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脆蜜金柑果肉转录组SSR分布及其序列特征分析
1
作者 黄秋岚 田程飘 +3 位作者 刘功德 毛立彦 邓小红 龙凌云 《南方农业学报》 北大核心 2025年第2期583-591,共9页
【目的】分析脆蜜金柑果肉转录组中简单重复序列(SSR)的分布情况及序列特征,为金柑属的遗传多样性分析、SSR分子标记开发及分子辅助育种等提供参考依据。【方法】以脆蜜金柑为试验材料,通过DNBSEQ-G99高通量测序平台对其果肉组织进行转... 【目的】分析脆蜜金柑果肉转录组中简单重复序列(SSR)的分布情况及序列特征,为金柑属的遗传多样性分析、SSR分子标记开发及分子辅助育种等提供参考依据。【方法】以脆蜜金柑为试验材料,通过DNBSEQ-G99高通量测序平台对其果肉组织进行转录组测序,高质量测序数据经严格过滤、拼接及组装后,使用MISA对转录组测序得到的Unigenes进行SSR位点检索,并分析其分布情况及序列特征。【结果】脆蜜金柑果肉转录组测序数据经质控及组装后共获得32257条Unigenes,Unigenes总长度为63342722 bp;经MISA搜索,鉴定出22447个SSR位点,分布在11119条Unigenes上,SSR发生频率为34.47%,平均分布距离为2.82 kb。在22447个SSR位点中,以单核苷酸重复类型数量最多(14002个),占62.38%;其次是二核苷酸重复类型(3949个)和三核苷酸重复类型(3980个),分别占17.59%和17.73%。从22447个SSR位点共搜索出116种重复基元种类,且以A/T、AG/CT和AT/AT这3种重复基元的数量占绝对优势(合计占73.99%);A/T是单核苷酸重复基元中的绝对优势基元,占59.41%;AG/CT是二核苷酸重复基元中的优势基元,占8.87%;AAT/ATT是三核苷酸重复基元中的优势基元,占4.55%。SSR重复基元出现频次从5次到44次均有分布,以出现频次大于10次的SSR重复基元数量最多(10395个,占46.31%),其次是出现频次为10次的SSR重复基元(4997个,占22.26%)。脆蜜金柑果肉转录组SSR位点的平均基序长度为29.63 bp,以基序长度在12~20 bp的SSR位点数量最多(12692个,占56.54%),呈中度多态性。采用Primer3设计SSR引物,共有17118个SSR位点可设计出引物,成功率为76.26%。【结论】脆蜜金柑果肉转录组SSR位点数量庞大,基元类型丰富,呈中度以上多态性,可用于开发SSR分子标记,为金柑及其他柑橘属植物的遗传图谱绘制、病害抗病分析及种质资源鉴定等研究提供技术支撑。 展开更多
关键词 脆蜜金柑 转录组 简单重复序列(SSR) 序列特征 重复基元
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广泛靶向代谢组学分析不同采收期紫黑香米和普通大米成分差异 被引量：4
2
作者 田程飘 龙凌云 +4 位作者 刘功德 叶雪英 谢秀萍 檀小辉 王丽萍 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第1期125-132,共8页
采用超高效液相色谱-串联质谱联用广泛靶向代谢组学对广西地区产的紫黑香米和普通大米进行分析,主要分析紫黑香米与普通大米代谢物种类及含量差异,并阐述显著差异代谢途径。样品中共鉴定出667个代谢物,包含脂质、类黄酮、酚酸、生物碱... 采用超高效液相色谱-串联质谱联用广泛靶向代谢组学对广西地区产的紫黑香米和普通大米进行分析,主要分析紫黑香米与普通大米代谢物种类及含量差异,并阐述显著差异代谢途径。样品中共鉴定出667个代谢物,包含脂质、类黄酮、酚酸、生物碱及有机酸等几大类;通过主成分分析、聚类分析及整体代谢物剖析发现,紫黑香米与普通大米相比,成熟样品组间存在的278种差异代谢物中上调的有239种,提前20d采收组存在的267种差异代谢物中上调的有235种;不同时期的紫黑香米成分相似,说明提前采收的紫黑香米兼具食用粥软糯口感及完整营养结构。京都基因与基因组百科全书分析发现与普通大米相比,在紫黑香米中显著上调的鼠李素-3-O-葡萄糖苷、橙皮素-7-O-葡萄糖苷、高圣草酚、圣草酚、橙皮素、儿茶素、槲皮素、柚皮素查耳酮等化合物参与到黄酮和黄酮醇的生物合成途径,调节黄酮、黄酮醇类物质含量,提升紫黑香米营养品质及抗氧化功效。 展开更多
关键词 紫黑香米 普通大米 广泛靶向代谢组学 差异代谢物 代谢途径
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蝶豆花青素超声辅助提取工艺及抗氧化活性研究 被引量：8
3
作者 田程飘 黄秋岚 +4 位作者 韦璐阳 龙凌云 黄秋伟 黄惠芳 王丽萍 《中国食品添加剂》 CAS 北大核心 2022年第11期18-26,共9页
通过研究蝶豆花青素的吸收特性确定花青素含量测定方法,采用超声辅助提取蝶豆花青素,以正交试验法筛选蝶豆花青素提取的最佳工艺,评价蝶豆提取物抗氧化活性,以期为蝶豆今后的开发利用提供参考依据。以蓝色重瓣蝶豆花为研究对象,采用单... 通过研究蝶豆花青素的吸收特性确定花青素含量测定方法,采用超声辅助提取蝶豆花青素,以正交试验法筛选蝶豆花青素提取的最佳工艺,评价蝶豆提取物抗氧化活性,以期为蝶豆今后的开发利用提供参考依据。以蓝色重瓣蝶豆花为研究对象,采用单一pH法测定花青素含量,考察不同超声时间、料液比、乙醇体积分数、温度和超声功率对提取效果的影响;以抗坏血酸为阳性对照,评价蝶豆提取物抗氧化活性(DPPH自由基、ABTS+自由基清除率和总还原力测定)。结果表明:超声辅助提取蝶豆花青素,最佳提取工艺为超声时间20min,料液比1∶200(g/mL),乙醇体积分数65%,超声温度50℃,在此条件下蝶豆花青素提取量为13.604±0.145mg/g;抗氧化活性测定试验中,蝶豆花提取物浓度为0.8mg/mL时,对DPPH自由基和ABTS+自由基的清除率分别为87.83%和99%。本研究表明超声辅助可以有效提取出蝶豆花青素,蝶豆提取物具有较好的抗氧化活性。 展开更多
关键词 蝶豆 花青素 天然色素 超声辅助提取 抗氧化活性
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香蓼精油成分及其生理活性分析 被引量：4
4
作者 伍燕 田程飘 +1 位作者 向霞 申利群 《贵州农业科学》 CAS 2019年第12期24-28,共5页
为香蓼精油的推广与利用提供参考,采用水蒸气蒸馏法提取兴义产香蓼精油,气相色谱-质谱联用(GC-MS)测定香蓼精油的可挥发性成分,0.5麦氏标准比浊法检测香蓼精油对几种常见致病微生物的抑菌作用,并探索不同浓度精油对玉米粘虫的拒食作用;... 为香蓼精油的推广与利用提供参考,采用水蒸气蒸馏法提取兴义产香蓼精油,气相色谱-质谱联用(GC-MS)测定香蓼精油的可挥发性成分,0.5麦氏标准比浊法检测香蓼精油对几种常见致病微生物的抑菌作用,并探索不同浓度精油对玉米粘虫的拒食作用;以抗坏血酸为对照,检测香蓼精油对ABTs自由基、DPPH自由基和·OH自由基的清除效果。结果表明:香蓼精油有32种挥发性化学成分被鉴定,占总质量的96.01%,其中含量较高的成分有十二烷醛(24.57%)、葵醇(12.08%)、异长叶烯(9.39%)、葵烷(8.14%)、蛇麻烯(5.72%)、石竹烯氧化物(3.05%)、石竹烯(2.36%)、补身醇(2.17%)、倍半香桧烯(1.44%)和α-橄榄烯(1.30%)。香蓼精油对枯草芽孢杆菌和大肠杆菌抑制效果明显,最小抑菌浓度(MIC)分别为4.88μg/mL和39.06μg/mL;0.0125~0.2 mL/mL香蓼精油对玉米粘虫均达到80%以上的拒食活性;香蓼精油对ABTs、DPPH和·OH自由基有良好的清除作用,其EC50分别为3.20 mg/mL、10.87 mg/mL和10.24 mg/mL。 展开更多
关键词 香蓼 精油 气相色谱-质谱联用仪 生物活性
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生姜与醋泡姜抗氧化、抑菌和抗肿瘤活性比较研究 被引量：24
5
作者 田程飘 朱伟伟 +3 位作者 宋雅玲 牛思琪 申利群 吴爱群 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2019年第14期18-23,共6页
本文研究了生姜和醋泡姜的姜油和姜乙醇提取物的抗氧化、抑菌和抗肿瘤作用的活性差异。以抗坏血酸为对照,评价两类姜提取物的抗氧化活性(DPPH自由基、ABTS+自由基、羟自由基(·OH)清除能力和总还原能力);以96孔板微量稀释法比较了... 本文研究了生姜和醋泡姜的姜油和姜乙醇提取物的抗氧化、抑菌和抗肿瘤作用的活性差异。以抗坏血酸为对照,评价两类姜提取物的抗氧化活性(DPPH自由基、ABTS+自由基、羟自由基(·OH)清除能力和总还原能力);以96孔板微量稀释法比较了两类姜提取物对几种常见致病菌的抑菌活性;同时研究了两类姜提取物对HCT116(人结肠癌细胞)、HepG2(人肝癌细胞)、Skov3(卵巢癌细胞)等肿瘤细胞的抗癌效果。结果表明:醋泡姜的抗氧化活性总体上好于生姜,其中醋姜油对羟自由基(·OH)的清除能力(IC50为0.28mg/mL)明显强于生姜油(IC50为0.42mg/mL);生姜和醋泡生姜提取物都有一定的抑菌作用,醋姜油的抑菌效果稍好于生姜油,其中最好的是醋姜油对金黄色葡萄球菌的抑制作用(156.25μg/mL);抗肿瘤活性基本相当。本研究结果表明,醋泡姜在抗氧化、抑菌功能上一定程度优于生姜。 展开更多
关键词 生姜 醋泡 抗氧化活性 抑菌活性 抗肿瘤活性
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多花筋骨草提取物抗氧化活性研究 被引量：1
6
作者 马露 田程飘 +1 位作者 李云志 何宁 《辽宁中医药大学学报》 CAS 2019年第7期53-56,共4页
目的:采用体外抗氧化实验,对多花筋骨草醇提物的抗氧化活性进行研究,为多花筋骨草的开发和应用提供参考数据。方法:用甲醇冷浸提取多花筋骨草,减压浓缩得到多花筋骨草醇提物,采用1,1-二苯基-2-三硝基苯肼(DPPH·)法、2,2’-联氮-双... 目的:采用体外抗氧化实验,对多花筋骨草醇提物的抗氧化活性进行研究,为多花筋骨草的开发和应用提供参考数据。方法:用甲醇冷浸提取多花筋骨草,减压浓缩得到多花筋骨草醇提物,采用1,1-二苯基-2-三硝基苯肼(DPPH·)法、2,2’-联氮-双(3-乙基苯并噻唑啉-6-磺酸)二铵盐(ABTS+)法和总还原能力测定法,研究其提取物的抗氧化活性。结果:多花筋骨草醇提物对DPPH·、ABTS+均有清除活性,以及较强还原能力,且DPPH·清除活性(IC50值)为0.348 mg/mL、ABTS+清除活性(IC50值)为0.292 mg/mL,总还原能力(IC50值)为2.736 mg/mL。结论:多花筋骨草醇提物有较强的抗氧化活性,且抗氧化活性与醇提物质量浓度两者间存在一定量效关联。 展开更多
关键词 多花筋骨草 醇提物 抗氧化活性
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百香果叶总酚的提取工艺优化、抗氧化活性及其抑制α-葡萄糖苷酶活性 被引量：18
7
作者 许海棠 田程飘 +3 位作者 赵彦芝 廖华珍 申利群 周菊英 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2019年第20期223-227,236,共6页
目的:旨在研究百香果叶多酚的提取工艺及其生物活性。方法:应用微波辅助提取百香果叶多酚,并考察乙醇体积分数、微波功率、微波时间及料液比四个单因素对总酚提取量的影响,在单因素试验基础上采用正交实验设计对总酚的提取工艺进行优化... 目的:旨在研究百香果叶多酚的提取工艺及其生物活性。方法:应用微波辅助提取百香果叶多酚,并考察乙醇体积分数、微波功率、微波时间及料液比四个单因素对总酚提取量的影响,在单因素试验基础上采用正交实验设计对总酚的提取工艺进行优化;采用测定清除3种自由基能力和总还原力的方法对其抗氧化性进行评估;并测定了百香果叶多酚对α-葡萄糖苷酶的抑制作用。结果:提取百香果叶总酚的最佳工艺条件为:乙醇体积分数60%,微波功率400 W,微波时间20 min,料液比1∶40 g/mL;在此条件下百香果叶总酚提取量为(2.200±0.015)mg/g。结论:百香果叶多酚具有较好的抗氧化活性和抑制α-葡萄糖苷酶的作用。 展开更多
关键词 百香果叶 多酚 微波辅助提取 抗氧化 Α-葡萄糖苷酶
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固定化木瓜蛋白酶的应用进展 被引量：1
8
作者 黄秋岚 田程飘 +2 位作者 唐桓伟 单彬 庞新华 《农业研究与应用》 2022年第1期44-48,共5页
木瓜蛋白酶是来自于热带、亚热带水果番木瓜的蛋白酶,经固定化后可以增强其功能特性,有利于进一步开发与利用。固定化木瓜蛋白酶应用范围广泛,在多个领域中均有应用,但是同时也存在着研究水平较低、应用程度较浅的问题,因此还可以做更... 木瓜蛋白酶是来自于热带、亚热带水果番木瓜的蛋白酶,经固定化后可以增强其功能特性,有利于进一步开发与利用。固定化木瓜蛋白酶应用范围广泛,在多个领域中均有应用,但是同时也存在着研究水平较低、应用程度较浅的问题,因此还可以做更深入、全面的开发,将其优秀的酶学性质发挥到各个行业中。本文简述了木瓜蛋白酶的固定化方法及固定化木瓜蛋白酶在食品、医药等行业的应用,以期为木瓜蛋白酶今后的研究与利用提供参考。 展开更多
关键词 番木瓜 木瓜蛋白酶 固定化
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超临界和水蒸气蒸馏提取沉香精油成分分析及抗氧化、抑菌活性对比研究 被引量：35
9
作者 田程飘 宋雅玲 +3 位作者 许海棠 牛思琪 吴志鸿 申利群 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第18期4000-4008,共9页
沉香是中国等东南亚国家的传统名贵药材和天然香料,具备镇痛、止泻、抗炎、抗菌等诸多药理活性,为众香之首。因其价格昂贵且资源稀缺,前人对其研究甚少,此前的研究集中在水蒸气蒸馏提取沉香精油和溶剂提取物的成分方面。该研究采用GC-M... 沉香是中国等东南亚国家的传统名贵药材和天然香料,具备镇痛、止泻、抗炎、抗菌等诸多药理活性,为众香之首。因其价格昂贵且资源稀缺,前人对其研究甚少,此前的研究集中在水蒸气蒸馏提取沉香精油和溶剂提取物的成分方面。该研究采用GC-MS对超临界CO2和水蒸气蒸馏提取沉香精油进行分析,比较传统提取方法与新兴的绿色超临界提取方法得到的沉香精油成分和含量差异,同时结合清除DPPH,ABTS,羟自由基(·OH)的能力、总还原力等抗氧化实验和采用微量肉汤稀释法测试对金黄色葡萄球菌等5种试验菌的MIC,探究2种沉香精油的抗氧化活性和抑菌活性的区别。实验结果表明,水蒸馏提取沉香精油中主要成分为倍半萜类(68.68%),超临界提取沉香精油主要成分为倍半萜类(23.78%)和色酮类(29.42%),共有成分为benzyl acetone,α-santalol,γ-eudesmol,agarospirol和guaiol等14个特征成分;超临界提取沉香精油的抗氧化活性和抑菌MIC均优于水蒸气蒸馏提取沉香精油,首次发现沉香精油对枯草芽孢杆菌生长有较好的抑制作用。 展开更多
关键词 沉香精油 超临界提取 GC-MS 抗氧化 抑菌
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