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南极中山站伯氏肩孔南极鱼体液和肠道微生物的分离鉴定及功能分析
1
作者 邵琪 翟万营 +2 位作者 蔡爽 孙凤宇 陈良标 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期429-436,共8页
为研究南极鱼体微生物的功能,对采自南极中山站附近海域的伯氏肩孔南极鱼(Trematomus bernacchii)体液和肠道内容物中的微生物进行筛选培养,挑选代表性菌株进行生理生化特性测定和次级代谢产物功能验证,并在活体上进行功能初探,观察在... 为研究南极鱼体微生物的功能,对采自南极中山站附近海域的伯氏肩孔南极鱼(Trematomus bernacchii)体液和肠道内容物中的微生物进行筛选培养,挑选代表性菌株进行生理生化特性测定和次级代谢产物功能验证,并在活体上进行功能初探,观察在低温环境下其对宿主的影响。结果表明:分离获得的菌株主要分布在变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes),通过16S rDNA基因序列比对发现,菌株Ignatzschineria sp.LJ11可能是一株潜在新种;伊格纳茨氏菌属(Ignatzschineria)和芽孢杆菌属(Bacillus)菌的菌液粗提物对枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis ATCC 6633)、嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila ATCC 35654)及金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)有明显的抑制作用;用菌株Ignatzschineria sp.LJ11和Bacillus sp.hb117饲喂的斑马鱼在低温下存活的时间较对照组更长;肠道微生物多样性分析显示,投喂Bacillus sp.hb117的斑马鱼肠道微生物中气单胞菌属(Aeromonas)细菌占比最高(超过60%),而投喂Ignatzschineria sp.LJ11的斑马鱼肠道微生物中弧菌属(Vibrio)为优势属。研究表明,在低温(18℃)条件下使用不同类型培养基从伯氏肩孔南极鱼体液和肠道内容物中分离出的多为变形菌门和厚壁菌门,这些菌株具有新型抗生素潜力,同时还有增强宿主耐寒的潜质,该发现为进一步探究极地细菌功能提供了新的思路。 展开更多
关键词 南极 伯氏肩孔南极鱼 细菌分离 抑菌作用 低温
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基于线粒体Cytb序列的伯氏肩孔南极鱼群体遗传结构初步分析 被引量：1
2
作者 赵娜 马春艳 +6 位作者 宋炜 冯春雷 王鲁民 张凤英 蒋科技 赵宪勇 马凌波 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2019年第1期16-24,共9页
选择线粒体Cytb序列为遗传标记分析了伯氏肩孔南极鱼(Trematomus bernacchii)在5个采样点(凯西站、罗斯海、长城站、戴维斯站和中山站)的种群多样性、遗传结构与种群演化历史。从5个采样点98个样本的线粒体Cytb序列中共检测到27种单倍... 选择线粒体Cytb序列为遗传标记分析了伯氏肩孔南极鱼(Trematomus bernacchii)在5个采样点(凯西站、罗斯海、长城站、戴维斯站和中山站)的种群多样性、遗传结构与种群演化历史。从5个采样点98个样本的线粒体Cytb序列中共检测到27种单倍型。与其它分布于南大洋的鱼类相比,伯氏肩孔南极鱼有着相似的遗传多样性特征,即较高的单倍型多样性(haplotype diversity,h=0. 685 90±0. 002 36)和较低的核苷酸多样性(nucleotide diversity,Pi=0. 002 59±0. 013 43)。伯氏肩孔南极鱼种群间的平均遗传距离为0. 39%,分子变异分析(AMOVA)结果显示,组群间的变异为4. 42%(P <0. 05),群体内的为95. 58%(P <0. 05),基于单倍型构建的进化树的结果均表明伯氏肩孔南极鱼群体不具有明显的地理谱系结构。中性进化分析表明伯氏肩孔南极鱼群体在10万年前(大约中更新世时期)经历过快速扩张时期。分子方差分析和Fst表明伯氏肩孔南极鱼的遗传变异主要来自种群内的个体之间,极少数遗传变异来自于群体之间。研究结果显示南极地区的伯氏肩孔南极鱼5个采样点之间具有一定的基因交流,是一个随机交配的群体。 展开更多
关键词 伯氏肩孔南极鱼 CYTB 遗传结构 遗传多样性
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伯氏肩孔南极鱼dusp1基因在冷应激中的功能研究 被引量：3
3
作者 王映 胡玲红 +1 位作者 王化敏 陈良标 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1105-1112,共8页
为了研究极地鱼类双特异性磷酸酶1 (dual-specificity phosphatase 1, dusp1)基因在低温胁迫下的作用,实验采用RT-PCR技术从Trematomus bernacchii中克隆获得了编码区含有1128个核苷酸的dusp1同源基因,可编码376个氨基酸残基。将其通过... 为了研究极地鱼类双特异性磷酸酶1 (dual-specificity phosphatase 1, dusp1)基因在低温胁迫下的作用,实验采用RT-PCR技术从Trematomus bernacchii中克隆获得了编码区含有1128个核苷酸的dusp1同源基因,可编码376个氨基酸残基。将其通过同源重组的方法构建真核表达载体pcDNA3.1-dusp1并转染至人胚肾293T(HEK293T)细胞中,同时以pcDNA3.1空载质粒作为对照。使用荧光探针DCFH-DA检测了细胞活性氧(Reactive oxygen species assay, ROS)含量,采用流式细胞术检测了低温胁迫下细胞的存活率,采用Western Blot检测了P38/MAPK的磷酸化水平和RT-qPCR技术分析了半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(caspase-3)的mRNA表达水平。结果表明,伯氏肩孔南极鱼dusp1基因能在293T细胞中大量表达,并定位于细胞核;在低温胁迫下,与对照组相比,伯氏肩孔南极鱼dusp1基因的过表达能显著减少细胞ROS的含量和细胞凋亡率,并抑制促凋亡基因P38/MAPK的过度磷酸化和凋亡效应基因caspase-3的上调,减轻细胞在低温下的受损程度。研究表明伯氏肩孔南极鱼dusp1的过表达提高了293T细胞的抗寒能力,在细胞低温应激过程中具有保护功能。研究结果为探究极地鱼类低温适应性进化研究提供了新的证据,同时也为进一步探究冷胁迫下硬骨鱼类dusp1的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 冷应激 双特异性磷酸酶1 P38/MAPK 伯氏肩孔南极鱼
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独角雪冰鱼和伯氏肩孔南极鱼TRPV1基因的克隆及低温适应功能检测 被引量：4
4
作者 王桂志 张永 +1 位作者 张弛 许强华 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期124-130,共7页
为从细胞水平上研究独角雪冰鱼Chionodraco hamatus和伯氏肩孔南极鱼Trematomus bernacchii的低温适应能力，采用RT-PCR方法，获得独角雪冰鱼和伯氏肩孔南极鱼的瞬时受体电位阳离子通道蛋白（transient receptor potential channels V1... 为从细胞水平上研究独角雪冰鱼Chionodraco hamatus和伯氏肩孔南极鱼Trematomus bernacchii的低温适应能力，采用RT-PCR方法，获得独角雪冰鱼和伯氏肩孔南极鱼的瞬时受体电位阳离子通道蛋白（transient receptor potential channels V1，TRPVl）基因序列，其开放阅读框全长均为2310bp；生物信息学分析表明，两种南极鱼豫PⅥ基因均编码769氨基酸残基，预测其蛋白相对分子质量分别为88210和88160，理论等电点分别为7．63和8．26；两种南极鱼TRPVl蛋白均无信号肽；亚细胞定位显示，TRPVl蛋白主要在细胞膜和内质网中发挥生物学功能：理化性质分析表明，两种南极鱼的TRPVl为不溶性跨膜蛋白，分别有34、35个磷酸化位点和6、5个糖基化位点，二者均含有6个跨膜结构域、5个锚蛋白结构域，二级结构以随机卷曲为主：同源性分析显示，独角雪冰鱼TRPVl氨基酸序列与伯氏肩孔南极鱼的一致性最高，为93．4％，与其他物种的一致性为44．3％～69．8％；低温适应试验结果显示，两种南极鱼的豫PⅥ基因不能被温度所激活。研究表明，独角雪冰鱼和伯氏肩孔南极鱼豫PⅥ基因可能与低温适应无关。 展开更多
关键词 独角雪冰鱼 伯氏肩孔南极鱼 珊Ⅵ基因 低温适应
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独角雪冰鱼和伯氏肩孔南极鱼骨骼中的元素分析 被引量：3
5
作者 孙建飞 刘洋 许强华 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期387-392,共6页
为探究缺失血红蛋白的南极独角雪冰鱼Chionodraco hamatus(CH)和具有血红蛋白的伯氏肩孔南极鱼Trematomus bernacchii(TB)骨骼中元素含量的差异,采用电感耦合等离子体质谱法对两种南极鱼的脊椎骨与头盖骨中Na、Mg、Al、K、Ca、56Fe、Zn... 为探究缺失血红蛋白的南极独角雪冰鱼Chionodraco hamatus(CH)和具有血红蛋白的伯氏肩孔南极鱼Trematomus bernacchii(TB)骨骼中元素含量的差异,采用电感耦合等离子体质谱法对两种南极鱼的脊椎骨与头盖骨中Na、Mg、Al、K、Ca、56Fe、Zn等常量元素,以及V、Cr、Mn、As、Se、206Pb等微量元素含量进行了测定与分析。结果表明:两种南极鱼脊椎骨中Al、K、56Fe、Mn、Se含量有显著性差异(P<0.05),头盖骨中Mg、K、Ca、56Fe、V、Mn等元素含量有显著性差异(P<0.05),推测此差异可能与南极冰鱼缺失功能性血红细胞有关;将两种南极鱼脊椎骨骨骼中的元素含量与7种非南极海水鱼和3种淡水鱼相比,发现两种南极鱼骨骼中K、Na、Mg、56Fe、Zn、Ca等常量元素含量较少,且Mn、V、Cr、206Pb等微量元素含量明显低于非南极鱼,这可能与南极海域存在较低污染相关。本研究中首次测定了两种南极鱼骨骼中的元素含量,为后续拟通过体内组织元素分析探索南极鱼类的生理差异提供了科学依据。 展开更多
关键词 独角雪冰鱼 伯氏肩孔南极鱼 常量元素 微量元素 骨骼
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伯氏肩孔南极鱼和革首南极鱼皮肤微生物多样性的研究 被引量：5
6
作者 赵文静 许强华 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期792-797,共6页
为研究南极鱼皮肤微生物群落的多样性,揭示不同种类南极鱼皮肤微生物的差异,提取伯氏肩孔南极鱼Trematomus bernacchii(TB)和革首南极鱼Notothenia coriiceps(NC)皮肤微生物基因组总DNA,采用16S rDNA分子标记和高通量测序技术检测样品... 为研究南极鱼皮肤微生物群落的多样性,揭示不同种类南极鱼皮肤微生物的差异,提取伯氏肩孔南极鱼Trematomus bernacchii(TB)和革首南极鱼Notothenia coriiceps(NC)皮肤微生物基因组总DNA,采用16S rDNA分子标记和高通量测序技术检测样品微生物群落多样性。结果表明:对两种南极鱼的6个样本分别进行测序,共获得有效序列数378517条,获得操作分类单元(OTUs)740个;两种南极鱼皮肤的优势菌门包括厚壁菌门Firmicutes、变形菌门Proteobacteria、异常球菌-栖热菌门Deinococcus-Thermus、拟杆菌门Bacteroidetes、软壁菌门Tenericutes、放线菌门Actinobacteria等,以厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门的丰度较高;两种南极鱼皮肤的优势菌属为厌氧芽孢杆菌属Anoxybacillus、火山岩菌属Vulcaniibacterium、芽孢杆菌属Bacillus、嗜冷杆菌属Psychrobacter、青枯菌属Ralstonia、短波单胞菌属Brevundimonas、假单胞菌属Pseudomonas和嗜甲基菌属Methylophilus;同种南极鱼不同个体间皮肤微生物菌群差异较小,且伯氏肩孔南极鱼和革首南极鱼间皮肤微生物菌群无显著性差异(P>0.05)。研究表明,采用高通量测序可以精准地对两种南极鱼皮肤微生物主要菌群进行分析比较,厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门是伯氏肩孔南极鱼和革首南极鱼皮肤微生物的优势菌门,两种南极鱼间的皮肤微生物菌群无显著性差异。 展开更多
关键词 伯氏肩孔南极鱼 革首南极鱼 高通量测序 皮肤微生物
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伯氏肩孔南极鱼和独角雪冰鱼血清及血细胞中的元素分析
7
作者 王宇航 许强华 +2 位作者 王铄 候微微 翟万营 《海洋湖沼通报（中英文）》 CSCD 北大核心 2024年第5期96-102,共7页
为探究伯氏肩孔南极鱼Trematomus bernacchii和南极独角雪冰鱼Chionodraco hamatus血清和血细胞中元素含量的差异,本实验采用电感耦合等离子体质谱(ICP-OES)法测定和分析了该两种南极鱼血清和血细胞中的Na、Mg、Al、K、Ca、Fe、Zn等常... 为探究伯氏肩孔南极鱼Trematomus bernacchii和南极独角雪冰鱼Chionodraco hamatus血清和血细胞中元素含量的差异,本实验采用电感耦合等离子体质谱(ICP-OES)法测定和分析了该两种南极鱼血清和血细胞中的Na、Mg、Al、K、Ca、Fe、Zn等常量元素,及V、Cr、Mn、Ni、Se、As、Pb等微量元素。结果表明:两种南极鱼血清中Cr、Mn、Ni、Se含量呈显著性差异,Fe、V呈现出极显著性差异;两种南极鱼血细胞中仅有Fe含量呈极显著性差异,推测该测定结果与独角雪冰鱼体内缺乏血红蛋白有关。本次实验首次测量了南极鱼类血清和血细胞中的元素含量,补充了南极鱼物种血细胞生理生化的研究数据,可为更好地开发和利用南极生物资源提供参考资料。 展开更多
关键词 伯氏肩孔南极鱼 独角雪冰鱼 血清 血细胞 元素
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两种南极鱼类4种组织中微量元素测定与比较
8
作者 李雪 翟万营 +2 位作者 江守文 吴智超 许强华 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2024年第3期325-333,共9页
为探究两种南极鱼类——独角雪冰鱼(Chionodraco hamatus)与伯氏肩孔南极鱼(Trematomus bernacchii)的生理差异,采用电感耦合等离子体质谱法检测比较了鱼体内头肾、中肾、脾与肝4种组织中Cr、Mn、Fe、Cu、Zn、As、Se、Cd、Hg等9种微量... 为探究两种南极鱼类——独角雪冰鱼(Chionodraco hamatus)与伯氏肩孔南极鱼(Trematomus bernacchii)的生理差异,采用电感耦合等离子体质谱法检测比较了鱼体内头肾、中肾、脾与肝4种组织中Cr、Mn、Fe、Cu、Zn、As、Se、Cd、Hg等9种微量元素的含量。结果发现:独角雪冰鱼头肾中Fe、Mn、Zn、Hg,脾中Cr、Mn、Fe、As、Se、Cd与Hg,肝中Fe、Mn、Zn、As、Cd与Hg的含量显著低于伯氏肩孔南极鱼对应组织中的含量(P<0.05);独角雪冰鱼中肾中Se、Cd与Hg含量显著高于伯氏肩孔南极鱼中肾中的含量(P<0.05)。Fe作为血红蛋白的重要组成部分,在两种鱼类的3种组织中差异显著,独角雪冰鱼的头肾、脾与肝中Fe含量均显著低于伯氏肩孔南极鱼(P<0.05),血红蛋白的缺失限制了独角雪冰鱼3种组织对Fe的吸收。与其他普通纬度海域的海洋鱼类相比,两种南极鱼肝脏中Hg的含量显著偏高,提示南极水域可能已经存在一定程度Hg污染。 展开更多
关键词 独角雪冰鱼 伯氏肩孔南极鱼 微量元素 造血组织 污染
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南极鱼类——冰海里演化出的奇迹
9
作者 陈良标 《人与生物圈》 2017年第1期96-99,共4页
2011年1月,南半球的夏天,我国南极中山站近海,海冰还未消融。在离岸几百米的地方,几位考察队员铲去地上的浮雪,用铁钻钻透1~2米的厚冰,形成一个直径不足10厘米的冰洞,或者干脆找一个冰裂隙,垂下鱼钩和鱼线。等待不超过10秒钟,鱼竿上就... 2011年1月,南半球的夏天,我国南极中山站近海,海冰还未消融。在离岸几百米的地方,几位考察队员铲去地上的浮雪,用铁钻钻透1~2米的厚冰,形成一个直径不足10厘米的冰洞,或者干脆找一个冰裂隙,垂下鱼钩和鱼线。等待不超过10秒钟,鱼竿上就会传来明确的拖拉和抖动的感觉,收起鱼线,鱼钩上总会挂着一条重约1 00克、体色稍黄、 展开更多
关键词 南极大陆 冰海 伯氏肩孔南极鱼 海冰 冰裂隙 南极中山站 鱼线 冰鱼 抗冻糖蛋白 体色
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