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关注生生交往 创新思品课堂
1
作者
毛成菊
《中学政史地(教学指导)》
2008年第6期26-27,共2页
新课改让我们达成了一个共识:课堂的活力来自于学生动态的发展。教师必须紧紧抓住学生动态发展的各个环节,来提高课掌教学的实效。而生生之间的交往则是课堂教学动态发展中的一个重要环节,在教学过程中具有重要意义。笔者从有效生生...
新课改让我们达成了一个共识:课堂的活力来自于学生动态的发展。教师必须紧紧抓住学生动态发展的各个环节,来提高课掌教学的实效。而生生之间的交往则是课堂教学动态发展中的一个重要环节,在教学过程中具有重要意义。笔者从有效生生交往的作用和构建两方面,结合课堂教学实际谈谈自己的一些体会。
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关键词
课堂教学
交往
创新
动态发展
教学过程
学生
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职称材料
基于RNA-Seq技术分析不同生物被膜形成能力的临床耐药鲍曼不动杆菌基因表达差异
2
作者
刘巍巍
国果
+6 位作者
吴兆颖
毛成菊
李忠旬
贾利娜
尚小丽
彭建
吴建伟
《贵州医科大学学报》
CAS
2021年第11期1241-1248,1270,共9页
目的了解不同生物被膜形成能力的临床分离耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌菌株(CRAB)基因表达的差异。方法选取8株临床分离CRAB,将生物被膜形成能力强的菌株4、55、78、117号作为强生物被膜(BF)组,将生物被膜形成能力弱的菌株13、177、191、19...
目的了解不同生物被膜形成能力的临床分离耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌菌株(CRAB)基因表达的差异。方法选取8株临床分离CRAB,将生物被膜形成能力强的菌株4、55、78、117号作为强生物被膜(BF)组,将生物被膜形成能力弱的菌株13、177、191、196号作为弱生物被膜(WBF)组,培养两组菌株形成生物被膜,分别提取RNA进行文库构建和转录组测序(RNA-Seq),以鲍曼不动杆菌AB030(NZ_CP009257.1)的基因组作为参考基因组对测序数据进行分析,鉴定差异表达基因(DEGs),并进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,选取8个DEGs利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证转录组测序结果。结果RNA样品完整无污染,测序数据错误率为0.03%;BF组与WBF组相比,鉴定到171个DEGs,其中106条基因为上调表达,65条基因为下调表达;这些基因主要涉及DNA结合、膜蛋白、菌毛调控、ATP的合成和分解等;GO分析显示较多基因被注释到生物过程部分,KEGG分析显示DEGs富集到多种物质代谢途径;选取的8个DEGs利用qRT-PCR进行验证,结果与转录组测序结果趋势一致。结论不同生物被膜形成能力的临床CRAB的基因表达存在差异,多基因和多条信号通路影响生物被膜的形成。
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关键词
细菌
耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌
生物被膜形成能力
菌毛
外膜蛋白
信号通路
差异表达基因
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职称材料
生物被膜态和游离态临床耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌转录组的差异分析
3
作者
刘巍巍
国果
+6 位作者
吴兆颖
毛成菊
李忠旬
贾利娜
尚小丽
彭建
吴建伟
《贵州医科大学学报》
CAS
2021年第11期1249-1257,共9页
目的了解临床分离的耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)生物被膜态和游离态的转录组差异,探究生物被膜形成的机制。方法从住院病人痰液或血液样本分离CRAB 4、55、78及117菌株,挑取单菌落分别培养生物被膜态菌(A组)和游离态菌(B组),采用Tri...
目的了解临床分离的耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)生物被膜态和游离态的转录组差异,探究生物被膜形成的机制。方法从住院病人痰液或血液样本分离CRAB 4、55、78及117菌株,挑取单菌落分别培养生物被膜态菌(A组)和游离态菌(B组),采用Trizol法提取2组细菌核糖核酸(RNA)样本进行转录组测序;使用DESeq软件进行差异表达基因(DEGs)分析,通过GOSeq R软件进行基因本体(GO)富集分析,通过KOBAS软件进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;选择8个DEGs,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证转录组测序分析结果。结果RNA样品完整无污染满足测序要求,测序数据错误率不超过0.03%;A与B组相比鉴定到407个差异基因,其中212条基因为上调表达,195条基因为下调表达,涉及铁的摄取和转运、菌毛合成的调控、生化代谢酶类及转录调节因子等;GO分析显示,GO条目主要富集于分子功能类别和生物过程类别;KEGG分析显示,DEGs富集到硫代谢、ATP结合盒(ABC)转运系统、万古霉素耐药、群体感应及阳离子抗菌肽耐药等多条通路;选取的8个差异基因通过qRT-PCR进行验证,结果与转录组结果趋势一致。结论临床分离的CRAB菌株,其生物被膜态和游离态存在基因表达差异,生物被膜的形成涉及多基因和多信号通路参与。
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关键词
细菌
耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌
生物被膜
游离菌
转录组
差异表达基因
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职称材料
题名
关注生生交往 创新思品课堂
1
作者
毛成菊
机构
浙江省奉化市尚田中学
出处
《中学政史地(教学指导)》
2008年第6期26-27,共2页
文摘
新课改让我们达成了一个共识:课堂的活力来自于学生动态的发展。教师必须紧紧抓住学生动态发展的各个环节,来提高课掌教学的实效。而生生之间的交往则是课堂教学动态发展中的一个重要环节,在教学过程中具有重要意义。笔者从有效生生交往的作用和构建两方面,结合课堂教学实际谈谈自己的一些体会。
关键词
课堂教学
交往
创新
动态发展
教学过程
学生
分类号
C912.1 [经济管理]
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职称材料
题名
基于RNA-Seq技术分析不同生物被膜形成能力的临床耐药鲍曼不动杆菌基因表达差异
2
作者
刘巍巍
国果
吴兆颖
毛成菊
李忠旬
贾利娜
尚小丽
彭建
吴建伟
机构
贵州医科大学基础医学院人体寄生虫学教研室
贵州医科大学基础医学院现代病原生物学特色重点实验室
贵州医科大学生物工程学院
出处
《贵州医科大学学报》
CAS
2021年第11期1241-1248,1270,共9页
基金
国家自然科学基因(81660347)
国家科技支撑计划(2011BAC06B12)
贵州省科技厅科技支撑计划[黔科合支撑(2019)2823]。
文摘
目的了解不同生物被膜形成能力的临床分离耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌菌株(CRAB)基因表达的差异。方法选取8株临床分离CRAB,将生物被膜形成能力强的菌株4、55、78、117号作为强生物被膜(BF)组,将生物被膜形成能力弱的菌株13、177、191、196号作为弱生物被膜(WBF)组,培养两组菌株形成生物被膜,分别提取RNA进行文库构建和转录组测序(RNA-Seq),以鲍曼不动杆菌AB030(NZ_CP009257.1)的基因组作为参考基因组对测序数据进行分析,鉴定差异表达基因(DEGs),并进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,选取8个DEGs利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证转录组测序结果。结果RNA样品完整无污染,测序数据错误率为0.03%;BF组与WBF组相比,鉴定到171个DEGs,其中106条基因为上调表达,65条基因为下调表达;这些基因主要涉及DNA结合、膜蛋白、菌毛调控、ATP的合成和分解等;GO分析显示较多基因被注释到生物过程部分,KEGG分析显示DEGs富集到多种物质代谢途径;选取的8个DEGs利用qRT-PCR进行验证,结果与转录组测序结果趋势一致。结论不同生物被膜形成能力的临床CRAB的基因表达存在差异,多基因和多条信号通路影响生物被膜的形成。
关键词
细菌
耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌
生物被膜形成能力
菌毛
外膜蛋白
信号通路
差异表达基因
Keywords
bacteria
carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii(CRAB)
biofilm formation
fimbria
outer membrane protein
pathway
differentially expressed genes(DEGs)
分类号
R384.2 [医药卫生—医学寄生虫学]
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职称材料
题名
生物被膜态和游离态临床耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌转录组的差异分析
3
作者
刘巍巍
国果
吴兆颖
毛成菊
李忠旬
贾利娜
尚小丽
彭建
吴建伟
机构
贵州医科大学基础医学院人体寄生虫学教研室
贵州医科大学基础医学院现代病原生物学特色重点实验室
贵州医科大学生物工程学院
出处
《贵州医科大学学报》
CAS
2021年第11期1249-1257,共9页
基金
国家自然科学基金(81660347)
国家科技支撑计划(2011BAC06B12)
贵州省科技厅科技支撑计划[黔科合支撑(2019)2823]。
文摘
目的了解临床分离的耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)生物被膜态和游离态的转录组差异,探究生物被膜形成的机制。方法从住院病人痰液或血液样本分离CRAB 4、55、78及117菌株,挑取单菌落分别培养生物被膜态菌(A组)和游离态菌(B组),采用Trizol法提取2组细菌核糖核酸(RNA)样本进行转录组测序;使用DESeq软件进行差异表达基因(DEGs)分析,通过GOSeq R软件进行基因本体(GO)富集分析,通过KOBAS软件进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;选择8个DEGs,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证转录组测序分析结果。结果RNA样品完整无污染满足测序要求,测序数据错误率不超过0.03%;A与B组相比鉴定到407个差异基因,其中212条基因为上调表达,195条基因为下调表达,涉及铁的摄取和转运、菌毛合成的调控、生化代谢酶类及转录调节因子等;GO分析显示,GO条目主要富集于分子功能类别和生物过程类别;KEGG分析显示,DEGs富集到硫代谢、ATP结合盒(ABC)转运系统、万古霉素耐药、群体感应及阳离子抗菌肽耐药等多条通路;选取的8个差异基因通过qRT-PCR进行验证,结果与转录组结果趋势一致。结论临床分离的CRAB菌株,其生物被膜态和游离态存在基因表达差异,生物被膜的形成涉及多基因和多信号通路参与。
关键词
细菌
耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌
生物被膜
游离菌
转录组
差异表达基因
Keywords
bacteria
carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii(CRAB)
biofilm
planktonic
transcriptome
differentially expressed genes(DEGs)
分类号
R384.2 [医药卫生—医学寄生虫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
关注生生交往 创新思品课堂
毛成菊
《中学政史地(教学指导)》
2008
0
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职称材料
2
基于RNA-Seq技术分析不同生物被膜形成能力的临床耐药鲍曼不动杆菌基因表达差异
刘巍巍
国果
吴兆颖
毛成菊
李忠旬
贾利娜
尚小丽
彭建
吴建伟
《贵州医科大学学报》
CAS
2021
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
生物被膜态和游离态临床耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌转录组的差异分析
刘巍巍
国果
吴兆颖
毛成菊
李忠旬
贾利娜
尚小丽
彭建
吴建伟
《贵州医科大学学报》
CAS
2021
0
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