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猪源大肠杆菌的生物膜形成能力和耐药性分析 被引量:2
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作者 陈舒怡 王栋 +4 位作者 邬德淑 李迁 孙坚 廖晓萍 方亮星 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2024年第9期30-38,共9页
为明确成膜大肠杆菌的耐药特征及其与生物膜形成能力的关系,本试验对广西南宁地区腹泻猪粪便样品中分离的506株大肠杆菌进行结晶紫染色检测其生物膜形成能力;随机挑选110株大肠杆菌进行药敏试验;进一步针对85株成膜大肠杆菌进行全基因... 为明确成膜大肠杆菌的耐药特征及其与生物膜形成能力的关系,本试验对广西南宁地区腹泻猪粪便样品中分离的506株大肠杆菌进行结晶紫染色检测其生物膜形成能力;随机挑选110株大肠杆菌进行药敏试验;进一步针对85株成膜大肠杆菌进行全基因组测序(WGS)并基于核心单核苷酸多态性(SNP)基因组构建系统发育进化树,进行克莱蒙分型(Clemon typing)、多位点序列分型(MLST)和Pearson相关系数分析。结果显示,387株(76.48%)大肠杆菌能够形成生物膜,其中,32株(6.32%)为强成膜菌。成膜大肠杆菌对β-内酰胺类、四环素类、酰胺醇类和喹诺酮类抗生素的耐药率都较高(78%~95%),且强成膜菌株对头孢噻呋、阿米卡星和多西环素等8种抗菌药的耐药率显著高于弱成膜和无成膜菌株(P<0.05)。系统发育进化树显示,强成膜菌株整体上遗传背景呈现多样性。强成膜菌株的克莱蒙分型主要是A型和B1型,MLST共35种,其中ST 1286和ST 648较为流行;基因分布特征分析结果显示,49株强成膜菌株携带floR、qnrS1和bla_(TEM-1B)等耐药基因以及bcsA、csg、filA和mrk等生物膜形成相关基因;基于Pearson相关系数分析结果发现,耐药基因bla_(OXA-10)(r=0.23,P=0.034)和菌毛基因mrk(r=0.44,P=2.10×10^(-5))检出与生物膜形成能力呈正向线性相关性。本试验明确了猪源大肠杆菌生物膜形成能力和强成膜大肠杆菌的耐药特征以及其复杂的种群结构,为成膜大肠杆菌的防控提供了科学依据。 展开更多
关键词 大肠杆菌 全基因组测序 生物膜 耐药性
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鹅HIF-1α基因克隆与组织表达分析 被引量:1
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作者 邬德淑 陈世健 +4 位作者 杨晨 廖伟莉 彭翠甜 黄运茂 刘文俊 《仲恺农业工程学院学报》 CAS 2020年第2期15-20,共6页
缺氧诱导因子-1(HIF-1)是在缺氧细胞中发现的一种转录因子,在生物体氧平衡调节中起关键作用.缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)是HIF-1活化的关键调控因子,参与细胞的生长、分化和凋亡的调节.为进一步了解家鹅的缺氧应答系统,本研究参考NCBI上... 缺氧诱导因子-1(HIF-1)是在缺氧细胞中发现的一种转录因子,在生物体氧平衡调节中起关键作用.缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)是HIF-1活化的关键调控因子,参与细胞的生长、分化和凋亡的调节.为进一步了解家鹅的缺氧应答系统,本研究参考NCBI上公布的鹅HIF-1α基因序列设计引物,并成功克隆了马岗鹅HIF-1αmRNA,获得了HIF-1α完整的ORF序列,全长为2403 bp,编码800个氨基酸.研究表明,马岗鹅HIF-1α基因结构保守,在家禽中的同源性较高且与鸡的同源性最高达到94.1%,蛋白结构主体包含螺旋-环-螺旋模式(Helix loop helix,HLH)、PAS(Per ARNT Sim)蛋白、PAC(Motif C-terminal to PAS motifs)等结构域,符合HIF-1α蛋白的结构特征.组织表达差异分析结果显示HIF-1α基因在肺和胰腺表达高,在肌肉中表达低,在气管中几乎不表达. 展开更多
关键词 缺氧诱导因子 基因克隆 序列分析 表达差异分析
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