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基于选择清除分析挖掘连翘异型花柱候选基因
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作者 杜晓蓉 李琦 +6 位作者 李澳旋 樊阿梅 何龙娇 靳亚鑫 张灵灵 乔永刚 宋芸 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期451-461,共11页
连翘(Forsythia suspensa (Thunb.) Vahl)为多年生木本植物,花柱二型具有自交不亲和性。挖掘连翘异型花柱发育候选基因,利于揭示连翘异型花柱的进化与发育机理。对40株长花柱型与短花柱型连翘植株进行全基因组重测序,检测样本基因组的SN... 连翘(Forsythia suspensa (Thunb.) Vahl)为多年生木本植物,花柱二型具有自交不亲和性。挖掘连翘异型花柱发育候选基因,利于揭示连翘异型花柱的进化与发育机理。对40株长花柱型与短花柱型连翘植株进行全基因组重测序,检测样本基因组的SNP变异位点,开展选择清除分析。利用遗传分化系数Fst和核苷酸多态性πratio结合的方法筛选候选区域(前5%水平),对差异基因进行GO数据库和KEGG数据库功能注释分析,采用qRT-PCR对候选基因在花柱发育不同时期的表达量进行检测。选择清除分析显示受选择基因295个,主要在植物的生长发育以及代谢调控方面发挥重要作用。分析植物激素调节相关的部分通路,确定连翘异型花柱候选基因CYP734A1(EVM0010386)、BRI1(EVM0011829)、CYCD3(EVM0018316),基因表达结果显示CYP734A1基因在连翘短花柱发育的关键时期持续高表达,露冠期BRI1与CYCD3基因表达水平在短花柱型中显著高于长花柱型。本研究挖掘的候选基因在连翘长花柱与短花柱中存在差异表达,油菜素甾醇参与了连翘异型花柱的发育,是产生连翘花柱异型的原因之一。本研究为连翘异型花柱的进化以及遗传发育调控机制解析奠定基础并提供思路。 展开更多
关键词 连翘 异型花柱 全基因组重测序 选择清除分析 表达分析
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柴胡植物新品种DUS测试指南的研制
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作者 何龙娇 孙哲 +5 位作者 樊阿梅 杜晓蓉 李澳旋 李佳杰 宋芸 乔永刚 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期3121-3132,共12页
柴胡(Bupleurum chinens e DC.)为伞形科柴胡属多年生草本植物,以根入药。柴胡生产中种质混杂较为严重,新品种选育势在必行。为完善柴胡植物新品种特异性、一致性和稳定性(Distinctness,uniformity and stability,DUS)测试指南,本试验... 柴胡(Bupleurum chinens e DC.)为伞形科柴胡属多年生草本植物,以根入药。柴胡生产中种质混杂较为严重,新品种选育势在必行。为完善柴胡植物新品种特异性、一致性和稳定性(Distinctness,uniformity and stability,DUS)测试指南,本试验收集了22份不同产地柴胡,对二年生与三年生柴胡基于形态学性状开展了DUS测试指南的研制,与原指南相比,增加了根的产量与含量相关的性状,最终确定了41个测试性状,其中包括24个必测的基本性状,17个选测性状;有质量性状0个、假质量性状15个和数量性状26个;涉及到植株性状6个、茎性状4个、叶性状7个、基生叶性状7个、花性状6个、根性状10个、生育期性状1个。本指南为我国柴胡性状测试、新品种的授权提供了支撑,对柴胡新品种选育具有重大意义。 展开更多
关键词 柴胡 DUS 性状
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