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pBV220载体中外源基因表达水平定量分析 被引量:29
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作者 李伍举 吴加金 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1997年第2期126-133,共8页
运用基于螺旋区随机堆积的RNA二级结构预测与密码子偏性计算等序列分析技术,分析了pBV220载体中携带的人白细胞介素2、人白细胞介素4等22个外源基因的表达水平。结果表明:5′端-30~39区域和3′端30~-39区... 运用基于螺旋区随机堆积的RNA二级结构预测与密码子偏性计算等序列分析技术,分析了pBV220载体中携带的人白细胞介素2、人白细胞介素4等22个外源基因的表达水平。结果表明:5′端-30~39区域和3′端30~-39区域的二级结构自由能与表达水平具有显著的统计学意义;其次是3′端9bp的局部密码子偏性,SD序列与起始密码子ATG之间碱基数在8±3范围内与表达水平无显著关系。另外,运用判别分析方法构建了判别函数,判别符合率高达95.5%。 展开更多
关键词 基因载体 pBV220载体 表达水平 外源基因
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基于螺旋区随机堆积的RNA二级结构预测 被引量:15
2
作者 李伍举 吴加金 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 1996年第2期213-218,共6页
提出了基于螺旋区随机堆积的RNA二级结构预测算法,包括三个步骤:1.根据螺旋区定义,找出所有可能螺旋区;2进行螺旋区随机堆积,形成一定数目的RNA二级结构;3.统计处理,推测RNA可能折叠方式。最后以酵母Phe-tR... 提出了基于螺旋区随机堆积的RNA二级结构预测算法,包括三个步骤:1.根据螺旋区定义,找出所有可能螺旋区;2进行螺旋区随机堆积,形成一定数目的RNA二级结构;3.统计处理,推测RNA可能折叠方式。最后以酵母Phe-tRNA为例来说明方法的可行性。 展开更多
关键词 RNA 二级结构 随机堆积 螺旋区 预测
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RNA二级结构预测系统构建 被引量:12
3
作者 李伍举 吴加金 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1996年第5期449-453,共5页
运用下列RNA二级结构预测算法:碱基最大配对方法、Zuker极小化自由能方法、螺旋区最优堆积、螺旋区随机堆积和所有可能组合方法与基于一级螺旋区的RNA二级结构绘图技术,构建了RNA二级结构预测系统Rnafold.另外... 运用下列RNA二级结构预测算法:碱基最大配对方法、Zuker极小化自由能方法、螺旋区最优堆积、螺旋区随机堆积和所有可能组合方法与基于一级螺旋区的RNA二级结构绘图技术,构建了RNA二级结构预测系统Rnafold.另外,通过随机选取20个tRNA序列,从自由能和三叶草结构两个方面比较了前4种二级结构预测算法,并运用t检验方法分析了自由能的统计学差别.从三叶草结构来看,以随机堆积方法最好,其次是螺旋区最优堆积方法和Zuker算法,以碱基最大配对方法最差.最后,分析了两种极小化自由能方法之间的差别. 展开更多
关键词 RNA 二级结构 预测
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蛋白质功能位点预测 被引量:4
4
作者 李伍举 吴加金 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1993年第1期60-62,共3页
在 IBM-PC 机上开发了蛋白质功能位点预测软件:PROSITE.根据 EMBL发布于激光光盘上的蛋白质功能位点氨基酸片段的保守模式数据库,对给定的蛋白质序列,可按19类443个氨基酸保守模式来探测蛋白质的所属家族,各种功能区的位置和活性部位等... 在 IBM-PC 机上开发了蛋白质功能位点预测软件:PROSITE.根据 EMBL发布于激光光盘上的蛋白质功能位点氨基酸片段的保守模式数据库,对给定的蛋白质序列,可按19类443个氨基酸保守模式来探测蛋白质的所属家族,各种功能区的位置和活性部位等性质,通过52个序列的验证结果和 SWWISS 蛋白质数据库相一致.此外该软件还具有操作灵活,多种输入输出方式等特点。 展开更多
关键词 蛋白 功能位点 预测 计算机
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pBV220载体中外源基因二级结构与表达水平关系 被引量:3
5
作者 李伍举 吴加金 《生物技术通讯》 CAS 1996年第4期149-151,共3页
运用极小化自由能RNA二级结构预测方法分析了pBV220载体中以表达水平20%作为分类标准的人白细胞介素2、人白细胞介素4等32个外源基因表达水平,结果表明5′端32~41区域和3′端25~46区域的二级结构自由能与表达水平具有显著的统计学意... 运用极小化自由能RNA二级结构预测方法分析了pBV220载体中以表达水平20%作为分类标准的人白细胞介素2、人白细胞介素4等32个外源基因表达水平,结果表明5′端32~41区域和3′端25~46区域的二级结构自由能与表达水平具有显著的统计学意义,并运用Bays判别分析方法构建了判别函数,判别符合率为87.5%。 展开更多
关键词 pBV220载体 表达水平 RNA二级结构 判别分析
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基于碱基分布矩阵的序列比较
6
作者 李伍举 吴加金 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 1994年第1期144-148,共5页
提出了基于碱基分布矩阵的全局性序列比较算法,利用此算法编程时所需的常驻内存仅为一个碱基分布矩阵和一个序列,因此序列个数和长度均有较大增加,可以实现200个长度为5Kbp的核酸序列比较,此外,还论述了在PCR模板选择中... 提出了基于碱基分布矩阵的全局性序列比较算法,利用此算法编程时所需的常驻内存仅为一个碱基分布矩阵和一个序列,因此序列个数和长度均有较大增加,可以实现200个长度为5Kbp的核酸序列比较,此外,还论述了在PCR模板选择中的应用。 展开更多
关键词 碱基分布矩阵 序列比较 理论生物物理
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计算机辅助设计使重组ricin-A链在E.coli中的高效表达 被引量:8
7
作者 裴武红 沈倍奋 +3 位作者 李伍举 胡美茹 黎燕 贺永怀 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 1998年第1期33-36,共4页
基于对螺旋区随机堆积的RNA二级结构的预测和密码子偏性计算,建立了pBV220载体中外源基因高效表达的判别模型。该模型认为,外源基因的表达水平,与其5′端3039区域,以及3′端3039区域的二级结构自由能具有显... 基于对螺旋区随机堆积的RNA二级结构的预测和密码子偏性计算,建立了pBV220载体中外源基因高效表达的判别模型。该模型认为,外源基因的表达水平,与其5′端3039区域,以及3′端3039区域的二级结构自由能具有显著的统计学意义;其次与3′端9bp的局部密码子偏性相关。据此模型,我们设计了用于克隆表达ricinA链的引物。将PCR扩增的基因克隆入pBV220载体中,在DH5α宿主中获得了高效表达(表达水平在20%以上),而且在pExSecI载体系统中亦获得了高效表达。 展开更多
关键词 重组ricin-A链 RNA 二级结构 CAD
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microRNA计算发现方法的研究进展 被引量:13
8
作者 侯妍妍 应晓敏 李伍举 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期687-696,共10页
microRNA(miRNA)是近几年发现的一类长度为~21nt的内源非编码小RNA,在植物和动物中发挥着重要而广泛的调控功能。它的发现主要有cDNA克隆测序和计算发现两条途径。由于cDNA克隆测序方法受miRNA表达的时间和组织特异性以及表达水平的影... microRNA(miRNA)是近几年发现的一类长度为~21nt的内源非编码小RNA,在植物和动物中发挥着重要而广泛的调控功能。它的发现主要有cDNA克隆测序和计算发现两条途径。由于cDNA克隆测序方法受miRNA表达的时间和组织特异性以及表达水平的影响,而计算发现可以弥补其不足,因此miRNA的计算发现方法研究受到了广泛的重视。文章对近几年计算发现miRNA的研究进展进行了综述,根据计算发现方法的本质,将计算发现方法归纳为5类,分别是同源片段搜索方法、基于比较基因组学的预测方法、基于序列和结构特征打分的预测方法、结合作用靶标的预测方法和基于机器学习的预测方法,并对各类方法的原理、核心思想、优点和局限性进行了分析,最后探讨了进一步的发展方向。 展开更多
关键词 MICRORNA 计算发现 同源搜索 比较基因组学 作用靶标 机器学习
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细菌sRNA基因及其靶标预测研究进展 被引量:8
9
作者 王立贵 赵雅琳 李伍举 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期1-5,共5页
细菌sRNA是一类长度在40-500 nt之间的非编码RNA,主要以不完全碱基配对方式与靶标mRNA5′端相互作用进而发挥其生物学功能。鉴于预测方法可以为细菌sRNA及其靶标的实验发现提供指导,因此,细菌sRNA与靶标预测研究受到了广泛重视。文... 细菌sRNA是一类长度在40-500 nt之间的非编码RNA,主要以不完全碱基配对方式与靶标mRNA5′端相互作用进而发挥其生物学功能。鉴于预测方法可以为细菌sRNA及其靶标的实验发现提供指导,因此,细菌sRNA与靶标预测研究受到了广泛重视。文章首先将sRNA预测方法分为3类,分别是基于比较基因组学的预测方法、基于转录单元的预测方法和基于机器学习的预测方法;其次,将sRNA靶标预测方法分为2类,分别是序列比较方法与基于RNA二级结构的预测方法;最后对各类方法的原理、核心思想、优点和局限性进行了分析,并探讨了进一步的发展方向。 展开更多
关键词 SRNA 预测 靶标 细菌
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核酸和蛋白质序列分析的软件系统——GOLDKEY 被引量:12
10
作者 吴加金 李伍举 +1 位作者 雷红星 孙涛 《生物技术通讯》 CAS 1994年第4期189-193,共5页
近年来基因工程和蛋白质工程取得巨大进展,但核酸和蛋白质实验费用昂贵,分析工作繁杂,难于考虑周全。提供一套快速、严格而又尽可能全面地分析实验可行性并对实验结果作初步预测的软件,将大大提高实验在最有利条件下取得成功的可能性。... 近年来基因工程和蛋白质工程取得巨大进展,但核酸和蛋白质实验费用昂贵,分析工作繁杂,难于考虑周全。提供一套快速、严格而又尽可能全面地分析实验可行性并对实验结果作初步预测的软件,将大大提高实验在最有利条件下取得成功的可能性。因此,从基因工程技术诞生起,相应的计算机软件和数学方法也随之产生。随着基因工程技术的深入发展。 展开更多
关键词 软件系统 GOLDKEY 蛋白质序列 计算机软件 序列图 蛋白质工程 功能模块 基因工程技术 实验费用 数学方法
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RT-LAMP检测甲型H1N1病毒核酸几种结果判定方法 被引量:6
11
作者 付文亮 蔡欣 +6 位作者 查磊 高杰 洪明 邹民吉 李伍举 徐东刚 吴奎武 《医学研究杂志》 2010年第5期68-70,共3页
目的比较RT-LAMP检测甲型H1N1流感病毒核酸几种不同的结果判定方法的差异,优化检测方法。方法利用已知的阳性病毒样本,对比电泳、直接观察、加入SYBR GREENⅠ核酸染料和优化后的预染核酸染料和的检测灵敏度。结果电泳检测的灵敏度最高,... 目的比较RT-LAMP检测甲型H1N1流感病毒核酸几种不同的结果判定方法的差异,优化检测方法。方法利用已知的阳性病毒样本,对比电泳、直接观察、加入SYBR GREENⅠ核酸染料和优化后的预染核酸染料和的检测灵敏度。结果电泳检测的灵敏度最高,加入SYBR GREENⅠ染料的灵敏度略低,而直接的肉眼观察灵敏度低约2个数量级。加入优化后的预染染料其检测灵敏度与加入SYBR GREENⅠ核酸染料相当。结论电泳法检测的灵敏度最高,可通过加入优化后的预染染料提高目测判定反应结果的灵敏度,增强反应的特异性,并可降低气溶胶污染。 展开更多
关键词 甲型H1N1流感病毒 RT—LAMP 结果判定
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食管癌相关功能未知基因的电子克隆延伸与ncRNA的发现 被引量:3
12
作者 吴炳礼 许丽艳 +3 位作者 应晓敏 牛永东 李伍举 李恩民 《癌变.畸变.突变》 CAS CSCD 2008年第2期85-88,共4页
背景与目的:运用电子克隆等生物信息学方法研究筛查出的48个与食管癌相关功能未知的DNA序列片段,为食管癌相关研究提供指导。材料与方法:以48个DNA序列片段为核心,运用BioEdit建立本地数据库;通过电子克隆的方法对48个DNA序列中功能未... 背景与目的:运用电子克隆等生物信息学方法研究筛查出的48个与食管癌相关功能未知的DNA序列片段,为食管癌相关研究提供指导。材料与方法:以48个DNA序列片段为核心,运用BioEdit建立本地数据库;通过电子克隆的方法对48个DNA序列中功能未知的基因片段进行序列延伸;通过BLAST同源分析搜索48个基因的内含子以及上下游基因间隔区中存在的非编码RNA(noncodingRNA,ncRNA)。结果:48个DNA序列中功能未知的基因片段通过电子克隆的方法平均能够延伸190bp以上;在48个基因的内含子以及上下游基因间隔区存在着与已知ncRNA相似性很高的片段。结论:运用电子克隆的方法可以使某些食管癌相关功能未知基因的序列得以明显延伸;一些食管癌相关基因所在的染色体区段存在着某些与ncRNA高度相似的片段,这提示我们,ncRNA可能参与食管癌的发生过程,其具体功能有待深入研究。 展开更多
关键词 生物信息学 序列分析 非编码RNA 电子克隆
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拟南芥基因组中新的microRNA预测及分析 被引量:2
13
作者 金伟波 孔栋 +2 位作者 应晓敏 郭蔼光 李伍举 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期389-396,共8页
MicroRNA(miRNA)是一类存在于动植物体内、长度为21 ̄25nt的内源性小RNA,对生物体的转录后基因调控起着关键作用,但一些低丰度的miRNA和组织特异性miRNA往往很难发现。为了系统识别拟南芥基因组中新的非同源miRNA,首先基于已报道的拟南... MicroRNA(miRNA)是一类存在于动植物体内、长度为21 ̄25nt的内源性小RNA,对生物体的转录后基因调控起着关键作用,但一些低丰度的miRNA和组织特异性miRNA往往很难发现。为了系统识别拟南芥基因组中新的非同源miRNA,首先基于已报道的拟南芥miRNA的特征,从全基因组范围中筛选出453条可能的miRNA前体;其次,为了进一步对上述miRNA前体进行筛选,利用人的miRNA前体数据构建了支持向量机模型GenomicSVM,该模型对人测试集的敏感性和特异性分别为86.3%和98.1%(30个人miRNA前体和1000个阴性miRNA前体),对拟南芥测试集的正确率为93.6%(78个miRNA前体);最后,利用GenomicSVM预测上述453条miRNA前体序列,得到了37条候选的新的拟南芥miRNA前体,为进一步的miRNA实验发现研究提供了指导。 展开更多
关键词 拟南芥 基因组 MICRORNA 预测
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pBV220载体中外源基因高效表达的自动化设计 被引量:2
14
作者 查磊 应晓敏 +4 位作者 王立贵 曹源 骆志刚 苑波 李伍举 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期379-382,共4页
pBV220载体是国内科学家构建的原核系统表达载体,目前仍在广泛应用.但是,实现外源基因的高效表达需要综合考虑诸如RNA二级结构等多种因素,极其耗时费力.为此,基于我们提出的pBV220载体中外源基因高效表达数学模型,编写了外源基因高效表... pBV220载体是国内科学家构建的原核系统表达载体,目前仍在广泛应用.但是,实现外源基因的高效表达需要综合考虑诸如RNA二级结构等多种因素,极其耗时费力.为此,基于我们提出的pBV220载体中外源基因高效表达数学模型,编写了外源基因高效表达的自动化设计软件,并可定性用于原核系统其它载体中外源基因表达水平分析,最终为加快实验进程提供帮助. 展开更多
关键词 PBV220 高效表达 自动化设计
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人NMDA受体主亚基M3-M4环基因片段的高效表达、纯化与鉴定 被引量:1
15
作者 张玉梅 孙长凯 +5 位作者 范明 李伍举 刘淑红 赵杰 韩大跃 王嘉玺 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期588-593,共6页
用基因工程方法获得人N 甲基 D 天冬氨酸 (N methyl D aspartate ,NMDA)受体主亚基M3 M4环靶片段 ,以此为免疫原 ,用于进一步免疫原性及相关应用研究 .自人脑胶质瘤组织中提取总RNA ,采用RT PCR扩增出人NMDA受体主亚基M3 M4环的基因片... 用基因工程方法获得人N 甲基 D 天冬氨酸 (N methyl D aspartate ,NMDA)受体主亚基M3 M4环靶片段 ,以此为免疫原 ,用于进一步免疫原性及相关应用研究 .自人脑胶质瘤组织中提取总RNA ,采用RT PCR扩增出人NMDA受体主亚基M3 M4环的基因片段 ,并按照计算机辅助原核表达载体pBV2 2 0中外源基因高效表达的数学模型预测方法 ,将其进行优化改构 .将目的基因克隆到pBV2 2 0中 ,转化大肠杆菌DH5α ,升温诱导表达 ,从蛋白质水平检测重组体在大肠杆菌中的表达情况 ,通过制备性SDS PAGE进行纯化 ,从相对分子质量、免疫反应性、肽质谱指纹分析等方面进行鉴定 .结果表明 ,成功构建了人NMDA受体主亚基M3 M4环的原核表达载体 (命名为pBV NR1L3) ,通过基因优化 ,实现了高效表达 .凝胶扫描分析表达量约占菌体总蛋白 2 9% ,重组肽纯度达 95 展开更多
关键词 受体 亚基 M3—M4环基因 纯化 鉴定 原核表达 N—甲基—D—天冬氨酸
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口蹄疫病毒分型诊断芯片探针设计初报 被引量:3
16
作者 相磊 陈小玲 +6 位作者 李伍举 梁之昶 章振华 王学文 胡国良 徐福洲 石岗 《动物医学进展》 CSCD 2008年第2期1-5,共5页
为建立口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)不同血清型与基因型的基因芯片检测方法,设计针对O型8个基因型、A型3个基因型和亚洲1型的特异性探针。从美国GenBank与英国世界口蹄疫参考实验室基因库下载了O型、A型和亚洲1型FMDV... 为建立口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)不同血清型与基因型的基因芯片检测方法,设计针对O型8个基因型、A型3个基因型和亚洲1型的特异性探针。从美国GenBank与英国世界口蹄疫参考实验室基因库下载了O型、A型和亚洲1型FMDV的VP1基因序列547条。对每一血清型序列用DNA Star软件ClastalW程序进行多重比对,做系统发育分析并进行基因分型。用生物学软件BioSun 2.0建立基因型数据库,设计每一基因型的特异性探针。共设计出104条候选探针,通过芯片试验筛选出12条特异性探针。以各型特异性探针所对应的靶序列模板做10倍系列稀释进行PCR扩增,扩增产物与探针杂交,验证各探针的灵敏度。对O型SEA、Euro-SA、ME-SA、WA 4个基因型的各条探针的灵敏度进行了检验,结果这些探针能够检测到102数量级拷贝数的阳性靶标。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 血清型 基因型 VP1基因 基因芯片 寡核苷酸探针
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反义寡核苷酸联用对肺腺癌A549细胞增殖的抑制作用 被引量:1
17
作者 杨英 李伍举 +1 位作者 丁雨 王升启 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第8期694-696,共3页
目的 研究多基因靶向的反义寡核苷酸联用对肺腺癌细胞A5 4 9增殖的抑制作用 ,建立初步筛选、分析组合靶点的实验方法及统计学方法。方法 选择以端粒酶、PKC α、Bcl 2和IGF 1R为靶点的 4种反义寡核苷酸 ,进行两药组合。以脂质体介导... 目的 研究多基因靶向的反义寡核苷酸联用对肺腺癌细胞A5 4 9增殖的抑制作用 ,建立初步筛选、分析组合靶点的实验方法及统计学方法。方法 选择以端粒酶、PKC α、Bcl 2和IGF 1R为靶点的 4种反义寡核苷酸 ,进行两药组合。以脂质体介导进行反义寡核苷酸转染 ,用MTT法染色并计算细胞生长抑制率 ,用SAS统计软件及金正均Q值法进行数据分析。结果 联合用药对A5 4 9细胞增殖的抑制作用显著高于单药 (P <0 0 5 ) ,并筛选出有协同作用的药物组合 (Q≥ 1 15 )。结论 反义寡核苷酸联合用药可以靶向多个与肿瘤发生发展密切相关的基因 ,提高对肿瘤细胞增殖的抑制效果。 展开更多
关键词 反义寡核苷酸 端粒酶 PKG-α Bcl-2 IGF-1R 联合用药 A549
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单克隆抗体免疫交叉反应现象及其原因探讨 被引量:3
18
作者 王洪海 张遵一 +2 位作者 刘成贵 吴加金 李伍举 《单克隆抗体通讯》 CSCD 1992年第1期49-53,共5页
本文应用免疫双扩散及免疫印染技术证实了组蛋白与抗人FN和抗人CRP单抗之间发生的免疫交叉反应。借助于电子计算机帮助,分析了交叉反应的分子基础,发现组蛋白和FN之间具有5个氨基酸序列同源区域,同源区域与Pollard 1990年所预测的组蛋... 本文应用免疫双扩散及免疫印染技术证实了组蛋白与抗人FN和抗人CRP单抗之间发生的免疫交叉反应。借助于电子计算机帮助,分析了交叉反应的分子基础,发现组蛋白和FN之间具有5个氨基酸序列同源区域,同源区域与Pollard 1990年所预测的组蛋白抗原决定簇相一致。文章同时讨论了单抗与不相关抗原发生交叉反应的原因,包括分子模拟。构型表位,电荷空间分布及中间介质诱导等因素。 展开更多
关键词 FN 组蛋白 交叉反应 单克隆抗体
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低氧对人骨髓间充质干细胞基因表达谱的影响 被引量:1
19
作者 吴恩惠 李海生 +6 位作者 赵彤 樊俊蝶 马鑫 熊雷 李伍举 朱玲玲 范明 《生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期227-232,共6页
低氧可以促进人骨髓间充质干细胞(human bone marrow-derived mesenchymal stem cells,hMSCs)增殖。为探讨其可能机制,本实验采用cDNA芯片技术动态检测低氧促进hMSCs增殖过程中基因表达的变化,用RT-PCR验证芯片结果。结果显示,在含21 32... 低氧可以促进人骨髓间充质干细胞(human bone marrow-derived mesenchymal stem cells,hMSCs)增殖。为探讨其可能机制,本实验采用cDNA芯片技术动态检测低氧促进hMSCs增殖过程中基因表达的变化,用RT-PCR验证芯片结果。结果显示,在含21 329条基因探针的芯片上,检测到282个基因差异表达,其中代谢类基因最多;差异表达基因的数目随低氧时间不同而变化,其中24 h时差异表达基因的数目最多。差异表达基因中4个为已知的低氧诱导因子-1(hypoxia- inducible factor 1,HIF-1)靶基因,在低氧处理36 h时都基本上调。此外,差异表达基因中有10个连续变化的基因,这些基因中既有上调基因也有下调基因。4个HIF-1靶基因和连续变化的基因的RT1-PCR结果大部分与cDNA芯片结果一致。结果提示,低氧促进hMSCs增殖是多基因参与的过程,可能与HIF-1及其下游信号通路有关。 展开更多
关键词 低氧 人骨髓间充质干细胞 CDNA芯片 差异表达基因
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影响外源基因在原核中表达水平因素分析 被引量:2
20
作者 吴加金 李伍举 王嘉玺 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 1996年第S1期97-101,共5页
为了预测外源基因在E.coli中的表达水平,我们分析外源基因在固定载体pBV220中表达水平的实验数据,结合有关参考资料,提出预测外源基因表达水平的一组判据:在AUG附近的RNA二级结构能量,AUG附近的密码子自适应... 为了预测外源基因在E.coli中的表达水平,我们分析外源基因在固定载体pBV220中表达水平的实验数据,结合有关参考资料,提出预测外源基因表达水平的一组判据:在AUG附近的RNA二级结构能量,AUG附近的密码子自适应指数,RBS和AUG距离及AUG附近的构象。 展开更多
关键词 基因表达 二级结构 计算机
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