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基于转录组学探讨心力衰竭和认知障碍的共同分子特征
1
作者
曾倩
石瑀
+7 位作者
彭轲
刘晓颖
张奎
柯雪雯
谢颖豪
奉水东
韩桂圆
李镒冲
《岭南心血管病杂志》
CAS
2024年第1期57-66,共10页
目的 利用生物信息学技术探究心力衰竭(heart failure,HF)和认知障碍共同的生物学过程及基因特征,为后续分子机制研究提供思路。方法 从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)下载HF数据集GSE116250和认知障碍数据集GSE1220...
目的 利用生物信息学技术探究心力衰竭(heart failure,HF)和认知障碍共同的生物学过程及基因特征,为后续分子机制研究提供思路。方法 从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)下载HF数据集GSE116250和认知障碍数据集GSE122063,鉴定出共同差异表达基因后,进行基因本体论(gene ontology,GO)富集分析,再应用String数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络筛选出中枢基因,在外部HF数据集GSE57338和认知障碍数据集GSE33000中验证中枢基因的表达,从JASPER和RegNetwork数据库中获得潜在的转录因子(transcription factor,TF)和微小RNA(micro RNA,miR)构建分子共调控网络。结果 共筛选出387个上调和388个下调差异基因(differential expressed genes,DEGs),主要富集在发育过程、细胞运动调节和主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)Ⅱ类蛋白复合物组装通路上。通过PPI网络鉴定出8个中枢基因(HLA-F、HLA-E、HLA-B、HLA-DRA、B2M、HLA-DQA1、HLADQB1、HSPA1A),主要通过内源性和外源性抗原加工和提呈通路激活免疫应答。在共调控网络中,FOXC1、GATA2、NFIC、NFYA、核转录因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)1、miR-10是调控中枢基因的关键TFs和miR,潜在的NF-κB1/HLA-E/miR-10调控轴被认为在HF与认知障碍发展中发挥着重要作用。结论 本研究结果表明免疫调节可能在HF患者发生认知障碍的过程中发挥重要作用,可为研究“心-脑轴交互作用”提供新见解,但仍需进一步的分子生物学验证及人群研究证据。
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关键词
心力衰竭
认知障碍
中枢基因
分子共调控网络
生物信息学分析
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职称材料
深圳市成人B期心力衰竭患病情况流行病学调查
2
作者
柯雪雯
吕德良
+15 位作者
吴肖冰
刘晓颖
彭轲
谢凤珠
谢尉
谢雨欣
尚庆刚
闵芊玲
武小艳
符紫薇
温熙麟
曾倩
谢颖豪
奉水东
赵志广
李镒冲
《中国慢性病预防与控制》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期343-348,352,共7页
目的了解深圳市成人B期心力衰竭的流行病学特征及相关影响因素,为心力衰竭防控政策的制定提供参考依据。方法数据来源于2021年深圳市心力衰竭流行病学调查,采用多阶段分层随机抽样的方法,对6128名≥18岁深圳市常住居民进行一般信息问卷...
目的了解深圳市成人B期心力衰竭的流行病学特征及相关影响因素,为心力衰竭防控政策的制定提供参考依据。方法数据来源于2021年深圳市心力衰竭流行病学调查,采用多阶段分层随机抽样的方法,对6128名≥18岁深圳市常住居民进行一般信息问卷调查、身体测量和超声心动图检查,获取心脏结构及功能相关信息。使用R 4.1.3软件进行基于复杂抽样设计的Rao-Scott χ^(2)检验、多因素二分类logistic回归和无序多分类logistic回归,并进行敏感性分析。结果加权后,深圳市成人B期心力衰竭患病率为14.45%(95%CI:12.88%~16.12%),心脏结构和功能均异常、仅结构异常和仅功能异常的患病率分别为1.33%(95%CI:0.92%~1.84%)、9.77%(95%CI:8.44%~11.23%)和3.35%(95%CI:2.80%~3.96%)。多因素分析结果显示,45~64岁(OR=1.51)、65岁及以上(OR=2.85)、离退休或无业或失业(OR=1.63)、超重(OR=2.11)、肥胖(OR=4.09)、高血压(OR=1.65)和其他心血管疾病(OR=4.27)与B期心力衰竭高风险相关,血脂异常(OR=0.77)与B期心力衰竭低风险相关,均有统计学意义(P<0.05)。结论深圳市B期心力衰竭普遍流行,应积极采取措施预防或延缓其进展为有症状性心力衰竭。
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关键词
B期心力衰竭
流行病学
患病率
原文传递
超重、肥胖与高血压对B期心力衰竭患病的交互作用分析
被引量:
1
3
作者
谢颖豪
吕德良
+9 位作者
彭轲
刘晓颖
曾倩
柯雪雯
周桂丽
钟新波
江勇
赵志广
吴成秋
李镒冲
《中国慢性病预防与控制》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期260-263,268,共5页
目的了解超重、肥胖与高血压的交互作用对B期心力衰竭患病风险的影响,为科学合理预防或延缓心力衰竭病情提供科学依据。方法数据来源于2021年深圳市心力衰竭流行病学调查,采用分层随机抽样的方法,对6080名≥18岁深圳市常住居民进行一般...
目的了解超重、肥胖与高血压的交互作用对B期心力衰竭患病风险的影响,为科学合理预防或延缓心力衰竭病情提供科学依据。方法数据来源于2021年深圳市心力衰竭流行病学调查,采用分层随机抽样的方法,对6080名≥18岁深圳市常住居民进行一般信息问卷调查、身体测量和超声心动图检查。采用R 4.2.1进行χ^(2)检验,用logistic模型分析超重、肥胖与高血压对B期心力衰竭患病的影响,用相乘与相加模型分析超重、肥胖与高血压的交互作用。计算相对超额危险度(RERI)、交互作用归因比(API)、交互作用指数(SI)。结果B期心衰患者940例(15.46%),高血压患者1650例(27.14%),超重患者1985例(32.65%),肥胖患者734例(12.07%)。多因素logistic回归分析模型调整混杂因素后结果显示,超重、肥胖与高血压不存在相乘交互作用(超重OR=1.36,95%CI:0.95~1.94,肥胖OR=1.37,95%CI:0.90~2.09)。超重、肥胖与高血压对B期心力衰竭的患病风险存在正向相加交互作用,超重与高血压的交互作用RERI、API和SI分别为0.98(95%CI:0.31~1.65)、0.33(95%CI:0.14~0.51)和1.97(95%CI:1.17~3.30),肥胖与高血压交互作用的RERI、API和SI分别为2.41(95%CI:0.66~4.16)、0.37(95%CI:0.17~0.58)和1.81(95%CI:1.19~2.74)。结论超重、肥胖与高血压可能存在相加交互作用,同时控制高血压与体质指数在正常水平可能会协同预防或延缓B期心力衰竭的发生。
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关键词
体质指数
高血压
心力衰竭
交互作用
原文传递
题名
基于转录组学探讨心力衰竭和认知障碍的共同分子特征
1
作者
曾倩
石瑀
彭轲
刘晓颖
张奎
柯雪雯
谢颖豪
奉水东
韩桂圆
李镒冲
机构
南华大学衡阳医学院公共卫生学院
中国医学科学院阜外医院深圳医院、国家心血管疾病临床医学研究中心·深圳
出处
《岭南心血管病杂志》
CAS
2024年第1期57-66,共10页
基金
广东省基础与应用基础研究基金项目(项目编号:2023A1515010076)
广东省基础与应用基础研究基金项目(2021A1515220173)
+1 种基金
深圳市医疗卫生三名工程(项目编号:SZSM201811096)
中国医学科学院阜外医院深圳医院院内青年英才培育基金(项目编号:YS-2022-006)。
文摘
目的 利用生物信息学技术探究心力衰竭(heart failure,HF)和认知障碍共同的生物学过程及基因特征,为后续分子机制研究提供思路。方法 从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)下载HF数据集GSE116250和认知障碍数据集GSE122063,鉴定出共同差异表达基因后,进行基因本体论(gene ontology,GO)富集分析,再应用String数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络筛选出中枢基因,在外部HF数据集GSE57338和认知障碍数据集GSE33000中验证中枢基因的表达,从JASPER和RegNetwork数据库中获得潜在的转录因子(transcription factor,TF)和微小RNA(micro RNA,miR)构建分子共调控网络。结果 共筛选出387个上调和388个下调差异基因(differential expressed genes,DEGs),主要富集在发育过程、细胞运动调节和主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)Ⅱ类蛋白复合物组装通路上。通过PPI网络鉴定出8个中枢基因(HLA-F、HLA-E、HLA-B、HLA-DRA、B2M、HLA-DQA1、HLADQB1、HSPA1A),主要通过内源性和外源性抗原加工和提呈通路激活免疫应答。在共调控网络中,FOXC1、GATA2、NFIC、NFYA、核转录因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)1、miR-10是调控中枢基因的关键TFs和miR,潜在的NF-κB1/HLA-E/miR-10调控轴被认为在HF与认知障碍发展中发挥着重要作用。结论 本研究结果表明免疫调节可能在HF患者发生认知障碍的过程中发挥重要作用,可为研究“心-脑轴交互作用”提供新见解,但仍需进一步的分子生物学验证及人群研究证据。
关键词
心力衰竭
认知障碍
中枢基因
分子共调控网络
生物信息学分析
Keywords
heart failure
cognitive impairment
hub gene
molecular co-regulatory network
bioinformatics analysis
分类号
R541.6 [医药卫生—心血管疾病]
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职称材料
题名
深圳市成人B期心力衰竭患病情况流行病学调查
2
作者
柯雪雯
吕德良
吴肖冰
刘晓颖
彭轲
谢凤珠
谢尉
谢雨欣
尚庆刚
闵芊玲
武小艳
符紫薇
温熙麟
曾倩
谢颖豪
奉水东
赵志广
李镒冲
机构
南华大学衡阳医学院公共卫生学院
中国医学科学院阜外医院深圳医院
深圳市慢性病防治中心心脑血管疾病与糖尿病防控科
汕头市中心医院医院感染管理科
出处
《中国慢性病预防与控制》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期343-348,352,共7页
基金
广东省引进创新创业团队项目(2019ZT08Y481)
广东省基础与应用基础研究基金项目(2021A1515110307)
深圳市医疗卫生三名工程(SZSM201811096)。
文摘
目的了解深圳市成人B期心力衰竭的流行病学特征及相关影响因素,为心力衰竭防控政策的制定提供参考依据。方法数据来源于2021年深圳市心力衰竭流行病学调查,采用多阶段分层随机抽样的方法,对6128名≥18岁深圳市常住居民进行一般信息问卷调查、身体测量和超声心动图检查,获取心脏结构及功能相关信息。使用R 4.1.3软件进行基于复杂抽样设计的Rao-Scott χ^(2)检验、多因素二分类logistic回归和无序多分类logistic回归,并进行敏感性分析。结果加权后,深圳市成人B期心力衰竭患病率为14.45%(95%CI:12.88%~16.12%),心脏结构和功能均异常、仅结构异常和仅功能异常的患病率分别为1.33%(95%CI:0.92%~1.84%)、9.77%(95%CI:8.44%~11.23%)和3.35%(95%CI:2.80%~3.96%)。多因素分析结果显示,45~64岁(OR=1.51)、65岁及以上(OR=2.85)、离退休或无业或失业(OR=1.63)、超重(OR=2.11)、肥胖(OR=4.09)、高血压(OR=1.65)和其他心血管疾病(OR=4.27)与B期心力衰竭高风险相关,血脂异常(OR=0.77)与B期心力衰竭低风险相关,均有统计学意义(P<0.05)。结论深圳市B期心力衰竭普遍流行,应积极采取措施预防或延缓其进展为有症状性心力衰竭。
关键词
B期心力衰竭
流行病学
患病率
Keywords
Stage B heart failure
Epidemiology
Prevalence
分类号
R541.6 [医药卫生—心血管疾病]
原文传递
题名
超重、肥胖与高血压对B期心力衰竭患病的交互作用分析
被引量:
1
3
作者
谢颖豪
吕德良
彭轲
刘晓颖
曾倩
柯雪雯
周桂丽
钟新波
江勇
赵志广
吴成秋
李镒冲
机构
南华大学衡阳医学院公共卫生学院
中国医学科学院阜外医院深圳医院
深圳市慢性病防治中心心脑血管疾病与糖尿病防控科
中国医学科学院阜外医院深圳医院超声科
出处
《中国慢性病预防与控制》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期260-263,268,共5页
基金
广东省引进创新创业团队项目(2019ZT08Y481)
广东省基础与应用基础研究基金项目(2021A1515110307)
+1 种基金
深圳市医疗卫生三名工程(SZSM201811096)
胡盛寿院士青年英才培育基金(YS-2020-006)。
文摘
目的了解超重、肥胖与高血压的交互作用对B期心力衰竭患病风险的影响,为科学合理预防或延缓心力衰竭病情提供科学依据。方法数据来源于2021年深圳市心力衰竭流行病学调查,采用分层随机抽样的方法,对6080名≥18岁深圳市常住居民进行一般信息问卷调查、身体测量和超声心动图检查。采用R 4.2.1进行χ^(2)检验,用logistic模型分析超重、肥胖与高血压对B期心力衰竭患病的影响,用相乘与相加模型分析超重、肥胖与高血压的交互作用。计算相对超额危险度(RERI)、交互作用归因比(API)、交互作用指数(SI)。结果B期心衰患者940例(15.46%),高血压患者1650例(27.14%),超重患者1985例(32.65%),肥胖患者734例(12.07%)。多因素logistic回归分析模型调整混杂因素后结果显示,超重、肥胖与高血压不存在相乘交互作用(超重OR=1.36,95%CI:0.95~1.94,肥胖OR=1.37,95%CI:0.90~2.09)。超重、肥胖与高血压对B期心力衰竭的患病风险存在正向相加交互作用,超重与高血压的交互作用RERI、API和SI分别为0.98(95%CI:0.31~1.65)、0.33(95%CI:0.14~0.51)和1.97(95%CI:1.17~3.30),肥胖与高血压交互作用的RERI、API和SI分别为2.41(95%CI:0.66~4.16)、0.37(95%CI:0.17~0.58)和1.81(95%CI:1.19~2.74)。结论超重、肥胖与高血压可能存在相加交互作用,同时控制高血压与体质指数在正常水平可能会协同预防或延缓B期心力衰竭的发生。
关键词
体质指数
高血压
心力衰竭
交互作用
Keywords
Body mass index
Hypertension
Heart failure
Interaction
分类号
R544.1 [医药卫生—心血管疾病]
R541.6 [医药卫生—心血管疾病]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于转录组学探讨心力衰竭和认知障碍的共同分子特征
曾倩
石瑀
彭轲
刘晓颖
张奎
柯雪雯
谢颖豪
奉水东
韩桂圆
李镒冲
《岭南心血管病杂志》
CAS
2024
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2
深圳市成人B期心力衰竭患病情况流行病学调查
柯雪雯
吕德良
吴肖冰
刘晓颖
彭轲
谢凤珠
谢尉
谢雨欣
尚庆刚
闵芊玲
武小艳
符紫薇
温熙麟
曾倩
谢颖豪
奉水东
赵志广
李镒冲
《中国慢性病预防与控制》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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3
超重、肥胖与高血压对B期心力衰竭患病的交互作用分析
谢颖豪
吕德良
彭轲
刘晓颖
曾倩
柯雪雯
周桂丽
钟新波
江勇
赵志广
吴成秋
李镒冲
《中国慢性病预防与控制》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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