基于UPLC-MS/MS技术的线纹香茶菜白花型与紫花型种质代谢物的比较分析

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作者 邱道寿 罗永坚 +1 位作者 徐友阳 张慧晔 《广东农业科学》 CAS 2024年第5期16-29,共14页

【目的】溪黄草是一种我国民间习用传统中草药,其基源植物有3~4种。现有的鉴别和考证研究认为线纹香茶菜是“溪黄草”的正品之一。广泛栽培的线纹香茶菜多为紫花型,利用代谢组学技术对获得的白花型种质与常规紫花型种质的代谢产物开展... 【目的】溪黄草是一种我国民间习用传统中草药,其基源植物有3~4种。现有的鉴别和考证研究认为线纹香茶菜是“溪黄草”的正品之一。广泛栽培的线纹香茶菜多为紫花型,利用代谢组学技术对获得的白花型种质与常规紫花型种质的代谢产物开展比较研究,可为正品“溪黄草”种质创制、新品种选育提供依据。【方法】采用UPLC-MS/MS技术,以广泛栽培的紫花型线纹香茶菜种质为对照,比较白花型与紫花型线纹香茶菜间的差异代谢物,并进行差异代谢物富集通路分析。【结果】从两份种质检测到的868种代谢物中筛选到125种差异代谢物,其中,有67种在白花型种质中显著上调、58种表现下调。两种质的差异代谢物主要包括黄酮类、有机酸、氨基酸及其衍生物、酚酸类、生物碱、游离脂肪酸等,其中黄酮类化合物占比最高、为45.6%。黄酮类、黄酮糖苷和异黄酮三类差异代谢物在白花型种质中上调数量高于紫花型种质;而黄酮醇类化合物是两种质差异代谢物最多的类别,且多数在紫花型种质中呈显著上调。进一步通路富集分析发现,125种差异代谢物共注释到47条代谢通路,其中,显著富集的有类黄酮(Flavonoid)、异黄酮(Isoflavonoid)、花青素(Anthocyanin)、黄酮(Flavone)、黄酮醇(Flavonol)、芪类化合物(Stilbenoid)、二芳基庚烷(diarylheptanoid)和姜酚(Gingerol)生物合成及嘌呤(Purine)代谢等途径。【结论】白花型线纹香茶菜种质中黄酮类、黄酮醇类化合物含量显著多于紫花型种质,将为后期线纹香茶菜种质资源的挖掘、创制和新品种选育研究提供良好材料。 展开更多

关键词 线纹香茶菜 种质 代谢组学 UPLC-MS/MS 代谢通路

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不同加工方式的穿心莲药材在不同贮藏期的含量变化 被引量：8

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作者 徐友阳 张慧晔 +2 位作者 邓乔华 梁惠瑜 余小林 《现代中药研究与实践》 CAS 2015年第3期21-23,共3页

目的通过对不同加工方式的穿心莲药材在不同贮藏期的含量变化进行研究,从而确定穿心莲药材最佳的加工方式和贮藏时间。方法从本公司穿心莲GAP基地采收新鲜的穿心莲药材,分别采用四种不同的加工方式进行加工,然后一起放在贮藏室内贮藏至... 目的通过对不同加工方式的穿心莲药材在不同贮藏期的含量变化进行研究,从而确定穿心莲药材最佳的加工方式和贮藏时间。方法从本公司穿心莲GAP基地采收新鲜的穿心莲药材,分别采用四种不同的加工方式进行加工,然后一起放在贮藏室内贮藏至规定时间后取样进行含量测定。结果穿心莲内酯含量以晒干后切段加工方式在贮藏初期为最高;脱水穿心莲内酯含量以晒干后切段加工方式在贮藏21个月时最高;穿心莲总内酯含量以晒干后切段加工方式在贮藏初期为最高。结论以穿心莲药材为原料提取穿心莲内酯或穿心莲总内酯时,建议最好采用晒干后切段加工的新鲜药材提取。以穿心莲药材为原料提取脱水穿心莲内酯时,建议最好采用晒干后切段加工方式贮藏21个月时的药材提取。 展开更多

关键词 穿心莲 加工方式 贮藏 穿心莲内酯 脱水穿心莲内酯 穿心莲总内酯

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显齿蛇葡萄转录组测序、注释与分析 被引量：1

3

作者 徐友阳 王德勤 +3 位作者 李静宇 梅瑜 王继华 蔡时可 《农业研究与应用》 2022年第5期15-23,共9页

本研究通过高通量转录组测序和生物信息学分析获得显齿蛇葡萄的转录表达数据,提取显齿蛇葡萄叶片和茎的总RNA(Ribonucleic Acid,核糖核酸)、建库、测序、组装,注释和比对等生物信息分析技术得到显齿蛇葡萄转录组的遗传信息。共检测到23,... 本研究通过高通量转录组测序和生物信息学分析获得显齿蛇葡萄的转录表达数据,提取显齿蛇葡萄叶片和茎的总RNA(Ribonucleic Acid,核糖核酸)、建库、测序、组装,注释和比对等生物信息分析技术得到显齿蛇葡萄转录组的遗传信息。共检测到23,208,741个高质量的Reads,对数据进行Denovo组装后,获得43,603个Unigene,其中Unigene的N50长度为1580 bp,平均长度为1000.2 bp。在KOG、GO、KEGG、NR、SwissProt数据库中进行比对,得到注释的有25714个(58.97%)Unigene。其中25,801个Unigene在Nr数据库中得到注释,15,934个Unigene在KEGG数据库中得到注释,涉及135条代谢通路。在显齿蛇葡萄中我们共鉴定到75个Unigene涉及黄酮类生物合成,其中参与黄酮和黄酮醇生物合成的Unigene有4个,参与异黄酮生物合成的Unigene有13个。同时还检测到922个转录因子(Transcription factors,TFs)。采用MISA(Microsatellite identification tool)对组装的1000 bp以上的unigene分析发现,4771个Unigene包含5869个简单重复序列(Simple sequence repeats,SSRs),并使用Primer 3.0设计引物。利用高通量测序和生物信息学分析获得了显齿蛇葡萄的转录组信息特征,转录组数据为显齿蛇葡萄的重要功能基因鉴定,次生代谢通的挖掘奠定了研究基础。 展开更多

关键词 显齿蛇葡萄 转录组 UNIGENE 功能注释 SSR

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广东等五省穿心莲药材中穿心莲内酯和脱水穿心莲内酯含量比较 被引量：12

4

作者 邓乔华 梁惠瑜 +2 位作者 徐友阳 郭福源 黄勇 《现代中药研究与实践》 CAS 2014年第1期9-11,共3页

目的通过比较不同产地穿心莲药材中穿心莲内酯和脱水穿心莲内酯含量，寻找穿心莲药材最适宜的栽培地区。方法收集全国5个省9个不同产地25个穿心莲样品，按2010版《中国药典》一部穿心莲项下方法进行检测与分析。结果不同产地及批次穿心... 目的通过比较不同产地穿心莲药材中穿心莲内酯和脱水穿心莲内酯含量，寻找穿心莲药材最适宜的栽培地区。方法收集全国5个省9个不同产地25个穿心莲样品，按2010版《中国药典》一部穿心莲项下方法进行检测与分析。结果不同产地及批次穿心莲样品中总内酯的含量在1．03％-6．98％之间；穿心莲不同部位总内酯的含量：叶在3．43％～6．98％之间，茎在0．93％～1，33％之间，全草在1，99％-4．41％之间；不同采集方式穿心莲样品总内酯含量：自采样品含量在3．20％-4．41％之间，产地供应商提供的样品含量在1．99％-3．36％之间。结论穿心莲不同产地、不同采集方式及不同部位的含量均存在着显著差异，选择适宜的产地建立基地、适时采收及加工对穿心莲药材的质量控制意义重大。 展开更多

关键词 穿心莲 穿心莲内酯 脱水穿心莲内酯 含量测定

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裕丹参采收加工与贮运标准操作规程的初步研究 被引量：4

5

作者 邓乔华 曹金斌 +3 位作者 潘永存 陈悦 徐友阳 梁惠瑜 《中国现代中药》 CAS 2007年第7期35-35,39,共2页

关键词 裕丹参 采收 加工 贮运 标准操作规程

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影响穿心莲药材质量因素的调查和研究 被引量：5

6

作者 邓乔华 徐友阳 +4 位作者 李淑如 蔡玉辉 林蔚兰 彭云 梁惠瑜 《现代中药研究与实践》 CAS 2009年第5期5-7,共3页

穿心莲为爵床科植物穿心莲Andrographis paniculata（Burm.f）Nees的干燥地上部分（全草或叶），性味苦寒，具有清热解毒，凉血消肿的功效。用于感冒发热，咽喉肿痛，口舌生疮，顿咳劳嗽，

关键词 穿心莲 质量差异 栽培 加工方式

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溪黄草考证及性状鉴别法的验证 被引量：4

7

作者 邓乔华 王德勤 +4 位作者 黄亦南 梁惠瑜 徐友阳 徐小飞 张为亮 《现代中药研究与实践》 CAS 2014年第2期15-18,12,共5页

目的对溪黄草进行考证,并对药材溪黄草及植物溪黄草的性状鉴别法进行验证。方法对药材溪黄草及植物溪黄草两种植物的新鲜及干燥枝叶的性状鉴定方法进行验证。结果药材溪黄草原植物线纹香茶菜Isodon striatus(Benth.)Kudo及变种纤花香茶... 目的对溪黄草进行考证,并对药材溪黄草及植物溪黄草的性状鉴别法进行验证。方法对药材溪黄草及植物溪黄草两种植物的新鲜及干燥枝叶的性状鉴定方法进行验证。结果药材溪黄草原植物线纹香茶菜Isodon striatus(Benth.)Kudo及变种纤花香茶菜Isodon Iophanthoides var.graciliflora(Benth.)Hara与植物溪黄草Isodon serra(Maxim.)Kudo有显著差别,前二者具有传统溪黄草黄汁及红腺点特征,而后者无黄汁及无红腺点,容易鉴别。结论药材溪黄草和植物溪黄草采用此性状鉴定方法很容易鉴别出来,植物溪黄草是否可作为药材溪黄草使用值得商榷。此法简单直观,经济易行,有一定的使用价值。 展开更多

关键词 溪黄草 线纹香茶菜 纤花香茶菜 性状鉴别法

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溪黄草规范化种植示范基地的建设 被引量：5

8

作者 邓乔华 赵宇 +4 位作者 王德勤 蔡玉辉 徐友阳 梁惠瑜 黄勇 《现代中药研究与实践》 CAS 2011年第1期10-12,共3页

溪黄草为唇形科植物线纹香茶菜Isodon lophanthoides（Buch.-Ham.ex D.Don）H.Hara.的干燥全草,具有清热利湿、退黄祛湿、凉血散瘀的功效,用于治疗急性黄疸型肝炎、急性胆囊炎、痢疾、肠炎等病症,是我国南方地区治疗乙型肝炎的常用中药... 溪黄草为唇形科植物线纹香茶菜Isodon lophanthoides（Buch.-Ham.ex D.Don）H.Hara.的干燥全草,具有清热利湿、退黄祛湿、凉血散瘀的功效,用于治疗急性黄疸型肝炎、急性胆囊炎、痢疾、肠炎等病症,是我国南方地区治疗乙型肝炎的常用中药。本公司在广东清远和台山地区建立了溪黄草规范化科研和示范基地,开展溪黄草规范化种植研究,现作以下报道。 展开更多

关键词 溪黄草 GAP基地 规范化种植

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中药材GAP基地建设中存在的问题与建议 被引量：4

9

作者 邓乔华 黄勇 +1 位作者 徐友阳 潘雪峰 《现代中药研究与实践》 CAS 2013年第6期3-6,共4页

根据广州白云山和记黄埔中药有限公司实施中药材规范化种植13年来所取得的经验,总结了中药材规范化种植过程中普遍存在的14个方面的问题,提出了解决这些问题的7个对策和建议,以期保证中药材基地的GAP建设健康发展和药品质量的安全。

关键词 中药材 GAP 基地 问题 建议

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溪黄草规范化种植技术的初步研究 被引量：4

10

作者 邓乔华 徐友阳 +5 位作者 丘金裕 蔡玉辉 潘永存 梁惠瑜 彭云 田汉卿 《现代中药研究与实践》 CAS 2010年第2期3-5,共3页

溪黄草为唇形科植物线纹香茶菜lsodon lophanthoides（Buch．-Ham．ex D．Don）H．Hara的干燥全草。主产于长江以南的湖南、四川、云南、江西、广东、广西等地区。具有清热利湿、退黄祛湿、凉血散瘀的功效，用于治疗急性黄疸型肝炎、急... 溪黄草为唇形科植物线纹香茶菜lsodon lophanthoides（Buch．-Ham．ex D．Don）H．Hara的干燥全草。主产于长江以南的湖南、四川、云南、江西、广东、广西等地区。具有清热利湿、退黄祛湿、凉血散瘀的功效，用于治疗急性黄疸型肝炎、急性胆囊炎、痢疾、肠炎等病症，是我国南方地区治疗乙型肝炎的常用草药。 展开更多

关键词 溪黄草 基地 规范化种植

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穿心莲旱地绿色栽培技术的研究 被引量：2

11

作者 邓乔华 徐友阳 +6 位作者 丘金裕 蔡玉辉 黄勇 梁惠瑜 张卓能 黄亦南 田汉卿 《现代中药研究与实践》 CAS 2011年第6期13-14,共2页

目的规范穿心莲旱地绿色栽培技术,提高旱地栽培穿心莲药材的产量和质量。方法在公司穿心莲旱地种植示范基地,近年来开展了一系列穿心莲旱地绿色栽培技术的研究。结果在田间试验及示范基地中试与推广的基础上,总结出穿心莲旱地绿色栽培... 目的规范穿心莲旱地绿色栽培技术,提高旱地栽培穿心莲药材的产量和质量。方法在公司穿心莲旱地种植示范基地,近年来开展了一系列穿心莲旱地绿色栽培技术的研究。结果在田间试验及示范基地中试与推广的基础上,总结出穿心莲旱地绿色栽培技术。结论这一技术对于在粤北山区丘陵坡地建设穿心莲规范化生产基地,提高穿心莲药材产量和质量具有重要的意义。 展开更多

关键词 穿心莲 旱地 绿色栽培技术

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超甜玉米生产性能模糊综合评价 被引量：3

12

作者 王晓明 翟英芬 徐友阳 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期142-146,共5页

应用模糊综合评价方法,对2003～2004年全国超甜玉米区试新组合的6个生产性能进行了定量化评价。结果表明:①用模糊数学综合评价能够将多种性状指标归纳为一个统一的量化综合评价指标(模糊综合指数,FCI),该指标能较好地反映各新组合的实... 应用模糊综合评价方法,对2003～2004年全国超甜玉米区试新组合的6个生产性能进行了定量化评价。结果表明:①用模糊数学综合评价能够将多种性状指标归纳为一个统一的量化综合评价指标(模糊综合指数,FCI),该指标能较好地反映各新组合的实际综合生长性能水平,所获得的最终评价值不仅能反映各评价单元之间的相对级别,而且能直接反映它们的绝对等级。②根据FCI划分为5个综合评价等级,绝大多数超甜玉米新组合(或品种)处于3～4级。我国超甜玉米新品种选育需要种质资源的创新和选育水平的提高。 展开更多

关键词 超甜玉米 模糊综合指数 区域试验

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溪黄草中熊果酸含量测定方法学研究 被引量：5

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作者 李楚源 邓乔华 +1 位作者 黄琳 徐友阳 《中外医疗》 2009年第28期155-156,共2页

目的选择熊果酸作为溪黄草质量评价的指标成分,为正确评价溪黄草药材的质量提供理论依据。方法采用HPLC法测定溪黄草药材熊果酸的含量,并对该测定方法进行了方法学的系统研究。结果不同产地、不同批次的样品,熊果酸含量差异相大。结论... 目的选择熊果酸作为溪黄草质量评价的指标成分,为正确评价溪黄草药材的质量提供理论依据。方法采用HPLC法测定溪黄草药材熊果酸的含量,并对该测定方法进行了方法学的系统研究。结果不同产地、不同批次的样品,熊果酸含量差异相大。结论溪黄草最佳指标成分及质量评价标准有待进一步深入研究。 展开更多

关键词 溪黄草 熊果酸 含量测定 方法学研究

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丹参种质繁育规范化生产标准操作规程的初步研究 被引量：1

14

作者 邓乔华 曹金斌 +4 位作者 高致明 张重义 潘永存 徐友阳 陈悦 《现代中药研究与实践》 CAS 2007年第4期3-6,共4页

关键词 丹参 种质 GAP 标准操作规程

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清远穿心莲规范化种植基地生态环境质量评价 被引量：1

15

作者 黄勇 邓乔华 +2 位作者 蔡玉辉 徐友阳 梁惠瑜 《现代中药研究与实践》 CAS 2012年第3期5-7,共3页

目的对穿心莲种植基地环境质量进行评价。方法采用国家规定的环境质量及其分析方法标准和相关的文献方法对穿心莲规范化种植基地空气、土壤环境和水资源进行评价。结果穿心莲规范化种植基地的土壤环境达到GB15618-1995(国家土壤环境质... 目的对穿心莲种植基地环境质量进行评价。方法采用国家规定的环境质量及其分析方法标准和相关的文献方法对穿心莲规范化种植基地空气、土壤环境和水资源进行评价。结果穿心莲规范化种植基地的土壤环境达到GB15618-1995(国家土壤环境质量标准)的一级标准,水资源达GB5084-92(农业灌溉水质标准)的一类水质标准,大气质量标准达GB3095-1996(环境空气质量)二级标准。结论穿心莲规范化种植区环境质量良好。 展开更多

关键词 穿心莲 基地 环境评价

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溪黄草药材的质量研究 被引量：2

16

作者 李楚源 邓乔华 +3 位作者 梁敬仪 梁惠瑜 黄琳 徐友阳 《今日药学》 CAS 2009年第5期63-68,共6页

目的对本公司溪黄草生产基地生产的溪黄草药材进行质量研究,为正确评价溪黄草药材的质量提供理论依据。方法对溪黄草性状、鉴别、水分、浸出物、总灰分进行检验,采用高效液相色谱(HPLC)法测定溪黄草药材熊果酸的含量。结果不同批次的药... 目的对本公司溪黄草生产基地生产的溪黄草药材进行质量研究,为正确评价溪黄草药材的质量提供理论依据。方法对溪黄草性状、鉴别、水分、浸出物、总灰分进行检验,采用高效液相色谱(HPLC)法测定溪黄草药材熊果酸的含量。结果不同批次的药材样品,熊果酸含量差异较大;溪黄草叶浸出物较高,茎浸出物较低。结论溪黄草以叶多者为佳,溪黄草质量标准有待进一步深入研究。 展开更多

关键词 溪黄草 质量 研究

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基于高通量测序的穿心莲连作根际土壤细菌群落多样性分析 被引量：7

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作者 周界 李明 +4 位作者 徐友阳 洪彪 段书蕾 张慧晔 邹江林 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期55-63,共9页

【目的】研究穿心莲Andrographis paniculata连作对土壤细菌多样性及种群结构的影响。【方法】通过16S rRNA基因高通量测序对连作组(连作5年穿心莲的根际土壤)和对照组(连作5年穿心莲周边相同土质的未耕作自然土壤)样品进行测序分析,比... 【目的】研究穿心莲Andrographis paniculata连作对土壤细菌多样性及种群结构的影响。【方法】通过16S rRNA基因高通量测序对连作组(连作5年穿心莲的根际土壤)和对照组(连作5年穿心莲周边相同土质的未耕作自然土壤)样品进行测序分析,比较2组土壤细菌的丰富度、多样性和群落结构差异。【结果】α多样性指数分析结果显示,连作组土壤中细菌丰富度指数Chao1指数、Observed species指数显著低于对照组(P<0.05),连作组土壤中的多样性指数Shannon指数和Simpson指数均低于对照组,但差异不显著。主坐标分析及分子方差分析进行组间群落结构差异显著性分析结果显示,穿心莲连作显著改变了土壤细菌群落结构(P<0.05)。从2个处理组土壤样品中共检测到2 769个可操作分类单元,分属于47门885属,穿心莲连作明显改变了土壤细菌在门和属水平上的结构分布。在门分类水平上,酸杆菌门Acidobacteria、变形菌门Proteobacteria、拟杆菌门Bacteroidetes和Patescibacteria等11个细菌门是2个处理组的主要细菌类群,连作组土壤中变形菌门和酸杆菌门的相对丰度较对照组分别增加了21.97%和46.33%(P<0.05),而Patescibacteria较对照组减少了68.99%(P<0.05);在属分类水平上,有10个优势菌属的相对丰度变化显著(P<0.05),其中连作组土壤中有益生防细菌黄杆菌属Flavobacterium和Haliangium的相对丰度较对照组分别减少了78.40%和54.55%,而植物病原细菌伯克氏菌属Burkholderia-Caballeronia-Paraburkholderia的相对丰度较对照组增加了804.17%。【结论】穿心莲5年连作降低了土壤细菌丰富度和多样性水平,使土壤微生态系统稳定性降低,同时有益菌相对丰度显著降低,而病原菌相对丰度显著增加造成细菌群落结构改变。上述变化打破了原有的土壤微生态平衡,可能是穿心莲连作障碍的重要原因之一。 展开更多

关键词 穿心莲 连作障碍 土壤细菌种群结构 高通量测序 相对丰度

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响应面法优化三七茎叶茶酶解工艺 被引量：2

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作者 蔡树杏 邹江林 +1 位作者 徐友阳 王德勤 《食品与发酵科技》 CAS 2021年第2期108-114,共7页

为改善三七茎叶茶口感及增加人参皂苷Rb3的溶出量,本研究利用外源性酶对三七茎叶进行酶解。经对比研究,发现纤维素酶酶解效果好。通过单因素考察,确定了最佳酶解温度、酶溶液加入量及食用醋加入量,并在此基础上利用响应面试验进行优化,... 为改善三七茎叶茶口感及增加人参皂苷Rb3的溶出量,本研究利用外源性酶对三七茎叶进行酶解。经对比研究,发现纤维素酶酶解效果好。通过单因素考察,确定了最佳酶解温度、酶溶液加入量及食用醋加入量,并在此基础上利用响应面试验进行优化,结果发现,三七茎叶茶最佳酶解工艺为:纤维素酶溶液加入量25%,酶解温度49℃、食用醋加入量11%。在此条件下,人参皂苷Rb_(3)的溶出量及口感评分最高。 展开更多

关键词 三七茎叶 酶解工艺 响应面法 优化

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二甲戊乐灵在溪黄草及土壤中的残留分析方法研究

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作者 刘凯丽 段敏敏 +3 位作者 吴加伦 王德勤 张慧晔 徐友阳 《分析科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期401-404,共4页

本文对溪黄草样品采用丙酮-正己烷提取,活性炭-中性氧化铝柱净化,石油醚-丙酮淋洗前处理;土壤样品经乙腈提取等步骤前处理,建立了溪黄草及土壤中二甲戊乐灵残留的气相色谱-电子捕获检测器（GC-ECD）的分析方法。结果表明：二甲戊乐灵的... 本文对溪黄草样品采用丙酮-正己烷提取,活性炭-中性氧化铝柱净化,石油醚-丙酮淋洗前处理;土壤样品经乙腈提取等步骤前处理,建立了溪黄草及土壤中二甲戊乐灵残留的气相色谱-电子捕获检测器（GC-ECD）的分析方法。结果表明：二甲戊乐灵的最小检出量为0.1ng,其在溪黄草和土壤中的最低检测浓度均为0.01mg/kg,在溪黄草中的平均回收率为88.53%～90.45%,相对标准偏差（RSD）为1.33%～2.76%;在土壤中的平均回收率为93.94%～96.23%,RSD为4.67%～4.80%,二甲戊乐灵在0.01～2mg/L范围内具有良好的线性关系。 展开更多

关键词 二甲戊乐灵 溪黄草 土壤 气相色谱法

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中泰南五味子转录组测序及生物信息学分析 被引量：3

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作者 李静宇 徐友阳 +1 位作者 蔡时可 王继华 《广州中医药大学学报》 CAS 2022年第10期2387-2393,共7页

【目的】利用高通量测序技术获得中泰南五味子的转录组信息。【方法】中泰南五味子叶片总RNA经过提取、建库、测序、de novo组装,获得Unigene序列,再进行注释和比对,得到中泰南五味子转录组的遗传信息。【结果】共获得29915条Unigene,... 【目的】利用高通量测序技术获得中泰南五味子的转录组信息。【方法】中泰南五味子叶片总RNA经过提取、建库、测序、de novo组装,获得Unigene序列,再进行注释和比对,得到中泰南五味子转录组的遗传信息。【结果】共获得29915条Unigene,平均长度为1033 bp,N50为1554 bp。共有22359条Unigene在至少1个数据库中获得功能注释,中泰南五味子与荷花Nelumbo nucifera的序列相似度最高。在京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库中共有14284个Unigene得到注释;在基因本体论(GO)数据库中共有18084条中泰南五味子Unigene获得注释,包括ATP结合、膜的组成成分和生物过程等。此外,采用MISA对组装的1000 bp以上的10747条Unigene进行简单序列重复(SSR)检测,共鉴定到6363个SSR位点,并使用Primer 3.0设计引物。【结论】获得的转录组数据为中泰南五味子的药用活性成分合成通路和功能基因的挖掘奠定了基础,也有利于其资源保护和开发利用。 展开更多

关键词 中泰南五味子 转录组 生物信息学 高通量测序 UNIGENE 功能注释 简单序列重复(SSR)

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