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FABP2基因在不同比例花椒籽饲喂育肥猪的组织差异表达、克隆及生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
李杰
黄晓宇
+10 位作者
尚学峰
杨姣姣
张娟丽
谢开会
张亚丽
闫尊强
王鹏飞
高小莉
杨巧丽
马艳萍
滚双宝
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2022年第6期228-238,共11页
旨在分析不同比例花椒籽替代部分玉米饲喂三元杂交育肥猪不同组织FABP2的差异表达,寻找肌内脂肪沉积的关键基因;同时克隆三元杂交育肥猪FABP2编码区序列,并用生物信息学方法对其进行分析。选取288头90日龄杜×长×大三元杂交育...
旨在分析不同比例花椒籽替代部分玉米饲喂三元杂交育肥猪不同组织FABP2的差异表达,寻找肌内脂肪沉积的关键基因;同时克隆三元杂交育肥猪FABP2编码区序列,并用生物信息学方法对其进行分析。选取288头90日龄杜×长×大三元杂交育肥猪(33 kg),随机分为4组,每组4个重复,每个重复18头猪;对照组饲喂基础日粮,试验组分别用花椒籽代替饲粮中2.5%(试验Ⅰ组),5.0%(试验Ⅱ组),7.5%(试验Ⅲ组)的玉米,预试验7 d,正试期100 d。采用qRT-PCR检测试验组不同组织中FABP2的相对表达量,同时克隆三元杂交育肥猪FABP2编码区,利用生物信息学分析软件,预测FABP2蛋白理化性质、结构域和磷酸化激酶位点等。结果表明:FABP2在各组织中均有不同程度表达,其中空肠和肝脏中FABP2显著高表达。与对照组相比,各试验组心脏、肺脏、肾脏、十二指肠、空肠和盲肠组织中FABP2显著下调表达;试验Ⅱ组和试验Ⅲ组脾脏和回肠组织中FABP2显著上调表达;试验Ⅰ组肝脏、结肠、直肠和背肌组织中FABP2显著上调表达,说明饲粮中添加花椒籽对三元杂交育肥猪FABP2基因的表达谱具有显著影响。成功克隆并鉴定出三元杂交育肥猪FABP2编码区全长(399 bp),编码132个氨基酸,存在2处错义突变;FABP2蛋白是一种酸性稳定的非分泌蛋白,二级结构主要由延伸链和无规则卷曲构成,含有一个Lipocalin-FABP2超家族保守结构域和3个无序化区域。
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关键词
三元杂交育肥猪
花椒籽
FABP2基因
组织表达
克隆
生物信息学分析
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职称材料
题名
FABP2基因在不同比例花椒籽饲喂育肥猪的组织差异表达、克隆及生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
李杰
黄晓宇
尚学峰
杨姣姣
张娟丽
谢开会
张亚丽
闫尊强
王鹏飞
高小莉
杨巧丽
马艳萍
滚双宝
机构
甘肃农业大学动物科学技术学院
甘肃农业大学图书馆
甘肃省现代养猪技术工程研究中心
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2022年第6期228-238,共11页
基金
甘肃省科技创新项目(GSSYLXM-02)
甘肃省青年基金项目(20JR5RA005)。
文摘
旨在分析不同比例花椒籽替代部分玉米饲喂三元杂交育肥猪不同组织FABP2的差异表达,寻找肌内脂肪沉积的关键基因;同时克隆三元杂交育肥猪FABP2编码区序列,并用生物信息学方法对其进行分析。选取288头90日龄杜×长×大三元杂交育肥猪(33 kg),随机分为4组,每组4个重复,每个重复18头猪;对照组饲喂基础日粮,试验组分别用花椒籽代替饲粮中2.5%(试验Ⅰ组),5.0%(试验Ⅱ组),7.5%(试验Ⅲ组)的玉米,预试验7 d,正试期100 d。采用qRT-PCR检测试验组不同组织中FABP2的相对表达量,同时克隆三元杂交育肥猪FABP2编码区,利用生物信息学分析软件,预测FABP2蛋白理化性质、结构域和磷酸化激酶位点等。结果表明:FABP2在各组织中均有不同程度表达,其中空肠和肝脏中FABP2显著高表达。与对照组相比,各试验组心脏、肺脏、肾脏、十二指肠、空肠和盲肠组织中FABP2显著下调表达;试验Ⅱ组和试验Ⅲ组脾脏和回肠组织中FABP2显著上调表达;试验Ⅰ组肝脏、结肠、直肠和背肌组织中FABP2显著上调表达,说明饲粮中添加花椒籽对三元杂交育肥猪FABP2基因的表达谱具有显著影响。成功克隆并鉴定出三元杂交育肥猪FABP2编码区全长(399 bp),编码132个氨基酸,存在2处错义突变;FABP2蛋白是一种酸性稳定的非分泌蛋白,二级结构主要由延伸链和无规则卷曲构成,含有一个Lipocalin-FABP2超家族保守结构域和3个无序化区域。
关键词
三元杂交育肥猪
花椒籽
FABP2基因
组织表达
克隆
生物信息学分析
Keywords
DLY fattening pigs
Zanthoxylum seeds
FABP2 gene
Tissue expression
Cloning
Bioinformatics analysis
分类号
S828.03 [农业科学—畜牧学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
FABP2基因在不同比例花椒籽饲喂育肥猪的组织差异表达、克隆及生物信息学分析
李杰
黄晓宇
尚学峰
杨姣姣
张娟丽
谢开会
张亚丽
闫尊强
王鹏飞
高小莉
杨巧丽
马艳萍
滚双宝
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2022
1
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