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金槐ISSR-PCR反应体系的优化和引物筛选 被引量：5
1
作者 唐健民 邹蓉 +4 位作者 史艳财 舒文将 朱世缘 蒋运生 熊忠臣 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期2747-2749,共3页
目的优化和建立稳定的金槐ISSR-PCR反应体系并筛选出稳定的ISSR-PCR引物。方法采用L16(45)正交设计方法,以dNTP、Tap酶、ISSR引物、Mg^(2+)浓度和模版DNA 5个影响因素进行4水平优化试验,并对反应体系进行验证;采用优化所得的最佳反应体... 目的优化和建立稳定的金槐ISSR-PCR反应体系并筛选出稳定的ISSR-PCR引物。方法采用L16(45)正交设计方法,以dNTP、Tap酶、ISSR引物、Mg^(2+)浓度和模版DNA 5个影响因素进行4水平优化试验,并对反应体系进行验证;采用优化所得的最佳反应体系进行引物筛选。结果确立了金槐的最佳ISSR-PCR反应体系:即在25μl总体积反应体系中包含10×Buffer2.5μl,MgCl22.5mmol·L^(-1),ISSR引物0.6μmol·L^(-1),dNTPs0.25mmol·L^(-1),Taq酶1.0U,模板DNA约50ng。通过最佳体系进行引物筛选,获得11条适宜金槐扩增的ISSR引物。结论经过12份金槐样品的验证,证明所建立的体系稳定可靠,可用于金槐遗传多样性、指纹图谱和标记辅助育种等方面的研究。 展开更多
关键词 金槐 issp-pcr 正交设计 引物筛选
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新疆贝母属药用贝母ISSR-PCR体系的确立和优化 被引量：1
2
作者 詹羽姣 盛萍 +2 位作者 张鹏葛 安露莎 张煊 《中国野生植物资源》 2015年第4期9-15,29,共8页
目的:建立适合新疆贝母属植物总DNA的ISSR-PCR优化反应体系,为新疆贝母属8种药用贝母品种鉴定和遗传多样性研究提供依据。方法:综合利用单因素实验和L16(45)正交试验,对因素Taq DNA聚合酶、d NTPs、Mg2+、引物浓度、模板DNA含量进行优化... 目的:建立适合新疆贝母属植物总DNA的ISSR-PCR优化反应体系,为新疆贝母属8种药用贝母品种鉴定和遗传多样性研究提供依据。方法:综合利用单因素实验和L16(45)正交试验,对因素Taq DNA聚合酶、d NTPs、Mg2+、引物浓度、模板DNA含量进行优化,并考察循环次数、延长时间及退火温度。结果:每个因素的不同水平对PCR反应有显著影响,其中Mg2+影响最大。新疆贝母属植物总DNA的ISSR-PCR最适体系为50μL:5μL 10×Buffer、2.5 mmol/L Mg2+、0.30 mmol/L d NTPs、0.8μmol/L引物、0.75 U Taq酶、1.0 ng/μL模板DNA、33.35μL dd H2O。循环次数为45 cycle,延伸时间10 min,引物UBC853的最适退火温度为49.8℃。结论:建立的新疆贝母属植物总DNA的ISSR-PCR反应体系经23份新疆贝母属8种药用贝母样品检验,ISSR-PCR扩增效果显著,证明该体系具有较高的稳定性和可重现性,为新疆贝母属8种药用贝母遗传多样性的分子标记研究奠定基础。 展开更多
关键词 贝母属 issp-pcr 体系优化
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鸭梨Hc ISSR-PCR反应体系的优化
3
作者 支婷 刘春琴 +1 位作者 崔建州 杜克久 《北方园艺》 CAS 北大核心 2011年第12期89-92,共4页
应用正交设计的方法对影响鸭梨Hc ISSR-PCR反应的4个因素(模板DNA、引物、dNTPs、TaqDNA聚合酶)进行5个水平的优化试验,以DPS 7.55软件分析。结果表明:鸭梨HcISSR-PCR的最佳反应体系(20μL)为:模板DNA 60 ng、引物浓度0.4μmol/L、dNTP... 应用正交设计的方法对影响鸭梨Hc ISSR-PCR反应的4个因素(模板DNA、引物、dNTPs、TaqDNA聚合酶)进行5个水平的优化试验,以DPS 7.55软件分析。结果表明:鸭梨HcISSR-PCR的最佳反应体系(20μL)为:模板DNA 60 ng、引物浓度0.4μmol/L、dNTPs浓度0.1mmol/L、TaqDNA聚合酶2 U。 展开更多
关键词 鸭梨Hc ISSR-PCR反应体系 正交设计 优化
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鸭梨ISSR-PCR反应体系的初步建立
4
作者 支婷 杜克久 +1 位作者 崔建州 刘春琴 《河北林果研究》 2011年第1期65-68,共4页
以沧州泊头市鸭梨为试验材料,对鸭梨ISSR-PCR反应体系中的模板DNA用量、dNTPs浓度、引物浓度以及Taq酶浓度进行了探索,初步建立适合鸭梨ISSR-PCR反应体系为:在20μL反应体系中,含1×Taq PCR Buffer[1.5 mmol/L Mg2+]0、.15 mmol/L d... 以沧州泊头市鸭梨为试验材料,对鸭梨ISSR-PCR反应体系中的模板DNA用量、dNTPs浓度、引物浓度以及Taq酶浓度进行了探索,初步建立适合鸭梨ISSR-PCR反应体系为:在20μL反应体系中,含1×Taq PCR Buffer[1.5 mmol/L Mg2+]0、.15 mmol/L dNTPs、0.40μmol/L引物、40 ng DNA和1 U Taq酶。 展开更多
关键词 鸭梨 ISSR-PCR反应 单因素优化
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