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马缨丹中一个2,3-环氧角鲨烯环化酶基因LaOSC1的鉴定和克隆
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作者 高蝶娜 范志高 冯时茵 《中南药学》 CAS 2024年第4期955-960,共6页
目的鉴定并克隆药用植物马缨丹体内活性成分三萜皂苷生物合成途径的关键限速酶基因2,3-环氧角鲨烯环化酶基因。方法基于序列比对法,从马缨丹的转录组数据中鉴定出候选2,3-环氧角鲨烯环化酶基因,利用生物信息学软件分析其序列特征、预测... 目的鉴定并克隆药用植物马缨丹体内活性成分三萜皂苷生物合成途径的关键限速酶基因2,3-环氧角鲨烯环化酶基因。方法基于序列比对法,从马缨丹的转录组数据中鉴定出候选2,3-环氧角鲨烯环化酶基因,利用生物信息学软件分析其序列特征、预测其编码蛋白的生化特征及其进化关系,设计特异性引物从马缨丹cDNA中扩增该基因并构建克隆载体。结果成功鉴定出一个2,3-环氧角鲨烯环化酶基因LaOSC1,该基因具备OSC基因特有的保守功能域。进化分析结果提示其可能编码β-AS蛋白,可催化2,3-环氧角鲨烯形成β-香树脂醇,并成功构建了LaOSC1的克隆载体。结论成功鉴定并克隆了马缨丹中一个2,3-环氧角鲨烯环化酶基因LaOSC1,为后续对马缨丹体内活性成分的生物合成途径研究奠定了基础。 展开更多
关键词 马缨丹 2 3-环氧角鲨烯环化酶 基因克隆
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藜麦2,3-氧化角鲨烯环化酶基因(CqOSC)家族的全基因组鉴定与分析
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作者 杨博 丁洪霞 +2 位作者 陈方军 郭善利 陈世华 《烟台大学学报(自然科学与工程版)》 2024年第1期46-53,共8页
基于藜麦全基因组和转录组数据,利用生物信息学的方法对藜麦CqOSC基因家族进行了鉴定和系统分析。结果表明,在藜麦基因组中鉴定到15个CqOSC基因家族成员,可分为3个亚组,同亚组CqOSC基因具有相似的基因结构和蛋白Motif结构;在藜麦正常生... 基于藜麦全基因组和转录组数据,利用生物信息学的方法对藜麦CqOSC基因家族进行了鉴定和系统分析。结果表明,在藜麦基因组中鉴定到15个CqOSC基因家族成员,可分为3个亚组,同亚组CqOSC基因具有相似的基因结构和蛋白Motif结构;在藜麦正常生长发育过程中,CqOSC基因家族成员的表达模式存在明显差异,CqOSC7和CqOSC12在花和未成熟的种子及干种子中显著表达,而CqOSC9与CqOSC10在所有组织中均呈现出一定水平的表达;对于MeJA具有不同响应:CqOSC2、CqOSC4和CqOSC8基因表达量变化显著;CqOSC3、CqOSC6和CqOSC15基因表达量变化不明显;整体表现为“低促高抑”:在外施0.5 mmol/L和1 mmol/L MeJA时基因表达量显著上升,在浓度达到2 mmol/L时表达量显著下降。 展开更多
关键词 藜麦 2 3-氧化角鲨烯环化酶 CqOSC基因家族 生物信息学
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植物2,3-氧化鲨烯环化酶的研究进展
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作者 张斌 梁苗苗 +3 位作者 谭政委 孙俊聪 郭妍宏 薛哲勇 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2022年第5期1751-1759,共9页
三萜化合物是一类具有重要生物活性的天然产物,其生物合成途径受到极大的关注,在植物中它们都是由异戊二烯代谢途径,经过2,3-氧化鲨烯环化及羟基化和糖基化修饰产生,2,3-氧化鲨烯环化酶(OSC)催化底物环化生成三萜骨架是三萜结构多样和... 三萜化合物是一类具有重要生物活性的天然产物,其生物合成途径受到极大的关注,在植物中它们都是由异戊二烯代谢途径,经过2,3-氧化鲨烯环化及羟基化和糖基化修饰产生,2,3-氧化鲨烯环化酶(OSC)催化底物环化生成三萜骨架是三萜结构多样和生物活性的基础。本综述对植物OSC基因的研究方法、克隆和功能鉴定、进化及酶结构和催化机制等各个方面的研究进展进行了综述,为植物三萜代谢途径解析,特别是OSC功能的研究提供了依据。最后,从酶挖掘、结构预测和定向进化三个方面展望了植物OSC今后的发展和突破。 展开更多
关键词 三萜 2 3-氧化鲨烯环化酶 研究进展 功能鉴定 酶结构 催化机制 定向进化
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中药三萜皂苷合成通路的生物信息学分析 被引量:4
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作者 张召宝 侯林 +2 位作者 崔清华 潘晴 马鲁豫 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1255-1261,共7页
目的从系统进化学角度对中药三萜皂苷合成通路中关键酶进行生物信息学分析。方法从NCBI数据库下载已有17种中药中的鲨烯合成酶、鲨烯环氧酶、2,3-氧化鲨烯环化酶的蛋白质全长序列,通过生物信息学软件对其进行理化性质分析、保守域分析... 目的从系统进化学角度对中药三萜皂苷合成通路中关键酶进行生物信息学分析。方法从NCBI数据库下载已有17种中药中的鲨烯合成酶、鲨烯环氧酶、2,3-氧化鲨烯环化酶的蛋白质全长序列,通过生物信息学软件对其进行理化性质分析、保守域分析、蛋白质三维结构预测和系统进化树的构建。结果序列分析表明,鲨烯合成酶、鲨烯环氧酶、2,3-氧化鲨烯环化酶的蛋白质序列保守性均较高。其中鲨烯合成酶具有两个高度保守的区域——富含天冬氨酸的镁离子结合位点1和2——可作为认定鲨烯合成酶的依据;鲨烯环氧酶和2,3-氧化鲨烯环化酶的蛋白三维结构保守,无规则卷曲部分为高变区。结论上游合成在进化中趋于保守和稳定;三萜皂苷众多类型的形成可能与下游细胞色素P450、糖基转移酶、β-糖苷酶等的修饰有关。 展开更多
关键词 三萜皂苷 鲨烯合成酶 鲨烯环氧酶 2 3-氧化鲨烯环化酶
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西洋参环氧角鲨烯环化酶基因的克隆、分布与分析 被引量:3
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作者 吴琼 韩艺璇 张建清 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期1052-1055,共4页
目的克隆西洋参皂苷合成下游途径关键酶-环氧角鲨烯环化酶(oxidosqualene cyclases,OSC,EC 4.2.1.B2),分析基因功能及其在不同组织中的表达。方法采用大规模ESTs测序和cDNA末端扩增(RACE)技术,对西洋参中参与达玛烷皂苷合成的环氧角鲨... 目的克隆西洋参皂苷合成下游途径关键酶-环氧角鲨烯环化酶(oxidosqualene cyclases,OSC,EC 4.2.1.B2),分析基因功能及其在不同组织中的表达。方法采用大规模ESTs测序和cDNA末端扩增(RACE)技术,对西洋参中参与达玛烷皂苷合成的环氧角鲨烯环化酶基因(OSC)进行克隆和研究。结果获得了西洋参环氧角鲨烯环化酶(OSC)基因全长cDNA,命名为PqDS(GenBank注册号:GU997679),其核苷酸序列长度为2 310 bp,含有1个开放阅读框编码769个氨基酸的蛋白。保守结构域搜索显示PqDS含有环氧角鲨烯环化酶(OSC)共有的活性位点和保守基序。信号肽分析(Singal P3.0)表明西洋参PqDS属于非分泌型蛋白。采用实时荧光定量PCR(Real-time PCR)研究了PqDS基因在各个器官中的表达,结果显示在花中高表达,根、叶和茎中表达量相对较低。结论首次克隆了西洋参环氧角鲨烯环化酶(PqDS)基因全长序列,为研究该酶在植物体内的表达、功能与作用机制奠定了基础。 展开更多
关键词 西洋参 环氧角鲨烯环化酶 分子克隆 实时荧光定量PCR
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微生物合成植物三萜及其皂苷化合物 被引量:4
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作者 薛海洁 孙文涛 +2 位作者 赵雨佳 王颖 李春 《生物产业技术》 2019年第1期19-26,共8页
植物三萜及其皂苷化合物普遍存在于植物中,具有抗炎、抗过敏、保肝护肝等多种生物活性,因此被广泛应用于医药、农业和食品等多个行业。目前,植物三萜及其皂苷化合物的主要来源是从植物中直接提取,这种方式不仅消耗大量的人力物力而且会... 植物三萜及其皂苷化合物普遍存在于植物中,具有抗炎、抗过敏、保肝护肝等多种生物活性,因此被广泛应用于医药、农业和食品等多个行业。目前,植物三萜及其皂苷化合物的主要来源是从植物中直接提取,这种方式不仅消耗大量的人力物力而且会带来严重的环境问题。随着合成生物学及组学技术的快速发展,微生物因其生长快速、操作方便等优势成为广泛应用的宿主,这为替代传统的供应方式提供了可行的方法。然而,植物三萜类化合物复杂的合成途径和外源途径的代谢不平衡严重限制了其生产。综述了植物三萜及其皂苷化合物的生物合成途径,以及利用微生物细胞工厂合成三萜及其皂苷化合物的方法,并探讨了其高效微生物合成的策略。 展开更多
关键词 植物三萜及其皂苷化合物 微生物细胞工厂 氧化鲨烯环化酶 细胞色素P450酶 葡萄糖基转移酶
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Molecular cloning and functional characterization of multiple ApOSCs from Andrographis paniculata 被引量:3
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作者 WANG Jian LIN Hui-Xin +6 位作者 ZHAO Huan GUO Juan SU Ping YANG Jian WU Xiao-Yi HUANG Lu-Qi GAO Wei 《Chinese Journal of Natural Medicines》 SCIE CAS CSCD 2020年第9期659-665,共7页
Triterpenoids have been described in Andrographis paniculata. Oleanolic acid exhibits high biological activity and is widely used in the clinic, and β-sitosterol not only has good biological activity but also plays a... Triterpenoids have been described in Andrographis paniculata. Oleanolic acid exhibits high biological activity and is widely used in the clinic, and β-sitosterol not only has good biological activity but also plays an important physiological role in plants.However, analysis of the biosynthetic pathway of triterpenoids in Andrographis paniculata has not been reported. Here, we provide the first report of the isolation and identification of nine 2, 3-oxidosqualene cyclases(ApOSC3 to ApOSC11) from A. paniculata. The results showed that ApOSC4 represented a monofunctional synthase that could convert 2, 3-oxidosqualene to β-amyrin. ApOSC5 as a bifunctional 2, 3-oxidosqualene cyclases, could transfer 2, 3-oxidosqualene to β-amyrin and α-amyrin. ApOSC6 to ApOSC8 composed the multifunctional 2, 3-oxidosqualene cyclases that could convert 2, 3-oxidosqualene to β-amyrin, α-amyrin and one or two undetermined triterpenoids. This study provides a better understanding of the biosynthetic pathway of triterpenoids in A. paniculata, and the discovery of multifunctional 2, 3-oxidosqualene cyclases ApOSC5 to ApOSC8 of the facilitates knowledge of the compounds diversity in A. paniculata. 展开更多
关键词 TRITERPENOIDS 2 3-oxidosqualene cyclases A.paniculata β-Amyrin α-Amyrin
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Functional characterization of triterpene synthases in Cibotium barometz
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作者 Zhongju Ji Baolian Fan +7 位作者 Yidu Chen Jingyang Yue Jiabo Chen Rongrong Zhang Yi Tong Zhongqiu Liu Jincai Liang Lixin Duan 《Synthetic and Systems Biotechnology》 SCIE CSCD 2023年第3期437-444,共8页
Cibotium barometz(Linn.)J.Sm.,a tree fern in the Dicksoniaceae family,is an economically important industrial exported plant in China and widely used in Traditional Chinese Medicine.C.barometz produces a range of bioa... Cibotium barometz(Linn.)J.Sm.,a tree fern in the Dicksoniaceae family,is an economically important industrial exported plant in China and widely used in Traditional Chinese Medicine.C.barometz produces a range of bioactive triterpenes and their metabolites.However,the biosynthetic pathway of triterpenes in C.barometz remains unknown.To clarify the origin of diverse triterpenes in C.barometz,we conducted de novo transcriptome sequencing and analysis of C.barometz rhizomes and leaves to identify the candidate genes involved in C.barometz triterpene biosynthesis.Three C.barometz triterpene synthases(CbTSs)candidate genes were obtained.All of them were highly expressed in C.barometz rhizomes,consisting of the accumulation pattern of triterpenes in C.barometz.To characterize the function of these CbTSs,we constructed a squalene-and oxidosqualene-overproducing yeast chassis by overexpressing all the enzymes in the MVA pathway under the control of GAL-regulated promoter and disrupted the GAL80 gene in Saccharomyces cerevisiae simultaneously.Heterologous expressing CbTS1,CbTS2,and CbTS3 in engineering yeast strain produced cycloartenol,dammaradiene,and diploptene,respectively.Phylogenetic analysis revealed that CbTS1 belongs to oxidosqualene cyclase,while CbTS2 and CbTS3 belong to squalene cyclase.These results decipher enzymatic mechanisms underlying the origin of diverse triterpene in C.barometz. 展开更多
关键词 2 3-oxidosqualene cyclase Squalene cyclase Cibotium barometz Triterpene biosynthesis
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