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Molecular characterization of canine parvovirus type 2(CPV2)reveals a high prevalence of the CPV2c genotype among dogs sufering from diarrhea
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作者 Sajid Umar Di Gao +5 位作者 Semin Kim Yixi Cheng Zhenkun Fang qiu zhongqi Weidong Yu Benjamin D.Anderson 《Animal Diseases》 CAS 2024年第3期198-206,共9页
Canine parvovirus 2(CPV-2)is a highly contagious virus in dogs that typically causes hemorrhagic enteritis and a high mortality rate in unvaccinated puppies.The genetic variability and antigenic diversity of CPV-2 hin... Canine parvovirus 2(CPV-2)is a highly contagious virus in dogs that typically causes hemorrhagic enteritis and a high mortality rate in unvaccinated puppies.The genetic variability and antigenic diversity of CPV-2 hinder its efective prevention of infection by vaccination.To investigate the epidemiology and genetic characteristics of CPV-2 in China,rectal swabs from afected dogs were collected from diferent animal clinics in Kunshan from 2022 to 2023.Preliminary detection and capsid gene sequencing of CPV-2 were performed using previously described primers and protocols.The overall detection rate for CPV-2 was 16.5%(33/200).A signifcant association was found between the CPV-2-positivity and clinical signs,age,breed and vaccination status.Sequence analysis revealed the presence of CPV-2c genotypes in all positive samples,which were genetically similar to other Asian CPV-2c strains.Notably,four key mutations(A5G,F267Y,Y324I and Q370R)were detected in all isolates,and one novel mutation(I447M)was detected in three CPV-2 isolates.These mutations in the CPV-2 strains could impact vaccine efcacy and the efectiveness of the virus immune evasion.Surprisingly,no recombination events were observed between the identifed CPV-2c strains and reference strains from China.Our data revealed that amino acid residues 324,426 and 440 of VP2 may under strong selection pressure.This pattern of genetic variation in the CPV-2 lineage warrants continuous laboratory-based surveillance programs in other parts of China to better understand the pattern of seasonal distribution and association between emerging genotypes and the intensity of disease severity. 展开更多
关键词 Canine parvovirus DOGS Epidemiology Genetic diversity Phylogenetic analysis
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玉米农田生态系统蒸散发模型参数优化 被引量:4
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作者 邱中齐 周琳琳 +4 位作者 刘红娟 田强龙 赵子敬 张晓梅 魏国孝 《灌溉排水学报》 CSCD 北大核心 2022年第1期33-40,共8页
【目的】在无法根据实测值得到具体模型参数的地域,对经验参数进行优化以提高区域蒸散发模型的精度。【方法】通过黑河流域生态水文过程综合遥感试验水文气象观测数据集中的大满超级站气象要素梯度观测系统的数据,研究玉米农田生态系统... 【目的】在无法根据实测值得到具体模型参数的地域,对经验参数进行优化以提高区域蒸散发模型的精度。【方法】通过黑河流域生态水文过程综合遥感试验水文气象观测数据集中的大满超级站气象要素梯度观测系统的数据,研究玉米农田生态系统的蒸散发模型优化问题。采用差分进化自适应算法,以潜热通量和感热通量为优化目标,引入能量闭合因子对模型参数的优化,核心思想为贝叶斯理论,通过构造多条马尔科夫链来估计参数的后验信息;引入传统评价指标包括决定系数(R^(2))、线性回归斜率、均方根误差(RMSE)、一致性指数(IA)、纳什系数(NSE),对Shuttleworth-Wallace原模型和优化后模型的潜热通量和感热通量的模拟性能进行评价。【结果】模型校准期,优化后模型相对于Shuttleworth-Wallace原模型在模拟潜热通量时,均方根误差降低52.46%,一致性指数提高17.3%;优化后模型在模拟潜热通量时,纳什系数达到0.82。在模拟感热通量时,优化后模型相对于Shuttleworth-Wallace原模型的评价指数提高不明显。模型验证期,优化后模型相对于Shuttleworth-Wallace原模型在模拟潜热通量时,均方根误差降低50.51%,一致性指数提高14.46%;优化后模型模拟潜热通量时,纳什系数达到0.80。在模拟感热通量时,优化后模型相对于Shuttleworth-Wallace原模型的评价指数提高不明显。【结论】对于不能根据实测值得到具体模型参数的地域,根据条件相似获得该区域的经验参数,将经验参数代入Shuttleworth-Wallace原模型中模拟该区域蒸散发,效果不理想,模型评价数据较差;相对于Shuttleworth-Wallace原模型的评价数据,优化方案对经验参数进行优化,优化后模型对潜热通量的模拟有了较大的提高,但是对感热通量模拟性能提升的效果不明显。 展开更多
关键词 参数优化 蒸散发模型 能量闭合
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基于能量不平衡优化PSEB蒸散发模型
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作者 王福兵 刘红娟 +4 位作者 田强龙 赵子敬 邱中齐 杨泽伟 魏国孝 《灌溉排水学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第S02期58-64,共7页
【目的】优化PSEB蒸散发模型参数,提高模型性能。【方法】利用兰州大学半干旱区流域地表过程与环境变化野外科学观测站的数据,研究PSEB模型优化问题。采用差分进化自适应算法,其核心思想为贝叶斯理论,在PSEB模型中引入能量不平衡修正项(... 【目的】优化PSEB蒸散发模型参数,提高模型性能。【方法】利用兰州大学半干旱区流域地表过程与环境变化野外科学观测站的数据,研究PSEB模型优化问题。采用差分进化自适应算法,其核心思想为贝叶斯理论,在PSEB模型中引入能量不平衡修正项(αR_(n)),通过构造多条马尔科夫链来估计参数的后验信息。运用传统评价指标包括决定系数(R^(2))、线性回归斜率(Slope)、一致性系数(IA)、模型效率(EF)、平均偏倚误差(MBE)、均方根误差(RMSE),对优化后的PSEB模型性能进行评价。【结果】运用DREAM算法之后,模型的部分参数和能量不平衡修正项(αR_(n))得到了很好的约束。2种方案在模型校准期线性回归斜率分别为0.76、0.91,均方根误差(RMSE)值分别为91.24、78.33,方案二的斜率相比方案一更接近于1,且方案二的RMSE值相比方案一降低14%,2种方案的一致性指数(IA)均为0.93。在验证期,2种方案的线性回归斜率分别为0.51、0.54,均方根误差分别为73.14和67.02,比方案一,方案二的斜率更接近于1,且均方根误差(RMSE)降低了8%,一致性指数(IA)分别为0.87和0.88。【结论】DREAM算法降低了PSEB模型中部分参数和能量不平衡修正项的不确定性,提高了模型性能。 展开更多
关键词 蒸散发模型 参数优化 能量不平衡
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贵阳市观山湖区农田生态系统经济价值评估
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作者 孙亚青 仇忠启 +2 位作者 霍姮翠 殷瑞翔 文中正 《贵州农业科学》 CAS 2019年第3期155-158,共4页
为区域农业生态补偿和政策制定提供指导依据。利用遥感影像解译观山湖区农田土地利用数据并分析其变化特点,结合实地调研,采用市场替代法和功能价值法对观山湖区2000年、2005年、2010年和2015年的农田生态系统经济价值进行核算。结果表... 为区域农业生态补偿和政策制定提供指导依据。利用遥感影像解译观山湖区农田土地利用数据并分析其变化特点,结合实地调研,采用市场替代法和功能价值法对观山湖区2000年、2005年、2010年和2015年的农田生态系统经济价值进行核算。结果表明:观山湖区农田生态系统土地利用类型主要包括水田、旱地和园地,2000-2015年园地面积显著增加,水田和旱地面积显著减少,农田土地面积由13 440.39hm^2减少到6 375.65hm^2,降比为52.56%;农田生态系统经济价值整体显著下降,下降率达21.61%;土壤保持、涵养水源、气候调节、文化服务是该区农田生态系统的核心服务功能;农田生态系统土地资产价值均大于当年的生态系统服务价值。为观山湖农田资源资产化管理、生态补偿、农业资源生态损益治理成效及确定农业政策制定的重点方向提供了理论依据。 展开更多
关键词 农田 生态系统 经济价值 土地资产 生态系统服务 贵阳
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