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海子水牛瘤胃微生物的宏基因组学分析 被引量：12
1
作者 张慧敏 夏海磊 +4 位作者 黄强 绪欣 毛永江 岑宁 杨章平 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期4151-4161,共11页
为系统探讨海子水牛瘤胃内的微生物组成及木质纤维素降解酶系,本试验利用基于高通量测序的宏基因组学技术对海子水牛(2.5岁左右,平均体重为493 kg)瘤胃液样本进行组学分析。结果表明,共获得了77 283 638条reads,并拼接出744 712个scaff... 为系统探讨海子水牛瘤胃内的微生物组成及木质纤维素降解酶系,本试验利用基于高通量测序的宏基因组学技术对海子水牛(2.5岁左右,平均体重为493 kg)瘤胃液样本进行组学分析。结果表明,共获得了77 283 638条reads,并拼接出744 712个scaffold。经prodigal分析后,共预测出827 044个基因。通过基因注释发现海子水牛瘤胃中含有多种木质纤维素降解微生物,如生黄瘤胃球菌(Ruminococcus flavefaciens)、白色瘤胃球菌(Ruminococcus albus)、产琥珀酸丝状杆菌(Fibrobacter succinogenes)及栖瘤胃普雷沃氏菌(Prevotella ruminicola)。此外,还发现有38 011个基因编码蛋白质具有木质纤维素降解酶活性,其中糖苷水解酶(GH)基因数量最多(17 877个),糖基转移酶(GT)(8 637个)、碳水化合物结合模块(CBM)(4 693个)和碳水化合物酯酶(CE)基因(4 214个)数量次之,多糖裂合酶(PL)(1 296个)和辅助氧化还原酶(AA)基因(934个)数量较少。在GH基因中,归属于GH2、GH43、GH97、GH3家族的基因较多,且编码蛋白质具有寡糖降解酶活性的基因数量最多。此外还发现了少量的纤维小体组分蛋白基因。结合其他物种肠胃宏基因组中GH基因比对分析,发现海子水牛瘤胃中的纤维素酶、半纤维素酶和分支降解酶比例与奶牛瘤胃较为接近。由此可见,海子水牛瘤胃内含有丰富的木质纤维素降解微生物及酶系,这将为筛选具有工业应用潜力的酶基因奠定理论基础。 展开更多
关键词 海子水牛 瘤胃 宏基因组 微生物 木质纤维素降解酶
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海子水牛MSTN基因多样性与系统分化研究 被引量：3
2
作者 冀德君 常洪 +2 位作者 常春芳 耿荣庆 李永红 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2008年第2期164-167,共4页
针对牛肌肉生长抑制素基因(MSTN)编码区设计引物,以PCR扩增及测序的方法,检测了19头海子水牛样本的MSTN基因多样性,并对其系统分化进行研究。结果显示:海子水牛群体内MSTN基因编码区含1 128个碱基对,所检样本中存在3个核苷酸多态位点,... 针对牛肌肉生长抑制素基因(MSTN)编码区设计引物,以PCR扩增及测序的方法,检测了19头海子水牛样本的MSTN基因多样性,并对其系统分化进行研究。结果显示:海子水牛群体内MSTN基因编码区含1 128个碱基对,所检样本中存在3个核苷酸多态位点,但仅含有2种基因单型。说明海子水牛MSTN基因分化水平较低。 展开更多
关键词 海子水牛 MSTN基因 多态位点 基因分化
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海子水牛Cyt b基因序列分析 被引量：4
3
作者 李世平 常洪 +1 位作者 马国龙 陈宏宇 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2007年第30期9470-9471,9504,共3页
测定了18头海子水牛细胞色素b(Cyt b)基因全序列(1 140 bp)并对其进行了分析。Cyt b基因1 140个位点中,共发现10个可变位点,均为转换,其中1个位点引起氨基酸更换替代,其余可变位点均为同义替换。序列分析表明,海子水牛Cyt b基因表现出... 测定了18头海子水牛细胞色素b(Cyt b)基因全序列(1 140 bp)并对其进行了分析。Cyt b基因1 140个位点中,共发现10个可变位点,均为转换,其中1个位点引起氨基酸更换替代,其余可变位点均为同义替换。序列分析表明,海子水牛Cyt b基因表现出明显的碱基组成偏倚和密码子使用偏倚。研究发现,海子水牛终止密码子包括AGA和AGG两种,其中AGG为牛亚科动物Cyt b基因的终止密码子之一是国内外首次报道。18条Cyt b基因序列共定义了4种单倍型,单倍型多样性(Hd)为0.527,核苷酸多样性(Pi)为0.004 63,表明海子水牛的遗传多样度较高,推测海子水牛可能存在两种甚至更多不同的母系起源。 展开更多
关键词 海子水牛 细胞色素B基因 序列分析
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尼里-拉菲水牛及海子水牛瘤胃产甲烷菌多样性比较 被引量：1
4
作者 杨承剑 梁贤威 +4 位作者 梁辛 唐振华 郭艳霞 李孟伟 彭开屏 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第8期2296-2306,共11页
试验旨在比较尼里-拉菲水牛及海子水牛瘤胃液中产甲烷菌的多样性,选取成年雌性尼里-拉菲水牛及海子水牛各3头作为试验动物,采用口腔导管法收集瘤胃液,提取瘤胃液总DNA,采用产甲烷菌特异性引物Met86F/Met1340R扩增16S rDNA,构建16S rDNA... 试验旨在比较尼里-拉菲水牛及海子水牛瘤胃液中产甲烷菌的多样性,选取成年雌性尼里-拉菲水牛及海子水牛各3头作为试验动物,采用口腔导管法收集瘤胃液,提取瘤胃液总DNA,采用产甲烷菌特异性引物Met86F/Met1340R扩增16S rDNA,构建16S rDNA基因克隆文库。结果显示,从尼里-拉菲水牛和海子水牛中分别获得73、100条有效序列,均以Methanobrevibacter属为主。其中尼里-拉菲水牛有70条序列(17个OTUs)与已知菌的16S rDNA序列相似性≥97%,占总序列的95.89%,有3条序列(3个OTUs)与已知菌16S rDNA序列相似性处于93%~96%;海子水牛有70条序列(15个OTUs)与已知菌16S rDNA序列相似性≥97%,占总序列的70%,有30条序列(18个OTUs)与已培养菌16S rDNA序列相似性处于84%~96%。尼里-拉菲水牛和海子水牛瘤胃中的SGMT簇序列、RO簇序列所占总序列比例分别为76.71%、21.91%和76.00%、19.00%。系统进化树分析表明,所有序列分别聚集于两大分支上,其中海子水牛有16个OTUs代表序列和尼里-拉菲水牛8个OTUs代表序列聚集在进化树顶端的同一分支上,且系统发育距离与古菌中任何已知相似序列都相隔较远。综上所述,在本试验同等日粮条件下,尼里-拉菲水牛及海子水牛瘤胃内产甲烷菌序列均以Methanobrevibacter属为主,两水牛品种的SGMT簇序列比例基本一致,但尼里-拉菲水牛中的RO簇序列比例更高,海子水牛瘤胃内存在更多的未知产甲烷菌。 展开更多
关键词 尼里-拉菲水牛 海子水牛 瘤胃 产甲烷菌 多样性
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海子水牛的保种与开发利用 被引量：3
5
作者 程广凤 陆爱华 +1 位作者 刘德权 顾明法 《中国牛业科学》 2008年第5期60-62,共3页
从海子水牛的品种特性、发展历史出发,客观地分析了海子水牛保种的必要性,根据保种选育工作进展情况,详细制定了海子水牛的保种育种技术方案,并对如何开发利用这一品种资源进行了探讨。
关键词 海子水牛 保种 育种 开发利用
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一例海子水牛子宫外脱的临床保守疗法
6
作者 秦杰 赵亚军 张云霞 《畜牧兽医科技信息》 2007年第1期62-,共1页
关键词 海子水牛 子宫 女生殖器 子宫脱出 阴门
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浅谈德宏水牛品种资源保护设想与开发
7
作者 张家成 王岩相所 +2 位作者 叶丽明 王明东 和平 《中国畜牧业》 2024年第24期61-63,共3页
德宏水牛是云南著名地方优良品种,据永昌志记载,早在隋唐时期,就有乘象国饲养水牛记录,而那时的永昌(今云南保山)、南召(今大理)等地所饲养的水牛是由此地运入;现因德宏州内所饲养的水牛体型最大、质量最好,结合历史和现在故定名为德宏... 德宏水牛是云南著名地方优良品种,据永昌志记载,早在隋唐时期,就有乘象国饲养水牛记录,而那时的永昌(今云南保山)、南召(今大理)等地所饲养的水牛是由此地运入;现因德宏州内所饲养的水牛体型最大、质量最好,结合历史和现在故定名为德宏水牛。德宏水牛如今是中国八大水牛(广西西林水牛、广东兴隆水牛、福建福安水牛、云南德宏水牛、湖北滨湖水牛、四川德昌水牛、江苏海子水牛、上海水牛)之一,也是中国水牛中型种的代表种。 展开更多
关键词 地方优良品种 滨湖水牛 德宏水牛 中国水牛 福安水牛 海子水牛 德昌水牛 上海水牛
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