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椎间盘退行性变与473种肠道菌群的关系:芬兰数据库大数据信息可借鉴的意义
1
作者 王梓焜 李树栋 +3 位作者 高泷 范书豪 李城 孟纯阳 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第20期4369-4378,共10页
背景:有研究表明,调节肠道菌群可能会影响椎间盘退变的进程。然而,肠道菌群与椎间盘退变的因果关系尚不清楚。目的:采用孟德尔随机化方法来评估肠道菌群与椎间盘退变之间的潜在因果关系。方法:应用公开发表最新的473种肠道菌群的全基因... 背景:有研究表明,调节肠道菌群可能会影响椎间盘退变的进程。然而,肠道菌群与椎间盘退变的因果关系尚不清楚。目的:采用孟德尔随机化方法来评估肠道菌群与椎间盘退变之间的潜在因果关系。方法:应用公开发表最新的473种肠道菌群的全基因组关联分析汇总统计数据和芬兰数据库R11中的椎间盘退变的全基因组关联分析汇总数据(椎间盘退变病例46 205例和对照组322 314例)。采用逆方差加权法、MR-Egger回归法、加权中位数法、加权模型法和简单模型法来研究肠道菌群与椎间盘退变之间的因果关系。敏感性分析用于检验孟德尔随机化分析结果是否可靠。反向孟德尔随机化以全部肠道菌群作为结局进行效应分析和敏感性分析。结果与结论:(1)正向孟德尔随机化的逆方差加权法结果显示,毛螺菌目,UBA-6960科、嗜热厌氧杆菌科、盐单胞菌科、丛毛单菌属、戈登氏菌属和欧陆森氏菌属与椎间盘退变呈现正相关。短螺旋体目、假单胞菌目、短螺旋菌科、CAG-776属、螺杆菌属、CAG-448种sp003150135、CAG-776种sp000438195、布劳特氏菌种-A sp000285855和汉逊布劳氏菌种与椎间盘退变呈现负相关。(2)反向孟德尔随机化结果显示,椎间盘退变与玫瑰巴氏菌属、地电细菌属C、弗氏埃希菌种、弗氏丙酸杆菌种、UBA-1777种sp900319835、铜绿假单胞菌种和韦氏芽孢杆菌种呈正相关,与明串珠菌属、普雷沃氏菌种sp000434975、布劳特氏菌种-A sp000285855、CAG-194种sp002441865和CAG-590种sp000431135呈负相关。(3)双向敏感性分析均未发现存在异质性或水平多效性。(4)上述结果说明,基于芬兰数据库探究肠道菌群与椎间盘退变的因果关系,为临床上椎间盘退变的早期预测及治疗探索了新的生物标志物。另外,对于中国生物医学研究,可以借鉴建立大型数据库,整合多中心的医疗数据,为肠道菌群与椎间盘退变关系的研究提供坚实基础,与其他国家的科研团队加强交流与合作,共同推动肠道菌群与疾病关系的研究,为全球医学发展作出贡献。 展开更多
关键词 孟德尔随机化 椎间盘退变 肠道菌群 全基因组关联分析 单核苷酸多态性 逆方差加权法 水平多效性 敏感性分析
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肠道菌群与药物相关性骨坏死:两样本双向孟德尔随机化分析 被引量：3
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作者 柴金莲 李树栋 +4 位作者 李威 杜海涛 董丽敏 梁学振 王平 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第27期4325-4331,共7页
背景:药物相关性骨坏死是一类应用药物后出现的严重不良反应。大量的证据表明,肠道菌群与药物相关性骨坏死有关。然而,肠道菌群对药物相关性骨坏死的因果关系尚不清楚。目的:采用孟德尔随机化方法来评估肠道菌群与药物相关性骨坏死风险... 背景:药物相关性骨坏死是一类应用药物后出现的严重不良反应。大量的证据表明,肠道菌群与药物相关性骨坏死有关。然而,肠道菌群对药物相关性骨坏死的因果关系尚不清楚。目的:采用孟德尔随机化方法来评估肠道菌群与药物相关性骨坏死风险之间的潜在因果关系。方法:使用MiBioGen联盟肠道菌群的全基因组关联分析(GWAS)汇总统计数据(n=13266)和芬兰R9数据库中药物相关性骨坏死的GWAS数据(264例药物相关性骨坏死患者和377013例健康对照者)。采用逆方差加权法、MR-Egger回归法、加权中位数法、加权模型法和简单模型法来研究肠道菌群与药物相关性骨坏死之间的因果关系。敏感性分析用于检验孟德尔随机化分析结果是否可靠。反向孟德尔随机化以全部肠道菌群作为结局进行效应分析和敏感性分析。结果与结论:①逆方差加权法结果显示,黏胶球形菌门、黏胶球形菌纲、黑色素杆菌纲、嗜胃杆菌目、红螺菌目、食物谷菌目和双歧杆菌属与药物相关性骨坏死呈直接的正向因果关联;甲烷杆菌纲、芽孢杆菌目、甲烷杆菌目、毛螺菌科、甲烷杆菌科、霍尔德曼氏菌属、毛螺菌属(UCG010)、厌氧杆菌和泰泽氏菌属与药物相关性骨坏死呈直接的负向因果关联。②反向孟德尔随机化结果显示,药物相关性骨坏死与梭菌科、消化链球菌科、链球菌科、梭状芽胞杆属和链球菌属呈直接的负向因果关联,与艾森伯格菌属呈直接的正向因果关联。③双向敏感性分析均未发现存在异质性或水平多效性。④结果证实,肠道菌群作为暴露,药物相关性骨坏死作为结局,7种细菌性状对药物相关性骨坏死呈正相关因果关系,9种细菌性状对药物相关性骨坏死呈负相关因果关系;药物相关性骨坏死作为暴露,肠道菌群作为结局,药物相关性骨坏死与5种细菌性状有负相关因果关系,与1种细菌性状有正相关因果关系。改变肠道菌群的多样性和组成,有望改善药物相关性骨坏死的发病与预后,为骨科疾病的研究提供了思路。 展开更多
关键词 药物相关性骨坏死 肠道菌群 孟德尔随机化 单核苷酸多态性 全基因组关联分析 因果关系 逆方差加权法 异质性 水平多效性 敏感性分析
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慢性肩颈痛与慢性腰痛的因果关系:一项双向孟德尔随机化研究
3
作者 金晖 吴洁 +3 位作者 吴睿哲 马怀玉 曾景奇 王凡 《颈腰痛杂志》 2025年第2期320-325,共6页
目的探讨慢性肩颈疼痛与慢性腰痛之间的因果联系,为早期干预和个体化治疗提供帮助。方法利用全基因组关联研究(GWAS)获取慢性肩颈疼痛和慢性腰痛的遗传工具变量,并采用逆方差加权(IVW)法、MR-Egger回归法和加权中位数(WME)法进行孟德尔... 目的探讨慢性肩颈疼痛与慢性腰痛之间的因果联系,为早期干预和个体化治疗提供帮助。方法利用全基因组关联研究(GWAS)获取慢性肩颈疼痛和慢性腰痛的遗传工具变量,并采用逆方差加权(IVW)法、MR-Egger回归法和加权中位数(WME)法进行孟德尔随机化分析(MR)。同时对分析结果进行异质性检验和多效性分析。结果对于慢性肩颈疼痛,筛选后获得了13个单核苷酸多样性(SNP)作为工具变量,IVW法、MR-Egger法和WME法的结果显示,OR值和95%置信区间(CI)分别为1.334(95%CI:1.196~1.487)、1.237(95%CI:0.934~1.639)和1.359(95%CI:1.167~1.581)。对于慢性腰痛,筛选后获得了12个SNP作为工具变量,IVW法、MR-Egger法和WME法的结果显示,OR值和95%CI分别为1.273(95%CI:1.126~1.438)、1.007(95%CI:0.779~1.300)和1.225(95%CI:1.454~1.032)。在双向MR分析中,异质性检验结果均显示不存在异常变量,敏感性分析结果表明稳健性良好,并且结果不具有多效性。结论慢性肩颈疼痛与慢性腰痛之间存在双向因果关联。 展开更多
关键词 慢性肩颈疼痛 慢性腰痛 双向孟德尔随机化 全基因组关联研究 水平多效性 因果关联
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