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基于荧光SSR标记的白杨派种质资源遗传多样性研究 被引量：8
1
作者 姚俊修 毛秀红 +2 位作者 李善文 刘学良 吴德军 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期92-100,共9页
【目的】进行白杨派种质资源的遗传多样性研究,为毛白杨种质资源保存、评价与利用提供参考。【方法】对所收集的白杨派无性系采用毛细管电泳法进行荧光SSR-PCR产物检测,利用所得结果评价种源及无性系间的遗传变异和遗传多样性水平。【... 【目的】进行白杨派种质资源的遗传多样性研究,为毛白杨种质资源保存、评价与利用提供参考。【方法】对所收集的白杨派无性系采用毛细管电泳法进行荧光SSR-PCR产物检测,利用所得结果评价种源及无性系间的遗传变异和遗传多样性水平。【结果】16对SSR引物对272个无性系进行检测,共检测到106个等位基因,每位点的等位基因数为4~11个,平均等位基因数为6.625个;平均观测杂合度(Ho)值为0.561,平均期望杂合度(He)值为0.432,表明遗传多样性比较丰富;有9个位点的Ho/He大于1,表明杂合度比较高。对其中来自毛白杨6个集中分布区的234个无性系进行遗传变异分析,结果表明:2%的遗传变异来源于种源间,98%的遗传变异来自于种源内无性系间;由不同种源间的等位基因模型可知,山西、陕西、河南、山东和河北5个种源的无性系均有特有等位基因,杂交时可以适当选择不同种源的无性系作杂交亲本以拓宽杂交种的遗传基础,或种源间适当引种增加毛白杨种源间的遗传多样性。【结论】聚类分析和主坐标分析结果均表明,北京与河北种源亲缘关系最近,河南与陕西、山东与山西亲缘关系也较近,分别聚为3大类群,而相同种源的无性系并没有完全聚到一类,其原因可能是由于种源间相互引种或遗传变异造成的。研究结论为毛白杨种质资源保存和利用提供了理论依据。 展开更多
关键词 荧光ssr标记 毛白杨 种质资源 遗传多样性
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利用荧光SSR标记分析中国油橄榄品种遗传多样性 被引量：17
2
作者 李金花 俞宁 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第6期47-55,共9页
为研究我国53个油橄榄品种(13个引种驯化选育品种和40个引种品种)的遗传变异,利用SSR荧光标记技术对从甘肃的陇南、四川的西昌、广元和云南的永仁5个地点收集的107份材料进行遗传多样性分析。20对引物共检测出294个等位变异,每对引物的... 为研究我国53个油橄榄品种(13个引种驯化选育品种和40个引种品种)的遗传变异,利用SSR荧光标记技术对从甘肃的陇南、四川的西昌、广元和云南的永仁5个地点收集的107份材料进行遗传多样性分析。20对引物共检测出294个等位变异,每对引物的等位基因数在9～26之间,平均为14.7个;多态性信息量PIC值平均为0.73(0.33～0.89)。基于Jaccard系数的NJ法聚类分析结果表明,参试材料分为2大组,选育品种与引种品种未被分开,但大多数具有相同品种名称的材料被分在同一组中,无论是选育品种还是引种品种均具有高水平遗传多样性。对来自5个国家的油橄榄品种群体进行分子方差分析(AMOVA)结果表明,品种内遗传变异(86.61%)远远超过了群体间和群体内不同品种间的遗传变异(13.39%),大规模引种过程中对品种的起源和来源地等信息并不完全,以及在长期引种栽培和苗木繁育过程中品种混淆和同名异种等,都是造成品种内遗传变异水平高的原因。 展开更多
关键词 油橄榄 荧光ssr标记 遗传多样性 分子方差分析(AMOVA)
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百合荧光SSR标记体系构建及引物筛选 被引量：3
3
作者 周俐宏 石慧 +1 位作者 王志刚 蔡忠杰 《辽宁农业科学》 2019年第5期1-6,共6页
为了确定百合荧光SSR-PCR反应的最佳体系,对反应体系和程序中的模板DNA、酶量和退火温度进行了优化筛选。结果表明,适用于百合的荧光SSR-PCR反应体系为:总体系为20μl,10×PCRbuffer(Mg^2+)2μl,2.5mMdNTP1μl,正、反引物各0.5μl,... 为了确定百合荧光SSR-PCR反应的最佳体系,对反应体系和程序中的模板DNA、酶量和退火温度进行了优化筛选。结果表明,适用于百合的荧光SSR-PCR反应体系为:总体系为20μl,10×PCRbuffer(Mg^2+)2μl,2.5mMdNTP1μl,正、反引物各0.5μl,模板DNA40ng,Taq酶1U,用ddH2O补足。反应程序为:94℃预变性5min,94℃(30s)/58℃(45s)/72℃(45s)35个循环,最后72℃延伸10min。利用优化后的反应体系对百合SSR引物进行筛选,从50对引物中筛选出6对多态性高的SSR引物,并通过合成荧光标记引物对77个百合品(野生)种进行复选,验证了6对引物的稳定性。该研究为百合的遗传多样性分析、分子标记辅助育种等方面的进一步研究提供了技术支持。 展开更多
关键词 百合 ssr荧光标记 引物筛选
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利用荧光SSR标记划分玉米杂种优势群研究
4
作者 董艺兰 黄初女 +1 位作者 郑大浩 李钟民 《延边大学农学学报》 2011年第4期229-235,247,共8页
采用荧光SSR标记技术,对我国玉米育种中重要的32个代表性自交系进行遗传关系分析和杂种优势群划分.结果表明,兰卡斯特种质的自交系和唐四平头种质的自交系及这两种种质的自交系与其它种质的自交系遗传距离较大;而瑞德种质的自交系和旅... 采用荧光SSR标记技术,对我国玉米育种中重要的32个代表性自交系进行遗传关系分析和杂种优势群划分.结果表明,兰卡斯特种质的自交系和唐四平头种质的自交系及这两种种质的自交系与其它种质的自交系遗传距离较大;而瑞德种质的自交系和旅大红骨种质的自交系遗传距离最近.所研究自交系划分为3大类群(Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ),其中2个类群分别为兰卡斯特群(类群Ⅰ)和唐四平头群(类群Ⅲ);而瑞德种质和旅大红骨种质的自交系及选自美国杂交种的自交系均划归同一个群(类群Ⅱ)中. 展开更多
关键词 玉米 自交系 荧光ssr标记 聚类 杂种优势群
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基于荧光SSR标记分析濒危物种海南苏铁居群遗传多样性
5
作者 符瑞侃 戚华沙 +4 位作者 梁定民 刘艳 陈宣 全彬 杨珺 《中国野生植物资源》 2025年第3期71-77,共7页
目的:通过荧光SSR标记分析探究濒危物种海南苏铁的遗传多样性与遗传结构,以解析其濒危原因。方法:采用15对荧光标记SSR引物对9个居群150份海南苏铁样品基因组DNA进行荧光PCR扩增,并利用毛细管电泳法检测PCR产物,进而对海南苏铁各居群之... 目的:通过荧光SSR标记分析探究濒危物种海南苏铁的遗传多样性与遗传结构,以解析其濒危原因。方法:采用15对荧光标记SSR引物对9个居群150份海南苏铁样品基因组DNA进行荧光PCR扩增,并利用毛细管电泳法检测PCR产物,进而对海南苏铁各居群之间及居群内的遗传差异和遗传多样性进行分析。结果:15对引物共检测到181个等位基因,每个位点的平均等位基因数为12.07个,平均观测杂合度为0.66,平均期望杂合度为0.80,平均Shannon's多样性指数为1.91,平均多态性信息含量为0.77,表明海南苏铁居群具有较高的遗传多样性。近交系数平均值为0.03,说明海南苏铁居群杂合度较高。分子方差分析显示,遗传变异主要存在于居群内(87.65%),个体变异是海南苏铁遗传变异的主要来源;聚类分析和主坐标分析结果一致,将9个主要分布区的海南苏铁聚为2大类群:除海口单独聚为一类外,其余居群聚另外聚为一大类群,聚类依据为地理距离。结论:海南苏铁自身不存在导致濒危的遗传基础,人为的毁灭性砍伐和生境的破坏是其濒危的主要原因。 展开更多
关键词 海南苏铁 濒危植物 荧光ssr标记 遗传多样性 遗传结构
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基于SSR荧光标记法的桃同名异物品种鉴定技术与应用
6
作者 徐孟琪 李勇 王力荣 《果农之友》 2024年第11期1-6,共6页
为高效鉴别桃种质遗传差异及区分同名异物品种,建立了基于SSR荧光标记法的桃同名异物鉴定技术,利用10对SSR核心引物,通过SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带确定基因型,并对基因型进行分析和赋值,构建分子身份证。利用该鉴定技术进... 为高效鉴别桃种质遗传差异及区分同名异物品种,建立了基于SSR荧光标记法的桃同名异物鉴定技术,利用10对SSR核心引物,通过SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带确定基因型,并对基因型进行分析和赋值,构建分子身份证。利用该鉴定技术进行同名异物品种鉴定、苗木纯度分析和种质资源剔重,鉴定3对疑似同名异物桃品种、50份中油蟠9号桃苗木和102份新收集种质资源,结果表明,突围和春美、8D35和HBZZ10引物差异位点数目为0,分别判定为同名异物品种;50份中油蟠9号苗木差异位点数目为0,且与中油蟠9号相比差异位点数目为0,判定为同一品种,说明苗木纯度为100%;莎车白肉桃2号、莎车绿肉桃9号2份种质差异位点数目为0,莎车白肉桃4号、莎车白肉桃6号和莎车绿肉桃5号3份种质差异位点数目为0,说明上述5份种质保存2份即可。该技术的应用对知识产权保护和种质资源的高效保存具有重要意义。 展开更多
关键词 桃 种质资源 ssr荧光标记 分子身份证
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利用荧光标记SSR技术鉴定花生F1代杂交种 被引量：17
7
作者 李双铃 王辉 +4 位作者 任艳 石延茂 何国浩 禹山林 袁美 《花生学报》 2009年第4期35-38,共4页
杂种真实性的鉴定对花生杂交育种和遗传群体构建是非常重要的。利用IRD荧光标记SSR对亲本D145和D089及其F1单株进行分析。结果表明,在可扩增的41对引物中,6对在两亲本中表现多态性,多态性引物比率为14.6%。7个F1单株中,3株表现杂合带型... 杂种真实性的鉴定对花生杂交育种和遗传群体构建是非常重要的。利用IRD荧光标记SSR对亲本D145和D089及其F1单株进行分析。结果表明,在可扩增的41对引物中,6对在两亲本中表现多态性,多态性引物比率为14.6%。7个F1单株中,3株表现杂合带型,为真杂种,4株为假杂种,表现母本带型或新带型。根据F2:3家系的网斑病抗性分离表现和农艺性状可知,表现杂合带型的为真杂种,表现母本带型或新带型的为假杂种,与SSR标记鉴定的结果一致。证明应用荧光标记SSR技术鉴定真假杂种是切实可行的。 展开更多
关键词 花生 荧光ssr标记 杂种鉴定
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基于SSR荧光标记的121份野生枸杞种质遗传结构解析
8
作者 戴国礼 刘娜 +4 位作者 秦垦 张波 尹跃 米佳 何昕孺 《湖北农业科学》 2024年第5期207-214,共8页
以采集的121份野生枸杞(Lycium barbarum L.)种质为材料,用9对SSR引物进行扩增,采用GeneALEX、Power Marker软件进行多态性分析,利用NTSYS、STRUC-TURE软件进行遗传多样性分析、聚类分析和主成分分析。结果表明,9对SSR引物共检测到108... 以采集的121份野生枸杞(Lycium barbarum L.)种质为材料,用9对SSR引物进行扩增,采用GeneALEX、Power Marker软件进行多态性分析,利用NTSYS、STRUC-TURE软件进行遗传多样性分析、聚类分析和主成分分析。结果表明,9对SSR引物共检测到108个等位基因,等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、Shannon’s信息指数分别为12个、4.620个、0.678、0.651、0.629、1.568;聚类结果显示121份野生枸杞种质可划分为5个亚群,群体遗传结构表明当K=5时,121个种质划分为5个亚群,来自宁夏的NXGY-02、NXGY-032个种质与来自内蒙古的6个种质之间的遗传距离最远,亲缘关系较远,来自青海省、新疆、甘肃省及内蒙古的其余野生枸杞种质之间存在广泛的基因交流现象;宁夏、内蒙古的野生枸杞种质具有独立起源进化的可能,而新疆、甘肃省、青海省的种质与宁夏种质亲缘关系较近,很可能属于同一起源。 展开更多
关键词 野生枸杞(Lycium barbarum L.) 种质 ssr荧光标记 遗传结构
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利用荧光SSR标记分析元宝枫种质资源遗传多样性 被引量：2
9
作者 臧真荣 燕丽萍 +5 位作者 王因花 王开芳 梁燕 仲伟国 吴德军 权志珣 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2023年第24期8163-8171,共9页
为了研究元宝枫种质资源遗传的多样性,本研究对所采集的元宝枫无性系群体DNA进行荧光PCR扩增,利用毛细管电泳法检测PCR产物,分析元宝枫的集中分布区域之间及同源无性系间的遗传差异和遗传多样性。用11对荧光标记SSR引物对250个元宝枫无... 为了研究元宝枫种质资源遗传的多样性,本研究对所采集的元宝枫无性系群体DNA进行荧光PCR扩增,利用毛细管电泳法检测PCR产物,分析元宝枫的集中分布区域之间及同源无性系间的遗传差异和遗传多样性。用11对荧光标记SSR引物对250个元宝枫无性系进行分析,数据显示共102个等位基因,每个位点的等位基因数值4~16个不等,平均等位基因数为9.27;观测杂合度(Ho)为0.42~0.94,平均观测杂合度为0.66,期望杂合度(He)为0.45~0.88,平均期望杂合度为0.73。Shannon’s多样性指数(I)为0.916~6.875,平均值为2.078。多态性信息含量(PIC)为0.136~0.771,平均值为0.457。有2个SSR位点的Ho/He值大于1,说明其杂合度较高。对元宝枫9个主要分布区的250个无性系进行遗传多样性分析,结果表明:种源间存在着11%的遗传变异,同源内无性系之间具有85%的遗传变异。聚类分析和主坐标分析结果一致,9个主要分布区的元宝枫聚为3大类群:赤峰和泰安两个分布区的亲缘关系较近,聚为一大类群;北京、泗水、淄博、滕州、海阳和蒙山亲缘关系次近,聚为一类;四川的单独聚为一类。本研究结果为元宝枫种质资源保存和利用提供了理论支持。 展开更多
关键词 元宝枫 荧光ssr标记 种质资源 遗传多样性
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湖北省地方杏品种资源荧光SSR遗传多样性分析
10
作者 叶缘铭 蔡化 +6 位作者 田瑞 董志丹 张豫 蒋迎春 吴黎明 何利刚 刘模发 《湖北农业科学》 2024年第10期97-101,共5页
为探明湖北省地方杏品种资源的遗传多样性,以湖北省24个地方杏品种为试验材料,采用SSR分子标记结合荧光毛细管电泳技术开展研究。结果表明,来自杏、桃、扁桃和樱桃上的14对引物共扩增出162个多态性等位基因位点,平均每个位点的等位基因... 为探明湖北省地方杏品种资源的遗传多样性,以湖北省24个地方杏品种为试验材料,采用SSR分子标记结合荧光毛细管电泳技术开展研究。结果表明,来自杏、桃、扁桃和樱桃上的14对引物共扩增出162个多态性等位基因位点,平均每个位点的等位基因数目为11.571。有效等位基因总数为90.312,平均每个位点的有效等位基因数目为6.451。观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、香农指数(I)的平均值分别为0.652、0.813、2.031,多态性信息含量(PIC)平均值为0.794,说明所选近源物种的引物具有较高的通用性,多态性丰富。在相似系数0.580处将24个品种分为3个大组,第1组由洪平杏独立成组,第2组由榔梅、杏梅等4个品种组成,第3组由米杏、五祖杏等19个品种组成。可见,湖北省地方杏品种具有丰富的遗传多样性,采用SSR特异性引物可以鉴别湖北省地方杏品种。 展开更多
关键词 地方杏 种质资源 荧光ssr标记 遗传多样性 湖北省
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SSR荧光标记毛细管电泳检测法在水稻DNA指纹鉴定中的应用 被引量：65
11
作者 程本义 夏俊辉 +1 位作者 龚俊义 杨仕华 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期672-676,共5页
以16个杂交水稻不育系、恢复系及组合为材料,初步建立了水稻品种SSR荧光标记毛细管电泳检测方法。与常规凝胶电泳检测方法相比,荧光标记毛细管电泳检测方法可以读出目标DNA片段的准确大小,检测数据更为精确,检测效率更高。常规凝胶电泳... 以16个杂交水稻不育系、恢复系及组合为材料,初步建立了水稻品种SSR荧光标记毛细管电泳检测方法。与常规凝胶电泳检测方法相比,荧光标记毛细管电泳检测方法可以读出目标DNA片段的准确大小,检测数据更为精确,检测效率更高。常规凝胶电泳检测方法验证表明,利用SSR荧光标记毛细管电泳检测方法进行水稻品种DNA指纹鉴定,方法可行、结果可靠。 展开更多
关键词 水稻 ssr荧光标记 毛细管电泳 DNA指纹鉴定
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利用SSR荧光标记构建20个高粱品种指纹图谱 被引量：31
12
作者 王瑞 张福耀 +2 位作者 程庆军 田承华 凌亮 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期658-665,共8页
为建立高粱种子纯度及真实性鉴定技术体系，构建高粱栽培品种DNA指纹图谱数据库是必要的。利用SSR荧光标记技术筛选出36对SSR荧光标记引物，构建我国高粱杂种优势利用以来中晚熟区主推的20个品种的SSR指纹图谱。36对SSR引物共扩增出235... 为建立高粱种子纯度及真实性鉴定技术体系，构建高粱栽培品种DNA指纹图谱数据库是必要的。利用SSR荧光标记技术筛选出36对SSR荧光标记引物，构建我国高粱杂种优势利用以来中晚熟区主推的20个品种的SSR指纹图谱。36对SSR引物共扩增出235个等位基因，平均每个等位基因检测到多态性位点7个，多态性位点变化范围为2～12个。20个高粱品种36个SSR位点的遗传多样性指数和多态性信息量的变化范围分别为0．3490～0．8813和0．3144-0．8696，平均值分别为O．6976和0．6571。从36对SSR引物中筛选到多态性丰富的2对引物作为高粱品种鉴定的特征引物，2对SSR特征引物组合可区分所有供试品种。20＋高粱品种的SSR指纹图谱互不相同，可以作为各品种特定的图谱，为品种鉴别提供依据。 展开更多
关键词 高粱 品种鉴定 ssr荧光标记 指纹图谱
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利用SSR荧光标记构建山东地方梨种质资源分子身份证 被引量：26
13
作者 冉昆 隋静 +5 位作者 王宏伟 魏树伟 张勇 董冉 董肖昌 王少敏 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第A01期71-78,共8页
【目的】利用SSR荧光标记构建45份山东地方梨种质资源的分子身份证。【方法】从SSR富集文库中开发并设计40对引物,从中筛选出10对多态性良好的引物,采用SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带分子质量的方法对山东地方梨种质资源进行分... 【目的】利用SSR荧光标记构建45份山东地方梨种质资源的分子身份证。【方法】从SSR富集文库中开发并设计40对引物,从中筛选出10对多态性良好的引物,采用SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带分子质量的方法对山东地方梨种质资源进行分析,获得相应的扩增条带。采用个位数字和小写英文字母对不同带型进行编码,按照10对引物扩增带型数由少到多顺序串联排序的方式构建供试样品的分子身份证。【结果】10对SSR引物共检测到111个SSR等位位点和189个带型,平均每对引物对品种扩增的等位位点11.1个,带型18.9个。采用个位数字和小写英文字母结合对不同带型进行编码,成功构建了45份山东地方梨种质资源的分子身份证,可以将材料完全区分开。【结论】构建了45份山东地方梨种质资源分子身份证,有利于山东地方梨种质资源的保护与利用。 展开更多
关键词 梨 种质资源 山东 ssr荧光标记 分子身份证
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利用SSR荧光标记分析90个糯玉米地方品种的遗传多样性 被引量：25
14
作者 雍洪军 张世煌 +6 位作者 张德贵 李明顺 李新海 郝转芳 刘晓鑫 白丽 谢传晓 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期6-12,共7页
采取混合取样策略,利用荧光SSR技术对来源于我国7个省(自治区)的90份糯玉米地方品种和6个标准测验种自交系基因组的31个简单序列重复(SSR)位点进行了分析。在90个糯玉米地方品种中,共检测出216个等位变异,每个位点检测出2～12个,平均6.9... 采取混合取样策略,利用荧光SSR技术对来源于我国7个省(自治区)的90份糯玉米地方品种和6个标准测验种自交系基因组的31个简单序列重复(SSR)位点进行了分析。在90个糯玉米地方品种中,共检测出216个等位变异,每个位点检测出2～12个,平均6.97个,多态性信息量(PIC,polymorphic information content)为0.67,标记指数(MI,marker index)为4.92。可初步将90份糯玉米地方品种划为3个类群,其中,广西和贵州的糯玉米地方品种的遗传多样性相对更丰富。 展开更多
关键词 糯玉米 地方品种 遗传多样性 ssr荧光标记 混合取样
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桃品种特异性荧光SSR分子标记数据库构建 被引量：17
15
作者 李雄伟 孟宪桥 +8 位作者 贾惠娟 王力荣 王志强 马瑞娟 吴大军 董冰 Maria Jose Aranzana Pere Arús 高中山 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期924-932,共9页
【目的】选择通用的荧光SSR分子标记建立桃种质资源基因型数据库便于进行种质特异性鉴定、资源交换、管理和利用。【方法】根据48个SSR标记对国内外669份桃品系的遗传多样性测试结果，从中选择出一部分多态信息含量较高、适合品种鉴别... 【目的】选择通用的荧光SSR分子标记建立桃种质资源基因型数据库便于进行种质特异性鉴定、资源交换、管理和利用。【方法】根据48个SSR标记对国内外669份桃品系的遗传多样性测试结果，从中选择出一部分多态信息含量较高、适合品种鉴别的标记，采用不同荧光标识组合在ABI3130测序仪测试，为了使不同批次的测试结果准确可靠，6—8个参照品种纳入每次的测试中。结果用16个SSR标记基本可以判断品种的特异性，它们可以用4种荧光标识进行标记，便于分为4组在ABI遗传分析仪上测试。目前数据库包含641份材料．基因型一致的品系多为同一品种突变体和自交系演化的地方品种。文中列出了100份中国代表性种质资源分子标记数据库，并建议8个中国品系为参照。对17个桃品种进行系谱验证发现，我国资源圃所育成的7个品种系谱信息正确，但日本桃品种系谱信息与文献出现偏差。【结论】应用16个多态性高的SSR荧光标记可以构建精确的桃品种分子指纹数据库，测试方法及结果对品种特异性和系谱鉴定提供重要的参考．推动资源分子指纹数据库标准化建设工作。 展开更多
关键词 桃 荧光标记ssr 指纹图谱数据库 品种鉴定 系谱鉴定
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SSR荧光标记毛细管电泳法与国家冬油菜区试指纹鉴定平台的构建 被引量：21
16
作者 许鲲 李锋 +8 位作者 吴金锋 谷铁城 陈碧云 高桂珍 闫贵欣 李俊 乔江伟 汪念 伍晓明 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期150-159,共10页
为了油菜品种指纹检测的精确性及未来构建大规模油菜新品种指纹数据库,应用SSR荧光标记毛细管电泳检测法构建国家冬油菜区试指纹鉴定平台。以40对荧光引物对2012-2013年度163份国家冬油菜区试参试品种（系）进行分析。结果共检测到42个... 为了油菜品种指纹检测的精确性及未来构建大规模油菜新品种指纹数据库,应用SSR荧光标记毛细管电泳检测法构建国家冬油菜区试指纹鉴定平台。以40对荧光引物对2012-2013年度163份国家冬油菜区试参试品种（系）进行分析。结果共检测到42个等位位点和131个等位变异。其中A基因组（n1～n10）检测位点25个,C基因组（n11～n19）检测位点17个。每个位点等位变异数从2到6不等,平均为3.02。42个检测位点的PIC值变化范围在0.10～0.69之间,平均值为0.36。其中引物BRGMS171的杂合度、PIC值分别高达0.67、0.70,可考虑作为以后区试杂交种纯度鉴定的核心标记。SSR位点的纯合度分析得出本年度18份常规种平均纯合度为81.9%,145份杂交种为57.9%。以131个等位变异计算品种（系）间DICE相似系数,163份品种（系）间平均遗传相似系数变幅为0.607～0.765,变幅最大的为品种（系）FC03（0.438～0.879）,变幅最小为品种（系）宜油21（0.611～0.806）。 展开更多
关键词 冬油菜新品种(系) ssr荧光标记 毛细管电泳法
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利用SSR荧光标记构建41份山东省苹果资源分子身份证 被引量：17
17
作者 李慧峰 王涛 冉昆 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期70-77,共8页
山东自古为中国苹果的栽培中心,苹果属植物资源较为丰富,种间杂交类型较多,资源分类难度大,相关研究较为滞后。本研究选取山东省果树研究所苹果资源圃保存的41份资源为试材,利用SSR荧光标记构建分子身份证,旨在探索建立应用分子技术进... 山东自古为中国苹果的栽培中心,苹果属植物资源较为丰富,种间杂交类型较多,资源分类难度大,相关研究较为滞后。本研究选取山东省果树研究所苹果资源圃保存的41份资源为试材,利用SSR荧光标记构建分子身份证,旨在探索建立应用分子技术进行资源分类鉴定的技术体系。从SSR富集文库中开发并设计59对引物,从中筛选出10对多态性良好的引物,利用SSR荧光标记毛细管电泳检测扩增条带分子量的方法对41份山东省原产的苹果属资源进行分析,获得相应的等位基因。采用个位数字和小写英文字母对不同等位基因进行编码,按照10对引物从小到大串联排序的方式构建供试样品的分子身份证。试验结果表明:10对SSR引物共检测到139个SSR等位位点,244种基因型,平均每对引物对品种扩增等位位点13.9个,基因型24.4种。利用PopGen32软件计算引物的多态性信息含量,10对引物的平均多态性信息含量为0.85。基于10对SSR引物的扩增结果,采用个位数字和小写英文字母对不同等位基因进行编码,成功构建了41份山东苹果种质资源的分子身份证,为山东省苹果资源的鉴定工作提供了重要依据。 展开更多
关键词 种质资源 苹果属 分子身份证 山东省 ssr荧光标记
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基于SSR荧光标记的吉单系列玉米品种遗传分析 被引量：7
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作者 刘文国 张志军 +2 位作者 赵万庆 杨伟光 路明 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2016年第10期25-36,44,共13页
【目的】利用分子标记技术对吉单系列玉米品种亲本自交系的遗传关系进行剖析,为今后自交系类群划分和杂交种组配奠定基础。【方法】利用49对SSR荧光标记对2000-2009年审定的吉单系列玉米品种亲本自交系进行分析,根据Nei’s遗传距离,利用... 【目的】利用分子标记技术对吉单系列玉米品种亲本自交系的遗传关系进行剖析,为今后自交系类群划分和杂交种组配奠定基础。【方法】利用49对SSR荧光标记对2000-2009年审定的吉单系列玉米品种亲本自交系进行分析,根据Nei’s遗传距离,利用UMGMA聚类法和主成分分析法进行分析。【结果】49对标记在65份自交系间共检测出340个等位基因变异,每对引物检测出3~12个等位基因,平均6.94个,平均多态性信息量0.601,平均基因多样性指数0.644。Nei’s遗传距离变化于0.15~2.26,平均1.05。将65份自交系划分为Reid群、兰卡斯特、PB、四平头、旅大红骨、Volga和其他等7个类群,其中以Reid群、兰卡斯特、四平头、PB和Volga这5个类群为主。主要应用的杂种优势模式有Reid群×四平头群、兰卡斯特群×四平头群、Reid群×Volga群、兰卡斯特群×PB群、Reid群×兰卡斯特群和Reid群×PB群等6种,尤其以Reid群×四平头群、兰卡斯特群×四平头群和Reid群×Volga群这3种杂种优势模式占优势。确定了以吉V022、吉V993为代表的欧洲Volag种质与我国的Reid群、兰卡斯特、四平头等类群存在距离,并独立成群,建立了Reid群×Volga和四平头群×Volga 2个新的杂种优势模式,育成吉单519、吉单535、吉单522、吉单505、吉单517等一系列玉米品种并大面积推广应用。【结论】2000-2009年的吉单系列玉米品种具有较丰富的遗传多样性,在涵盖我国主要玉米类群的基础上,还具有Volag这一独特类群。 展开更多
关键词 吉单系列玉米 ssr荧光标记 遗传基础
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42份云南玉米自交系基于SSR荧光标记的遗传多样性分析 被引量：10
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作者 张鹏 管俊娇 +5 位作者 黄清梅 王江民 杨晓洪 刘艳芳 张建华 毛进 《江西农业学报》 CAS 2019年第10期29-33,共5页
通过分析云南常用42份玉米自交系品种的遗传多样性,以及云南近些年新育成自交系的遗传背景,为云南地区玉米育种提供参考依据。利用30对SSR多态性引物,对42个玉米自交系品种进行等位基因多样性和聚类分析,共检测到277个等位基因变异,平... 通过分析云南常用42份玉米自交系品种的遗传多样性,以及云南近些年新育成自交系的遗传背景,为云南地区玉米育种提供参考依据。利用30对SSR多态性引物,对42个玉米自交系品种进行等位基因多样性和聚类分析,共检测到277个等位基因变异,平均每个位点检测到的等位基因数为9.2个,变化范围4~17个,片段大小介于86~434 bp之间,每个SSR位点的多肽信息量(PIC)在0.7008~0.9979之间,平均为0.9712。基于UPGMA进行遗传聚类分析,供试材料分类不明显,遗传相似系数均大于0.82,遗传相似度较高。目前由于大部分的玉米自交系品种都由骨干自交系而来,品种资源狭窄、遗传多样性不够丰富,导致新育成的玉米品种遗传背景相似,血缘关系相近,因此亟需在品种资源的有效利用、资源评价、材料共享和交流等方面开展相关工作,促进玉米种业发展。 展开更多
关键词 玉米 ssr荧光标记 遗传多样性
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应用SSR荧光标记法构建山东地方桃种质资源分子身份证 被引量：12
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作者 刘伟 李淼 +3 位作者 李桂祥 董晓民 高晓兰 张安宁 《山东农业科学》 北大核心 2022年第2期6-13,共8页
为构建山东省地方桃种质资源分子身份证,本研究以60份山东省地方桃品种、名优特品种、选育品种为材料,从桃种质的SSR富集文库中开发并设计30对引物,选出10对具有良好多态性的引物进行PCR扩增,采用SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条... 为构建山东省地方桃种质资源分子身份证,本研究以60份山东省地方桃品种、名优特品种、选育品种为材料,从桃种质的SSR富集文库中开发并设计30对引物,选出10对具有良好多态性的引物进行PCR扩增,采用SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带分子质量的方法进行带型分析,采用阿拉伯数字1~9和小写英文字母对不同带型进行编码,无带编码为0,按照10对引物扩增带型数由少到多的顺序将编码串联,构建供试样品的分子身份证。结果表明,10对SSR引物共检测到58个SSR等位位点和116个带型,平均每对引物扩增的等位位点为5.8个,带型11.6个;多态性信息含量变幅为0.2044~0.7378,平均0.5699,说明引物的多态性较高,能够有效揭示60份桃种质的遗传多样性。通过对扩增带型的分析并编码,成功构建了60份桃种质的分子身份证。遗传聚类分析的结果与分子身份证结果一致。本研究结果可为山东省桃种质资源的保护和利用奠定基础,对于桃产业的发展具有重要意义。 展开更多
关键词 桃 种质资源 山东省 ssr荧光标记 分子身份证
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