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冷冻原肠浸泡解冻池水细菌多样性分析
被引量:
2
1
作者
仇保丰
宋鸿雁
+4 位作者
董蓉莲
高雪梅
蒋荧梅
顾炳泉
胡顺林
《动物医学进展》
北大核心
2017年第5期43-48,共6页
为了研究冷冻原肠浸泡解冻池水的细菌多样性,采集3份水样直接提取细菌基因组总DNA,再分别用PCR技术扩增出细菌16S rDNA并构建基因文库,经PCR鉴定后从3个文库中分别随机挑取50个阳性克隆进行DNA序列测定。分别对3个文库的测序结果进行分...
为了研究冷冻原肠浸泡解冻池水的细菌多样性,采集3份水样直接提取细菌基因组总DNA,再分别用PCR技术扩增出细菌16S rDNA并构建基因文库,经PCR鉴定后从3个文库中分别随机挑取50个阳性克隆进行DNA序列测定。分别对3个文库的测序结果进行分析发现,除去24.00%~32.00%为无法鉴定的未培养细菌和未分类细菌以外,其余细菌来自于芽胞杆菌纲、γ-变形菌纲、放线菌纲和黄杆菌纲,分别占各文库克隆总数的38.00%~42.00%、20.00%~26.00%、4.00%~8.00%和0~2.00%。除去44株无法鉴定的细菌,进一步对其他106株细菌进行分析发现,其中2株放线菌目细菌和5株肠杆菌科细菌无法进一步鉴定,其余99个菌株包含了来自19个属的至少30种细菌,且肠球菌属、变形杆菌属和芽胞杆菌属为其中的优势菌属。本研究显示冷冻原肠浸泡解冻池水中细菌多样性较高,其中部分细菌为致病菌和条件致病菌。
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关键词
冷冻原肠
解冻池
细菌多样性
16SrDNA文库
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职称材料
题名
冷冻原肠浸泡解冻池水细菌多样性分析
被引量:
2
1
作者
仇保丰
宋鸿雁
董蓉莲
高雪梅
蒋荧梅
顾炳泉
胡顺林
机构
扬州大学江苏省动物预防医学重点实验室
南通出入境检验检疫局
南通大学实验动物中心
江苏省疾病预防控制中心
出处
《动物医学进展》
北大核心
2017年第5期43-48,共6页
基金
江苏省动物预防医学重点实验室开放课题项目(K13044)
南通市科技项目(BK2012091和MS12016014)
江苏检验检疫局科研项目(2010KJ35)
文摘
为了研究冷冻原肠浸泡解冻池水的细菌多样性,采集3份水样直接提取细菌基因组总DNA,再分别用PCR技术扩增出细菌16S rDNA并构建基因文库,经PCR鉴定后从3个文库中分别随机挑取50个阳性克隆进行DNA序列测定。分别对3个文库的测序结果进行分析发现,除去24.00%~32.00%为无法鉴定的未培养细菌和未分类细菌以外,其余细菌来自于芽胞杆菌纲、γ-变形菌纲、放线菌纲和黄杆菌纲,分别占各文库克隆总数的38.00%~42.00%、20.00%~26.00%、4.00%~8.00%和0~2.00%。除去44株无法鉴定的细菌,进一步对其他106株细菌进行分析发现,其中2株放线菌目细菌和5株肠杆菌科细菌无法进一步鉴定,其余99个菌株包含了来自19个属的至少30种细菌,且肠球菌属、变形杆菌属和芽胞杆菌属为其中的优势菌属。本研究显示冷冻原肠浸泡解冻池水中细菌多样性较高,其中部分细菌为致病菌和条件致病菌。
关键词
冷冻原肠
解冻池
细菌多样性
16SrDNA文库
Keywords
frozen intestine
thawing pool
bacterial diversity
16S rDNA library
分类号
S852.6 [农业科学—基础兽医学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
冷冻原肠浸泡解冻池水细菌多样性分析
仇保丰
宋鸿雁
董蓉莲
高雪梅
蒋荧梅
顾炳泉
胡顺林
《动物医学进展》
北大核心
2017
2
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