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两广小花猪FOXL2基因多态性及其与几个重要经济性状的关联分析 被引量:1
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作者 廖伟莉 张笑科 +8 位作者 曾检华 阳林芳 李硕 胡梦婷 郭懿萱 陈赞谋 张豪 李加琪 袁晓龙 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期956-965,共10页
旨在筛选FOXL2(forkhead box protein L2)基因与猪排卵状态和屠宰性状相关的SNPs位点,为今后两广小花猪分子育种和遗传改良提供理论和参考依据。本研究以107头(365±25)日龄两广小花猪为研究对象,使用靶向测序基因型检测(genotyping... 旨在筛选FOXL2(forkhead box protein L2)基因与猪排卵状态和屠宰性状相关的SNPs位点,为今后两广小花猪分子育种和遗传改良提供理论和参考依据。本研究以107头(365±25)日龄两广小花猪为研究对象,使用靶向测序基因型检测(genotyping by target sequencing,GBTS)技术定位FOXL2基因的SNPs位点,对排卵状态、乳头数和屠宰性状进行关联分析和单倍型分析。两广小花猪FOXL2基因共检测到24个突变位点。剔除InDel突变和突变频率小于1%的SNP位点后,对得到的12个SNPs进行关联分析,其中2个位于编码区、10个位于非编码区。单SNP位点关联分析表明,g.79706726 T>C、g.79706898 C>T、g.79707794 T>C、g.79709005 T>C这4个位点对排卵状态均有显著性影响(P<0.05),对总乳头数性状无显著性影响(P>0.05)。g.79707040 A>G、g.79708079 T>C、g.79708152 G>T、g.79706726 T>C、g.79706898 C>T、g.79707794 T>C这6个SNPs位点对骨重、瘦肉率、腿臀重、左胴体重性状均有显著性影响(P<0.05),其中3个SNPs位点g.79707040 A>G、g.79708079 T>C、g.79708152 G>T对板油重性状有显著性影响(P<0.05)。SNP位点单倍型组合关联分析发现,g.79706726 T>C、g.79706898 C>T、g.79707794 T>C这3个位点处于强连锁区域内(r2>0.9)。H1H2单倍型组合(g.79706726 T>C和g.79706898 C>T)对排卵状态、骨重、瘦肉率、腿臀重、左胴体重性状均有显著性影响(P<0.05),其中CCTT单倍型个体的骨重、腿臀重和左胴体重性状显著高于TTCC单倍型个体(P<0.05),CCTT单倍型个体的瘦肉率性状显著低于TTCC单倍型个体(P<0.05)。FOXL2基因中有与排卵状态显著相关的g.79706726 T>C、g.79706898 C>T、g.79707794 T>C、g.79709005 T>C等SNPs位点。另外,本研究发现了FOXL2转录因子与猪屠宰性状相关的SNPs位点,表明FOXL2转录因子除了维持卵巢表型和功能以外,还影响猪的重要经济性状。本研究为FOXL2基因在两广小花猪的选种选育中提供重要参考,为分子标记辅助选择提供理论依据。 展开更多
关键词 卵巢 屠宰性状 FOXL2 SNPS 单倍型
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杜洛克猪生长性状全基因组关联分析及候选基因鉴定 被引量:6
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作者 张笑科 廖伟莉 +5 位作者 陈信佑 李婷婷 袁晓龙 李加琪 黄翔 张豪 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1868-1876,共9页
旨在对杜洛克猪生长性状进行全基因组关联分析及候选基因鉴定。本研究选用361头杜洛克种公猪作为试验群体,对达100 kg体重日龄、达100 kg平均日增重、达100 kg活体背膘厚和达100 kg眼肌面积性状进行测定,基因型信息使用50K单核苷酸多态... 旨在对杜洛克猪生长性状进行全基因组关联分析及候选基因鉴定。本研究选用361头杜洛克种公猪作为试验群体,对达100 kg体重日龄、达100 kg平均日增重、达100 kg活体背膘厚和达100 kg眼肌面积性状进行测定,基因型信息使用50K单核苷酸多态性阵列进行分型,质控后得到31618个SNPs。使用GCTA软件利用基因组信息对各生长性状进行遗传参数估计,使用R软件rMVP包FarmCPU模型进行全基因组关联分析,鉴定与生长性状相关的基因组区域和候选基因。结果表明,达100 kg体重日龄、达100 kg平均日增重、达100 kg活体背膘厚和达100 kg眼肌面积性状的遗传力分别为0.27、0.29、0.16和0.11,属于中等遗传力性状,达100 kg体重日龄和达100 kg平均日增重的遗传相关和表型相关值均为-0.99,为强负相关关系。全基因关联分析结果表明,在达100 kg体重日龄和达100 kg平均日增重性状上共检测到3个显著SNPs,均位于10号染色体上。使用最小显著差数检验法对显著SNPs的等位基因型进行多重比较,显著SNPs rs81237156、rs81424502和rs81313018的优势等位基因分别为G、T和A。候选基因HACD 1和BAMBI在显著SNPs附近的候选区域内被鉴定与猪生长性状相关。本研究新发现的候选基因将促进对生长性状的理解,而新变异的识别可为猪育种的潜在标记提供新的思路。 展开更多
关键词 生长性状 全基因组关联分析 候选基因 FarmCPU
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品种、季节、胎次、采精月龄及采精间隔对猪精液品质的影响 被引量:7
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作者 张笑科 廖伟莉 +7 位作者 李瑶 吴煜伟 庄汝柏 贾百威 袁晓龙 李加琪 黄翔 张豪 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2022年第10期3879-3890,共12页
【目的】探究品种、公猪出生胎次、公猪同窝仔猪数、公猪乳头数、采精季节、采精月龄和采精间隔对猪精液品质的影响,以及不同品种对精液质量稳定性的影响。【方法】选取909头杜洛克、长白、大白种公猪为试验群体,收集2021年4月至2022年4... 【目的】探究品种、公猪出生胎次、公猪同窝仔猪数、公猪乳头数、采精季节、采精月龄和采精间隔对猪精液品质的影响,以及不同品种对精液质量稳定性的影响。【方法】选取909头杜洛克、长白、大白种公猪为试验群体,收集2021年4月至2022年4月27408条精液测定记录,采用混合线性分析模型和方差分析探究品种、公猪出生胎次、公猪同窝仔猪数、公猪乳头数、采精季节、采精月龄和采精间隔对精液体积、精液密度、精子活力、直线前进运动精子比例、精子畸形率、总精子数及各精液性状稳定性的影响。【结果】从不同品种对精液品质的影响来看,长白猪精液体积和总精子数均显著高于大白猪、杜洛克猪(P<0.05),杜洛克猪精液密度显著高于大白猪和长白猪(P<0.05),杜洛克猪、大白猪精子活力均显著高于长白猪(P<0.05),大白猪直线前进运动精子比例显著高于长白猪和杜洛克猪(P<0.05),长白猪和大白猪精子畸形率均显著低于杜洛克猪(P<0.05);从不同公猪出生胎次对精液品质的影响来看,1~3胎出生的公猪具有较高的精液品质;从不同采精季节对精液品质的影响来看,精液密度、精子活力和总精子数秋、冬季显著高于春、夏季(P<0.05);从不同采精月龄对精液品质的影响来看,16~25月龄公猪具有较高的精液品质;从不同采精间隔对精液品质的影响来看,4~5 d为最佳采精间隔,采精间隔过长会导致精子畸形率上升;从不同公猪总乳头数来看,乳头数13~16个时,各精液性状品质都处于中等水平,有利于公猪生产应用。3个品种各精液性状间稳定性趋势不一,杜洛克猪和大白猪精液体积和精子活力的稳定性均显著高于长白猪(P<0.05),杜洛克猪精液密度、精子畸形率和总精子数的稳定性均显著高于大白猪和长白猪(P<0.05),大白猪直线前进运动精子比例的稳定性显著高于长白猪和杜洛克猪(P<0.05)。各品种中,长白猪稳定性较差;各精液性状中,精子活力稳定性最好。【结论】品种、公猪出生胎次、采精季节、采精月龄和采精间隔均会影响公猪精液品质,可根据不同品种公猪制定更完善的选择方案,提高精液质量,加速公猪遗传改良。 展开更多
关键词 精液性状 采精月龄 采精间隔 精液性状稳定性
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采精员和猪舍环境参数对杜洛克公猪精液品质的影响 被引量:1
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作者 张笑科 廖伟莉 +4 位作者 李婷婷 李瑶 李加琪 黄翔 张豪 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期220-229,共10页
【目的】研究采精员、猪舍温湿度、氨气浓度和光照强度对种公猪精液品质的影响,以提高猪精液品质。【方法】选取347头(580±48)d的杜洛克公猪,收集2021年11月至2022年2月共2966条精液测定记录,采精员做好每天公猪的采精记录,猪舍温... 【目的】研究采精员、猪舍温湿度、氨气浓度和光照强度对种公猪精液品质的影响,以提高猪精液品质。【方法】选取347头(580±48)d的杜洛克公猪,收集2021年11月至2022年2月共2966条精液测定记录,采精员做好每天公猪的采精记录,猪舍温湿度、氨气浓度和光照强度参数于每天上午09:00进行测定。使用R软件对采精员记录、环境参数和精液性状进行关联分析。【结果】①采精员对精液品质具有显著影响(P<0.05),8号采精员采集的精液精子活力最高、精子畸形率最低。②猪舍环境温度为22~25℃时,精子活力显著高于18.5~22℃(P<0.05),精子畸形率显著低于18.5~22℃(P<0.05)。③相对湿度在70%~77%时精子活力最高、精子畸形率最低,与相对湿度在46%~60%时差异显著(P<0.05),与相对湿度在60%~70%时无显著差异(P>0.05),相对湿度在60%~70%时精子活力、精子畸形率和总精子数都处于较高水平。④随着氨气浓度降低,精子活力和总精子数呈现上升趋势、精子畸形率呈下降趋势,氨气浓度2~4 ppm与5~7.3 ppm时精子活力、总精子数、精子畸形率差异显著(P<0.05)。⑤光照强度在90~110 lx时精子活力和直线前进运动精子比例最高,与光照强度为130~164.5 lx差异显著(P<0.05),光照强度对精子畸形率无显著影响(P>0.05)。【结论】猪舍环境参数温度范围为22~25℃、湿度范围为60%~70%、氨气浓度2~4 ppm和光照强度为90~110 lx时公猪的精液品质较高。生产中还应加强对采精员的管理培训,减少精液采集过程中造成的机械损伤及细菌污染,为今后研究、修订种公猪舒适环境参数,科学调控猪舍内环境提供参考和理论依据。 展开更多
关键词 杜洛克公猪 采精员 环境参数 精液品质
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手术关胸时间对大鼠急性心肌梗死模型存活率的影响
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作者 白国峰 廖伟莉 +4 位作者 董小莉 杨景昊 张柳红 张豪 王希龙 《动物医学进展》 2025年第6期65-70,共6页
左冠状动脉前降支(LAD)结扎后不同时间点进行心肌注射使得手术关胸时间产生差异,探究手术关胸时间差异对急性心肌梗死(AMI)大鼠存活率的影响,旨在为心肌梗死模型药物干预试验提供参考依据。选取24只雄性SD大鼠,随机分为4组,每组6只。其... 左冠状动脉前降支(LAD)结扎后不同时间点进行心肌注射使得手术关胸时间产生差异,探究手术关胸时间差异对急性心肌梗死(AMI)大鼠存活率的影响,旨在为心肌梗死模型药物干预试验提供参考依据。选取24只雄性SD大鼠,随机分为4组,每组6只。其中对照组进行假手术,即只过针不结扎;3个处理组,分别在LAD结扎后的10、30、45 min于左心室心肌定点注射生理盐水。连续记录21 d内处理组和对照组的大鼠存活天数并计算大鼠存活率。结果显示,LAD结扎后,3个处理组心电图ST段明显抬高,21 d后左心室前壁变薄;21 d内10 min注射组的大鼠存活率高达50%。结果表明,LAD结扎后应尽快注射,即手术关胸时间越早,术后大鼠存活率越高。研究结果可为LAD结扎后的注射时间提供参考范围,并为AMI相关干预研究提供依据。 展开更多
关键词 SD大鼠 心肌梗死模型 心肌定点注射 左冠状动脉前降支
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鹅HIF-1α基因克隆与组织表达分析 被引量:1
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作者 邬德淑 陈世健 +4 位作者 杨晨 廖伟莉 彭翠甜 黄运茂 刘文俊 《仲恺农业工程学院学报》 CAS 2020年第2期15-20,共6页
缺氧诱导因子-1(HIF-1)是在缺氧细胞中发现的一种转录因子,在生物体氧平衡调节中起关键作用.缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)是HIF-1活化的关键调控因子,参与细胞的生长、分化和凋亡的调节.为进一步了解家鹅的缺氧应答系统,本研究参考NCBI上... 缺氧诱导因子-1(HIF-1)是在缺氧细胞中发现的一种转录因子,在生物体氧平衡调节中起关键作用.缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)是HIF-1活化的关键调控因子,参与细胞的生长、分化和凋亡的调节.为进一步了解家鹅的缺氧应答系统,本研究参考NCBI上公布的鹅HIF-1α基因序列设计引物,并成功克隆了马岗鹅HIF-1αmRNA,获得了HIF-1α完整的ORF序列,全长为2403 bp,编码800个氨基酸.研究表明,马岗鹅HIF-1α基因结构保守,在家禽中的同源性较高且与鸡的同源性最高达到94.1%,蛋白结构主体包含螺旋-环-螺旋模式(Helix loop helix,HLH)、PAS(Per ARNT Sim)蛋白、PAC(Motif C-terminal to PAS motifs)等结构域,符合HIF-1α蛋白的结构特征.组织表达差异分析结果显示HIF-1α基因在肺和胰腺表达高,在肌肉中表达低,在气管中几乎不表达. 展开更多
关键词 缺氧诱导因子 基因克隆 序列分析 表达差异分析
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