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随机光学重构显微术及其应用研究进展
被引量:
5
1
作者
杨建宇
潘雷霆
+2 位作者
胡芬
张心正
许京军
《红外与激光工程》
EI
CSCD
北大核心
2017年第11期59-66,共8页
在光学显微成像领域,涌现出一批可以突破衍射极限的超分辨显微成像技术,极大地增强了人们研究亚细胞结构的能力。基于单分子定位技术的随机光学重构显微术(Stochastic Optical Reconstruction Microscopy,STORM)具有易懂的成像原理、简...
在光学显微成像领域,涌现出一批可以突破衍射极限的超分辨显微成像技术,极大地增强了人们研究亚细胞结构的能力。基于单分子定位技术的随机光学重构显微术(Stochastic Optical Reconstruction Microscopy,STORM)具有易懂的成像原理、简单的工作方式以及超高的分辨率等特点,受到越来越多的研究者青睐。首先,介绍了单分子定位技术的原理,讨论了STORM光路的搭建,阐述了二维和三维STORM超分辨显微成像原理。其次,探讨了多色STORM以及STORM与电镜关联成像现状。最后介绍了STORM技术现阶段的应用进展。
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关键词
超分辨成像
单分子定位
随机光学重构显微术
关联成像
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职称材料
超分辨显微成像技术在活细胞成像中的应用与发展
被引量:
6
2
作者
张娇
何勤
+3 位作者
武泽凯
于斌
屈军乐
林丹樱
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期1301-1315,共15页
超分辨显微成像技术(super-resolution microscopy,SRM)可以绕过光学衍射极限对成像分辨率的限制,让以前观察不到的纳米级结构实现可视化,这一重大研究进展推动了现代生命科学和生物医学研究的进步与发展.细胞是生物体的基本组成单位,...
超分辨显微成像技术(super-resolution microscopy,SRM)可以绕过光学衍射极限对成像分辨率的限制,让以前观察不到的纳米级结构实现可视化,这一重大研究进展推动了现代生命科学和生物医学研究的进步与发展.细胞是生物体的基本组成单位,对活细胞内部的细微结构和动力学过程进行研究是掌握生命本质必不可少的途径.但由于成像原理或条件的限制,早期的SRM技术在活细胞成像应用方面受到了不同程度的限制.近几年来,随着SRM和相关技术的发展,SRM在活细胞成像研究中的应用也越来越多.本文简要介绍目前常见的几种SRM技术的基本原理和特点,并在此基础上着重阐述它们在活细胞成像应用中所取得的最新研究进展和发展方向.
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关键词
随机光学重构显微术
受激发射损耗
显
微
术
结构光照明
显
微
术
超分辨成像
活细胞成像
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职称材料
超分辨率成像荧光探针材料应用进展
被引量:
3
3
作者
刘志贺
吴长锋
《中国光学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期344-362,共19页
为了进一步认知复杂环境中的细胞生物学过程,研究人员发展了各种各样的生物成像技术。在这些技术中,生物荧光成像因简单的成像条件以及对生物样品的相容性而得到了广泛的发展。然而,传统的荧光成像技术受到了光学衍射极限的限制,无法分...
为了进一步认知复杂环境中的细胞生物学过程,研究人员发展了各种各样的生物成像技术。在这些技术中,生物荧光成像因简单的成像条件以及对生物样品的相容性而得到了广泛的发展。然而,传统的荧光成像技术受到了光学衍射极限的限制,无法分辨低于200 nm的空间结构,阻碍了对亚细胞结构的生物学过程研究。超分辨荧光显微镜技术突破了传统光学衍射对成像分辨率的限制,能够获取纳米尺度的细胞动态过程。除了对传统的宽场荧光显微镜框架的改进及升级改造之外,目前典型的超分辨成像显微镜技术通常依赖于荧光探针材料的光物理性质。常用的荧光探针材料包括荧光蛋白、有机荧光分子和纳米荧光材料等。本文介绍了几种主流的超分辨荧光显微成像技术并总结了已经成功应用到超分辨生物荧光成像中的荧光探针材料的应用进展。
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关键词
超分辨荧光成像
受激发射损耗
显
微
镜
光激活定位荧光
显
微
术
随机光学重构显微术
超分辨
光学
涨落成像
荧光探针
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职称材料
基于深度学习的细胞骨架图像超分辨重建
被引量:
17
4
作者
胡芬
林洋
+4 位作者
侯梦迪
胡浩丰
潘雷霆
刘铁根
许京军
《光学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020年第24期48-55,共8页
21世纪初诞生的超分辨光学成像技术在生命科学研究中发挥着巨大作用,极大地增强了人们探索微纳尺度亚细胞结构的能力,然而这些成像技术往往耗时长,成本高。如今,许多研究者致力于基于深度学习的图像超分辨重建算法的研究中。利用自主搭...
21世纪初诞生的超分辨光学成像技术在生命科学研究中发挥着巨大作用,极大地增强了人们探索微纳尺度亚细胞结构的能力,然而这些成像技术往往耗时长,成本高。如今,许多研究者致力于基于深度学习的图像超分辨重建算法的研究中。利用自主搭建的随机光学重构超分辨显微镜获得细胞微管骨架超分辨图像,然后采用双线性插值降采样法处理得到低分辨率输入图集,再分别使用传统的三次样条插值法和增强型深度超分辨率神经网络进行学习训练,实现低分辨率图像的超分辨重建。结果表明:通过深度学习所重建的各种降采样的图像效果均优于采用传统插值法得到的图像效果,尤其是二倍降采样重建图像在主观和客观评价指标上可比拟实验获得的微管骨架超分辨图像。基于增强型深度超分辨率神经网络的细胞骨架图像超分辨重建有望提供一种简捷、有效和高性价比的成像方法,可应用于对细胞骨架超微结构的快速预测。
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关键词
图像处理
深度学习
图像超分辨重建
随机光学重构显微术
细胞骨架
原文传递
题名
随机光学重构显微术及其应用研究进展
被引量:
5
1
作者
杨建宇
潘雷霆
胡芬
张心正
许京军
机构
南开大学物理科学学院泰达应用物理研究院弱光非线性光子学教育部重点实验室
南开大学生物治疗协同创新中心
出处
《红外与激光工程》
EI
CSCD
北大核心
2017年第11期59-66,共8页
基金
国家自然科学基金(11574165)
111计划(B07013)
长江学者和创新团队发展计划资助课题(IRT_13R29)
文摘
在光学显微成像领域,涌现出一批可以突破衍射极限的超分辨显微成像技术,极大地增强了人们研究亚细胞结构的能力。基于单分子定位技术的随机光学重构显微术(Stochastic Optical Reconstruction Microscopy,STORM)具有易懂的成像原理、简单的工作方式以及超高的分辨率等特点,受到越来越多的研究者青睐。首先,介绍了单分子定位技术的原理,讨论了STORM光路的搭建,阐述了二维和三维STORM超分辨显微成像原理。其次,探讨了多色STORM以及STORM与电镜关联成像现状。最后介绍了STORM技术现阶段的应用进展。
关键词
超分辨成像
单分子定位
随机光学重构显微术
关联成像
Keywords
super-resolution imaging
single molecule localization
Stochastic Optical ReconstructionMicroscopy
correlative imaging
分类号
O439 [机械工程—光学工程]
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职称材料
题名
超分辨显微成像技术在活细胞成像中的应用与发展
被引量:
6
2
作者
张娇
何勤
武泽凯
于斌
屈军乐
林丹樱
机构
深圳大学生物医学光子学研究中心/物理与光电工程学院
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期1301-1315,共15页
基金
国家自然科学基金(61775144,61975131,61620106016,61525503,61835009)
广东省自然科学基金(2018A030313362)
深圳市科技计划(JCYJ20170818144012025,JCYJ20200109105411133,JCYJ20170818141701667,JCYJ20170412105003520)资助项目.
文摘
超分辨显微成像技术(super-resolution microscopy,SRM)可以绕过光学衍射极限对成像分辨率的限制,让以前观察不到的纳米级结构实现可视化,这一重大研究进展推动了现代生命科学和生物医学研究的进步与发展.细胞是生物体的基本组成单位,对活细胞内部的细微结构和动力学过程进行研究是掌握生命本质必不可少的途径.但由于成像原理或条件的限制,早期的SRM技术在活细胞成像应用方面受到了不同程度的限制.近几年来,随着SRM和相关技术的发展,SRM在活细胞成像研究中的应用也越来越多.本文简要介绍目前常见的几种SRM技术的基本原理和特点,并在此基础上着重阐述它们在活细胞成像应用中所取得的最新研究进展和发展方向.
关键词
随机光学重构显微术
受激发射损耗
显
微
术
结构光照明
显
微
术
超分辨成像
活细胞成像
Keywords
stochastic optical reconstruction microscopy
stimulated emission depletion microscopy
structured illumination microscopy
super-resolution imaging
live cell imaging
分类号
Q81 [生物学—生物工程]
Q63 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
超分辨率成像荧光探针材料应用进展
被引量:
3
3
作者
刘志贺
吴长锋
机构
吉林大学集成光电子国家重点联合实验室电子科学与工程学院
南方科技大学生物医学工程系
出处
《中国光学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期344-362,共19页
基金
国家自然科学基金(NO.61335001
No.81771930)
深圳市科技创新委员会基金(No.JCYJ20170307110157501)~~
文摘
为了进一步认知复杂环境中的细胞生物学过程,研究人员发展了各种各样的生物成像技术。在这些技术中,生物荧光成像因简单的成像条件以及对生物样品的相容性而得到了广泛的发展。然而,传统的荧光成像技术受到了光学衍射极限的限制,无法分辨低于200 nm的空间结构,阻碍了对亚细胞结构的生物学过程研究。超分辨荧光显微镜技术突破了传统光学衍射对成像分辨率的限制,能够获取纳米尺度的细胞动态过程。除了对传统的宽场荧光显微镜框架的改进及升级改造之外,目前典型的超分辨成像显微镜技术通常依赖于荧光探针材料的光物理性质。常用的荧光探针材料包括荧光蛋白、有机荧光分子和纳米荧光材料等。本文介绍了几种主流的超分辨荧光显微成像技术并总结了已经成功应用到超分辨生物荧光成像中的荧光探针材料的应用进展。
关键词
超分辨荧光成像
受激发射损耗
显
微
镜
光激活定位荧光
显
微
术
随机光学重构显微术
超分辨
光学
涨落成像
荧光探针
Keywords
super-resolution fluorescence imaging
stimulated emission depletion microscopy
photoactivated localization fluoroscopy
stochastic optical reconstruction microscopy
super-resolution optical fluctuation imaging
fluorescent probes
分类号
R318.51 [医药卫生—生物医学工程]
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职称材料
题名
基于深度学习的细胞骨架图像超分辨重建
被引量:
17
4
作者
胡芬
林洋
侯梦迪
胡浩丰
潘雷霆
刘铁根
许京军
机构
弱光非线性光子学教育部重点实验室
天津大学精密仪器与光电子工程学院
药物化学生物学国家重点实验室
极端光学协同创新中心
出处
《光学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020年第24期48-55,共8页
基金
国家自然科学基金(11874231,31801134)
天津市自然科学基金(18JCQNJC02000)
+1 种基金
长江学者和创新团队发展计划(IRT13R29)
中央高校基本科研业务费专项资金(2122019446)。
文摘
21世纪初诞生的超分辨光学成像技术在生命科学研究中发挥着巨大作用,极大地增强了人们探索微纳尺度亚细胞结构的能力,然而这些成像技术往往耗时长,成本高。如今,许多研究者致力于基于深度学习的图像超分辨重建算法的研究中。利用自主搭建的随机光学重构超分辨显微镜获得细胞微管骨架超分辨图像,然后采用双线性插值降采样法处理得到低分辨率输入图集,再分别使用传统的三次样条插值法和增强型深度超分辨率神经网络进行学习训练,实现低分辨率图像的超分辨重建。结果表明:通过深度学习所重建的各种降采样的图像效果均优于采用传统插值法得到的图像效果,尤其是二倍降采样重建图像在主观和客观评价指标上可比拟实验获得的微管骨架超分辨图像。基于增强型深度超分辨率神经网络的细胞骨架图像超分辨重建有望提供一种简捷、有效和高性价比的成像方法,可应用于对细胞骨架超微结构的快速预测。
关键词
图像处理
深度学习
图像超分辨重建
随机光学重构显微术
细胞骨架
Keywords
image processing
deep learning
image super-resolution reconstruction
stochastic optical reconstruction microscopy
cytoskeleton
分类号
O439 [机械工程—光学工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
随机光学重构显微术及其应用研究进展
杨建宇
潘雷霆
胡芬
张心正
许京军
《红外与激光工程》
EI
CSCD
北大核心
2017
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
超分辨显微成像技术在活细胞成像中的应用与发展
张娇
何勤
武泽凯
于斌
屈军乐
林丹樱
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2021
6
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
超分辨率成像荧光探针材料应用进展
刘志贺
吴长锋
《中国光学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2018
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
基于深度学习的细胞骨架图像超分辨重建
胡芬
林洋
侯梦迪
胡浩丰
潘雷霆
刘铁根
许京军
《光学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2020
17
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