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3株樱桃谷鸭源新型鹅细小病毒的分离及分子特征解析 被引量:6
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作者 贾婧宇 秘清灵 +4 位作者 李勇霖 李玉峰 于可响 王建业 朱国强 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2022年第2期7-13,共7页
为了深入揭示引起樱桃谷鸭短喙与矮小综合征(SBDS)的新型鹅细小病毒(NGPV)的鹅胚增殖特性及分子特征,对从山东省不同地区采集的3份SBDS典型病例在9日龄鹅胚上进行了病毒分离,并对其全基因组序列及编码蛋白序列进行比对。结果成功分离到3... 为了深入揭示引起樱桃谷鸭短喙与矮小综合征(SBDS)的新型鹅细小病毒(NGPV)的鹅胚增殖特性及分子特征,对从山东省不同地区采集的3份SBDS典型病例在9日龄鹅胚上进行了病毒分离,并对其全基因组序列及编码蛋白序列进行比对。结果成功分离到3株NGPV,分别为SDHT16、SDJN19和SDLC19。3株病毒均能在鹅胚中稳定传代,但致死鹅胚的时间明显长于经典型GPV。3株NGPV之间基因组的同源性高达98.9%~99.7%,而与经典GPV强毒株的同源性则稍低,为95.2%~96.1%。基于3株NGPV与已发表的NGPV毒株和经典GPV强毒株的编码蛋白比对分析显示,与国内经典GPV强毒株相比,NGPV毒株结构蛋白VP1共产生了16个氨基酸点突变,其中9个氨基酸位点与欧洲的B株相同;非结构蛋白Rep1则产生了12个氨基酸位点突变。与经典GPV LH株的末端倒置重复序列(ITR)相比,SDHT16、SDJN19和SDLC19在ITR的回文区茎部分别多出2、4、4个碱基,ITR的同源性达到98.1%~100.0%,而与LH株的同源性为93.0%~94.0%。本研究结果为今后进一步深入研究NGPV的致病机制奠定了基础。 展开更多
关键词 短喙与矮小综合征 新型鹅细小病毒 分离 分子特征 末端倒置重复序列
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重组型番鸭细小病毒JH10株的分子特征解析 被引量:3
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作者 王志仙 秘清灵 +6 位作者 凌珏怡 贾婧宇 鲍芳 王昱 王钜华 王建业 朱国强 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2020年第2期66-71,共6页
为了解析番鸭细小病毒(MDPV)分离株JH10的分子特征,本研究对该毒株全基因组进行了扩增、测序、重组分析及遗传进化树的构建。结果显示:JH10株基因组由5071个核苷酸组成,P9启动子区和VP3基因内部约1.1 kb区域经历了重组,GPV鹅胚化弱毒株S... 为了解析番鸭细小病毒(MDPV)分离株JH10的分子特征,本研究对该毒株全基因组进行了扩增、测序、重组分析及遗传进化树的构建。结果显示:JH10株基因组由5071个核苷酸组成,P9启动子区和VP3基因内部约1.1 kb区域经历了重组,GPV鹅胚化弱毒株SYG61v参与了P9启动子区的重组,而GPV强毒株LH、B和SYG61v不同程度地参与了VP3基因内部的重组;以VP3基因重组片段构建遗传进化树,JH10株与8个经典型GPV株处于同一个进化分支中,而以毗邻的上下游非重组区片段分别构建的遗传进化树中,JH10株则与4个经典型MDPV株处于同一分支。本研究结果表明,JH10株为经典型MDPV和GPV之间的重组产物,该研究结果为进一步阐明重组型MDPV的致病机理奠定了基础。 展开更多
关键词 番鸭细小病毒 重组 末端倒置重复 P9启动子
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2021年我国猪繁殖与呼吸综合征病毒分子流行病学调查与遗传变异性分析 被引量:1
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作者 吴慧娟 牛登云 +5 位作者 段宝敏 秘清灵 吕钊 马利芳 史秋颖 冯敬敬 《猪业科学》 2022年第12期64-69,共6页
猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是由病毒(PRRSV)引起的猪的一种繁殖障碍和呼吸系统的传染病,其临床特征是母猪发热厌食,妊娠后期流产,产死胎和木乃伊胎;仔猪则发生呼吸系统疾病且大量死亡,由... 猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是由病毒(PRRSV)引起的猪的一种繁殖障碍和呼吸系统的传染病,其临床特征是母猪发热厌食,妊娠后期流产,产死胎和木乃伊胎;仔猪则发生呼吸系统疾病且大量死亡,由于部分病猪耳部发紫,俗称“蓝耳病”。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 遗传变异性 繁殖障碍 呼吸系统疾病 分子流行病学调查 蓝耳病 妊娠后期 木乃伊
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1株重组型番鸭细小病毒的分子特征解析 被引量:3
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作者 鲍芳 秘清灵 +5 位作者 徐静雯 王昱 吴剑梅 王志仙 王建业 朱国强 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期33-37,共5页
为了对1株番鸭细小病毒(MDPV)分离株NY18株的分子特征予以准确揭示,通过设计重叠PCR引物,扩增NY18株的完整基因组并进行了测序。结果显示,NY18株基因组由5071个碱基组成,5′和3′端末端倒置重复序列(inverted terminal repeats,ITR)均由... 为了对1株番鸭细小病毒(MDPV)分离株NY18株的分子特征予以准确揭示,通过设计重叠PCR引物,扩增NY18株的完整基因组并进行了测序。结果显示,NY18株基因组由5071个碱基组成,5′和3′端末端倒置重复序列(inverted terminal repeats,ITR)均由424个碱基组成,其外侧385个碱基形成回文发夹结构。Simplot 3.5.1和RDP4软件分析表明,NY18株经历了2次重组事件,第1次重组产生在VP3基因的1.1 kb区域,第2次重组事件产生在P9启动子至Rep基因上游约100 bp区域内。2次重组均以经典型MDPV YY株作为主要亲本,而经典型鹅细小病毒(GPV)强毒株DY16和鹅胚化的弱毒疫苗株SYG61v作为次要亲本参与了重组。NY18株的ITR与经典型MDPV FM和YY株的同源性为97.9%和99.1%,而与GPV强毒株YZ99-6的同源性仅有86.0%,表明NY18株ITR仍来自于经典型MDPV。以VP1基因1.1 kb重组区片段构建遗传进化树,NY18株与经典型GPV处于同一分支,而以非重组区的Rep1基因1774 bp和VP1基因氨基端694 bp、羧基端405 bp片段分别构建遗传进化树,NY18株则与经典型MDPV处于同一分支。结果表明,NY18株既不同于经典型MDPV也不同于GPV,其本质是1株重组型的MDPV。 展开更多
关键词 重组型番鸭细小病毒 鹅细小病毒 末端倒置重复 分子特征 遗传进化树
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