们在讲授理论知识的同时,注重培养学生的实践操作技能,引入了PLINK等当前国际流行的统计分析软件。通过指导学生利用PLINK软件对一套类风湿性关节炎的真实案... 统计遗传学是一门理论实践相结合的课程,是生物信息学专业重要的必须课程。我们在讲授理论知识的同时,注重培养学生的实践操作技能,引入了PLINK等当前国际流行的统计分析软件。通过指导学生利用PLINK软件对一套类风湿性关节炎的真实案例的分析,即促进了学生理论联系实际,又激发了学习的积极主动性,为将来顺利开展科研训练打下基础。 展开更多
关键词 统计遗传学 plink软件 关联分析
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