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比较分子力场分析法(CoMFA)的研究新进展 被引量：11
1
作者 朱杰 盛春泉 张万年 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 2000年第2期203-207,共5页
Co MFA是目前 3D- QSAR中应用最广且最为成功的一种方法 ,但其在设计思想和实施过程中还存在一定缺陷 ,主要表现在匹配规则、新场引入、变量选择及数据处理等几个方面。本文对近年来关于 Co MFA方法的各种改进研究做了较为系统的综述 ,... Co MFA是目前 3D- QSAR中应用最广且最为成功的一种方法 ,但其在设计思想和实施过程中还存在一定缺陷 ,主要表现在匹配规则、新场引入、变量选择及数据处理等几个方面。本文对近年来关于 Co MFA方法的各种改进研究做了较为系统的综述 ,并就Co MFA在药物设计中的作用进行了展望。 展开更多
关键词 比较分子场分析法 3D-QSAR 匹配规则 药物设计
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单环β-内酰胺对大肠杆菌受体作用三维构效关系的比较分子力场分析(CoMFA)
2
作者 胡键 李恒光 +2 位作者 吴彤 谢如刚 吕丁 《四川大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期220-225,共6页
模拟受体活性部位与配体分子间作用的势场模型，从三维空间进一步探讨单环β－内酰胺抗生素构效关系，指导新化合物设计与合成．我们根据活性类似物原理，采用比较分子力场分析（ＣｏＭＦＡ）方法，对已知的２６个单环β－内酰胺化合物... 模拟受体活性部位与配体分子间作用的势场模型，从三维空间进一步探讨单环β－内酰胺抗生素构效关系，指导新化合物设计与合成．我们根据活性类似物原理，采用比较分子力场分析（ＣｏＭＦＡ）方法，对已知的２６个单环β－内酰胺化合物对大肠杆菌作用的构效关系进行了研究．模拟了大肠杆菌青霉素结合蛋白（ＰＢＰｓ）与配体分子间的作用力场和静电力场模型．该模型有利于指导新型β－内酰胺抗生素ｍｅ－ｔｏｏ类药物的设计． 展开更多
关键词 Β-内酰胺抗生素 3D-定量构效关系 比较分子力场分析 comfa大肠杆菌 抗菌活性 药物代谢动力学
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含氟农药的比较分子场分析研究 被引量：13
3
作者 谷妍 董喜城 +4 位作者 陈海峰 陈敏伯 张世相 袁身刚 郑崇直 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2000年第12期1540-1545,共6页
用比较分子场分析(CoMFA)方法对112种含氟农药分子的生物活性及毒性同时进行了定量构效关系研究.用78个化合物作为训练集,以距离比较方法(DISCO)确认的药效团为叠合规则构建CoMFA模型,发现影响活性的立体场与静电场的贡献分别为60.4％和... 用比较分子场分析(CoMFA)方法对112种含氟农药分子的生物活性及毒性同时进行了定量构效关系研究.用78个化合物作为训练集,以距离比较方法(DISCO)确认的药效团为叠合规则构建CoMFA模型,发现影响活性的立体场与静电场的贡献分别为60.4％和39.6％,影响毒性的立体场与静电场的贡献分别为59.2％和40.8％.药效模型与毒效模型在交叉验证时的相关系数平方(R^2)分别为0.652和0.611,非交叉验证的R^2分别为0.982和0.977,方差比F(8,69)值分别为463.6及362.9,活性和毒性的标准偏差-极差比s/Δγ值分别为3.6％和2.9％.,表明模型具有较好的自预测能力.对测试组34个化合物进行了活性和毒性的预测,活性与毒性预测的标准偏差-极差比s/Δγ值分别为10.4％和6.4％.最后,还建立了一个由97个化合物构建的扩大的模型,各种统计量得到了进一步提高.并预计了一个活性较高且毒性很低的新化合物. 展开更多
关键词 3D-QSAR 比较分子场分析 含氟农药 生物活性
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比较分子场分析法(CoMFA)研究三嗪类抗鸡球虫化合物 被引量：2
4
作者 James W. McFarland 郑文丽 《中国兽医寄生虫病》 2005年第4期41-45,共5页
关键词 鸡 球虫病 三嗪类化合物 比较分子场分析法 三维定量构效关系 生物活性
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比较分子场分析方法研究的最新进展 被引量：27
5
作者 侯廷军 徐筱杰 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 2001年第6期436-440,共5页
比较分子场分析方法 ( Co MFA)是目前在三维定量构效关系 ( 3D- QSAR)中应用最为广泛的方法之一。但传统的比较分子场分析方法在具体的实现过程中还存在着一些缺陷和不足 ,包括分子场势能函数的选择 ,活性构象的确定 ,分子的叠合以及分... 比较分子场分析方法 ( Co MFA)是目前在三维定量构效关系 ( 3D- QSAR)中应用最为广泛的方法之一。但传统的比较分子场分析方法在具体的实现过程中还存在着一些缺陷和不足 ,包括分子场势能函数的选择 ,活性构象的确定 ,分子的叠合以及分子场变量的选取等等。本文结合我们科研组的工作 ,就近几年Co MFA方法的最新进展做了较为详细的阐述 ,同时对 Co 展开更多
关键词 比较分子场分析 药物设计 三维定量构效关系 遗传算法 药物活性 结构
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硝基芳烃类含能材料撞击钝度的比较分子力场分析 被引量：5
6
作者 唐自强 杨伟华 +2 位作者 堵锡华 李鸣建 冯长君 《化学研究与应用》 CSCD 北大核心 2017年第8期1211-1215,共5页
基于比较分子力场分析(CoMFA)方法建立34种硝基芳烃类炸药分子的结构与撞击钝度(DH)的三维定量构效关系(3D-QSAR)。训练集中28个化合物用于建立预测模型,测试集6个化合物作为模型验证。已建立的CoMFA模型的交叉验证系数(Q^2)、非交叉验... 基于比较分子力场分析(CoMFA)方法建立34种硝基芳烃类炸药分子的结构与撞击钝度(DH)的三维定量构效关系(3D-QSAR)。训练集中28个化合物用于建立预测模型,测试集6个化合物作为模型验证。已建立的CoMFA模型的交叉验证系数(Q^2)、非交叉验证系数(R^2)分别为0.432、0.923,说明所建模型具有较强的稳定性和良好的预测能力。该模型中立体场、静电场贡献率依次为37.9%、62.1%,表明影响撞击钝度DH的主要因素是取代基的电荷分布,其次是取代基的空间位阻。所建模型可用于指导该类化合物的设计。 展开更多
关键词 硝基芳烃类炸药 撞击钝度 比较分子力场分析 三维定量构效关系
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用比较分子力场和比较分子相似性指数分析方法对氮蒽类化合物抗癌活性的三维定量构效关系研究(英文) 被引量：2
7
作者 栾锋 姚小军 +1 位作者 张海霞 刘满仓 《兰州大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期71-78,共8页
用比较分子力场(CoMFA)和比较分子相似性指数分析方法(CoMSIA)对一系列与DNA结合的氮蒽类化合物的潜在抗癌活性进行了3D定量构效关系的研究,对模型中的一些参数进行了优化以期得到最好的三维定量构效关系模型,优化结果显示用CoMSIA构建... 用比较分子力场(CoMFA)和比较分子相似性指数分析方法(CoMSIA)对一系列与DNA结合的氮蒽类化合物的潜在抗癌活性进行了3D定量构效关系的研究,对模型中的一些参数进行了优化以期得到最好的三维定量构效关系模型,优化结果显示用CoMSIA构建的模型优于用CoMFA构建的模型．通过CoMSIA分析,用训练集所建立的模型有较好的统计性(20个化合物,q2=0．666,r2=0．916),测试集化合物的预测活性与实验值有很好的一致性．本文还给出了主要分子力场的等势线图． 展开更多
关键词 比较分子力场 比较分子相似性指数分析方法 三维定量构效关系
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α_1-AR拮抗剂DDPH类似物的比较分子力场分析 被引量：6
8
作者 习保民 赵文娜 +1 位作者 邹建卫 倪沛洲 《Chinese Journal of Structural Chemistry》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第8期962-968,共7页
利用比较分子力场分析(CoMFA)方法, 建立苯(氧)烷胺类α1-肾上腺素受体拮抗剂DDPH及其类似物的三维定量构效关系模型。交叉验证回归系数q2、非交叉验证回归系数r2和标准偏差SEE分别为0.457, 0.953, 0.208,研究结果显示立体场比静电场对... 利用比较分子力场分析(CoMFA)方法, 建立苯(氧)烷胺类α1-肾上腺素受体拮抗剂DDPH及其类似物的三维定量构效关系模型。交叉验证回归系数q2、非交叉验证回归系数r2和标准偏差SEE分别为0.457, 0.953, 0.208,研究结果显示立体场比静电场对活性的影响更大。所得模型具有一定的预测能力,可用来指导设计新的苯氧烷胺类α1-肾上腺素受体拮抗剂 ,并为以后进一步的工作提供依据。 展开更多
关键词 比较分子力场分析 α1-肾上腺素受体拮抗剂 苯氧烷胺类 三维定量构效关系 盐酸非洛普 抗高血压药
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乙酰胆碱酯酶抑制剂定量构效关系的比较分子场分析 被引量：2
9
作者 赵文娜 黄美兰 +3 位作者 张兵 邹建卫 商志才 俞庆森 《浙江大学学报（理学版）》 CAS CSCD 2003年第2期196-200,共5页
乙酸胆碱酯酶抑制剂是治疗早老性痴呆病的主要药物 ,为了给合成提供一些理论依据 ,可以利用 3 D-QSAR中的 Co MFA方法研究乙酰胆碱酯酶抑制剂定量构效关系 .研究表明 ,从 PL S分析的 rcv2 ,r2值看 ,模型有较强的预测能力 ;从立体与静电... 乙酸胆碱酯酶抑制剂是治疗早老性痴呆病的主要药物 ,为了给合成提供一些理论依据 ,可以利用 3 D-QSAR中的 Co MFA方法研究乙酰胆碱酯酶抑制剂定量构效关系 .研究表明 ,从 PL S分析的 rcv2 ,r2值看 ,模型有较强的预测能力 ;从立体与静电作用分数比看 ,立体因素占主要地位 。 展开更多
关键词 乙酰胆碱酯酶抑制剂 定量构效关系 早老性痴呆 比较分子场分析 毒副作用 三维空间结构
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酪氨酸激酶抑制剂的比较分子场分析 被引量：3
10
作者 彭涛 裴剑锋 周家驹 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2003年第6期1076-1079,共4页
采用比较分子场分析 (Co MFA)方法研究了一组嘧啶类衍生物酪氨酸激酶抑制剂活性与结构的关系 .所得模型不仅能够很好地预报训练集中的化合物的活性 ,而且还可以准确地预报预报集中的化合物活性 .通过分析分子场等值面图在空间的分布 ,... 采用比较分子场分析 (Co MFA)方法研究了一组嘧啶类衍生物酪氨酸激酶抑制剂活性与结构的关系 .所得模型不仅能够很好地预报训练集中的化合物的活性 ,而且还可以准确地预报预报集中的化合物活性 .通过分析分子场等值面图在空间的分布 ,可以观察到叠加分子周围的立体和静电特征对化合物活性的影响 . 展开更多
关键词 酪氨酸激酶抑制剂 比较分子场分析 嘧啶类衍生物 活性 结构 三维定量构效关系 药物设计
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比较分子力场分析法在天然药物成分研究中的应用 被引量：1
11
作者 王涛 祝晨蔯 陈传兵 《中国药学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第24期1844-1846,共3页
目的综述了比较分子力场分析法(CoMFA法)的主要原理、优缺点及其在天然药物成分研究中的应用进展。方法利用天然药物成分结构不同进行分类,分别对各类天然药物成分三维构效研究的国内外现状进行归纳、分析。结果CoMFA法在各类天然药物... 目的综述了比较分子力场分析法(CoMFA法)的主要原理、优缺点及其在天然药物成分研究中的应用进展。方法利用天然药物成分结构不同进行分类,分别对各类天然药物成分三维构效研究的国内外现状进行归纳、分析。结果CoMFA法在各类天然药物成分的构效研究中均可获得预测能力强的定量构效关系(QSAR)模型。结论CoMFA法具有很好的应用前景。 展开更多
关键词 三维定量构效关系 比较分子力场分析法 药物设计
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两类HPPD酶抑制剂的比较分子场分析研究 被引量：3
12
作者 黄美兰 商志才 +2 位作者 邹建卫 杨定亚 俞庆森 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第9期1556-1563,共8页
用比较分子场分析法 (CoMFA)研究了环己二酮类及 3 烷基酸 2 环己烯酯类化合物的结构与活性的关系 .本研究从蛋白酶与底物动力学模拟的复合物结构出发构建两类抑制剂化合物分子的构象 ,并进行了全空间搜索 ,CoMFA分析得到了较好的模型 ... 用比较分子场分析法 (CoMFA)研究了环己二酮类及 3 烷基酸 2 环己烯酯类化合物的结构与活性的关系 .本研究从蛋白酶与底物动力学模拟的复合物结构出发构建两类抑制剂化合物分子的构象 ,并进行了全空间搜索 ,CoMFA分析得到了较好的模型 (交叉验证回归系数q2 =0 .779,模型的线性回归系数r2 =0 .989) .该方程不仅可以帮助推测抑制剂与受体的结合方式 ,还可定量地预测结构相近的类似物活性 ,为设计合成新的HPPD酶抑制剂提供了理论依据 . 展开更多
关键词 HPPD酶抑制剂 比较分子力场分析法 HPPD酶 动力学模拟 3-烷基酸-2-环乙烯酯 除草剂 结构活性 4-羟苯基丙酮酸双氧化酶 环己酮
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比较分子场分析方法与Hansch方法相结合的定合构效关系研究 被引量：3
13
作者 李仁利 《国外医学（药学分册）》 1996年第1期6-12,共7页
比较分子场分析（CoMFA）方法以其独特的优，或吸引了药物化学界的广泛注意，但其主要的不足之处恰好是Hansch方法可弥朴的。因此，CoMFA方法与Hansch方法相结合，可以起到取长补短的作用。本文结合实例综述了CoMFA方法与Hansch方法相... 比较分子场分析（CoMFA）方法以其独特的优，或吸引了药物化学界的广泛注意，但其主要的不足之处恰好是Hansch方法可弥朴的。因此，CoMFA方法与Hansch方法相结合，可以起到取长补短的作用。本文结合实例综述了CoMFA方法与Hansch方法相结合所取得的研究结呆，并分析了两种方法的主要优缺点，认为两种方法结合进行定量构效关系和药物设计研究将会有广阔的前景。 展开更多
关键词 比较分子场分析方法 Hansch方法 结构活性关系
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非肽类凝血酶抑制剂的比较分子力场分析 被引量：7
14
作者 韩晓峰 刘莹 +1 位作者 高莹 来鲁华 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第7期1136-1139,共4页
在血栓症和止血疗法中凝血酶起重要的生物调节作用,凝血酶抑制剂由于其溶血栓作用成为药物设计的热点.对非肽类芳基磺酸酯系列凝血酶抑制剂进行了三维定量构效关系研究,用Autodock方法和比较分子力场分析相结合构建了该类分子的定量构... 在血栓症和止血疗法中凝血酶起重要的生物调节作用,凝血酶抑制剂由于其溶血栓作用成为药物设计的热点.对非肽类芳基磺酸酯系列凝血酶抑制剂进行了三维定量构效关系研究,用Autodock方法和比较分子力场分析相结合构建了该类分子的定量构效关系模型,得到三维等值线图.模型的传统相关系数r^2=0.956,交叉验证系数q^2=0.681,F_(4.16)=85.985,标准偏差S=0.158.该模型为凝血酶抑制剂的进一步结构改造提供了有益的启示. 展开更多
关键词 非肽类凝血酶抑制剂 比较分子力场分析 结构 血栓症 止血疗法 三维定量构效关系
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γ-羟基丁烯羟酸内酯类内皮激素拮抗剂的比较分子场分析 被引量：2
15
作者 顾长明 侯廷军 徐筱杰 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2001年第11期1864-1868,共5页
采用比较分子场分析方法 ( Co MFA)分析了一组 γ-羟基丁烯羟酸内酯类内皮激素拮抗剂的活性与结构的关系 .在计算中 ,除了考察立体场和静电场 ,还引入了氢键场 ,结果表明 ,引入氢键场可以明显改善计算的结果 .所得模型不仅能够很好地预... 采用比较分子场分析方法 ( Co MFA)分析了一组 γ-羟基丁烯羟酸内酯类内皮激素拮抗剂的活性与结构的关系 .在计算中 ,除了考察立体场和静电场 ,还引入了氢键场 ,结果表明 ,引入氢键场可以明显改善计算的结果 .所得模型不仅能够很好地预测训练集中的分子 ,而且还可准确地预测测试集中的化合物 .通过分析分子场等值面图在空间的分布 ,可以观察到叠合分子周围的立体、静电以及氢键特征对化合物活性的影响 . 展开更多
关键词 γ-羟基丁烯羟酸内酯 内皮激素 拮抗剂 比较分子场法分析 血管收缩药物 抑制作用 抑制剂
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二氢嘧啶酮类α_(1A)-肾上腺素受体拮抗剂的比较分子力场分析 被引量：1
16
作者 张瀛 张立伟 李嘉宾 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期216-221,共6页
采用比较分子力场分析(CoMFA)构建了二氢嘧啶酮类α1A-肾上腺素受体拮抗剂的三维定量构效关系模型。交叉验证相关系数(q2)、非交叉验证相关系数(r2)和标准偏差(SEE)分别为0.604、0.987和0.105,研究结果显示静电场对活性的影响大于立体... 采用比较分子力场分析(CoMFA)构建了二氢嘧啶酮类α1A-肾上腺素受体拮抗剂的三维定量构效关系模型。交叉验证相关系数(q2)、非交叉验证相关系数(r2)和标准偏差(SEE)分别为0.604、0.987和0.105,研究结果显示静电场对活性的影响大于立体场。所构建的模型具有一定的预测能力,可用于指导设计新的二氢嘧啶酮类α1A-肾上腺素受体拮抗剂,为该类化合物的结构优化提供理论依据。 展开更多
关键词 α1A-肾上腺素受体拮抗剂 比较分子力场分析 二氢嘧啶酮
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3-哌啶甲酸和四氢烟酸的4,4-二芳基-3-丁烯衍生物的三维定量构效关系(比较分子力场分析)研究(英文) 被引量：1
17
作者 郑剑斌 闻韧 +1 位作者 罗小民 蒋华良 《中国药物化学杂志》 CAS CSCD 2004年第4期197-201,208,共6页
目的研究 3 哌啶甲酸和四氢烟酸的 4 ,4 二芳基 3 丁烯衍生物结构和对γ 氨基丁酸摄取抑制活性之间的关系。方法使用三维定量构效关系 (3D QSAR)———比较分子场分析 (CoMFA)方法进行构效关系研究。结果交叉验证系数q2和非交叉验证系... 目的研究 3 哌啶甲酸和四氢烟酸的 4 ,4 二芳基 3 丁烯衍生物结构和对γ 氨基丁酸摄取抑制活性之间的关系。方法使用三维定量构效关系 (3D QSAR)———比较分子场分析 (CoMFA)方法进行构效关系研究。结果交叉验证系数q2和非交叉验证系数r2 分别为 0 72 6和 0 986 ,方差比F为 117 5 6 2 ,标准估计误差 (SEE)为 0 0 6 2。结论这些数值表明所得的CoMFA模型有实际意义 ,并且对 3 哌啶甲酸和四氢烟酸的 4 ,4 二芳基 3 丁烯衍生物抑制活性具有较好的预测能力。 展开更多
关键词 药物化学 三维定量构效关系 比较分子场分析 3-哌啶甲酸衍生物 四氢烟酸衍生物 GABA摄取抑制剂
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吡咯烷类胞液型磷脂酶A2抑制剂的比较分子力场分析
18
作者 黄常康 高莹 +2 位作者 刘振明 刘莹 来鲁华 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第1期79-81,共3页
胞液型磷脂酶A2能引发关节炎,针对胞液型磷脂酶A2的抑制剂有可能成为治疗关节炎的特效药,因此引起了广泛的关注.文章对于吡咯烷类胞液型磷脂酶A2抑制剂进行了三维定量构效关系研究,利用比较分子力场分析构建了该类分子的定量构效关系,... 胞液型磷脂酶A2能引发关节炎,针对胞液型磷脂酶A2的抑制剂有可能成为治疗关节炎的特效药,因此引起了广泛的关注.文章对于吡咯烷类胞液型磷脂酶A2抑制剂进行了三维定量构效关系研究,利用比较分子力场分析构建了该类分子的定量构效关系,得到三维等值线图,为胞液型磷脂酶A2抑制剂的进一步改造提供了有益的启示. 展开更多
关键词 胞液型磷脂酶A2抑制剂 比较分子力场分析 吡咯烷类抑制剂 抗炎症药物 结构 活性 定量构效关系
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应用分子图形学、分子力学、量子化学及静电势研究农药分子结构与性能关系(ΧⅢ)──用比较分子力场方法研究4-肟醚基喹唑啉类化合物的结构与抗烟草花叶病毒活性的三维构效关系 被引量：2
19
作者 方亚寅 王霞 +4 位作者 李慧英 马翼 袁满雪 黄润秋 赖城明 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2001年第4期587-590,共4页
应用比较分子力场分析 (Co MFA)方法研究 4 -肟醚基喹唑啉类化合物抗烟草花叶病毒活性的三维构效关系 (3 D-QSAR) ,引入分子的摩尔折射率 (MR)和偶极矩 (DIPOLE)分别作为 Co MFA的第三和第四个场 .在此基础上进行偏最小二乘 (PLS)分析 ... 应用比较分子力场分析 (Co MFA)方法研究 4 -肟醚基喹唑啉类化合物抗烟草花叶病毒活性的三维构效关系 (3 D-QSAR) ,引入分子的摩尔折射率 (MR)和偶极矩 (DIPOLE)分别作为 Co MFA的第三和第四个场 .在此基础上进行偏最小二乘 (PLS)分析 :交叉验证 (leave-one-out)结果为 r2cv=0 .4 43 ,非交叉验证 (novalidation)结果为 r2 =0 .93 2 ,说明所建立的模型有较好的可靠性 ,并且在三维等值线图的基础上得到了一个此类化合物的模拟作用模型 。 展开更多
关键词 三维定量构效关系 比较分子力场分析 4-肟醚基喹2唑啉类化合物 抗烟草花叶病毒活性 农药 结构 性能
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喹唑啉衍生物抗癌活性的比较分子力场研究 被引量：1
20
作者 冯长君 蔡可迎 +1 位作者 杨伟华 沐来龙 《武汉理工大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期62-65,共4页
运用比较分子力场分析(CoMFA)方法,建立了16种标题化合物对鼠白血病抗癌活性的三维构效模型(3D-QSAR)。在CoMFA研究中,考察了网格结构、步长及探针原子等因素对统计结果的影响。该模型显示立体场、静电场对生物活性贡献依次为61.5%、38.... 运用比较分子力场分析(CoMFA)方法,建立了16种标题化合物对鼠白血病抗癌活性的三维构效模型(3D-QSAR)。在CoMFA研究中,考察了网格结构、步长及探针原子等因素对统计结果的影响。该模型显示立体场、静电场对生物活性贡献依次为61.5%、38.5%,其中立体场是造成这些化合物抗肿瘤活性差异的主要因素。此3D-QSAR模型的交叉验证系数(q2)为0.320,非交互验证系数(R2)为0.992。所建的3D-QSAR模型及其三维等值线图可用于指导新型抗肿瘤喹唑啉衍生物的设计与结构优化。 展开更多
关键词 喹唑啉类衍生物 抗癌活性 比较分子力场分析 三维定量结构-活性相关性
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