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基于质谱和生物信息学分析的小菜蛾蛋白质鉴定
被引量：
3
1
作者
谢苗
成娟
+2 位作者
尤民生
杨广
蔡敬轩
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第11期1206-1212,共7页
本研究以非模式昆虫小菜蛾Plutella xylostella为材料,对比2,3,4龄幼虫的蛋白质组双向电泳图谱,得到24个蛋白质差异点,从中选取了编号为1111的差异表达蛋白质点进行质谱鉴定和生物信息学分析。采用胶内酶解的多肽进行MALDI-TOF/TOF分析...
本研究以非模式昆虫小菜蛾Plutella xylostella为材料,对比2,3,4龄幼虫的蛋白质组双向电泳图谱,得到24个蛋白质差异点,从中选取了编号为1111的差异表达蛋白质点进行质谱鉴定和生物信息学分析。采用胶内酶解的多肽进行MALDI-TOF/TOF分析,获得该点的肽质量指纹图谱(PMF)及串联质谱(MS/MS)图谱。将获得的PMF分别用MASCOT和ProFound等常用软件在NCBInr的Metazoa蛋白质数据库进行搜索,匹配结果不理想。进一步用PMF+MS/MS谱图搜索NCBInr的Metazoa蛋白质数据库,以及小菜蛾EST数据库。在NCBInr库中匹配结果为拟暗果蝇Drosophila pseudoobscura中的一种假定蛋白GA18218-PA,而用EST库搜索的结果为家蚕Bombyx mori的ATP合酶的亚基。为验证搜索结果,将该蛋白质点进行磺基异硫氰酸苯酯(SPITC)化学衍生后de novo测序,最后确认该点可能为ATP合酶的一个亚基。最后着重讨论了蛋白质的质谱鉴定与生物信息学分析的联合使用,希望据此选择出最适合于非模式昆虫蛋白质组学鉴定的方法。
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关键词
小菜蛾
蛋白质
肽质量指纹图谱
串联质谱
denovo测序
生物信息学
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职称材料
PBL+LBL双轨教学法在STEM教学中的实践——以《钢珠过坡》为例
2
作者
蔡敬轩
黄福裕
《科教导刊》
2021年第15期101-104,共4页
PBL教学法是一种基于问题的教学方法,其灵活、开放的教学活动能激发学生的积极性,有利于引发学生高层次思维活动。LBL教学法是一种以教师授课,学生听课为主的传统教学方式。本文以来自荷兰的Schmidt教授和Moust教授所提出的PBL循环发展...
PBL教学法是一种基于问题的教学方法,其灵活、开放的教学活动能激发学生的积极性,有利于引发学生高层次思维活动。LBL教学法是一种以教师授课,学生听课为主的传统教学方式。本文以来自荷兰的Schmidt教授和Moust教授所提出的PBL循环发展模型为基准,基于小学科学课堂教育,开展PBL+LBL双轨教学法的效果对比,摸索适应国内环境的STEM教学模式,得出适用于小学的PBL教学流程图,并以此开展教学实践研究。
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关键词
PBL+LBL双轨教学法
课时
互动
课程效果
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职称材料
题名
基于质谱和生物信息学分析的小菜蛾蛋白质鉴定
被引量：
3
1
作者
谢苗
成娟
尤民生
杨广
蔡敬轩
机构
福建农林大学应用生态研究所
福建农林大学生命科学学院
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第11期1206-1212,共7页
基金
国家自然科学基金项目(30600403)
科技部农业科技成果转化资金项目(2008GB2C400138)
文摘
本研究以非模式昆虫小菜蛾Plutella xylostella为材料,对比2,3,4龄幼虫的蛋白质组双向电泳图谱,得到24个蛋白质差异点,从中选取了编号为1111的差异表达蛋白质点进行质谱鉴定和生物信息学分析。采用胶内酶解的多肽进行MALDI-TOF/TOF分析,获得该点的肽质量指纹图谱(PMF)及串联质谱(MS/MS)图谱。将获得的PMF分别用MASCOT和ProFound等常用软件在NCBInr的Metazoa蛋白质数据库进行搜索,匹配结果不理想。进一步用PMF+MS/MS谱图搜索NCBInr的Metazoa蛋白质数据库,以及小菜蛾EST数据库。在NCBInr库中匹配结果为拟暗果蝇Drosophila pseudoobscura中的一种假定蛋白GA18218-PA,而用EST库搜索的结果为家蚕Bombyx mori的ATP合酶的亚基。为验证搜索结果,将该蛋白质点进行磺基异硫氰酸苯酯(SPITC)化学衍生后de novo测序,最后确认该点可能为ATP合酶的一个亚基。最后着重讨论了蛋白质的质谱鉴定与生物信息学分析的联合使用,希望据此选择出最适合于非模式昆虫蛋白质组学鉴定的方法。
关键词
小菜蛾
蛋白质
肽质量指纹图谱
串联质谱
denovo测序
生物信息学
Keywords
Plutella xylostella
protein
peptide mass fingerprinting
tandem mass spectrometry
bioinformatics
分类号
S433 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
PBL+LBL双轨教学法在STEM教学中的实践——以《钢珠过坡》为例
2
作者
蔡敬轩
黄福裕
机构
福建省厦门市民立小学
福建省厦门外国语学校附属小学
出处
《科教导刊》
2021年第15期101-104,共4页
文摘
PBL教学法是一种基于问题的教学方法,其灵活、开放的教学活动能激发学生的积极性,有利于引发学生高层次思维活动。LBL教学法是一种以教师授课,学生听课为主的传统教学方式。本文以来自荷兰的Schmidt教授和Moust教授所提出的PBL循环发展模型为基准,基于小学科学课堂教育,开展PBL+LBL双轨教学法的效果对比,摸索适应国内环境的STEM教学模式,得出适用于小学的PBL教学流程图,并以此开展教学实践研究。
关键词
PBL+LBL双轨教学法
课时
互动
课程效果
Keywords
PBL+LBL dual track teaching method
lesson
interaction
course effect
分类号
G623.6 [文化科学—教育学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于质谱和生物信息学分析的小菜蛾蛋白质鉴定
谢苗
成娟
尤民生
杨广
蔡敬轩
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
3
在线阅读
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职称材料
2
PBL+LBL双轨教学法在STEM教学中的实践——以《钢珠过坡》为例
蔡敬轩
黄福裕
《科教导刊》
2021
0
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