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高性能稀疏矩阵向量乘的程序设计综述
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作者 杜臻 谭光明 孙凝晖 《高技术通讯》 CAS 北大核心 2024年第8期807-823,共17页
稀疏矩阵向量乘(SpMV)广泛应用于科学计算、图计算、数据分析等领域,是自现代计算机诞生以来经久不衰且挑战依旧的研究热点。本文系统回顾了20世纪70年代以来稀疏矩阵向量乘程序设计的发展脉络和各阶段的代表性工作;分析比较了这一领域... 稀疏矩阵向量乘(SpMV)广泛应用于科学计算、图计算、数据分析等领域,是自现代计算机诞生以来经久不衰且挑战依旧的研究热点。本文系统回顾了20世纪70年代以来稀疏矩阵向量乘程序设计的发展脉络和各阶段的代表性工作;分析比较了这一领域4条技术路线,即人工程序设计、自动调优器、稀疏编译器和自动程序设计器,在当今的流行方法;并在此基础上对高性能稀疏矩阵向量乘程序设计的研究趋势做出预测,力图给学习者和研究者带来有益的知识与启示。 展开更多
关键词 稀疏矩阵向量乘(SpMV) 稀疏矩阵格式 自动调优 稀疏编译器 高性能计算 并行算法
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基于异构平台的稀疏矩阵向量乘自适应计算优化
2
作者 李博 黄建强 +1 位作者 黄东强 王晓英 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2024年第12期3867-3875,共9页
稀疏矩阵向量乘(SpMV)是一种重要的数值线性代数运算,现有的优化存在预处理及通信时间考虑不全面、存储结构不具有普适性等问题。为了解决这些问题,提出异构平台下SpMV的自适应优化方案。所提方案利用皮尔逊相关系数确定相关度高的特征... 稀疏矩阵向量乘(SpMV)是一种重要的数值线性代数运算,现有的优化存在预处理及通信时间考虑不全面、存储结构不具有普适性等问题。为了解决这些问题,提出异构平台下SpMV的自适应优化方案。所提方案利用皮尔逊相关系数确定相关度高的特征参数,并使用基于梯度提升决策树(GBDT)的极端梯度提升(XGBoost)和轻量级梯度提升(LightGBM)算法训练预测模型,以确定某一稀疏矩阵更优的存储格式。利用网格搜索确定模型训练时更优的模型超参数,使这2种算法选择更适合的存储结构的准确率都超过85%。此外,对于预测存储结构为混合(HYB)格式的稀疏矩阵,在GPU和CPU上分别计算其中的等长列(ELL)与坐标(COO)存储格式部分,建立基于CPU+GPU的并行混合计算模式;同时为小数据量的稀疏矩阵选择硬件平台,提高运算速度。实验结果表明,自适应计算优化相较于cuSPARSE库中的压缩稀疏行(CSR)存储格式计算的平均加速比可以达到1.4,相较于按照HYB和ELL存储格式计算的平均加速比则可以分别达到2.1和2.6。 展开更多
关键词 稀疏矩阵向量乘 自适应优化 皮尔逊相关系数 极端梯度提升 轻量级梯度提升机器学习
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基于FPGA和行折叠的稀疏矩阵向量乘优化
3
作者 周智 高建花 计卫星 《计算机工程与科学》 CSCD 北大核心 2024年第8期1340-1348,共9页
稀疏矩阵向量乘(SpMV)是科学与工程计算中的一个关键内核。由于稀疏矩阵中不规则的数据分布和SpMV计算中不规则的访存操作,SpMV在多核CPU和GPU等设备上的性能与这些设备的理论峰值还具有较大差距。现有的CPU和GPU由于在架构上受到限制,... 稀疏矩阵向量乘(SpMV)是科学与工程计算中的一个关键内核。由于稀疏矩阵中不规则的数据分布和SpMV计算中不规则的访存操作,SpMV在多核CPU和GPU等设备上的性能与这些设备的理论峰值还具有较大差距。现有的CPU和GPU由于在架构上受到限制,导致它们无法很好地利用稀疏矩阵的特殊结构来加速SpMV计算,而现场可编程门阵列(FPGA)可以通过自定义电路实现高效的并行运算,能够更好地处理稀疏矩阵的计算和存储问题。基于FPGA提出了一种SpMV优化方法,该优化方法基于高级综合的流式处理引擎,采用了一种自适应多行折叠的SpMV优化策略。该方法通过行折叠减少了处理引擎中零元的无效存储和计算,从而提升了基于FPGA的SpMV计算性能。实验结果表明,相比于现有的FPGA实现方案,设计的基于行折叠优化的数据流引擎实现了最高1.78倍和平均1.15倍的加速。 展开更多
关键词 稀疏矩阵向量乘 现场可编程门阵列 高级综合 行折叠
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基于GPU对角稀疏矩阵向量乘法的动态划分算法
4
作者 涂进兴 李志雄 黄建强 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2024年第11期3521-3529,共9页
在图形处理器(GPU)上实现对角稀疏矩阵向量乘法(SpMV)可以充分利用GPU的并行计算能力,并加速矩阵向量乘法;然而,相关主流算法存在零元填充数据多、计算效率低的问题。针对上述问题,提出一种对角SpMV算法DIA-Dynamic(DIAgonal-Dynamic)... 在图形处理器(GPU)上实现对角稀疏矩阵向量乘法(SpMV)可以充分利用GPU的并行计算能力,并加速矩阵向量乘法;然而,相关主流算法存在零元填充数据多、计算效率低的问题。针对上述问题,提出一种对角SpMV算法DIA-Dynamic(DIAgonal-Dynamic)。首先,设计一种全新的动态划分策略,根据矩阵的不同特征进行分块,在保证GPU高计算效率的同时大幅减少零元填充,去除冗余计算量;其次,提出一种对角稀疏矩阵存储格式BDIA(Block DIAgonal)存储分块数据,并调整数据布局,提高GPU上的访存性能;最后,基于GPU的底层进行条件分支优化,以减少分支判断,并使用动态共享内存解决向量的不规则访问问题。DIA-Dynamic与前沿Tile SpMV算法相比,平均加速比达到了1.88;与前沿BRCSD(Diagonal Compressed Storage based on Row-Blocks)-Ⅱ算法相比,平均零元填充减少了43%,平均加速比达到了1.70。实验结果表明,DIA-Dynamic能够有效提高GPU上对角SpMV的计算效率,缩短计算时间,提升程序性能。 展开更多
关键词 图形处理器 对角稀疏矩阵 稀疏矩阵向量乘 动态划分 共享内存
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基于GPU的高性能稀疏矩阵向量乘及CG求解器优化 被引量:7
5
作者 王迎瑞 任江勇 田荣 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2013年第3期46-49,共4页
以有限元/有限差分等为代表的一类数值方法,其总体矩阵常常具有"带状"、稀疏的特点。针对"带状"稀疏矩阵,提出和实现了一种高效的矩阵向量乘存储格式和算法"bDIA"。基于nVidia的GTX280系列GPU对其进行了... 以有限元/有限差分等为代表的一类数值方法,其总体矩阵常常具有"带状"、稀疏的特点。针对"带状"稀疏矩阵,提出和实现了一种高效的矩阵向量乘存储格式和算法"bDIA"。基于nVidia的GTX280系列GPU对其进行了测试,结果显示:与CUSP支持的5种常见稀疏矩阵存储格式和算法相比较,所提出的bDIA格式以及相应的spMV算法的单双精度浮点效率均可以提高1倍以上,并突破了该系列GPU在spMV计算时4%的单精度浮点效率上限和22.2%的双精度浮点效率上限;应用于共轭梯度(CG)与稳定双共轭梯度(BiCGStab)求解器,相对于DIA格式均有1.5倍左右的加速。 展开更多
关键词 带状稀疏矩阵向量乘 bDIA 广义有限元 GPU CG求解器优化
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GPU稀疏矩阵向量乘的性能模型构造 被引量:3
6
作者 尹孟嘉 许先斌 +3 位作者 何水兵 胡婧 叶从欢 张涛 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2017年第4期182-187,206,共7页
稀疏矩阵向量乘(Sparse matrix-vector multiplication,SPMV)是广泛应用于大规模线性求解系统和求解矩阵特征值等问题的基本运算,但在迭代处理过程中它也常常成为处理的瓶颈,影响算法的整体性能。对于不同形态的矩阵,选择不同的存储格式... 稀疏矩阵向量乘(Sparse matrix-vector multiplication,SPMV)是广泛应用于大规模线性求解系统和求解矩阵特征值等问题的基本运算,但在迭代处理过程中它也常常成为处理的瓶颈,影响算法的整体性能。对于不同形态的矩阵,选择不同的存储格式,对应的算法往往会产生较大的性能影响。通过实验分析,找到各种矩阵形态在不同存储结构下体现的性能变化特征,构建一个有效的性能度量模型,为评估稀疏矩阵运算开销、合理选择存储格式做出有效的指导。在14组CSR,COO,HYB格式和8组ELL格式的测试用例下,性能预测模型和测量之间的差异低于9%。 展开更多
关键词 GPU 稀疏矩阵向量乘 性能模型
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基于FPGA的稀疏矩阵向量乘的设计研究 被引量:9
7
作者 张禾 陈客松 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2014年第6期1756-1759,共4页
作为典型的不规则算法,稀疏矩阵向量乘的计算过程具有非常低的访存局部性和计算访存比,因此在基于cache的通用处理器上计算效率很低。提出了一种面向可重构计算平台的基于IEEE-754浮点数据格式标准的稀疏矩阵向量乘算法加速器的设计。... 作为典型的不规则算法,稀疏矩阵向量乘的计算过程具有非常低的访存局部性和计算访存比,因此在基于cache的通用处理器上计算效率很低。提出了一种面向可重构计算平台的基于IEEE-754浮点数据格式标准的稀疏矩阵向量乘算法加速器的设计。在一维划分的行压缩稀疏矩阵数据存储技术以及计算部件的流水化设计的基础上,提出了一种基于单个浮点加法器的无阻塞累加器设计。通过实验验证表明,简化了算法的设计提高了算法执行的并行度和外部存储器的带宽利用率,获得了相对于传统处理器1.37-2.60倍的性能加速比。 展开更多
关键词 稀疏矩阵向量乘 现场可编程逻辑门阵列 可重构计算 并行算法
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稀疏矩阵向量乘的FPGA设计与实现 被引量:3
8
作者 宋庆增 顾军华 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2011年第23期214-216,共3页
针对传统的通用处理器(GPP)平台上执行稀疏矩阵向量乘计算效率低的问题,提出一种基于可重构计算平台的SpMXV协处理器设计。方案采用二叉树结构高度流水的数据流、IEEE-754的32 bit浮点数数据格式和对角存储格式。数据通路以流水线方式... 针对传统的通用处理器(GPP)平台上执行稀疏矩阵向量乘计算效率低的问题,提出一种基于可重构计算平台的SpMXV协处理器设计。方案采用二叉树结构高度流水的数据流、IEEE-754的32 bit浮点数数据格式和对角存储格式。数据通路以流水线方式进行组织,能够优化计算性能。仿真结果表明,与GPP平台上的软件实现相比,通过硬件实现的设计能达到最高2.69倍的性能加速。 展开更多
关键词 可重构计算 协处理器 稀疏线性方程组 稀疏矩阵向量乘 归约阵列
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基于PPR模型的稀疏矩阵向量乘及卷积性能优化研究 被引量:5
9
作者 谢震 谭光明 孙凝晖 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2021年第3期445-457,共13页
稀疏矩阵向量乘和卷积作为高性能计算的两大计算核心,是非规则和规则访存的典型代表.目前已经做了许多针对性的优化工作,但是对于大量运行着不同指令集和拥有不同计算和访存性能的机器,仍然无法判定在特定的体系结构下导致性能效率无法... 稀疏矩阵向量乘和卷积作为高性能计算的两大计算核心,是非规则和规则访存的典型代表.目前已经做了许多针对性的优化工作,但是对于大量运行着不同指令集和拥有不同计算和访存性能的机器,仍然无法判定在特定的体系结构下导致性能效率无法被完全释放的主要原因及性能瓶颈,同时也很难准确预测出程序在特定机器上可达到的最佳性能.通过使用性能模型方法,建模程序在真实机器上的运行细节,可以得出更加精确的性能预测,并且根据模型输出的反馈信息提出针对性的优化指导.提出了PPR(probability-process-ram)模型,并在一个通用处理器上建模程序内指令执行和数据传输开销,其中包括使用模型预测各种指令数量及内存层次之间的数据传输大小去分析程序各个阶段的性能瓶颈,并且根据模型反馈的信息提出优化方案以及优化后的性能期望.最终使用PPR建模和优化2个计算核心,同时也比较了与常用的Roofline和ECM模型的区别. 展开更多
关键词 性能模型 反馈优化 稀疏矩阵向量乘 卷积 cache模拟器
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基于深度学习的稀疏矩阵向量乘运算性能预测模型 被引量:3
10
作者 曹中潇 冯仰德 +5 位作者 王珏 闵维潇 姚铁锤 高岳 王丽华 高付海 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期86-91,共6页
稀疏矩阵向量乘(SpMV)是求解稀疏线性方程组的计算核心,被广泛应用在经济学模型、信号处理等科学计算和工程应用中,对于SpMV及其调优技术的研究有助于提升解决相关领域问题的运算效率。传统SpMV自动调优方法基于硬件平台的体系结构参数... 稀疏矩阵向量乘(SpMV)是求解稀疏线性方程组的计算核心,被广泛应用在经济学模型、信号处理等科学计算和工程应用中,对于SpMV及其调优技术的研究有助于提升解决相关领域问题的运算效率。传统SpMV自动调优方法基于硬件平台的体系结构参数设置来提升SpMV性能,但巨大的参数设置量导致搜索空间变大且自动调优耗时大幅增加。采用深度学习技术,基于卷积神经网络,构建由双通道稀疏矩阵特征融合以及稀疏矩阵特征与体系结构特征融合组成的SpMV运算性能预测模型,实现快速自动调优。为提高SpMV运算时间的预测精度,选取特征数据并利用箱形图统计SpMV时间信息,同时在佛罗里达稀疏矩阵数据集上进行实验设计与验证,结果表明,该模型的SpMV运算时间预测准确率达到80%以上,并且具有较强的泛化能力。 展开更多
关键词 稀疏矩阵向量乘 自动调优 深度学习 卷积神经网络 特征融合
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基于Intel Xeon Phi的稀疏矩阵向量乘性能优化 被引量:1
11
作者 张爱民 安虹 +3 位作者 姚文军 梁伟浩 江霞 李丰 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2016年第4期818-823,共6页
稀疏矩阵向量乘(Sp MV)是线性求解系统等科学计算中重要的计算核心.鉴于传统的稀疏矩阵向量乘算法在Intel Xeon Phi众核集成架构上存在SIM D利用率低,不规则访存开销高及负载不均衡的问题,难以发挥其运算能力.本文针对Intel Xeon Phi的... 稀疏矩阵向量乘(Sp MV)是线性求解系统等科学计算中重要的计算核心.鉴于传统的稀疏矩阵向量乘算法在Intel Xeon Phi众核集成架构上存在SIM D利用率低,不规则访存开销高及负载不均衡的问题,难以发挥其运算能力.本文针对Intel Xeon Phi的体系结构特点,提出了一种通用的分块压缩存储表示的稀疏矩阵向量乘并行算法:(1)在ELLPACK存储格式基础上按列分块及压缩矩阵,增加非零元的密度,提高SIMD利用率;(2)通过精心的数据重排,保留矩阵非零元本身的局部性,从而提高数据重用率,降低访存开销;(3)将矩阵压缩后划分成近似等大的矩阵块并静态等量分配到不同核上计算,使各核负载均衡.实验结果表明,与Intel Xeon Phi上已有的MKL数学库中的CSR算法相比,本算法获得了更高的计算访存比,性能比M KL的CSR算法平均快2.05倍. 展开更多
关键词 稀疏矩阵向量乘 数据布局重组 INTEL XEON PHI 分块压缩存储
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二元域大型稀疏矩阵向量乘的FPGA设计与实现 被引量:4
12
作者 苏锦柱 邬贵明 贾迅 《计算机工程与科学》 CSCD 北大核心 2016年第8期1530-1535,共6页
作为Wiedemannn算法的核心部分,稀疏矩阵向量乘是求解二元域上大型稀疏线性方程组的主要步骤。提出了一种基于FPGA的二元域大型稀疏矩阵向量乘的环网硬件系统架构,为解决Wiedemannn算法重复计算稀疏矩阵向量乘,提出了新的并行计算结构... 作为Wiedemannn算法的核心部分,稀疏矩阵向量乘是求解二元域上大型稀疏线性方程组的主要步骤。提出了一种基于FPGA的二元域大型稀疏矩阵向量乘的环网硬件系统架构,为解决Wiedemannn算法重复计算稀疏矩阵向量乘,提出了新的并行计算结构。实验分析表明,提出的架构提高了Wiedemannn算法中稀疏矩阵向量乘的并行性,同时充分利用了FPGA的片内存储器和吉比特收发器,与目前性能最好的部分可重构计算PR模型相比,实现了2.65倍的加速性能。 展开更多
关键词 稀疏矩阵向量乘 二元域 FPGA 吉比特收发器
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选择粗化函数优化并行稀疏矩阵向量乘法
13
作者 叶纬材 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期50-53,共4页
讨论了如何分划稀疏矩阵的非零元素以减少并行矩阵向量乘法的通信代价。通过以粗化函数为工具,统一现有的数据分划方法;提出一种基于行列分划为初解的粗化函数选取方法,在理论上的证明其运行效率与分划质量不逊于一维数据分划方法;实验... 讨论了如何分划稀疏矩阵的非零元素以减少并行矩阵向量乘法的通信代价。通过以粗化函数为工具,统一现有的数据分划方法;提出一种基于行列分划为初解的粗化函数选取方法,在理论上的证明其运行效率与分划质量不逊于一维数据分划方法;实验数据表明,该方法产生分划质量超过一维数据分划方法的结果,接近甚至超过二维细粒度方上法的结果。 展开更多
关键词 选择粗化函数 数据分划 并行 稀疏矩阵向量乘
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面向稀疏矩阵向量乘的DMA设计与验证
14
作者 曹亚松 刘胜 《计算机与数字工程》 2019年第11期2686-2690,共5页
稀疏矩阵向量乘法(SpMV)是迭代法求解大型线性方程组的核心算法,被广泛应用在科研和工程中。高性能共轭梯度算法(HPCG)是评价高性能计算系统性能的测试程序之一,需要多次调用SpMV进行迭代计算。但是,SpMV计算过程中包含大量不规则访存操... 稀疏矩阵向量乘法(SpMV)是迭代法求解大型线性方程组的核心算法,被广泛应用在科研和工程中。高性能共轭梯度算法(HPCG)是评价高性能计算系统性能的测试程序之一,需要多次调用SpMV进行迭代计算。但是,SpMV计算过程中包含大量不规则访存操作,降低了系统计算性能。基于X-DSP项目,在DMA中设计一条面向SpMV的专用数据通道实现不规则访存的功能,提高HPCG算法运算速度。设计代码的验证与综合结果表明预期的功能实现正确,且满足项目对时序、面积和功耗的要求。 展开更多
关键词 稀疏矩阵向量乘法(SpMV) 直接内存存取(DMA) 压缩稀疏行(CSR)
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稀疏矩阵向量乘的自动调优
15
作者 杜臻 谭光明 《计算物理》 CSCD 北大核心 2024年第1期33-39,共7页
分析稀疏矩阵向量乘(SpMV)程序优化的难点,介绍两个自动调优的代表性工作:基于预实现模板的SMAT和从头设计程序的AlphaSparse。详细介绍了它们的设计思路、实现细节、测试结果以及各自的优缺点。最后,对SpMV自动调优的发展趋势进行了分... 分析稀疏矩阵向量乘(SpMV)程序优化的难点,介绍两个自动调优的代表性工作:基于预实现模板的SMAT和从头设计程序的AlphaSparse。详细介绍了它们的设计思路、实现细节、测试结果以及各自的优缺点。最后,对SpMV自动调优的发展趋势进行了分析和预测。 展开更多
关键词 高性能科学计算 稀疏矩阵 自动调优 稀疏矩阵向量乘
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大规模稀疏矩阵的主特征向量计算优化方法 被引量:3
16
作者 王伟 陈建平 +2 位作者 曾国荪 俞莉花 谭一鸣 《计算机科学与探索》 CSCD 2012年第2期118-124,共7页
矩阵主特征向量(principal eigenvectors computing,PEC)的求解是科学与工程计算中的一个重要问题。随着图形处理单元通用计算(general-purpose computing on graphics pro cessing unit,GPGPU)的兴起,利用GPU来优化大规模稀疏矩阵的图... 矩阵主特征向量(principal eigenvectors computing,PEC)的求解是科学与工程计算中的一个重要问题。随着图形处理单元通用计算(general-purpose computing on graphics pro cessing unit,GPGPU)的兴起,利用GPU来优化大规模稀疏矩阵的图形处理单元求解得到了广泛关注。分别从应用特征和GPU体系结构特征两方面分析了PEC运算的性能瓶颈,提出了一种面向GPU的稀疏矩阵存储格式——GPU-ELL和一个针对GPU的线程优化映射策略,并设计了相应的PEC优化执行算法。在ATI HD Radeon5850上的实验结果表明,相对于传统CPU,该方案获得了最多200倍左右的加速,相对于已有GPU上的实现,也获得了2倍的加速。 展开更多
关键词 图形处理单元通用计算(GPGPU) 主特征向量计算 稀疏矩阵向量乘 线程优化
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基于CUDA编程模型的稀疏对角矩阵向量乘优化 被引量:3
17
作者 秦晋 龚春叶 +1 位作者 胡庆丰 刘杰 《计算机工程与科学》 CSCD 北大核心 2012年第7期78-83,共6页
稀疏矩阵向量乘是很多科学计算问题中的核心问题。本文针对稀疏对角矩阵,在DIA存储格式的基础上,设计了一种新型压缩存储格式CDIA,结合CUDA编程模型的特点,在计算线程上进行了细粒度的任务分配,同时为满足CUDA对存储器的合并访问要求,... 稀疏矩阵向量乘是很多科学计算问题中的核心问题。本文针对稀疏对角矩阵,在DIA存储格式的基础上,设计了一种新型压缩存储格式CDIA,结合CUDA编程模型的特点,在计算线程上进行了细粒度的任务分配,同时为满足CUDA对存储器的合并访问要求,将压缩矩阵做了相应的转置处理,设计了细粒度算法与程序,并根据稀疏矩阵向量乘特点,做了相应的程序优化。实验数据显示,这种存储格式能够很好地发挥CUDA在数据处理方面的优势,在测试数据中,最高获得了单精度39.6Gflop/s和双精度19.6Gflop/s的浮点计算性能,性能在Nathan Bell和Michael Garland的基础上分别提高了7.6%和17.4%。 展开更多
关键词 GPU CDIA CUDA 稀疏矩阵向量乘
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并行计算稀疏矩阵乘以向量的负载平衡算法 被引量:2
18
作者 刘杰 迟利华 +1 位作者 胡庆丰 李晓梅 《计算机工程与科学》 CSCD 2006年第3期76-77,91,共3页
稀疏矩阵乘以一个向量(SpM×V)的问题是许多大型应用问题的核心计算问题,文中提出了一种在并行计算机上并行计算SpM×V的负载平衡算法,计算复杂性为O(N)(N为稀疏矩阵的阶),而目前计算此类问题的最优负载平衡算法的计算复杂性为O... 稀疏矩阵乘以一个向量(SpM×V)的问题是许多大型应用问题的核心计算问题,文中提出了一种在并行计算机上并行计算SpM×V的负载平衡算法,计算复杂性为O(N)(N为稀疏矩阵的阶),而目前计算此类问题的最优负载平衡算法的计算复杂性为O(N.P)(P为处理机台数)。文章最后给出了并行数值实验。 展开更多
关键词 并行计算 稀疏矩阵乘以向量 负载平衡
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并行稀疏矩阵与向量乘的负载平衡和通信优化 被引量:1
19
作者 付朝江 张武 杨林峰 《水动力学研究与进展(A辑)》 CSCD 北大核心 2004年第z1期937-941,共5页
 本文考虑了在工作站机群上实现大型稀疏矩阵和向量乘的负载平衡。提出了一个快速负载平衡和有效的消息传递技术相结合的方法,来缓解计算和节点间通信。该方法的性能在工作站机群上进行测试,可获得良好结果;并且,通过I/O延迟隐藏和整...  本文考虑了在工作站机群上实现大型稀疏矩阵和向量乘的负载平衡。提出了一个快速负载平衡和有效的消息传递技术相结合的方法,来缓解计算和节点间通信。该方法的性能在工作站机群上进行测试,可获得良好结果;并且,通过I/O延迟隐藏和整体负载平衡使I/O开销能有效地分摊。 展开更多
关键词 稀疏矩阵-向量乘 负载平衡 并行计算 消息传递
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基于GPU的稀疏矩阵压缩存储格式研究
20
作者 陈闽昊 边浩东 《电子技术应用》 2024年第11期1-8,共8页
稀疏矩阵向量乘法(Sparse Matrix-Vector Multiplication,SpMV)是矩阵数值计算领域重要的线性代数子程序。通过对SpMV算法的负载均衡以及访存频度这两个关键性能瓶颈的研究,提出了一种VCSR(Vectorized Com‐pressed Sparse Row)稀疏矩... 稀疏矩阵向量乘法(Sparse Matrix-Vector Multiplication,SpMV)是矩阵数值计算领域重要的线性代数子程序。通过对SpMV算法的负载均衡以及访存频度这两个关键性能瓶颈的研究,提出了一种VCSR(Vectorized Com‐pressed Sparse Row)稀疏矩阵压缩存储格式。该格式根据各行非零元素分布的统计特性调整各个线程的数据负载来防止线程发散的问题,并且基于快速分段求和的策略以及使用矢量化的方法来提高SpMV流程的计算性能。通过使用佛罗里达大学的稀疏矩阵作为测试集,在GPU上进行性能测试,获得了相较CSR5(Compressed Sparse Row 5)格式平均10%到30%,最高50%的性能提升。 展开更多
关键词 稀疏矩阵向量乘 负载均衡 存储格式 分段求和 浮点运算 矢量化 图形处理器
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