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油茶bHLH基因家族鉴定与响应干旱胁迫的基因表达分析
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作者 谢荟清 苏文娟 +5 位作者 赵娜红 程钦华 朱鸿洋 樊昊琦 胡冬南 刘娟 《中南林业科技大学学报》 北大核心 2025年第1期168-180,共13页
【目的】探究油茶bHLH基因家族成员及其应对干旱胁迫的表达调控模式。【方法】基于油茶全基因组数据,鉴定CobHLHs基因成员,分析其系统发育进化关系,研究其在油茶染色体上的分布、顺式作用元件预测、家族成员间共线性分析,探究CobHLHs基... 【目的】探究油茶bHLH基因家族成员及其应对干旱胁迫的表达调控模式。【方法】基于油茶全基因组数据,鉴定CobHLHs基因成员,分析其系统发育进化关系,研究其在油茶染色体上的分布、顺式作用元件预测、家族成员间共线性分析,探究CobHLHs基因的组织表达特异性及其在干旱胁迫、ABA处理下的表达模式。【结果】共鉴定出127个CobHLHs。根据其系统发育关系,将其分为17个亚族。共线性分析结果显示,全基因组范围内共发生了22次片段复制事件。干旱胁迫下叶组织转录组分析结果显示,共有106个CobHLHs参与油茶干旱胁迫响应过程。组织特异表达分析发现,参与干旱胁迫的CobHLHs主要在叶中高表达,在根中表达相对较低。PEG模拟干旱胁迫和同源基因功能预测证实,9个CobHLHs的表达均在不同程度上受干旱胁迫诱导,不同基因表达调控模式存在差异,CobHLH071在干旱胁迫下为低表达,表现为12、48 h分别为对照的0.07和0.24倍;CobHLH006、CobHLH082在干旱胁迫下高表达,CobHLH006在12、48 h为对照的8.2、54.1倍,而CobHLH082在48 h才出现显著高表达。进一步进行ABA处理研究其可能的表达调控模式发现,CobHLH071可能通过ABA依赖负调控干旱胁迫应答。CobHLH006、CobHLH082可能通过影响ABA信号通路相关基因的表达,正调控油茶干旱胁迫应答,但两者的响应时间存在差异,前者可能同时存在非ABA依赖调控模式。【结论】大部分CobHLHs基因在干旱胁迫下参与响应,其中CobHLH071、CobHLH082在干旱胁迫下和ABA处理下均出现响应,且两者响应方式不同,研究进一步表明CobHLH可能通过不同方式参与ABA信号途径响应干旱胁迫。 展开更多
关键词 油茶 bHLH基因家族 表达分析 干旱胁迫
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