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基因表达模式分析及软件系统 被引量:4
1
作者 谢建明 孙啸 +1 位作者 谢雪英 陆祖宏 《东南大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第2期201-204,共4页
研究和实现了 4种基因表达模式的聚类方法 ,开发了基因表达模式分析软件系统 .该软件包含了两两平均连锁聚类法、系统聚类法、自组织特征映射法和模糊聚类等聚类算法 ,其中模糊聚类算法是首次用于基因表达模式分析 .该软件同时具有数据... 研究和实现了 4种基因表达模式的聚类方法 ,开发了基因表达模式分析软件系统 .该软件包含了两两平均连锁聚类法、系统聚类法、自组织特征映射法和模糊聚类等聚类算法 ,其中模糊聚类算法是首次用于基因表达模式分析 .该软件同时具有数据过滤、多种相似性度量选择、聚类方法选择和结果可视化等功能 .对于同一组基因表达数据 ,可通过不同的聚类算法的组合 ,提供更多的基因分类信息 。 展开更多
关键词 基因表达模式 聚类分析 软件系统 模糊聚类 生物信息学软件 两两平均连锁聚类法 系统聚类法 自组织特征映射法
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cDNA微阵列检测萌发期水稻重要代谢基因表达模式 被引量:3
2
作者 孙亮先 董海涛 李德葆 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期299-303,共5页
使用含 2 2 0 0条水稻表达序列标签的 c DNA微阵列检测了萌发期水稻胚芽、胚轴 (含糊粉层和盾片 )、胚根的基因表达模式 ,得到 10 32个有效的基因表达数据。其中 ,在胚芽、胚根、胚轴中特异表达的基因数分别为 5 5、10 6和 36个。以胚... 使用含 2 2 0 0条水稻表达序列标签的 c DNA微阵列检测了萌发期水稻胚芽、胚轴 (含糊粉层和盾片 )、胚根的基因表达模式 ,得到 10 32个有效的基因表达数据。其中 ,在胚芽、胚根、胚轴中特异表达的基因数分别为 5 5、10 6和 36个。以胚轴为参比 ,70个基因在胚芽、胚根中均表达上调 ,包括延伸因子 1和多个核糖体蛋白基因 ,这些基因与顶端生长点的细胞分化和生长有关。胚轴特异表达的基因有 36个 ,大部分参与胚乳贮藏物质的代谢 ,如聚泛蛋白基因。 展开更多
关键词 CDNA微阵列 萌发期 基因表达模式 水稻 物质代谢 胚芽 胚轴 胚根
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籽鹅卵巢组织中雌激素受体基因表达模式的研究 被引量:1
3
作者 康波 杨焕民 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2009年第5期43-44,共2页
雌激素是重要的生殖激素之一,其作用的发挥受雌激素受体(estrogen receptor,ESR)介导。因此,研究雌激素受体表达的动态变化规律对阐明鹅卵巢发育和产蛋的分子调控机制具有重要意义。研究利用实时定量PCR技术检测发育期和产蛋期籽... 雌激素是重要的生殖激素之一,其作用的发挥受雌激素受体(estrogen receptor,ESR)介导。因此,研究雌激素受体表达的动态变化规律对阐明鹅卵巢发育和产蛋的分子调控机制具有重要意义。研究利用实时定量PCR技术检测发育期和产蛋期籽鹅卵巢组织中雌激素受体1(ESR1)和雌激素受体2(ESR2)表达的动态变化,为鹅卵巢组织中雌激素及其受体调控机理的研究奠定基础。 展开更多
关键词 雌激素受体 卵巢组织 基因表达模式 籽鹅 动态变化规律 实时定量PCR 分子调控机制 生殖激素
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桃果实采后乙烯合成及乙烯受体ETR1同源基因表达模式的研究 被引量:5
4
作者 谢永红 陈学年 +2 位作者 吕斌 丁志祥 欧毅 《西南园艺》 2005年第3期1-3,共3页
研究了温度和乙烯吸收剂对“南京白凤”桃(AmygdaluspersicaL.)果实采后乙烯生成和乙烯受体ETR1同源基因表达的影响。结果表明,低温和乙烯吸收剂处理降低了果实乙烯释放量,延缓乙烯释放高峰期。定量PCR分析表明,ETR1的mRNA表达水平受温... 研究了温度和乙烯吸收剂对“南京白凤”桃(AmygdaluspersicaL.)果实采后乙烯生成和乙烯受体ETR1同源基因表达的影响。结果表明,低温和乙烯吸收剂处理降低了果实乙烯释放量,延缓乙烯释放高峰期。定量PCR分析表明,ETR1的mRNA表达水平受温度和乙烯吸收剂调节,随着乙烯合成能力的增强,ETR1同源基因的表达水平增加,在桃果实乙烯信号传导过程中呈正向表达模式。 展开更多
关键词 ETR1 乙烯受体 果实采后 基因表达模式 乙烯合成 乙烯吸收剂 mRNA表达 乙烯释放量 定量PCR 乙烯生成 合成能力 同源基因 信号传导 高峰期 分析表 桃果实 温度 水平
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水稻化感抑草的基因表达模式研究(摘要)
5
作者 方长旬 徐铁城 +2 位作者 王大红 沈荔花 林文雄 《中国稻米》 2013年第4期147-147,共1页
杂草危害是水稻产量的主要生物限制因子之一,利用水稻化感作用来控制田间杂草的这种环境友好型技术可望在可持续农业发展中发挥作用。基因表达调控是水稻化感抑草作用形成的核心过程。本研究发现在稗草胁迫下,化感水稻P1312777的PAL... 杂草危害是水稻产量的主要生物限制因子之一,利用水稻化感作用来控制田间杂草的这种环境友好型技术可望在可持续农业发展中发挥作用。基因表达调控是水稻化感抑草作用形成的核心过程。本研究发现在稗草胁迫下,化感水稻P1312777的PAL基因家族的多数成员基因均上调表达, 展开更多
关键词 基因表达模式 水稻产量 化感作用 摘要 基因表达调控 环境友好型 限制因子 杂草危害
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普通小麦Px基因表达模式与转换的激素调节 被引量:1
6
作者 程炜中 《自然杂志》 1990年第10期700-701,共2页
在高等植物个体发育过程中,Px(过氧化物酶)同工酶的表达不仅具有严格的品种基因型、组织器官和生长发育时期的特异性,还可被外源激素所调节。
关键词 PX 基因表达模式 个体发育过程 同工酶 生长发育时期 激素调节 时空特异性 转换规律 外源激素 过氧化物酶
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不同成骨诱导作用下骨髓间充质干细胞的基因表达模式 被引量:8
7
作者 段瑞平 吴凌 +3 位作者 林云锋 刘磊 汤炜 田卫东 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期856-859,共4页
目的研究骨髓间充质干细胞不同成骨分化模式的分子调控机制,为将其作为骨组织缺损基因治疗的载体细胞奠定理论基础。方法用密度梯度离心结合贴壁培养法分离纯化小鼠骨髓间充质干细胞(MSCs),传代扩增后分别用矿化培养基(100nmol/L地塞米... 目的研究骨髓间充质干细胞不同成骨分化模式的分子调控机制,为将其作为骨组织缺损基因治疗的载体细胞奠定理论基础。方法用密度梯度离心结合贴壁培养法分离纯化小鼠骨髓间充质干细胞(MSCs),传代扩增后分别用矿化培养基(100nmol/L地塞米松、10mmol/Lβ-甘油磷酸钠和50mg/mL抗坏血酸)与重组人骨形成蛋白-2(rhBMP-2,500ng/mL)进行诱导,分别于诱导后1、2周行茜素红染色鉴定钙结节形成情况;诱导后1、2和3d时用RT-PCR检测Runx2、Osx、OCN和Col的基因表达情况。结果矿化诱导组和rhBMP-2诱导组,茜素红染色均呈阳性钙结节,但矿化诱导组细胞于1周后形成矿化结节,时间早于rhBMP-2诱导组(2周后形成矿化结节);RT-PCR显示,在矿化诱导组,Runx2在诱导的1、2、3d均没有表达,Osx在诱导后2、3d有表达,OCN和Col在诱导的1、2、3d均有表达;在rhBMP-2诱导组,Runx2和Osx于诱导的第2d开始表达,OCN和Col在诱导的1、2、3d均表达。结论与rhBMP-2相比,矿化培养基通过更为直接的信号传导方式调控着骨髓间充质干细胞向成骨细胞分化,因此矿化培养基诱导骨髓间充质干细胞形成矿化结节的能力强于rhBMP-2。 展开更多
关键词 骨髓间充质干细胞 矿化诱导 骨形成蛋白-2 基因表达模式
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用主成分分析探索基因表达模式 被引量:2
8
作者 王成雄 饶妮妮 王玉 《生物医学工程学杂志》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第4期736-741,共6页
以时间点(阵列)为变量,对酵母时间表达序列进行主成分分析,提取出三个主成分:第一主成分代表整个酵母细胞周期中平稳的基因表达状态,第二主成分代表酵母细胞周期中lateG1期和M期差异的基因表达状态,第三主成分表示的是earlyG1期和S/G2... 以时间点(阵列)为变量,对酵母时间表达序列进行主成分分析,提取出三个主成分:第一主成分代表整个酵母细胞周期中平稳的基因表达状态,第二主成分代表酵母细胞周期中lateG1期和M期差异的基因表达状态,第三主成分表示的是earlyG1期和S/G2期差异的基因表达状态。由第二、和第三主成分揭示出基因表达谱中四个周期性基因表达模式:分别对应lateG1期、M期、earlyG1期和S/G2期,而且发现了一批表达水平呈周期性变化的基因,为进一步研究基因周期性表达和基因调控网络提供有价值的指导。 展开更多
关键词 主成分分析 微阵列 基因表达 基因表达模式
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昆明小鼠胃肠道钙离子跨膜吸收途径相关基因表达模式分析
9
作者 杨艺 《中国畜牧兽医文摘》 2014年第9期157-157,共1页
本研究旨在分析钙离子(Ca2+)跨膜吸收途径相关基因在昆明小鼠胃肠道中的表达模式。选取12只8周龄、平均体重(30.71±2.93)g的雌性昆明小鼠,取胃、十二指肠、空肠、回肠、盲肠和结肠组织样品,利用实时定量PCR法检测维生素D... 本研究旨在分析钙离子(Ca2+)跨膜吸收途径相关基因在昆明小鼠胃肠道中的表达模式。选取12只8周龄、平均体重(30.71±2.93)g的雌性昆明小鼠,取胃、十二指肠、空肠、回肠、盲肠和结肠组织样品,利用实时定量PCR法检测维生素D依赖性钙结合蛋白(CaBP-D9k)、瞬时性受体电位通道香草酸受体6(TRPV6)和维生素D受体(VDR)mRNA表达量。结果表明:1)CaBP-D9k、TRPV6和VDRmRNA在胃内属低水平表达, 展开更多
关键词 基因表达模式 昆明小鼠 胃肠道 膜吸收 钙离子 维生素D受体 钙结合蛋白 相关基因
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跨平台基因表达模式分析软件系统 被引量:1
10
作者 胡弘 谢建明 +1 位作者 汪德正 孙啸 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2004年第10期146-148,共3页
构建了可在不同操作系统平台之间通用的基因表达模式分析软件系统。该软件集成了多种基因表达模式分析算法,并通过模块化设计保持了算法的可扩展性。同时具有原始数据可视化和过滤、多种相似性度量选择、聚类方法选择、表达模式匹配查... 构建了可在不同操作系统平台之间通用的基因表达模式分析软件系统。该软件集成了多种基因表达模式分析算法,并通过模块化设计保持了算法的可扩展性。同时具有原始数据可视化和过滤、多种相似性度量选择、聚类方法选择、表达模式匹配查询、计算结果可视化等功能。软件使用Java作为开发平台,具有良好的可移植性,为在高性能计算机上进行基因表达模式分析打下了良好的基础。 展开更多
关键词 基因表达模式分析 跨平台 软件系统
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果蝇tap基因表达模式的测定
11
作者 王越 胡澍 +2 位作者 汪欣怡 张明炎 蒋豫 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期35-38,共4页
果蝇tap基因因具有和哺乳动物ngn基因极高的碱基序列相似度,被定性为ngn同源基因。近二十年来,在已知ngn同源基因中,除tap以外,其他基因的功能和调控基本都得到了比较充分的研究,而对tap基因的相应研究几乎停滞。直到利用同源重组技术,... 果蝇tap基因因具有和哺乳动物ngn基因极高的碱基序列相似度,被定性为ngn同源基因。近二十年来,在已知ngn同源基因中,除tap以外,其他基因的功能和调控基本都得到了比较充分的研究,而对tap基因的相应研究几乎停滞。直到利用同源重组技术,将tap基因的编码序列准确地替换成Gal4蛋白的编码序列,培育出tap Gal4品系,并与UAS-GFP品系杂交,通过对子代果蝇中GFP进行荧光染色,明确了tap基因在蕈形体发育过程的表达模式。进而通过量化分析,确定了tap基因在蕈形体发育中不具有原神经功能,而是对神经轴突的生长和靶向延伸起重要作用。主要展示了tap基因在大脑,复眼发育过程中的表达模式,利于针对性地在这些器官中敲除、敲低或过量表达Tap蛋白,进而根据由此产生的表型改变,探究tap基因在这些器官发育中的功能和调控。 展开更多
关键词 果蝇 tap基因表达模式 Gal4系统 免疫荧光染色
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不同浓度氮处理毛竹水通道蛋白基因表达模式及其调控网络
12
作者 朱成磊 林泽铭 +1 位作者 李天阔 高志民 《世界竹藤通讯》 2022年第6期21-29,共9页
氮和水分平衡对植物生长发育具有重要作用,在长期进化过程中植物体内形成了氮运输和水分平衡的复杂调控网络。为揭示竹子速生的内在调控机制,研究了不同浓度氮处理下毛竹根中水通道蛋白(AQP)基因的表达模式,并预测了其表达调控网络。结... 氮和水分平衡对植物生长发育具有重要作用,在长期进化过程中植物体内形成了氮运输和水分平衡的复杂调控网络。为揭示竹子速生的内在调控机制,研究了不同浓度氮处理下毛竹根中水通道蛋白(AQP)基因的表达模式,并预测了其表达调控网络。结果表明,在不同浓度氮处理下,在毛竹根的转录本中共鉴定到30个差异表达的PeAQP s,包括14个PePIP s、8个PeTIP s、7个PeNIP s和PeSIP 2-1;随着氮浓度的提高,PeAQP s的表达模式主要分为2类:一类呈上调表达,另一类呈下调表达。在这些差异表达AQP基因的启动子中鉴定到了许多转录因子(TF)的结合元件,同时通过筛选差异表达TFs,构建了差异表达TFs和PeAQP s的共表达网络。代表性差异表达TFs和PeAQP s表达的相关性分析和共表达结果表明,这些TF可能参与调控毛竹中水分和氮的协调运输。研究结果可为深入解析毛竹快速生长的分子机制提供参考。 展开更多
关键词 毛竹 氮处理 水通道蛋白 基因表达模式 表达网络
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利用基因表达模式对慢性肝病和HCC进行分子诊断的可能性
13
《传染病网络动态》 2007年第7期14-14,共1页
通过DNA微阵列和其他高效技术进行基因表达谱分析使得同时对一份生物标本中的所有基因进行研究成为可能,提供了健康或者病态组织转录状态的一个大概了解。尽管当前大多数的应用手段仍然着力于研究的方向:对疾病机制/涉及的信号途径... 通过DNA微阵列和其他高效技术进行基因表达谱分析使得同时对一份生物标本中的所有基因进行研究成为可能,提供了健康或者病态组织转录状态的一个大概了解。尽管当前大多数的应用手段仍然着力于研究的方向:对疾病机制/涉及的信号途径、识别新的致癌基因/抑癌基因,这种技术的临床诊断性应用正在开始进入更规范的分子水平上的应用。 展开更多
关键词 基因表达模式 分子诊断 慢性肝病 HCC DNA微阵列 表达谱分析 生物标本 信号途径
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肝细胞癌的微阵分析法:从基因表达模式到新的挑战
14
《传染病网络动态》 2008年第1期19-19,共1页
多种基因表达上变异和改变的积累可导致癌症的发生,微阵技术的发展使研究者可综合性地确定基因表达上的改变对致癌的影响。许多研究已将这项技术应用到肝细胞癌(HCC)上,并确定了一些基因可作为癌症分期,预测复发和预后以及治疗方... 多种基因表达上变异和改变的积累可导致癌症的发生,微阵技术的发展使研究者可综合性地确定基因表达上的改变对致癌的影响。许多研究已将这项技术应用到肝细胞癌(HCC)上,并确定了一些基因可作为癌症分期,预测复发和预后以及治疗方案选择的生物标记物。 展开更多
关键词 基因表达模式 肝细胞癌 癌症分期 生物标记物 治疗方案 预测复发
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使用RNA测序的基因表达模式分析长双歧杆菌BBMN68酸胁迫应答的机制获得进展
15
《中国乳业》 2013年第3期44-44,共1页
中国农业大学金君华等通过高通量的RNA测序方法分析了长双歧杆菌BBMN68酸诱导后基因表达的变化。研究发现,在pH值4.5条件下培养2h后的菌株,再在致死酸环境pH值3.5下培养2h,与直接在pH值3.5下培养2h相比,存活率增加了70倍,293个... 中国农业大学金君华等通过高通量的RNA测序方法分析了长双歧杆菌BBMN68酸诱导后基因表达的变化。研究发现,在pH值4.5条件下培养2h后的菌株,再在致死酸环境pH值3.5下培养2h,与直接在pH值3.5下培养2h相比,存活率增加了70倍,293个基因的表达上调超过2倍,245个基因下调超过2倍。这说明细菌面对酸胁迫时,增强了细胞壁的完整性,改变了细胞膜的通透性, 展开更多
关键词 基因表达模式 长双歧杆菌 测序方法 RNA 胁迫应答 机制 中国农业大学 PH值
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急性淋巴细胞性白血病细胞耐药性的基因表达模式及其对治疗的反应
16
作者 Holleman A. Cheok M.H. +2 位作者 Den Boer M.L. W.E.Evans 刘健 《世界核心医学期刊文摘(儿科学分册)》 2005年第1期6-7,共2页
背景:大约80%的儿童期急性淋巴细胞性白血病(ALL)采用化学疗法是可以治愈的,但是余下20%的患者治疗失败的原因尚不清楚。方法:对173例受试儿童进行了白血病细胞对强的松龙、长春新碱、L-门冬酰胺酶和柔红霉素的体外药敏试验,然后采用14... 背景:大约80%的儿童期急性淋巴细胞性白血病(ALL)采用化学疗法是可以治愈的,但是余下20%的患者治疗失败的原因尚不清楚。方法:对173例受试儿童进行了白血病细胞对强的松龙、长春新碱、L-门冬酰胺酶和柔红霉素的体外药敏试验,然后采用14500个探针组进行细胞基因表达的评估,确定出对ALL药物敏感和耐药性不同表达的基因。 展开更多
关键词 白血病细胞 门冬酰胺酶 柔红霉素 化学疗法 体外药敏试验 基因表达模式 强的松龙 长春新碱 表达模型 患者群体
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丙型肝炎相关的基因表达模式与肝移植受体早期进展为肝纤维化有关
17
作者 Smith M. W. Walters K. -A. +3 位作者 Korth M. J. M.G. Katze. 成虹(译) 陈云茹(校) 《世界核心医学期刊文摘(胃肠病学分册)》 2006年第6期36-37,共2页
Background &Aims: Liver transplant recipients infected with hepatitis C virus (HCV) develop recurrent hepatitis soon after transplantation and, in some cases, progress to fibrosis within the first 2 years. Our goa... Background &Aims: Liver transplant recipients infected with hepatitis C virus (HCV) develop recurrent hepatitis soon after transplantation and, in some cases, progress to fibrosis within the first 2 years. Our goals were to identify molecular processes influencing the liver disease progression and to find potential gene markers of early fibrosis. Methods: We performed gene expression profiling on serial liver biopsy specimens obtained from 13 (11 infected and 2 uninfected) transplant recipients within the first year after transplantation at 0, 3, 6, and 12 months. The data were compared with clinical observations and with a gene expression database obtained for 55 nontransplant HCV-infected and uninfected liver samples. Results: We identified several specific gene expression patterns. The first pattern was unique for the transplant recipients regardless of their infection status. The corresponding genes encoded stress response proteins and blood proteins involved in coagulation that were differentially expressed in response to posttransplantation graft recovery. The second pattern was specific to HCV-infected samples and included up-regulation of genes encoding components of the interferon-mediated antiviral response and immune system (antigen presentation, cytotoxic response). This upregulation pattern was absent or suppressed in the patients who developed early fibrosis, indicating that the disease progression might result from an impaired liver response to infection. Finally, we identified gene expression patterns that were specific for 12-month biopsy specimens in all 4 HCV-infected patients who developed early fibrosis. Conclusions: The identified gene expression patterns may prove useful for diagnostic and prognostic applications in HCV-infected patients, including predicting early progression to fibrosis. 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒(HCV) 早期肝纤维化 基因表达模式 肝移植受体 肝移植术后 肝活检标本 非感染者 基因表达分析 基因编码 疾病进展
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山新杨谷胱甘肽转移酶基因的生物信息学与表达模式分析
18
作者 黄颖 遇文婧 +1 位作者 刘雪峰 刁桂萍 《生物技术通报》 北大核心 2025年第2期248-256,共9页
【目的】分析山新杨谷胱甘肽转移酶(GST)基因的表达模式,为深入研究木本植物GST基因的功能提供基础。【方法】克隆山新杨GST基因并进行生物信息学分析,通过荧光定量PCR技术分析GST基因在植物激素及非生物胁迫下的表达模式。【结果】克隆... 【目的】分析山新杨谷胱甘肽转移酶(GST)基因的表达模式,为深入研究木本植物GST基因的功能提供基础。【方法】克隆山新杨GST基因并进行生物信息学分析,通过荧光定量PCR技术分析GST基因在植物激素及非生物胁迫下的表达模式。【结果】克隆了3个PdbGST基因家族成员,分别命名为PdbGST1、PdbGST2和PdbGST3,cDNA全长分别为678、660和690 bp,编码氨基酸分别为225、219和229个,形成的蛋白质均为稳定亲水酸性蛋白,且均定位于细胞质。同时,这3个蛋白质均具有谷胱甘肽转移酶的典型结构,且其启动子区域具有能够响应生物或非生物胁迫以及植物激素的元件。此外,这3个基因的表达不同程度地受外源植物激素或非生物胁迫诱导。【结论】3个PdbGST基因均能够不同程度地响应非生物胁迫或外源植物激素的诱导,可能参与到杨树对逆境胁迫的响应过程中。 展开更多
关键词 谷胱甘肽转移酶 生物信息学分析 基因表达模式 山新杨
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保幼激素环氧水解酶基因在蠋蝽滞育过程中的表达模式及其功能研究
19
作者 王胜男 张茂森 +5 位作者 周磊 井晓宇 张洪志 李玉艳 吴惠惠 张礼生 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第6期43-51,共9页
保幼激素(juvenile hormone,JH)缺乏是引发昆虫生殖滞育的主要原因,保幼激素环氧水解酶(JHEH)作为JH的主要降解酶,通过调控JH滴度水平在昆虫滞育中发挥重要作用。为研究JHEH在蠋蝽生殖滞育中的调控功能,克隆获得了蠋蝽JHEH基因(AcJHEH)... 保幼激素(juvenile hormone,JH)缺乏是引发昆虫生殖滞育的主要原因,保幼激素环氧水解酶(JHEH)作为JH的主要降解酶,通过调控JH滴度水平在昆虫滞育中发挥重要作用。为研究JHEH在蠋蝽生殖滞育中的调控功能,克隆获得了蠋蝽JHEH基因(AcJHEH),该基因编码452个氨基酸,具有典型环氧水解酶结构特征,无跨膜结构域,存在1个信号肽位点。同源性及系统进化分析结果表明,AcJHEH在不同物种间具有较高保守性,与茶翅蝽(Halyomorpha halys)的JHEH相似性较高,达65.46%。利用RT-qPCR技术测定了AcJHEH在蠋蝽不同组织及滞育不同时期的表达量,发现AcJHEH表达量在滞育诱导期先下降后升高,滞育诱导20 d时表达量最低;滞育初期(诱导40 d)表达量最高,滞育维持期(诱导50~60 d)的表达量稳定在较高水平,与成虫初羽化时水平接近。AcJHEH在滞育蠋蝽的头部表达量最高,其次是中后肠和脂肪体,在卵巢中表达量最低。利用RNAi敲降蠋蝽初羽化成虫的JHEH基因表达后,雌虫体内的卵黄蛋白原(vitelliogenin,Vg)基因表达量上升,卵黄沉积明显,推测滞育诱导期高表达的JHEH基因可能通过抑制Vg基因的表达,抑制卵黄蛋白沉积和卵巢发育,从而促进蠋蝽的生殖滞育。本研究结果为解析JHEH在生殖滞育中的调控作用提供了参考依据。 展开更多
关键词 蠋蝽 生殖滞育 保幼激素环氧水解酶 基因表达模式 基因功能
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铁皮石斛糖苷水解酶GH3基因家族鉴定及表达模式分析
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作者 李亚萍 金福来 +5 位作者 黄宗贵 张涛 段晓婧 姜武 陶正明 陈家栋 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期790-799,共10页
利用生物信息学方法对铁皮石斛GH3基因家族成员进行筛选、鉴定,对其基因结构、蛋白理化性质、亚细胞定位、系统进化、蛋白质二级结构及跨膜预测、基序及染色体定位进行分析,同时分析GH3基因家族在不同组织以及低磷与正常磷水平下的表达... 利用生物信息学方法对铁皮石斛GH3基因家族成员进行筛选、鉴定,对其基因结构、蛋白理化性质、亚细胞定位、系统进化、蛋白质二级结构及跨膜预测、基序及染色体定位进行分析,同时分析GH3基因家族在不同组织以及低磷与正常磷水平下的表达模式。在铁皮石斛全基因组中筛选得到13个GH3家族基因,其中一个基因存在可变剪切,表达为14个GH3蛋白。GH3基因家族蛋白可分为3个亚家族,各亚家族中不同基因相对保守;各成员均含有内含子与外显子,内含子相位在0~2,13个基因分布在8染色体上。GH3基因家族在铁皮石斛的8个组织中均有表达,其中白根和花蕾表达量高,茎和唇瓣低,推测GH3基因家族可能参与铁皮石斛根系生长以及开花现蕾。低磷与正常磷水平表达结果表明,低磷水平下叶中基因LOC 110110392、LOC 110100144表达上调,根中基因LOC 110095762、LOC 110107269表达上调。该研究对铁皮石斛糖苷水解酶GH3基因家族成员生物信息学、在不同组织以及正常磷与低磷条件下的表达水平进行研究分析,筛选响应低磷信号的糖苷水解酶基因,为后期研究糖苷水解酶参与低磷条件下铁皮石斛多糖代谢调节机制提供研究基础。 展开更多
关键词 铁皮石斛 糖苷水解酶GH3 生物信息学分析 基因表达模式
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