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黄瓜抗病基因类似序列(RGA)的同源性分析和Southern鉴定 被引量:13
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作者 丁国华 池春玉 +1 位作者 周秀艳 秦智伟 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期355-360,共6页
使用ClustalW和DNAMAN3.0分析了本实验室克隆的15个黄瓜抗病基因类似序列(RGA)之间以及与烟草的N基因、亚麻的L6基因和拟南芥的RPS2基因之间的同源性,并对这些RGA进行了PCR和Southern验证与分析。结果表明:15个黄瓜RGA中,核苷酸序列同... 使用ClustalW和DNAMAN3.0分析了本实验室克隆的15个黄瓜抗病基因类似序列(RGA)之间以及与烟草的N基因、亚麻的L6基因和拟南芥的RPS2基因之间的同源性,并对这些RGA进行了PCR和Southern验证与分析。结果表明:15个黄瓜RGA中,核苷酸序列同源性最高的是CsRGA2、CsR-GA4和CsRGA5,其次是CsRGA6、CsRGA7、CsRGA8和CsRGA9,CsRGA1和CsRGA3也存在较高的同源性;其余的RGA同源性较低。在氨基酸序列上也表现了相同的特征。与N、L6和RPS2等抗病基因的产物之间同源性最高46%,最低22%。根据核苷酸序列设计了15对特异引物,用PCR方法验证了所有黄瓜RGA的存在,其中CsRGA3在黄瓜品种间表现出多态性。利用特异引物PCR方法合成了15个黄瓜RGA的地高辛探针,与EcoRⅤ酶解的黄瓜‘215’、‘129’和‘L18’的基因组DNA进行Southern杂交,证实了各个RGA在基因组上的存在,同时发现,CsRGA9、CsRGA11~CsRGA15都是多拷贝,CsRGA3是单拷贝,其余为双拷贝。 展开更多
关键词 黄瓜 抗病基因类似序列 同源性 Southem杂交
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抗香蕉枯萎病的野生蕉抗病基因类似序列的克隆与表达(英文) 被引量:6
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作者 陈雅平 陈云风 +2 位作者 赵杰堂 黄霞 黄学林 《植物生理与分子生物学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期567-573,共7页
野生蕉是香蕉遗传改良的天然基因库。为了分离野生蕉中的抗病基因类似序列,根据核苷酸结合位点(nucleotide binding site,NBS)和丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶域设计简并性引物,以经过鉴定的抗香蕉枯萎病4号生理小种的野生蕉(Musa acuminata)叶... 野生蕉是香蕉遗传改良的天然基因库。为了分离野生蕉中的抗病基因类似序列,根据核苷酸结合位点(nucleotide binding site,NBS)和丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶域设计简并性引物,以经过鉴定的抗香蕉枯萎病4号生理小种的野生蕉(Musa acuminata)叶片cDNA为模板进行PCR扩增。经过对扩增产物进行克隆和测序,获得了6个500 bp左右的RGAs片段。其中有2个RGA(WNB1和WNB2)具有NB-ARC保守结构域特征,并且WNB1具有连续的ORF。其余4个RGAs(WST1、WST2、WST3和WST4)均具有丝氨酸,苏氨酸蛋白激酶域特征,且WST3编码的氨基酸序列与水稻抗叶斑病基因Xa21同源性很高。用半定量PCR分析枯萎病菌诱导后野生蕉叶片中RGAs的表达情况,结果表明WNB1和WST3受枯萎病菌诱导后表达量增强,这表明WNB1和WST3的表达可能与香蕉枯萎病抗性相关。 展开更多
关键词 野生蕉(Musa acuminata) 枯萎病 抗病基因类似序列(RGAs) 克隆 表达
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小麦抗病基因类似序列BRG1的分离与功能分析 被引量:2
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作者 李宁 黄茜 +4 位作者 刘燕 赵丹 刘艳 黄占景 张增艳 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期998-1004,共7页
利用cDNA-AFLP技术筛选到1个在抗黄矮病的小麦-中间偃麦草易位系YW642中特异表达的小麦抗病基因类似序列(BYDV resistance-related gene1,BRG1)的基因片段。利用cDNA末端快速扩增技术(RACE)和RT-PCR技术,从YW642中分离出BRG1基因全长cDN... 利用cDNA-AFLP技术筛选到1个在抗黄矮病的小麦-中间偃麦草易位系YW642中特异表达的小麦抗病基因类似序列(BYDV resistance-related gene1,BRG1)的基因片段。利用cDNA末端快速扩增技术(RACE)和RT-PCR技术,从YW642中分离出BRG1基因全长cDNA序列,获得了一个通读的抗病同源基因cDNA序列,编码由645个氨基酸组成的蛋白质,包含1个NB-ARC保守结构域和3个LRR结构域,该蛋白属于nucleotide-site binding,leucine-rich repeats(NBS-LRR)家族。荧光定量或半定量RT-PCR表达分析表明,BRG1在抗病小麦易位系YW642叶片中优势表达,受BYDV的诱导,BYDV接种后48h表达量最高,BRG1在感病小麦亲本中8601中表达量始终较低,随BYDV接种时间延长呈轻微的下调趋势;而且外源激素水杨酸(SA)与茉莉酸(JA)处理可上调该基因在YW642中的表达。利用病毒介导的基因沉默技术分析了BRG1基因的功能,结果表明该基因沉默的抗病小麦易位系YW642中BYDV相对含量增加,但未造成抗病性表型显著改变,说明该基因参与抗黄矮病反应,但不是小麦抗黄矮病重要基因。 展开更多
关键词 小麦-中间偃麦草易位系 小麦黄矮病抗性 CDNA-AFLP 抗病基因类似序列 病毒介导的基因沉默
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园艺及园林观赏植物抗病基因类似物的研究进展
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作者 习珺珺 于丽霞 +3 位作者 张亚萍 李斌 高则睿 鄢波 《中国园艺文摘》 2012年第4期35-38,88,共5页
目前已从不同植物中分别克隆出70余个植物抗病基因。根据已克隆的抗病基因的结构特征,可分为4大类:NBS-LRR、STK、胞外LRR、STK与胞外LRR。对于园艺及园林观赏植物抗病基因同源序列(RGA)的研究已应用在基因克隆、分子标记、基因定位和... 目前已从不同植物中分别克隆出70余个植物抗病基因。根据已克隆的抗病基因的结构特征,可分为4大类:NBS-LRR、STK、胞外LRR、STK与胞外LRR。对于园艺及园林观赏植物抗病基因同源序列(RGA)的研究已应用在基因克隆、分子标记、基因定位和基因进化中,但相关报道较少。RGA的分析,对于在果蔬生产及园林绿化上指导我们培育具有广谱性抗病的植物品种具有深远的意义。 展开更多
关键词 抗病基因类似序列 基因克隆 分子标记 基因定位 基因进化
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树木抗病基因研究进展 被引量:4
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作者 张谦 林善枝 +3 位作者 林元震 张志毅 王泽亮 杨俊杰 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第9期1921-1930,共10页
在长期进化过程中,植物形成了一系列防御机制,抵抗各类病原物入侵,抗病R基因在其中发挥着关键作用.R基因的研究,在农作物中取得很大进展,已成为植物病理学的研究热点.相比之下,树木抗病基因研究较为落后,虽从苹果、杨树和柚子中已分离... 在长期进化过程中,植物形成了一系列防御机制,抵抗各类病原物入侵,抗病R基因在其中发挥着关键作用.R基因的研究,在农作物中取得很大进展,已成为植物病理学的研究热点.相比之下,树木抗病基因研究较为落后,虽从苹果、杨树和柚子中已分离了几个与已知R基因具有类似结构与功能的基因,但还没有真正的树木抗病R基因被克隆出来;目前,大部分研究主要集中在利用分子标记构建连锁图谱,寻找抗病数量性状位点(Q uan titativetra it loc i,QTL)和与R基因紧密连锁或共分离的质量性状标记;其中一些标记已经应用在分子辅助选育中,并显示了诱人的应用前景.另外,利用已知抗病R基因的保守区域,从多种植物中已扩增出许多抗病基因类似序列,它们大多被转化为与R基因紧密连锁的标记或被当作抗病候选基因. 展开更多
关键词 QTL 遗传图谱 分子标记 R基因 抗病基因类似序列
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植物抗病基因研究现状 被引量:2
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作者 卢志国 韩建民 董金皋 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第z1期160-163,共4页
植物抗病基因研究是植物遗传学和植物病理学所关注的热点问题 ,主要介绍了近十年来植物抗病基因的研究进展 ,包括抗病基因的克隆方法 ,抗病基因的分类 ,抗病基因的结构特点及其功能 ,并讨论了抗病基因的应用前景。另外 。
关键词 植物抗病基因 抗病基因类似序列 克隆
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黄瓜RGA基因的半定量RT-PCR表达分析 被引量:6
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作者 丁国华 许春梅 +2 位作者 于虹 周秀艳 秦智伟 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期659-664,共6页
以黄瓜(Cucumis sativusL.)抗霜霉病品种东农129为材料,利用RT-PCR半定量法研究了接种霜霉病菌(Pseudoperonospora cubensisRostow)、喷施水杨酸(SA)和氯化钙(CaCl2)等不同处理对黄瓜抗病基因类似序列(RGA)表达的影响.结果表明:CsRGA1和... 以黄瓜(Cucumis sativusL.)抗霜霉病品种东农129为材料,利用RT-PCR半定量法研究了接种霜霉病菌(Pseudoperonospora cubensisRostow)、喷施水杨酸(SA)和氯化钙(CaCl2)等不同处理对黄瓜抗病基因类似序列(RGA)表达的影响.结果表明:CsRGA1和CsRGA5基因的表达受霜霉病菌的侵染而启动或加强,外施SA和CaCl2都能够增强其表达;CsRGA4和CsRGA8属于组成型表达基因,其表达可能与霜霉病菌的侵染无关;CsRGA2的表达与外施SA和CaCl2缺乏密切关联. 展开更多
关键词 黄瓜 抗病基因类似序列 半定量RT-PCR 表达分析
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小麦抗叶锈病基因Lr35的RGA分析 被引量:7
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作者 高倩 王海燕 +2 位作者 刘大群 李星 杨文香 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2008年第6期50-53,共4页
根据已知植物抗病基因的NBS,LRR等保守结构域设计引物,对小麦全套抗叶锈病近等基因系材料进行RGA分析。引物对Pto-kin1IN/XLRR-INV1从近等基因系TcLr35中扩增获得一条747 bp的特异性片段。序列分析表明,该片段与小麦基因片段Triticum ur... 根据已知植物抗病基因的NBS,LRR等保守结构域设计引物,对小麦全套抗叶锈病近等基因系材料进行RGA分析。引物对Pto-kin1IN/XLRR-INV1从近等基因系TcLr35中扩增获得一条747 bp的特异性片段。序列分析表明,该片段与小麦基因片段Triticum urartu clone BAC 210J24,Triticum monococcum DV92的BAC克隆231A16等具有较高同源性,为Lr35的克隆奠定了基础。 展开更多
关键词 小麦叶锈病 抗病基因 LR35 抗病基因类似序列
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野生二粒小麦抗条锈病基因YrH52的RGA分子标记 被引量:2
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作者 严俊 杨足君 程剑平 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期590-597,共8页
为开发与野生二粒小麦抗条锈病基因Yr H52紧密连锁的分子标记,并为该基因的克隆及应用奠定基础,运用RGA(Resistance gene analog)分子标记法,以Yr H52定位作图F2群体形成的F4抗性和感病基因池(Gene pool)及其亲本(抗病材料H52与感病材料... 为开发与野生二粒小麦抗条锈病基因Yr H52紧密连锁的分子标记,并为该基因的克隆及应用奠定基础,运用RGA(Resistance gene analog)分子标记法,以Yr H52定位作图F2群体形成的F4抗性和感病基因池(Gene pool)及其亲本(抗病材料H52与感病材料Ldn)进行多态性筛选分析,共获得17个RGA分子标记。使用已有的遗传图并进行MultiPoint分析,构建了由与抗性(H)和感病(L)两个亲本对应的显性位点组成的两个遗传图,即H遗传图和L遗传图。在H图中,Yr H52与10个RGA标记,即X_uhw3,X_uhw17,X_uhw18,X_uhw23,X_uhw36,X_uhw38,X_uhw46,X_uhw59,X_uhw62和X_uhw73紧密连锁,其中X_uhw23标记为共显性分子标记,连锁距离为1.0 c M。在L图中,发现X_uhw57,X_uhw68,X_uhw189,X_uhw192及其X_uhw23与Yr H52相聚成簇(Cluster)。本研究结果说明RGA分子标记结合集群分离分析法(Bulked segregant analysis,BSA)是一种快速开发与小麦抗病基因紧密连锁标记的有效方法,对小麦抗条锈病分子育种和抗病基因的克隆具有促进作用。 展开更多
关键词 野生二粒小麦 条锈病基因YrH52 遗传图 抗病基因类似序列 分子标记
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云南省区试玉米新品种抗性鉴定与RGA分析 被引量:1
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作者 马荣 吴景芝 +2 位作者 沙本才 吴毅歆 何月秋 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期208-213,共6页
2006年和2007年人工接种鉴定云南省区域试验42份新品种对灰斑病、大斑病(northern leaf blight,NLB)、小斑病(southern leaf blight,SLB)、弯孢霉叶斑病(Curvularia leafspot,CLS)、纹枯病(sheath blight,SB)、茎腐病(stem rot,SR)、穗... 2006年和2007年人工接种鉴定云南省区域试验42份新品种对灰斑病、大斑病(northern leaf blight,NLB)、小斑病(southern leaf blight,SLB)、弯孢霉叶斑病(Curvularia leafspot,CLS)、纹枯病(sheath blight,SB)、茎腐病(stem rot,SR)、穗腐病(ear rot,ER)、丝黑穗病(head smut,HS)、锈病(rust)等9种玉米病害的抗性,仅海97-4能兼抗7种病害,占2.38%。7个品种兼抗6种病害,占16.67%。13份品种兼抗5种病害,占30.96%。能兼抗5种以上病害的品种共20份,占总数的47.62%。采用抗病基因类似序列(resistance gene analogue,RGA)分析,可把这42份品种划分为6个类群。第1类群,对弯孢霉叶斑病、丝黑穗病表现出抗性;第2类群,对灰斑病、丝黑穗病表现抗性;第3类群对弯孢霉叶斑病、茎腐病、丝黑穗病表现抗性;第4类群,对丝黑穗病、大斑病、小斑病表现抗性;第5类群对弯孢霉叶斑病、大斑病、小斑病病表现抗性;第6类群对大斑病、小斑病表现抗性。 展开更多
关键词 玉米 抗性鉴定 抗病基因类似序列分析
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