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石榴种皮木质素合成相关转录因子基因PgMYB的克隆与表达
被引量:
11
1
作者
曹丹琴
杨健
+3 位作者
关晓弯
张永娟
龚凌燕
张水明
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期23-29,共7页
为初步探讨石榴(Punica granatum L.)籽粒硬度产生机理及转录因子基因PgMYB在石榴种皮木质素生物合成途径中的作用,测定了不同石榴品种籽粒硬度及种皮总木质素含量并分析两者关系,利用RT-PCR结合RACE技术,克隆了‘红玉石籽’石榴的1个MY...
为初步探讨石榴(Punica granatum L.)籽粒硬度产生机理及转录因子基因PgMYB在石榴种皮木质素生物合成途径中的作用,测定了不同石榴品种籽粒硬度及种皮总木质素含量并分析两者关系,利用RT-PCR结合RACE技术,克隆了‘红玉石籽’石榴的1个MYB转录因子基因(PgMYB),通过实时荧光定量PCR技术分析了PgMYB的相对表达量。结果表明:(1)石榴籽粒硬度与种皮总木质素含量呈显著正相关关系,相关系数为0.906。(2)PgMYB基因cDNA全长1 088bp,开放阅读框921bp,编码蛋白由306个氨基酸组成,N端具有2个MYB DNA结合结构域,是植物中一个典型的R2R3-MYB转录因子;同源分析显示,该基因编码的氨基酸序列与银合欢的MYB1和拟南芥的MYB4一致性分别高达89%和84%。(3)在不同籽粒硬度石榴品种中PgMYB的表达与籽粒硬度和种皮总木质素含量呈负相关关系。(4)在石榴各个发育时期中,PgMYB表达与种皮总木质素含量同样呈负相关关系。推测该基因可能抑制石榴种皮总木质素的生物合成。
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关键词
石榴
籽粒硬度
种皮
总木质素
PgMYB基因
表达分析
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职称材料
石榴种皮总木质素含量及PgCOMT基因的克隆与表达
被引量:
16
2
作者
张水明
龚凌燕
+2 位作者
曹丹琴
张永娟
杨健
《热带亚热带植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期65-73,共9页
为探讨石榴(Punica granatum L.)籽粒硬度与种皮总木质素含量的相关性及种皮COMT基因的表达方式,利用Texture Analyser质构仪和巯基乙酸法测定6个品种的成熟籽粒硬度及种皮总木质素含量。结果表明,6个石榴品种的籽粒硬度与种皮总木质素...
为探讨石榴(Punica granatum L.)籽粒硬度与种皮总木质素含量的相关性及种皮COMT基因的表达方式,利用Texture Analyser质构仪和巯基乙酸法测定6个品种的成熟籽粒硬度及种皮总木质素含量。结果表明,6个石榴品种的籽粒硬度与种皮总木质素含量呈正相关,相关系数为0.9246。采用RACE技术从石榴种皮中克隆得到1条长度为1456 bp的Pg COMT基因c DNA序列(Gen Bank登录号为KJ713968)。实时荧光定量PCR分析表明,Pg COMT在‘红玉石籽’、‘粉皮’、‘会理软籽’、‘蒙自甜’和‘突尼斯软籽’石榴种皮中的相对表达量与石榴籽粒硬度较为一致;随着石榴种皮的发育其表达量先下降后上升。这为深入了解石榴软籽性状的产生机理奠定了基础。
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关键词
石榴
籽粒硬度
木质素
COMT基因
基因表达
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职称材料
一种适用于RT-PCR的石榴籽粒总RNA提取方法
被引量:
1
3
作者
黄有凯
曹丹琴
+2 位作者
彭媛媛
龚凌燕
张水明
《生物学杂志》
CAS
CSCD
2013年第4期90-92,共3页
为从石榴籽粒中提取高质量的RNA,以便进行后续分子生物学研究,针对石榴籽粒富含次生代谢物的特点,采用CTAB法并进行了改良,利用氯仿/异戊醇替代其他方法中的"异硫氰酸胍"和"Trizol试剂"进行反复抽提去除蛋白,无水...
为从石榴籽粒中提取高质量的RNA,以便进行后续分子生物学研究,针对石榴籽粒富含次生代谢物的特点,采用CTAB法并进行了改良,利用氯仿/异戊醇替代其他方法中的"异硫氰酸胍"和"Trizol试剂"进行反复抽提去除蛋白,无水乙醇去除多糖,LiCl消化DNA。结果显示:改良CTAB法提取的石榴籽粒总RNA的28S rRNA、18SrRNA条带清晰,完整性较好;OD260 nm/OD280 nm比值为1.9960,纯度较高。在此基础上通过反转录、PCR扩增出符合预期大小的Actin基因片段,表明该方法提取的RNA可满足后续RT-PCR等分子生物学试验研究。
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关键词
石榴籽粒
总RNA
改良CTAB法
RT-PCR
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职称材料
石榴PgGPX基因克隆及盐胁迫下的表达分析
被引量:
3
4
作者
彭媛媛
龚凌燕
+3 位作者
曹丹琴
杨健
朱立武
张水明
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第9期1735-1741,共7页
该研究以‘红玉石籽’籽粒为材料,通过RACE技术克隆了石榴GPX基因,利用Real-time PCR检测石榴在不同器官中及石榴叶片在盐胁迫处理下的相对表达量。结果表明:(1)PgGPX基因cDNA全长872bp,其中开放阅读框504bp,编码168个氨基酸。生物信息...
该研究以‘红玉石籽’籽粒为材料,通过RACE技术克隆了石榴GPX基因,利用Real-time PCR检测石榴在不同器官中及石榴叶片在盐胁迫处理下的相对表达量。结果表明:(1)PgGPX基因cDNA全长872bp,其中开放阅读框504bp,编码168个氨基酸。生物信息学分析显示,该蛋白具有植物GPX的典型结构,与可可树、荔枝、甜橙、玉米等植物的GPX基因相比,具有较高的一致性,分别为90.30%、87.40%、86.80%、86.20%。(2)PgGPX在石榴的叶片、花瓣和籽粒中均有所表达,且具有组织特异性,在盐胁迫下,石榴叶片中的PgGPX表达量显著上升。推测PgGPX基因在胁迫反应中可能发挥重要作用。
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关键词
石榴
GPX基因
RACE
REAL-TIME
PCR
盐胁迫
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职称材料
题名
石榴种皮木质素合成相关转录因子基因PgMYB的克隆与表达
被引量:
11
1
作者
曹丹琴
杨健
关晓弯
张永娟
龚凌燕
张水明
机构
安徽农业大学园艺学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期23-29,共7页
基金
国家自然科学基金(30900971)
文摘
为初步探讨石榴(Punica granatum L.)籽粒硬度产生机理及转录因子基因PgMYB在石榴种皮木质素生物合成途径中的作用,测定了不同石榴品种籽粒硬度及种皮总木质素含量并分析两者关系,利用RT-PCR结合RACE技术,克隆了‘红玉石籽’石榴的1个MYB转录因子基因(PgMYB),通过实时荧光定量PCR技术分析了PgMYB的相对表达量。结果表明:(1)石榴籽粒硬度与种皮总木质素含量呈显著正相关关系,相关系数为0.906。(2)PgMYB基因cDNA全长1 088bp,开放阅读框921bp,编码蛋白由306个氨基酸组成,N端具有2个MYB DNA结合结构域,是植物中一个典型的R2R3-MYB转录因子;同源分析显示,该基因编码的氨基酸序列与银合欢的MYB1和拟南芥的MYB4一致性分别高达89%和84%。(3)在不同籽粒硬度石榴品种中PgMYB的表达与籽粒硬度和种皮总木质素含量呈负相关关系。(4)在石榴各个发育时期中,PgMYB表达与种皮总木质素含量同样呈负相关关系。推测该基因可能抑制石榴种皮总木质素的生物合成。
关键词
石榴
籽粒硬度
种皮
总木质素
PgMYB基因
表达分析
Keywords
pomegranate
seed hardness
seed coat
lignin
PgMYB gene
expression analysis
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
石榴种皮总木质素含量及PgCOMT基因的克隆与表达
被引量:
16
2
作者
张水明
龚凌燕
曹丹琴
张永娟
杨健
机构
安徽农业大学园艺学院
出处
《热带亚热带植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第1期65-73,共9页
基金
国家自然科学基金项目(30900971)资助
文摘
为探讨石榴(Punica granatum L.)籽粒硬度与种皮总木质素含量的相关性及种皮COMT基因的表达方式,利用Texture Analyser质构仪和巯基乙酸法测定6个品种的成熟籽粒硬度及种皮总木质素含量。结果表明,6个石榴品种的籽粒硬度与种皮总木质素含量呈正相关,相关系数为0.9246。采用RACE技术从石榴种皮中克隆得到1条长度为1456 bp的Pg COMT基因c DNA序列(Gen Bank登录号为KJ713968)。实时荧光定量PCR分析表明,Pg COMT在‘红玉石籽’、‘粉皮’、‘会理软籽’、‘蒙自甜’和‘突尼斯软籽’石榴种皮中的相对表达量与石榴籽粒硬度较为一致;随着石榴种皮的发育其表达量先下降后上升。这为深入了解石榴软籽性状的产生机理奠定了基础。
关键词
石榴
籽粒硬度
木质素
COMT基因
基因表达
Keywords
Pomegranate
Seed hardness
Lignin
COMT
Gene expression
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
一种适用于RT-PCR的石榴籽粒总RNA提取方法
被引量:
1
3
作者
黄有凯
曹丹琴
彭媛媛
龚凌燕
张水明
机构
安徽农业大学园艺学院
合肥一中
出处
《生物学杂志》
CAS
CSCD
2013年第4期90-92,共3页
基金
国家自然科学基金项目(30900971)
文摘
为从石榴籽粒中提取高质量的RNA,以便进行后续分子生物学研究,针对石榴籽粒富含次生代谢物的特点,采用CTAB法并进行了改良,利用氯仿/异戊醇替代其他方法中的"异硫氰酸胍"和"Trizol试剂"进行反复抽提去除蛋白,无水乙醇去除多糖,LiCl消化DNA。结果显示:改良CTAB法提取的石榴籽粒总RNA的28S rRNA、18SrRNA条带清晰,完整性较好;OD260 nm/OD280 nm比值为1.9960,纯度较高。在此基础上通过反转录、PCR扩增出符合预期大小的Actin基因片段,表明该方法提取的RNA可满足后续RT-PCR等分子生物学试验研究。
关键词
石榴籽粒
总RNA
改良CTAB法
RT-PCR
Keywords
seeds of pomegranate
total RNA
improved CTAB method
RT-PCR
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
在线阅读
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职称材料
题名
石榴PgGPX基因克隆及盐胁迫下的表达分析
被引量:
3
4
作者
彭媛媛
龚凌燕
曹丹琴
杨健
朱立武
张水明
机构
安徽农业大学园艺学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第9期1735-1741,共7页
基金
国家自然科学基金(30900971)
文摘
该研究以‘红玉石籽’籽粒为材料,通过RACE技术克隆了石榴GPX基因,利用Real-time PCR检测石榴在不同器官中及石榴叶片在盐胁迫处理下的相对表达量。结果表明:(1)PgGPX基因cDNA全长872bp,其中开放阅读框504bp,编码168个氨基酸。生物信息学分析显示,该蛋白具有植物GPX的典型结构,与可可树、荔枝、甜橙、玉米等植物的GPX基因相比,具有较高的一致性,分别为90.30%、87.40%、86.80%、86.20%。(2)PgGPX在石榴的叶片、花瓣和籽粒中均有所表达,且具有组织特异性,在盐胁迫下,石榴叶片中的PgGPX表达量显著上升。推测PgGPX基因在胁迫反应中可能发挥重要作用。
关键词
石榴
GPX基因
RACE
REAL-TIME
PCR
盐胁迫
Keywords
pomegranate
glutathione peroxidase gene
RACE
real-time PCR
salt stress
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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1
石榴种皮木质素合成相关转录因子基因PgMYB的克隆与表达
曹丹琴
杨健
关晓弯
张永娟
龚凌燕
张水明
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
11
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职称材料
2
石榴种皮总木质素含量及PgCOMT基因的克隆与表达
张水明
龚凌燕
曹丹琴
张永娟
杨健
《热带亚热带植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
16
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职称材料
3
一种适用于RT-PCR的石榴籽粒总RNA提取方法
黄有凯
曹丹琴
彭媛媛
龚凌燕
张水明
《生物学杂志》
CAS
CSCD
2013
1
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职称材料
4
石榴PgGPX基因克隆及盐胁迫下的表达分析
彭媛媛
龚凌燕
曹丹琴
杨健
朱立武
张水明
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
3
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